{"id":295996,"date":"2019-12-18T15:00:32","date_gmt":"2019-12-18T15:00:32","guid":{"rendered":"http:\/\/savepearlharbor.com\/?p=295996"},"modified":"-0001-11-30T00:00:00","modified_gmt":"-0001-11-29T21:00:00","slug":"","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/savepearlharbor.com\/?p=295996","title":{"rendered":"\u0417\u0430\u0434\u0430\u0447\u0430 \u21161. \u0423\u0437\u043d\u0430\u0439\u0442\u0435 \u043f\u043e\u043b \u0438 \u0441\u0442\u0435\u043f\u0435\u043d\u044c \u0440\u043e\u0434\u0441\u0442\u0432\u0430"},"content":{"rendered":"\n<div class=\"post__text post__text-html js-mediator-article\" id=\"post-content-body\" data-io-article-url=\"https:\/\/habr.com\/ru\/company\/atlasbiomed\/blog\/480954\/\">\u0412\u00a0\u043f\u0440\u0435\u0434\u044b\u0434\u0443\u0449\u0435\u0439 \u043f\u043e\u0434\u0440\u043e\u0431\u043d\u043e\u0439 <a href=\"https:\/\/habr.com\/ru\/company\/atlasbiomed\/blog\/479602\/\">\u0441\u0442\u0430\u0442\u044c\u0435<\/a> \u043f\u0440\u043e <a href=\"https:\/\/atlas.ru\/wgs\">\u041f\u043e\u043b\u043d\u044b\u0439 \u0433\u0435\u043d\u043e\u043c<\/a> \u043c\u044b\u00a0\u043e\u0431\u0435\u0449\u0430\u043b\u0438 \u043e\u043f\u0443\u0431\u043b\u0438\u043a\u043e\u0432\u0430\u0442\u044c \u0442\u0440\u0438 \u0437\u0430\u0434\u0430\u0447\u0438 \u0438\u00a0\u043f\u043e\u0434\u0430\u0440\u0438\u0442\u044c \u0442\u0435\u0441\u0442 \u0442\u043e\u043c\u0443, \u043a\u0442\u043e \u043f\u0435\u0440\u0432\u044b\u043c \u0440\u0435\u0448\u0438\u0442 \u0432\u0441\u0435 \u0442\u0440\u0438 \u043f\u0440\u0430\u0432\u0438\u043b\u044c\u043d\u043e. \u0417\u0430\u043e\u0434\u043d\u043e \u0432\u00a0\u044d\u0442\u0438\u0445 \u0437\u0430\u0434\u0430\u0447\u0430\u0445 \u043c\u044b\u00a0\u0434\u0430\u0435\u043c \u043f\u0440\u0438\u043c\u0435\u0440\u044b, \u043a\u0430\u043a \u043c\u043e\u0436\u043d\u043e \u0440\u0430\u0431\u043e\u0442\u0430\u0442\u044c \u0441\u00a0\u0433\u0435\u043d\u0435\u0442\u0438\u0447\u0435\u0441\u043a\u0438\u043c\u0438 \u0434\u0430\u043d\u043d\u044b\u043c\u0438. \u0421\u0435\u0433\u043e\u0434\u043d\u044f \u043f\u0443\u0431\u043b\u0438\u043a\u0443\u0435\u043c \u043f\u0435\u0440\u0432\u0443\u044e.<\/p>\n<p>  <img decoding=\"async\" src=\"https:\/\/habrastorage.org\/webt\/qd\/mz\/ye\/qdmzye9a9sdyp82atstpktqrnu4.png\"><br \/>  <a name=\"habracut\"><\/a><br \/>  \u0412\u00a0\u043f\u0435\u0440\u0432\u043e\u0439 <a href=\"https:\/\/habr.com\/ru\/company\/atlasbiomed\/blog\/479602\/\">\u0441\u0442\u0430\u0442\u044c\u0435<\/a> \u043c\u044b\u00a0\u0434\u0435\u043b\u0438\u043b\u0438\u0441\u044c \u043f\u043e\u043b\u0435\u0437\u043d\u043e\u0439 \u0438\u043d\u0444\u043e\u0440\u043c\u0430\u0446\u0438\u0435\u0439 \u0438\u00a0\u0441\u0441\u044b\u043b\u043a\u0430\u043c\u0438, \u043a\u043e\u0442\u043e\u0440\u044b\u0435 \u043f\u0440\u0438\u0433\u043e\u0434\u044f\u0442\u0441\u044f \u0434\u043b\u044f \u0440\u0430\u0431\u043e\u0442\u044b \u0441\u00a0\u0431\u0438\u043e\u0438\u043d\u0444\u043e\u0440\u043c\u0430\u0442\u0438\u0447\u0435\u0441\u043a\u0438\u043c\u0438 \u0434\u0430\u043d\u043d\u044b\u043c\u0438. \u0421\u043e\u0432\u0435\u0442\u0443\u0435\u043c \u0441\u043d\u0430\u0447\u0430\u043b\u0430 \u043f\u0440\u043e\u0447\u0438\u0442\u0430\u0442\u044c\u00a0\u0435\u0435, \u0435\u0441\u043b\u0438 \u0432\u044b\u00a0\u043f\u0440\u043e\u043f\u0443\u0441\u0442\u0438\u043b\u0438.<\/p>\n<p>  <b>\u0414\u0438\u0441\u043a\u043b\u0435\u0439\u043c\u0435\u0440<\/b><br \/>  \u0420\u0430\u0431\u043e\u0442\u0430 \u0441\u00a0\u0433\u0435\u043d\u0435\u0442\u0438\u0447\u0435\u0441\u043a\u0438\u043c\u0438 \u0434\u0430\u043d\u043d\u044b\u043c\u0438 \u043f\u0440\u043e\u0432\u043e\u0434\u0438\u0442\u0441\u044f \u043d\u0430\u00a0Unix \u0441\u0438\u0441\u0442\u0435\u043c\u0430\u0445 (Linux, macOS), \u0442\u0430\u043a \u043a\u0430\u043a \u043d\u0435\u043a\u043e\u0442\u043e\u0440\u044b\u0435 \u043a\u043e\u043c\u0430\u043d\u0434\u044b \u0438\u00a0\u041f\u041e \u043d\u0435\u0434\u043e\u0441\u0442\u0443\u043f\u043d\u044b \u043d\u0430\u00a0Windows. \u041f\u043e\u044d\u0442\u043e\u043c\u0443 \u0434\u043b\u044f \u043f\u043e\u043b\u044c\u0437\u043e\u0432\u0430\u0442\u0435\u043b\u0435\u0439 Windows \u043e\u0434\u043d\u0438\u043c \u0438\u0437\u00a0\u0441\u0430\u043c\u044b\u0445 \u043f\u0440\u043e\u0441\u0442\u044b\u0445 \u0440\u0435\u0448\u0435\u043d\u0438\u0439 \u0431\u0443\u0434\u0435\u0442 \u0430\u0440\u0435\u043d\u0434\u043e\u0432\u0430\u0442\u044c \u0432\u0438\u0440\u0442\u0443\u0430\u043b\u044c\u043d\u0443\u044e \u043c\u0430\u0448\u0438\u043d\u0443 \u0441\u00a0Linux.<\/p>\n<p>  \u0412\u0441\u0435 \u043e\u043f\u0438\u0441\u0430\u043d\u043d\u044b\u0435 \u043d\u0438\u0436\u0435 \u043e\u043f\u0435\u0440\u0430\u0446\u0438\u0438 \u0432\u044b\u043f\u043e\u043b\u043d\u044f\u044e\u0442\u0441\u044f \u0432\u00a0\u043a\u043e\u043c\u0430\u043d\u0434\u043d\u043e\u0439 \u0441\u0442\u0440\u043e\u043a\u0435\u00a0\u2014 \u0442\u0435\u0440\u043c\u0438\u043d\u0430\u043b\u0435. \u041f\u0435\u0440\u0435\u0434 \u043d\u0430\u0447\u0430\u043b\u043e\u043c \u0432\u044b\u043f\u043e\u043b\u043d\u0435\u043d\u0438\u044f \u0443\u0437\u043d\u0430\u0439\u0442\u0435, \u043a\u0430\u043a \u0440\u0430\u0431\u043e\u0442\u0430\u0442\u044c \u0432\u00a0\u0442\u0435\u0440\u043c\u0438\u043d\u0430\u043b\u0435 \u043f\u043e\u0434 \u0443\u043f\u0440\u0430\u0432\u043b\u0435\u043d\u0438\u0435\u043c \u0432\u0430\u0448\u0435\u0439\u00a0\u041e\u0421 \u0438\u00a0\u0438\u0441\u043f\u043e\u043b\u044c\u0437\u043e\u0432\u0430\u0442\u044c \u043a\u043e\u043c\u0430\u043d\u0434\u044b, \u0442\u0430\u043a \u043a\u0430\u043a \u043d\u0435\u043a\u043e\u0442\u043e\u0440\u044b\u0435 \u0438\u0437\u00a0\u043d\u0438\u0445 \u043c\u043e\u0433\u0443\u0442 \u043f\u043e\u0442\u0435\u043d\u0446\u0438\u0430\u043b\u044c\u043d\u043e \u043d\u0430\u0432\u0440\u0435\u0434\u0438\u0442\u044c\u00a0\u041e\u0421 \u0438\u00a0\u0432\u0430\u0448\u0438\u043c \u0434\u0430\u043d\u043d\u044b\u043c.<\/p>\n<p>  <\/p>\n<h2>\u041d\u0435\u043e\u0431\u0445\u043e\u0434\u0438\u043c\u043e\u0435 \u041f\u041e<\/h2>\n<p>  \u041c\u044b\u00a0\u0441\u043e\u0431\u0440\u0430\u043b\u0438 <a href=\"https:\/\/cloud.yandex.ru\/marketplace\/products\/f2e5v4acgtukhi31n6o4\">\u043e\u0431\u0440\u0430\u0437 \u0432\u0438\u0440\u0442\u0443\u0430\u043b\u044c\u043d\u043e\u0439 \u043c\u0430\u0448\u0438\u043d\u044b<\/a> (\u0412\u041c) \u0441\u043e\u00a0\u0432\u0441\u0435\u043c \u043d\u0435\u043e\u0431\u0445\u043e\u0434\u0438\u043c\u044b\u043c\u00a0\u041f\u041e \u043d\u0430\u00a0\u042f\u043d\u0434\u0435\u043a\u0441.\u041e\u0431\u043b\u0430\u043a\u0435. \u0417\u0430\u0440\u0435\u0433\u0438\u0441\u0442\u0440\u0438\u0440\u0443\u0439\u0442\u0435\u0441\u044c \u0432\u00a0\u042f\u043d\u0434\u0435\u043a\u0441.\u041e\u0431\u043b\u0430\u043a\u0435, \u0432\u00a0\u043b\u0438\u0447\u043d\u043e\u043c \u043a\u0430\u0431\u0438\u043d\u0435\u0442\u0435 \u0432\u00a0\u0440\u0430\u0437\u0434\u0435\u043b\u0435 Compute Cloud \u043d\u0430\u0436\u043c\u0438\u0442\u0435 \u00ab\u0421\u043e\u0437\u0434\u0430\u0442\u044c \u0412\u041c\u00bb. \u0412\u00a0\u043a\u0430\u0447\u0435\u0441\u0442\u0432\u0435 \u043f\u0443\u0431\u043b\u0438\u0447\u043d\u043e\u0433\u043e \u043e\u0431\u0440\u0430\u0437\u0430 \u0432\u044b\u0431\u0435\u0440\u0438\u0442\u0435 \u0438\u0437\u00a0\u043a\u0430\u0442\u0430\u043b\u043e\u0433\u0430 \u00ab\u0410\u0442\u043b\u0430\u0441 \u0410\u043d\u0430\u043b\u0438\u0437 \u0414\u0430\u043d\u043d\u044b\u0445 1000\u00a0\u0413\u0435\u043d\u043e\u043c\u043e\u0432\u00bb. <\/p>\n<p>  \u041a\u043e\u043d\u0444\u0438\u0433\u0443\u0440\u0430\u0446\u0438\u044f \u0412\u041c: 100% 2vCPU, 8GB RAM, 20GB HDD. \u041f\u0440\u0438 \u0441\u043e\u0437\u0434\u0430\u043d\u0438\u0438\u00a0\u0412\u041c \u043d\u0435\u043e\u0431\u0445\u043e\u0434\u0438\u043c\u043e \u0432\u0432\u0435\u0441\u0442\u0438 \u043f\u043b\u0430\u0442\u0435\u0436\u043d\u044b\u0435 \u0434\u0430\u043d\u043d\u044b\u0435, \u043d\u043e\u00a0\u0441\u043e\u00a0\u0441\u0447\u0435\u0442\u0430 \u043d\u0438\u0447\u0435\u0433\u043e \u043d\u0435\u00a0\u0441\u043f\u0438\u0448\u0435\u0442\u0441\u044f. \u0421\u0442\u0430\u0440\u0442\u043e\u0432\u043e\u0433\u043e \u0438\u00a0\u0434\u043e\u043f\u043e\u043b\u043d\u0438\u0442\u0435\u043b\u044c\u043d\u043e\u0433\u043e \u0433\u0440\u0430\u043d\u0442\u0430 \u043f\u043e\u00a0\u043a\u043e\u0434\u043e\u0432\u043e\u043c\u0443 \u0441\u043b\u043e\u0432\u0443 \u0434\u043e\u0441\u0442\u0430\u0442\u043e\u0447\u043d\u043e, \u0447\u0442\u043e\u0431\u044b \u0440\u0430\u0431\u043e\u0442\u0430\u0442\u044c c\u00a0\u0412\u041c \u0438\u00a0\u043e\u0431\u0440\u0430\u0437\u043e\u043c \u043e\u0442\u00a0\u0410\u0442\u043b\u0430\u0441\u0430 \u0434\u043e\u00a031\u00a0\u0434\u0435\u043a\u0430\u0431\u0440\u044f 2019 \u0433\u043e\u0434\u0430 \u0431\u0435\u0441\u043f\u043b\u0430\u0442\u043d\u043e. \u0427\u0442\u043e\u0431\u044b \u043f\u043e\u043b\u0443\u0447\u0438\u0442\u044c \u0433\u0440\u0430\u043d\u0442 \u043d\u0430\u00a0\u043f\u0440\u043e\u0445\u043e\u0436\u0434\u0435\u043d\u0438\u0435 \u0437\u0430\u0434\u0430\u0447, \u043e\u0442\u043f\u0440\u0430\u0432\u044c\u0442\u0435 <a href=\"https:\/\/console.cloud.yandex.ru\/support\">\u0441\u043b\u0443\u0436\u0431\u0435 \u043f\u043e\u0434\u0434\u0435\u0440\u0436\u043a\u0438 \u042f\u043d\u0434\u0435\u043a\u0441.\u041e\u0431\u043b\u0430\u043a\u0430<\/a> \u043a\u043e\u0434\u043e\u0432\u043e\u0435 \u0441\u043b\u043e\u0432\u043e \u00ab\u0410\u0422\u041b\u0410\u0421\u00bb.<\/p>\n<p>  \u041f\u0440\u0438\u043c\u0435\u0447\u0430\u043d\u0438\u0435: \u0433\u0440\u0430\u043d\u0442 \u0434\u0435\u0439\u0441\u0442\u0432\u0438\u0442\u0435\u043b\u0435\u043d \u0434\u043b\u044f \u043d\u043e\u0432\u044b\u0445 \u043f\u043e\u043b\u044c\u0437\u043e\u0432\u0430\u0442\u0435\u043b\u0435\u0439 \u042f\u043d\u0434\u0435\u043a\u0441.\u041e\u0431\u043b\u0430\u043a\u0430, \u043a\u043e\u0442\u043e\u0440\u044b\u0435 \u0437\u0430\u0432\u0435\u043b\u0438 \u0430\u043a\u043a\u0430\u0443\u043d\u0442 \u0441\u00a018\u00a0\u0434\u0435\u043a\u0430\u0431\u0440\u044f 2019 \u0433\u043e\u0434\u0430 \u0438\u043b\u0438 \u0434\u043b\u044f \u0442\u0435\u0445, \u0443\u00a0\u043a\u043e\u0433\u043e \u0435\u0449\u0435 \u0434\u0435\u0439\u0441\u0442\u0432\u0443\u0435\u0442 \u043f\u0440\u043e\u0431\u043d\u044b\u0439 \u043f\u0435\u0440\u0438\u043e\u0434 \u0438\u00a0\u0438\u043c\u0435\u0435\u0442\u0441\u044f \u0441\u0442\u0430\u0440\u0442\u043e\u0432\u044b\u0439 \u0433\u0440\u0430\u043d\u0442. \u041a\u043e\u0434\u043e\u0432\u043e\u0435 \u0441\u043b\u043e\u0432\u043e \u00ab\u0410\u0422\u041b\u0410\u0421\u00bb \u0434\u0435\u0439\u0441\u0442\u0432\u0443\u0435\u0442 \u0442\u043e\u043b\u044c\u043a\u043e \u043e\u0434\u0438\u043d \u0440\u0430\u0437.<\/p>\n<p>  \u041f\u0440\u0435\u0434\u0432\u0430\u0440\u0438\u0442\u0435\u043b\u044c\u043d\u043e \u0441\u043e\u0437\u0434\u0430\u0439\u0442\u0435 ssh \u043a\u043b\u044e\u0447 \u043d\u0430\u00a0\u043b\u043e\u043a\u0430\u043b\u044c\u043d\u043e\u043c \u043a\u043e\u043c\u043f\u044c\u044e\u0442\u0435\u0440\u0435, \u0441\u00a0\u043a\u043e\u0442\u043e\u0440\u043e\u0433\u043e \u0432\u044b\u00a0\u043f\u043b\u0430\u043d\u0438\u0440\u0443\u0435\u0442\u0435 \u043f\u043e\u0434\u043a\u043b\u044e\u0447\u0430\u0442\u044c\u0441\u044f \u043a\u00a0\u0412\u041c:<\/p>\n<pre><code class=\"bash\">ssh-keygen -o -t rsa -b 4096 -C \"my-local-machine\" -f ~\/.ssh\/yandex-cloud -a 100 <\/code><\/pre>\n<p>  \u041d\u0435\u00a0\u0437\u0430\u0431\u0443\u0434\u044c\u0442\u0435 \u0441\u043a\u043e\u043f\u0438\u0440\u043e\u0432\u0430\u0442\u044c \u0441\u043e\u0434\u0435\u0440\u0436\u0438\u043c\u043e\u0435 <code>~\/.ssh\/yandex-cloud.pub<\/code> \u0444\u0430\u0439\u043b\u0430 \u0432\u00a0\u0441\u043e\u043e\u0442\u0432\u0435\u0442\u0441\u0442\u0432\u0443\u044e\u0449\u0435\u0435 \u043e\u043a\u043d\u043e \u043f\u0440\u0438 \u0441\u043e\u0437\u0434\u0430\u043d\u0438\u0438\u00a0\u0412\u041c.<\/p>\n<p>  \u0415\u0441\u043b\u0438 \u0432\u044b\u00a0\u0445\u043e\u0442\u0438\u0442\u0435 \u0443\u0441\u0442\u0430\u043d\u043e\u0432\u0438\u0442\u044c\u00a0\u041f\u041e \u043d\u0430\u00a0\u0441\u0432\u043e\u0439 \u043a\u043e\u043c\u043f\u044c\u044e\u0442\u0435\u0440, \u043d\u0438\u0436\u0435 \u0435\u0441\u0442\u044c \u0432\u0441\u044f \u0438\u043d\u0444\u043e\u0440\u043c\u0430\u0446\u0438\u044f \u043f\u043e\u00a0\u0443\u0441\u0442\u0430\u043d\u043e\u0432\u043a\u0435. \u0415\u0441\u043b\u0438 \u0432\u044b\u00a0\u0440\u0435\u0448\u0438\u043b\u0438 \u0432\u043e\u0441\u043f\u043e\u043b\u044c\u0437\u043e\u0432\u0430\u0442\u044c\u0441\u044f \u042f\u043d\u0434\u0435\u043a\u0441.\u041e\u0431\u043b\u0430\u043a\u043e\u043c\u00a0\u2014 \u0441\u043e\u0437\u0434\u0430\u0439\u0442\u0435\u00a0\u0412\u041c \u0438\u00a0\u043f\u0435\u0440\u0435\u0445\u043e\u0434\u0438\u0442\u0435 \u043a\u00a0\u0441\u043b\u0435\u0434\u0443\u044e\u0449\u0435\u043c\u0443 \u0440\u0430\u0437\u0434\u0435\u043b\u0443.<\/p>\n<p>  <\/p>\n<h3>Plink<\/h3>\n<p>  Plink\u00a0\u2014 \u043f\u0440\u043e\u0433\u0440\u0430\u043c\u043c\u043d\u044b\u0439 \u043f\u0430\u043a\u0435\u0442 \u0434\u043b\u044f \u043c\u0430\u043d\u0438\u043f\u0443\u043b\u044f\u0446\u0438\u0439 \u0441\u00a0\u0433\u0435\u043d\u0435\u0442\u0438\u0447\u0435\u0441\u043a\u0438\u043c\u0438 \u0434\u0430\u043d\u043d\u044b\u043c\u0438 \u0438\u00a0\u0448\u0438\u0440\u043e\u043a\u043e\u0433\u0435\u043d\u043e\u043c\u043d\u043e\u0433\u043e \u043f\u043e\u0438\u0441\u043a\u0430 \u0430\u0441\u0441\u043e\u0446\u0438\u0430\u0446\u0438\u0439 (GWAS). \u0415\u0433\u043e \u0440\u0430\u0437\u0440\u0430\u0431\u043e\u0442\u0430\u043b \u0433\u0435\u043d\u0435\u0442\u0438\u043a \u0428\u043e\u043d \u041f\u0435\u0440\u0441\u0435\u043b\u043b (Shaun Purcell). \u0421\u00a0\u043f\u043e\u043c\u043e\u0449\u044c\u044e Plink \u0441\u00a02008 \u0433\u043e\u0434\u0430 \u0431\u044b\u043b\u0438 \u0432\u044b\u043f\u043e\u043b\u043d\u0435\u043d\u044b \u0441\u043e\u0442\u043d\u0438 GWAS\u2019\u043e\u0432 \u043f\u043e\u00a0\u0432\u0441\u0435\u043c\u0443 \u043c\u0438\u0440\u0443, \u0440\u0435\u0437\u0443\u043b\u044c\u0442\u0430\u0442\u044b \u043b\u0443\u0447\u0448\u0438\u0445 \u0438\u0437\u00a0\u043a\u043e\u0442\u043e\u0440\u044b\u0445 \u0410\u0442\u043b\u0430\u0441 \u0438\u0441\u043f\u043e\u043b\u044c\u0437\u0443\u0435\u0442 \u043a\u0430\u043a \u0438\u0441\u0442\u043e\u0447\u043d\u0438\u043a \u0434\u0430\u043d\u043d\u044b\u0445 \u0434\u043b\u044f \u0430\u043b\u0433\u043e\u0440\u0438\u0442\u043c\u043e\u0432 \u0440\u0430\u0441\u0447\u0435\u0442\u0430 \u0440\u0438\u0441\u043a\u043e\u0432 \u0437\u0430\u0431\u043e\u043b\u0435\u0432\u0430\u043d\u0438\u0439.<\/p>\n<p>  Plink \u043f\u0440\u0435\u0434\u043b\u0430\u0433\u0430\u0435\u0442 \u043d\u0430\u0431\u043e\u0440 \u0438\u043d\u0441\u0442\u0440\u0443\u043c\u0435\u043d\u0442\u043e\u0432 \u0434\u043b\u044f \u0445\u0440\u0430\u043d\u0435\u043d\u0438\u044f \u0438\u00a0\u043a\u043e\u043d\u0432\u0435\u0440\u0442\u0430\u0446\u0438\u0438 \u0434\u0430\u043d\u043d\u044b\u0445 \u0433\u0435\u043d\u043e\u0442\u0438\u043f\u0438\u0440\u043e\u0432\u0430\u043d\u0438\u044f \u0438\u00a0\u043f\u043e\u0438\u0441\u043a\u0430 \u043f\u043e\u00a0\u043d\u0438\u043c. \u0422\u0430\u043a\u0436\u0435 Plink \u043f\u043e\u0437\u0432\u043e\u043b\u044f\u0435\u0442 \u043f\u0440\u043e\u0438\u0437\u0432\u043e\u0434\u0438\u0442\u044c \u0441\u0442\u0430\u0442\u0438\u0441\u0442\u0438\u0447\u0435\u0441\u043a\u0443\u044e \u043e\u0431\u0440\u0430\u0431\u043e\u0442\u043a\u0443, \u0430\u043d\u0430\u043b\u0438\u0437 \u043d\u0435\u0440\u0430\u0432\u043d\u043e\u0432\u0435\u0441\u043d\u043e\u0433\u043e \u0441\u0446\u0435\u043f\u043b\u0435\u043d\u0438\u044f (linkage disequilibrium, LD), \u0430\u043d\u0430\u043b\u0438\u0437 \u0438\u0434\u0435\u043d\u0442\u0438\u0447\u043d\u043e\u0441\u0442\u0438 \u043f\u043e\u00a0\u043f\u0440\u043e\u0438\u0441\u0445\u043e\u0436\u0434\u0435\u043d\u0438\u044e (identity by\u00a0descent, IBD) \u0438\u00a0\u043f\u043e\u00a0\u0441\u043e\u0441\u0442\u043e\u044f\u043d\u0438\u044e (identity by\u00a0state, IBS), \u043f\u043e\u043f\u0443\u043b\u044f\u0446\u0438\u043e\u043d\u043d\u0443\u044e \u0441\u0442\u0440\u0430\u0442\u0438\u0444\u0438\u043a\u0430\u0446\u0438\u044e \u0438\u00a0\u0442\u0435\u0441\u0442\u044b \u043d\u0430\u00a0\u044d\u043f\u0438\u0441\u0442\u0430\u0437\u00a0\u2014 \u0432\u0437\u0430\u0438\u043c\u043e\u0434\u0435\u0439\u0441\u0442\u0432\u0438\u0435 \u043d\u0435\u0441\u043a\u043e\u043b\u044c\u043a\u0438\u0445 \u0433\u0435\u043d\u0435\u0442\u0438\u0447\u0435\u0441\u043a\u0438\u0445 \u0432\u0430\u0440\u0438\u0430\u0446\u0438\u0439 \u043c\u0435\u0436\u0434\u0443 \u0441\u043e\u0431\u043e\u0439. <\/p>\n<p>  IBD \u0438\u00a0IBS \u0438\u0441\u043f\u043e\u043b\u044c\u0437\u0443\u044e\u0442\u0441\u044f \u0434\u043b\u044f \u0430\u043d\u0430\u043b\u0438\u0437\u0430 \u043f\u043e\u043f\u0443\u043b\u044f\u0446\u0438\u043e\u043d\u043d\u043e\u0433\u043e \u0441\u043e\u0441\u0442\u0430\u0432\u0430 \u0438\u00a0\u043e\u043f\u0440\u0435\u0434\u0435\u043b\u0435\u043d\u0438\u044f \u0440\u043e\u0434\u0441\u0442\u0432\u0430. <\/p>\n<p>  \u041f\u0440\u0438\u043c\u0435\u0440 \u044d\u043f\u0438\u0441\u0442\u0430\u0437\u0430\u00a0\u2014 \u0432\u0430\u0440\u0438\u0430\u0446\u0438\u0438 rs7412 \u0438\u00a0rs429358\u00a0\u0432 \u0433\u0435\u043d\u0435 APOE, \u043e\u043f\u0440\u0435\u0434\u0435\u043b\u0435\u043d\u043d\u043e\u0435 \u0441\u043e\u0447\u0435\u0442\u0430\u043d\u0438\u0435 \u0432\u0430\u0440\u0438\u0430\u043d\u0442\u043e\u0432 \u043a\u043e\u0442\u043e\u0440\u044b\u0445 \u0440\u0435\u0437\u043a\u043e \u043f\u043e\u0432\u044b\u0448\u0430\u0435\u0442 \u0440\u0438\u0441\u043a \u0440\u0430\u0437\u0432\u0438\u0442\u0438\u044f \u0431\u043e\u043b\u0435\u0437\u043d\u0438 \u0410\u043b\u044c\u0446\u0433\u0435\u0439\u043c\u0435\u0440\u0430, \u0442\u043e\u0433\u0434\u0430 \u043a\u0430\u043a \u043a\u0430\u0436\u0434\u044b\u0439 \u0432\u0430\u0440\u0438\u0430\u043d\u0442 \u043f\u043e\u00a0\u043e\u0442\u0434\u0435\u043b\u044c\u043d\u043e\u0441\u0442\u0438 \u0432\u043d\u043e\u0441\u0438\u0442 \u043b\u0438\u0448\u044c \u043d\u0435\u0437\u043d\u0430\u0447\u0438\u0442\u0435\u043b\u044c\u043d\u044b\u0439 \u0432\u043a\u043b\u0430\u0434 \u0432\u00a0\u0440\u0438\u0441\u043a.<\/p>\n<p>  \u0421\u043a\u0430\u0447\u0430\u0439\u0442\u0435 \u0441\u0442\u0430\u0431\u0438\u043b\u044c\u043d\u0443\u044e \u0432\u0435\u0440\u0441\u0438\u044e Plink \u0441\u00a0\u043e\u0444\u0438\u0446\u0438\u0430\u043b\u044c\u043d\u043e\u0433\u043e <a href=\"https:\/\/www.cog-genomics.org\/plink\/\">\u0441\u0430\u0439\u0442\u0430<\/a>.<\/p>\n<p>  <\/p>\n<h3>BCFtools<\/h3>\n<p>  BCFtools\u00a0\u2014 \u043d\u0430\u0431\u043e\u0440 \u0443\u0442\u0438\u043b\u0438\u0442 \u0434\u043b\u044f \u043c\u0430\u043d\u0438\u043f\u0443\u043b\u0438\u0440\u043e\u0432\u0430\u043d\u0438\u044f \u0433\u0435\u043d\u0435\u0442\u0438\u0447\u0435\u0441\u043a\u0438\u043c\u0438 \u0434\u0430\u043d\u043d\u044b\u043c\u0438 \u0432\u00a0\u0444\u043e\u0440\u043c\u0430\u0442\u0435 VCF \u0438\u00a0\u0435\u0433\u043e \u0431\u0438\u043d\u0430\u0440\u043d\u043e\u043c \u0430\u043d\u0430\u043b\u043e\u0433\u0435 BCF. \u0421\u043f\u0438\u0441\u043e\u043a \u0432\u043e\u0437\u043c\u043e\u0436\u043d\u044b\u0445 \u043f\u0440\u0438\u043c\u0435\u043d\u0435\u043d\u0438\u0439 \u043f\u0430\u043a\u0435\u0442\u0430 BCFtools \u0432\u043a\u043b\u044e\u0447\u0430\u0435\u0442 \u0430\u043d\u043d\u043e\u0442\u0430\u0446\u0438\u044e, \u0444\u0438\u043b\u044c\u0442\u0440\u0430\u0446\u0438\u044e, \u0441\u043b\u0438\u044f\u043d\u0438\u0435 \u0438\u00a0\u0440\u0430\u0437\u0434\u0435\u043b\u0435\u043d\u0438\u0435 VCF\/BCF \u0444\u0430\u0439\u043b\u043e\u0432, \u043d\u0430\u0445\u043e\u0436\u0434\u0435\u043d\u0438\u0435 \u0438\u0445\u00a0\u043f\u0435\u0440\u0435\u0441\u0435\u0447\u0435\u043d\u0438\u044f, \u0438\u043d\u0434\u0435\u043a\u0441\u0438\u0440\u043e\u0432\u0430\u043d\u0438\u0435, \u0432\u044b\u0431\u043e\u0440\u043e\u0447\u043d\u044b\u0439 \u043f\u043e\u0438\u0441\u043a, \u0441\u043e\u0440\u0442\u0438\u0440\u043e\u0432\u043a\u0443, \u043f\u043e\u0434\u0441\u0447\u0435\u0442 \u0441\u0442\u0430\u0442\u0438\u0441\u0442\u0438\u043a\u0438 \u0438\u00a0\u0442.\u043f.<\/p>\n<p>  \u0414\u043b\u044f \u0443\u0441\u0442\u0430\u043d\u043e\u0432\u043a\u0438 \u0432\u044b\u043f\u043e\u043b\u043d\u0438\u0442\u0435:  <\/p>\n<pre><code class=\"bash\">git clone git:\/\/github.com\/samtools\/htslib.git git clone git:\/\/github.com\/samtools\/bcftools.git cd bcftools # The following is optional: # autoheader &amp;&amp; autoconf &amp;&amp; .\/configure --enable-libgsl --enable-perl-filters make<\/code><\/pre>\n<p>  \u041f\u043e\u0434\u0440\u043e\u0431\u043d\u0435\u0435 \u043f\u0440\u043e\u0446\u0435\u0441\u0441 \u0443\u0441\u0442\u0430\u043d\u043e\u0432\u043a\u0438 \u043e\u043f\u0438\u0441\u0430\u043d <a href=\"https:\/\/samtools.github.io\/bcftools\/howtos\/install.html\">\u0437\u0434\u0435\u0441\u044c<\/a>.<\/p>\n<p>  <\/p>\n<h3>KING<\/h3>\n<p>  \u041f\u0430\u043a\u0435\u0442 KING (Kinship-based INference for Gwas) \u0438\u0441\u043f\u043e\u043b\u044c\u0437\u0443\u0435\u0442\u0441\u044f \u0432\u00a0\u043f\u043e\u043f\u0443\u043b\u044f\u0446\u0438\u043e\u043d\u043d\u044b\u0445 \u0438\u0441\u0441\u043b\u0435\u0434\u043e\u0432\u0430\u043d\u0438\u044f\u0445 \u043f\u0440\u0438 \u0440\u0430\u0431\u043e\u0442\u0435 \u0441\u00a0\u0434\u0430\u043d\u043d\u044b\u043c\u0438 \u043f\u043e\u043b\u043d\u043e\u0433\u0435\u043d\u043e\u043c\u043d\u043e\u0433\u043e \u043f\u043e\u0438\u0441\u043a\u0430 \u0430\u0441\u0441\u043e\u0446\u0438\u0430\u0446\u0438\u0439 \u0434\u043b\u044f \u043e\u043f\u0440\u0435\u0434\u0435\u043b\u0435\u043d\u0438\u044f \u0440\u043e\u0434\u0441\u0442\u0432\u0435\u043d\u043d\u044b\u0445 \u0441\u0432\u044f\u0437\u0435\u0439 \u0432\u00a0\u0438\u0441\u0441\u043b\u0435\u0434\u0443\u0435\u043c\u044b\u0445 \u0434\u0430\u043d\u043d\u044b\u0445. \u0412\u00a0\u044d\u0442\u043e\u0439 \u0437\u0430\u0434\u0430\u0447\u0435 KING \u043f\u043e\u043c\u043e\u0436\u0435\u0442 \u043e\u043f\u0440\u0435\u0434\u0435\u043b\u0438\u0442\u044c \u0441\u0442\u0435\u043f\u0435\u043d\u044c \u0440\u043e\u0434\u0441\u0442\u0432\u0430 \u043d\u0435\u0441\u043a\u043e\u043b\u044c\u043a\u0438\u0445 \u043e\u0431\u0440\u0430\u0437\u0446\u043e\u0432 \u0438\u0437\u00a0\u043f\u0440\u043e\u0435\u043a\u0442\u0430 \u00ab1000\u00a0\u0413\u0435\u043d\u043e\u043c\u043e\u0432\u00bb.<br \/>  \u0421\u043a\u0430\u0447\u0430\u0442\u044c \u043c\u043e\u0436\u043d\u043e <a href=\"http:\/\/people.virginia.edu\/~wc9c\/KING\/Download.htm\">\u0437\u0434\u0435\u0441\u044c<\/a>. \u0414\u043b\u044f \u0440\u0435\u0448\u0435\u043d\u0438\u044f \u0437\u0430\u0434\u0430\u0447 \u043f\u0440\u0438\u0433\u043e\u0434\u0438\u0442\u0441\u044f \u0440\u0443\u043a\u043e\u0432\u043e\u0434\u0441\u0442\u0432\u043e \u043a KING \u043f\u043e <a href=\"http:\/\/people.virginia.edu\/~wc9c\/KING\/manual.html\">\u0441\u0441\u044b\u043b\u043a\u0435<\/a>.<\/p>\n<blockquote><p>\u041f\u043e\u0447\u0442\u0438 \u0432\u0441\u0435 \u043e\u0448\u0438\u0431\u043a\u0438, \u043a\u043e\u0442\u043e\u0440\u044b\u0435 \u043c\u043e\u0433\u0443\u0442 \u0432\u043e\u0437\u043d\u0438\u043a\u043d\u0443\u0442\u044c \u0432 \u043f\u0440\u043e\u0446\u0435\u0441\u0441\u0435 \u0440\u0430\u0431\u043e\u0442\u044b \u0441 \u0438\u043d\u0441\u0442\u0440\u0443\u043c\u0435\u043d\u0442\u0430\u043c\u0438, \u043e\u043f\u0438\u0441\u0430\u043d\u044b \u043d\u0430 <a href=\"https:\/\/stackoverflow.com\/\">Stackoverflow<\/a> \u0438\u043b\u0438 \u0435\u0433\u043e \u0431\u0438\u043e\u0438\u043d\u0444\u043e\u0440\u043c\u0430\u0442\u0438\u0447\u0435\u0441\u043a\u043e\u043c \u0430\u043d\u0430\u043b\u043e\u0433\u0435 \u2014 <a href=\"https:\/\/www.biostars.org\/\">Biostars<\/a>. <\/p><\/blockquote>\n<p>  <\/p>\n<h2>\u0418\u0441\u043f\u043e\u043b\u044c\u0437\u0443\u0435\u043c\u044b\u0435 \u0434\u0430\u043d\u043d\u044b\u0435<\/h2>\n<p>  \u0414\u043b\u044f \u0440\u0443\u043a\u043e\u0432\u043e\u0434\u0441\u0442\u0432\u0430 \u043c\u044b\u00a0\u0438\u0441\u043f\u043e\u043b\u044c\u0437\u0443\u0435\u043c \u043e\u0442\u043a\u0440\u044b\u0442\u044b\u0435 \u0434\u0430\u043d\u043d\u044b\u0435 <a href=\"https:\/\/www.internationalgenome.org\/\">\u043f\u0440\u043e\u0435\u043a\u0442\u0430<\/a> \u00ab1000\u00a0\u0413\u0435\u043d\u043e\u043c\u043e\u0432\u00bb. \u0414\u043b\u044f \u0430\u043d\u0430\u043b\u0438\u0437\u0430 \u043c\u044b\u00a0\u0432\u044b\u0431\u0440\u0430\u043b\u0438 10\u00a0\u043e\u0431\u0440\u0430\u0437\u0446\u043e\u0432 \u0441\u00a0\u0438\u043d\u0444\u043e\u0440\u043c\u0430\u0446\u0438\u0435\u0439 \u043e\u00a0\u0433\u0435\u043d\u043e\u0442\u0438\u043f\u0430\u0445 \u043e\u043a\u043e\u043b\u043e 85\u00a0\u043c\u0438\u043b\u043b\u0438\u043e\u043d\u043e\u0432 \u0432\u0430\u0440\u0438\u0430\u0446\u0438\u0439, \u043f\u043e\u043b\u0443\u0447\u0435\u043d\u043d\u044b\u0445 \u043f\u0443\u0442\u0435\u043c \u0430\u043d\u0430\u043b\u0438\u0437\u0430 \u0434\u0430\u043d\u043d\u044b\u0445 NGS \u0441\u00a0\u0432\u044b\u0440\u0430\u0432\u043d\u0438\u0432\u0430\u043d\u0438\u0435\u043c \u043d\u0430\u00a0\u0432\u0435\u0440\u0441\u0438\u044e \u0440\u0435\u0444\u0435\u0440\u0435\u043d\u0441\u043d\u043e\u0433\u043e \u0433\u0435\u043d\u043e\u043c\u0430 GRCh37. \u0420\u043e\u0434\u0441\u0442\u0432\u0435\u043d\u043d\u044b\u0435 \u0441\u0432\u044f\u0437\u0438 \u0438\u00a0\u043f\u043e\u043f\u0443\u043b\u044f\u0446\u0438\u0438 \u043e\u0431\u0440\u0430\u0437\u0446\u043e\u0432 \u0443\u043a\u0430\u0437\u0430\u043d\u044b \u043d\u0430\u00a0\u0420\u0438\u0441\u0443\u043d\u043a\u0435\u00a01.<\/p>\n<p>  <img decoding=\"async\" src=\"https:\/\/habrastorage.org\/webt\/yr\/rt\/bg\/yrrtbgj6tct9huih0rg5gww63xc.png\"><br \/>  <b>\u0420\u0438\u0441\u0443\u043d\u043e\u043a\u00a01<\/b>. \u0420\u043e\u0434\u043e\u0441\u043b\u043e\u0432\u043d\u0430\u044f \u0438\u0441\u043f\u043e\u043b\u044c\u0437\u0443\u0435\u043c\u044b\u0445 \u0432\u00a0VCF \u043e\u0431\u0440\u0430\u0437\u0446\u043e\u0432. \u041a\u0432\u0430\u0434\u0440\u0430\u0442 \u0441\u043e\u043e\u0442\u0432\u0435\u0442\u0441\u0442\u0432\u0443\u0435\u0442 \u043c\u0443\u0436\u0441\u043a\u043e\u043c\u0443 \u043f\u043e\u043b\u0443, \u043a\u0440\u0443\u0433\u00a0\u2014 \u0436\u0435\u043d\u0441\u043a\u043e\u043c\u0443. \u041f\u0443\u043d\u043a\u0442\u0438\u0440\u043d\u0430\u044f \u043b\u0438\u043d\u0438\u044f \u043e\u0437\u043d\u0430\u0447\u0430\u0435\u0442 \u043d\u0435\u0443\u0441\u0442\u0430\u043d\u043e\u0432\u043b\u0435\u043d\u043d\u043e\u0435 \u0440\u043e\u0434\u0441\u0442\u0432\u043e \u0432\u0442\u043e\u0440\u043e\u0433\u043e \u043f\u043e\u0440\u044f\u0434\u043a\u0430.<\/p>\n<p>  <\/p>\n<h2>\u0412\u0437\u044f\u0442\u044c \u043d\u0430 \u0437\u0430\u043c\u0435\u0442\u043a\u0443<\/h2>\n<p>  \u0424\u043e\u0440\u043c\u0430\u0442 VCF \u043f\u043e\u0437\u0432\u043e\u043b\u044f\u0435\u0442 \u0445\u0440\u0430\u043d\u0438\u0442\u044c \u0438\u043d\u0444\u043e\u0440\u043c\u0430\u0446\u0438\u044e \u043e\u00a0\u043f\u043e\u043b\u0435 \u0447\u0435\u043b\u043e\u0432\u0435\u043a\u0430 \u0432\u00a0\u0432\u0438\u0434\u0435 \u043e\u0434\u043d\u043e\u0433\u043e \u0447\u0438\u0441\u043b\u0430, \u0435\u0441\u043b\u0438 \u044d\u0442\u0430 \u0438\u043d\u0444\u043e\u0440\u043c\u0430\u0446\u0438\u044f \u0431\u044b\u043b\u0430 \u0438\u0437\u0432\u0435\u0441\u0442\u043d\u0430 \u043f\u0440\u0438 \u0433\u0435\u043d\u0435\u0440\u0430\u0446\u0438\u0438 VCF. \u0412\u044b\u0433\u043b\u044f\u0434\u0438\u0442 \u044d\u0442\u043e \u0442\u0430\u043a: \u043f\u043e\u043b\u0435\u00a0GT (genotype, \u0433\u0435\u043d\u043e\u0442\u0438\u043f) \u0434\u043b\u044f \u0437\u0430\u043f\u0438\u0441\u0435\u0439 \u0441\u00a0\u0425 \u0445\u0440\u043e\u043c\u043e\u0441\u043e\u043c\u044b \u0441\u043e\u0434\u0435\u0440\u0436\u0438\u0442 \u043e\u0434\u043d\u043e \u0447\u0438\u0441\u043b\u0435\u043d\u043d\u043e\u0435 \u0437\u043d\u0430\u0447\u0435\u043d\u0438\u0435, \u043a\u043e\u0442\u043e\u0440\u043e\u0435 \u0441\u043e\u043e\u0442\u0432\u0435\u0442\u0441\u0442\u0432\u0443\u0435\u0442 \u043e\u0434\u043d\u043e\u0439 \u0430\u043b\u043b\u0435\u043b\u0438, \u0434\u043b\u044f \u043c\u0443\u0436\u0447\u0438\u043d \u0438\u00a0\u0434\u0432\u0430\u00a0\u2014 \u0434\u043b\u044f \u0436\u0435\u043d\u0449\u0438\u043d. \u0415\u0441\u043b\u0438 \u0438\u043d\u0444\u043e\u0440\u043c\u0430\u0446\u0438\u044f \u043e\u00a0\u0431\u0438\u043e\u043b\u043e\u0433\u0438\u0447\u0435\u0441\u043a\u043e\u043c \u043f\u043e\u043b\u0435 \u0441\u0435\u043a\u0432\u0435\u043d\u0438\u0440\u0443\u0435\u043c\u043e\u0433\u043e \u043e\u0431\u0440\u0430\u0437\u0446\u0430 \u043e\u0442\u0441\u0443\u0442\u0441\u0442\u0432\u0443\u0435\u0442, \u0442\u043e\u00a0\u043f\u043e\u043b\u0435\u00a0GT \u0431\u0443\u0434\u0435\u0442 \u043f\u043e\u00a0\u0443\u043c\u043e\u043b\u0447\u0430\u043d\u0438\u044e \u0441\u043e\u0434\u0435\u0440\u0436\u0430\u0442\u044c \u0434\u0432\u0430 \u0447\u0438\u0441\u043b\u043e\u0432\u044b\u0445 \u0437\u043d\u0430\u0447\u0435\u043d\u0438\u044f (\u0432\u044b\u0434\u0435\u043b\u0435\u043d\u044b \u043a\u0440\u0430\u0441\u043d\u044b\u043c \u043d\u0430\u00a0\u0440\u0438\u0441\u0443\u043d\u043a\u0435\u00a02).<\/p>\n<p>  \u0412\u00a0\u0438\u0441\u043f\u043e\u043b\u044c\u0437\u0443\u0435\u043c\u044b\u0445 \u0432\u00a0\u0434\u0430\u043d\u043d\u043e\u043c \u0440\u0443\u043a\u043e\u0432\u043e\u0434\u0441\u0442\u0432\u0435 VCF \u0444\u0430\u0439\u043b\u0430\u0445 Y-\u0445\u0440\u043e\u043c\u043e\u0441\u043e\u043c\u0430 \u0438\u0441\u043a\u043b\u044e\u0447\u0435\u043d\u0430, \u043d\u043e\u00a0\u0438\u00a0\u043d\u0430\u043b\u0438\u0447\u0438\u0435 \u0445\u0440\u043e\u043c\u043e\u0441\u043e\u043c\u044b\u00a0Y \u0432\u00a0VCF \u0444\u0430\u0439\u043b\u0435 \u0434\u0430\u043b\u0435\u043a\u043e \u043d\u0435\u00a0\u0432\u0441\u0435\u0433\u0434\u0430 \u0433\u043e\u0432\u043e\u0440\u0438\u0442 \u043e\u00a0\u0442\u043e\u043c, \u0447\u0442\u043e \u043e\u043d\u0430 \u0434\u0435\u0439\u0441\u0442\u0432\u0438\u0442\u0435\u043b\u044c\u043d\u043e \u0435\u0441\u0442\u044c \u0443\u00a0\u0441\u0435\u043a\u0432\u0435\u043d\u0438\u0440\u0443\u0435\u043c\u043e\u0433\u043e \u043e\u0431\u0440\u0430\u0437\u0446\u0430. \u042d\u0442\u043e \u043f\u0440\u043e\u0438\u0441\u0445\u043e\u0434\u0438\u0442 \u0438\u0437-\u0437\u0430 \u043f\u0441\u0435\u0432\u0434\u043e\u0430\u0443\u0442\u043e\u0441\u043e\u043c\u043d\u044b\u0445 \u0440\u0435\u0433\u0438\u043e\u043d\u043e\u0432 (PARs), \u043a\u043e\u0442\u043e\u0440\u044b\u0435 \u0438\u0434\u0435\u043d\u0442\u0438\u0447\u043d\u044b \u0434\u043b\u044f\u00a0\u0425 \u0438\u00a0Y \u0445\u0440\u043e\u043c\u043e\u0441\u043e\u043c \u0438\u00a0\u0440\u0430\u0441\u043f\u043e\u043b\u043e\u0436\u0435\u043d\u044b \u043d\u0430\u00a0\u0438\u0445\u00a0\u043a\u043e\u043d\u0446\u0430\u0445.<\/p>\n<p>  \u0420\u0430\u0437\u043d\u044b\u0435 \u0445\u0440\u043e\u043c\u043e\u0441\u043e\u043c\u044b \u0432\u00a0\u043d\u043e\u0440\u043c\u0435 \u043d\u0435\u00a0\u0438\u043c\u0435\u044e\u0442 \u0434\u043b\u0438\u043d\u043d\u044b\u0445 \u0438\u0434\u0435\u043d\u0442\u0438\u0447\u043d\u044b\u0445 (\u0433\u043e\u043c\u043e\u043b\u043e\u0433\u0438\u0447\u043d\u044b\u0445) \u0443\u0447\u0430\u0441\u0442\u043a\u043e\u0432, \u043e\u0434\u043d\u0430\u043a\u043e \u0445\u0440\u043e\u043c\u043e\u0441\u043e\u043c\u044b\u00a0\u0425 \u0438\u00a0Y \u043e\u0431\u043b\u0430\u0434\u0430\u044e\u0442 \u0442\u0430\u043a\u0438\u043c\u0438 \u0443\u0447\u0430\u0441\u0442\u043a\u0430\u043c\u0438 \u0434\u043b\u0438\u043d\u043e\u0439 \u043f\u043e\u00a0\u043d\u0435\u0441\u043a\u043e\u043b\u044c\u043a\u043e \u043c\u0438\u043b\u043b\u0438\u043e\u043d\u043e\u0432 \u043f\u0430\u0440 \u043e\u0441\u043d\u043e\u0432\u0430\u043d\u0438\u0439 \u0432\u00a0\u0441\u0430\u043c\u043e\u043c \u043d\u0430\u0447\u0430\u043b\u0435 (PAR1) \u0438\u00a0\u043a\u043e\u043d\u0446\u0435 (PAR2). \u041f\u043e\u044d\u0442\u043e\u043c\u0443 \u043f\u0440\u0438 \u0430\u043d\u0430\u043b\u0438\u0437\u0435 \u0434\u0430\u043d\u043d\u044b\u0445 NGS \u0443\u00a0\u043c\u0443\u0436\u0447\u0438\u043d \u0432\u00a0PAR \u0440\u0435\u0433\u0438\u043e\u043d\u0430\u0445 \u043e\u0431\u043d\u0430\u0440\u0443\u0436\u0438\u0432\u0430\u044e\u0442\u0441\u044f \u0434\u0432\u0430 \u0430\u043b\u043b\u0435\u043b\u044f (\u043f\u043e\u00a0\u043e\u0434\u043d\u043e\u043c\u0443 \u0441\u00a0\u043a\u0430\u0436\u0434\u043e\u0439 \u043f\u043e\u043b\u043e\u0432\u043e\u0439 \u0445\u0440\u043e\u043c\u043e\u0441\u043e\u043c\u044b), \u0430\u00a0\u0443\u00a0\u0436\u0435\u043d\u0449\u0438\u043d \u043c\u043e\u0433\u0443\u0442 \u043f\u043e\u044f\u0432\u0438\u0442\u044c\u0441\u044f \u0433\u0435\u043d\u043e\u0442\u0438\u043f\u044b \u0432\u00a0PAR \u0440\u0435\u0433\u0438\u043e\u043d\u0430\u0445\u00a0Y \u0445\u0440\u043e\u043c\u043e\u0441\u043e\u043c\u044b, \u0445\u043e\u0442\u044f \u043d\u0430\u00a0\u0441\u0430\u043c\u043e\u043c \u0434\u0435\u043b\u0435 \u044d\u0442\u043e \u0433\u0435\u043d\u043e\u0442\u0438\u043f\u044b \u0441\u00a0\u0438\u0445\u00a0X-\u0445\u0440\u043e\u043c\u043e\u0441\u043e\u043c\u044b.<\/p>\n<p>  <img decoding=\"async\" src=\"https:\/\/habrastorage.org\/webt\/xc\/nx\/ga\/xcnxgajnkuainexvlp2a5ppsqrg.png\"><br \/>  <b>\u0420\u0438\u0441\u0443\u043d\u043e\u043a\u00a02<\/b>. VCF \u0444\u0430\u0439\u043b \u0441\u00a0\u0433\u0435\u043d\u043e\u0442\u0438\u043f\u0430\u043c\u0438 \u0441\u00a0\u0425 \u0445\u0440\u043e\u043c\u043e\u0441\u043e\u043c\u044b \u043c\u0443\u0436\u0447\u0438\u043d\u044b \u0438\u0437\u00a0\u0440\u0435\u0433\u0438\u043e\u043d\u0430 PAR1 (\u043f\u0435\u0440\u0432\u044b\u0435 \u0434\u0432\u0435 \u0437\u0430\u043f\u0438\u0441\u0438) \u0438\u00a0\u043d\u0435\u043f\u0441\u0435\u0432\u0434\u043e\u0430\u0443\u0442\u043e\u0441\u043e\u043c\u043d\u043e\u0433\u043e \u0440\u0435\u0433\u0438\u043e\u043d\u0430 (\u043f\u043e\u0441\u043b\u0435\u0434\u043d\u0438\u0435 \u0434\u0432\u0435 \u0437\u0430\u043f\u0438\u0441\u0438).<\/p>\n<blockquote><p>\u041e\u0431\u0440\u0430\u0437\u043e\u0432\u0430\u0442\u0435\u043b\u044c\u043d\u044b\u0439 \u0431\u043b\u043e\u043a<br \/>  \u0413\u0435\u043d\u0435\u0442\u0438\u0447\u0435\u0441\u043a\u0438\u0439 \u043f\u043e\u043b\u00a0\u2014 \u044d\u0442\u043e \u043d\u0430\u0431\u043e\u0440 \u043f\u043e\u043b\u043e\u0432\u044b\u0445 \u0445\u0440\u043e\u043c\u043e\u0441\u043e\u043c, \u0441\u043e\u043e\u0442\u0432\u0435\u0442\u0441\u0442\u0432\u0443\u044e\u0449\u0438\u0445 \u043f\u0440\u043e\u044f\u0432\u043b\u0435\u043d\u0438\u044e \u043f\u0435\u0440\u0432\u0438\u0447\u043d\u044b\u0445 \u0438\u00a0\u0432\u0442\u043e\u0440\u0438\u0447\u043d\u044b\u0445 \u043f\u043e\u043b\u043e\u0432\u044b\u0445 \u043f\u0440\u0438\u0437\u043d\u0430\u043a\u043e\u0432 \u043f\u043e\u00a0\u043c\u0443\u0436\u0441\u043a\u043e\u043c\u0443 \u0438\u043b\u0438 \u0436\u0435\u043d\u0441\u043a\u043e\u043c\u0443 \u0442\u0438\u043f\u0443. \u0412\u00a0\u043d\u043e\u0440\u043c\u0435 \u043c\u0443\u0436\u0447\u0438\u043d\u044b \u0438\u043c\u0435\u044e\u0442 \u043e\u0434\u043d\u0443 \u0445\u0440\u043e\u043c\u043e\u0441\u043e\u043c\u0443\u00a0\u0425 \u0438\u00a0\u043e\u0434\u043d\u0443 \u0445\u0440\u043e\u043c\u043e\u0441\u043e\u043c\u0443\u00a0Y, \u0432\u00a0\u0442\u043e\u00a0\u0432\u0440\u0435\u043c\u044f \u043a\u0430\u043a \u0436\u0435\u043d\u0449\u0438\u043d\u044b \u0438\u043c\u0435\u044e\u0442 \u0434\u0432\u0435 \u0445\u0440\u043e\u043c\u043e\u0441\u043e\u043c\u044b X.\u00a0\u041f\u0440\u0438 \u0440\u0430\u0437\u043b\u0438\u0447\u043d\u044b\u0445 \u043d\u0430\u0440\u0443\u0448\u0435\u043d\u0438\u044f\u0445 \u043e\u0431\u0440\u0430\u0437\u043e\u0432\u0430\u043d\u0438\u044f \u043f\u043e\u043b\u043e\u0432\u044b\u0445 \u043a\u043b\u0435\u0442\u043e\u043a, \u044f\u0439\u0446\u0435\u043a\u043b\u0435\u0442\u043e\u043a \u0438\u00a0\u0441\u043f\u0435\u0440\u043c\u0430\u0442\u043e\u0437\u043e\u0438\u0434\u043e\u0432, \u0443\u00a0\u0440\u043e\u0434\u0438\u0442\u0435\u043b\u0435\u0439 \u043c\u043e\u0436\u0435\u0442 \u0440\u043e\u0434\u0438\u0442\u044c\u0441\u044f \u0440\u0435\u0431\u0435\u043d\u043e\u043a \u0441\u00a0\u043e\u0442\u043b\u0438\u0447\u043d\u044b\u043c \u043d\u0430\u0431\u043e\u0440\u043e\u043c \u043f\u043e\u043b\u043e\u0432\u044b\u0445 \u0445\u0440\u043e\u043c\u043e\u0441\u043e\u043c, \u0447\u0442\u043e \u0447\u0430\u0441\u0442\u043e \u043f\u0440\u0438\u0432\u043e\u0434\u0438\u0442 \u043a\u00a0\u043d\u0430\u0440\u0443\u0448\u0435\u043d\u0438\u044f\u043c \u0440\u0430\u0437\u0432\u0438\u0442\u0438\u044f \u043f\u0435\u0440\u0432\u0438\u0447\u043d\u044b\u0445 \u0438\u00a0\u0432\u0442\u043e\u0440\u0438\u0447\u043d\u044b\u0445 \u043f\u043e\u043b\u043e\u0432\u044b\u0445 \u043f\u0440\u0438\u0437\u043d\u0430\u043a\u043e\u0432. <\/p>\n<p>  \u0414\u0432\u0435 \u0441\u0430\u043c\u044b\u0445 \u0447\u0430\u0441\u0442\u044b\u0445 \u0445\u0440\u043e\u043c\u043e\u0441\u043e\u043c\u043d\u044b\u0445 \u043f\u043e\u043b\u043e\u0432\u044b\u0445 \u0430\u043d\u043e\u043c\u0430\u043b\u0438\u0438\u00a0\u2014 \u044d\u0442\u043e <a href=\"https:\/\/ru.wikipedia.org\/wiki\/%D0%A1%D0%B8%D0%BD%D0%B4%D1%80%D0%BE%D0%BC_%D0%A8%D0%B5%D1%80%D0%B5%D1%88%D0%B5%D0%B2%D1%81%D0%BA%D0%BE%D0%B3%D0%BE_%E2%80%94_%D0%A2%D1%91%D1%80%D0%BD%D0%B5%D1%80%D0%B0\">\u0441\u0438\u043d\u0434\u0440\u043e\u043c \u0422\u0451\u0440\u043d\u0435\u0440\u0430<\/a> (\u043d\u0430\u0431\u043e\u0440 \u0445\u0440\u043e\u043c\u043e\u0441\u043e\u043c\u00a0X0, \u0442\u043e\u00a0\u0435\u0441\u0442\u044c \u0432\u0441\u0435\u0433\u043e \u043e\u0434\u043d\u0430 X-\u0445\u0440\u043e\u043c\u043e\u0441\u043e\u043c\u0430) \u0438\u00a0<a href=\"https:\/\/ru.wikipedia.org\/wiki\/%D0%A1%D0%B8%D0%BD%D0%B4%D1%80%D0%BE%D0%BC_%D0%9A%D0%BB%D0%B0%D0%B9%D0%BD%D1%84%D0%B5%D0%BB%D1%8C%D1%82%D0%B5%D1%80%D0%B0\">\u0441\u0438\u043d\u0434\u0440\u043e\u043c \u041a\u043b\u0430\u0439\u043d\u0444\u0435\u043b\u044c\u0442\u0435\u0440\u0430<\/a> (\u043d\u0430\u0431\u043e\u0440 \u0445\u0440\u043e\u043c\u043e\u0441\u043e\u043c XXY).<\/p>\n<p>  \u0410\u043b\u043b\u0435\u043b\u044c\u00a0\u2014 \u043e\u0434\u0438\u043d \u0438\u043b\u0438 \u0431\u043e\u043b\u0435\u0435 \u043d\u0443\u043a\u043b\u0435\u043e\u0442\u0438\u0434, \u043a\u043e\u0442\u043e\u0440\u044b\u0439 \u043d\u0430\u0445\u043e\u0434\u0438\u0442\u0441\u044f \u0432\u00a0\u043a\u0430\u043a\u043e\u0439-\u043b\u0438\u0431\u043e \u043f\u043e\u0437\u0438\u0446\u0438\u0438 \u0433\u0435\u043d\u043e\u043c\u0430 \u0438\u00a0\u0438\u043c\u0435\u0435\u0442 \u0430\u043b\u044c\u0442\u0435\u0440\u043d\u0430\u0442\u0438\u0432\u043d\u044b\u0439 \u0432\u0430\u0440\u0438\u0430\u043d\u0442. \u041f\u043e\u043d\u044f\u0442\u0438\u0435 \u0438\u0441\u043f\u043e\u043b\u044c\u0437\u0443\u044e\u0442 \u043f\u0440\u0438 \u043e\u043f\u0438\u0441\u0430\u043d\u0438\u0438 \u0433\u0435\u043d\u043e\u0442\u0438\u043f\u043e\u0432. \u0420\u0430\u0437\u043b\u0438\u0447\u0430\u044e\u0442 \u0440\u0435\u0444\u0435\u0440\u0435\u043d\u0441\u043d\u044b\u0435 \u0430\u043b\u043b\u0435\u043b\u0438 \u0438\u00a0\u0430\u043b\u044c\u0442\u0435\u0440\u043d\u0430\u0442\u0438\u0432\u043d\u044b\u0435. \u0412\u0441\u0435 \u043e\u043d\u0438 \u0445\u0440\u0430\u043d\u044f\u0442\u0441\u044f \u0432\u00a0VCF \u0444\u0430\u0439\u043b\u0435 \u0432\u00a0\u043f\u043e\u043b\u044f\u0445 REF \u0438\u00a0ALT, \u0441\u043e\u043e\u0442\u0432\u0435\u0442\u0441\u0442\u0432\u0435\u043d\u043d\u043e.<\/p><\/blockquote>\n<p>  <\/p>\n<h2>\u041e\u043f\u0440\u0435\u0434\u0435\u043b\u044f\u0435\u043c \u043f\u043e\u043b<\/h2>\n<p>  <\/p>\n<div class=\"spoiler\"><b class=\"spoiler_title\">\u0414\u043b\u044f \u043f\u043e\u043b\u044c\u0437\u043e\u0432\u0430\u0442\u0435\u043b\u0435\u0439 \u042f\u043d\u0434\u0435\u043a\u0441.\u041e\u0431\u043b\u0430\u043a\u0430<\/b><\/p>\n<div class=\"spoiler_text\">\u0412\u0441\u0435 \u0434\u0430\u043d\u043d\u044b\u0435 \u0434\u043b\u044f \u0432\u044b\u043f\u043e\u043b\u043d\u0435\u043d\u0438\u044f \u0440\u0443\u043a\u043e\u0432\u043e\u0434\u0441\u0442\u0432\u0430 \u0438\u00a0\u0441\u0430\u043c\u043e\u0441\u0442\u043e\u044f\u0442\u0435\u043b\u044c\u043d\u044b\u0445 \u0437\u0430\u0434\u0430\u043d\u0438\u0439 \u0445\u0440\u0430\u043d\u044f\u0442\u0441\u044f \u043d\u0430\u00a0\u042f\u043d\u0434\u0435\u043a\u0441.\u041e\u0431\u043b\u0430\u043a\u0435 \u0441\u00a0\u0438\u0441\u043f\u043e\u043b\u044c\u0437\u043e\u0432\u0430\u043d\u0438\u0435\u043c \u0441\u0442\u0440\u0443\u043a\u0442\u0443\u0440\u044b, \u0438\u0437\u043e\u0431\u0440\u0430\u0436\u0435\u043d\u043d\u043e\u0439 \u043d\u0438\u0436\u0435. \u041f\u0430\u043f\u043a\u0430 <code>Tutorial<\/code> \u0441\u043e\u0434\u0435\u0440\u0436\u0438\u0442 VCF \u0444\u0430\u0439\u043b, \u043d\u0435\u043e\u0431\u0445\u043e\u0434\u0438\u043c\u044b\u0439 \u0434\u043b\u044f \u0432\u044b\u043f\u043e\u043b\u043d\u0435\u043d\u0438\u044f \u0440\u0443\u043a\u043e\u0432\u043e\u0434\u0441\u0442\u0432\u0430, \u043f\u0430\u043f\u043a\u0430 <code>Test<\/code>\u00a0\u2014 \u0434\u043b\u044f \u0432\u044b\u043f\u043e\u043b\u043d\u0435\u043d\u0438\u044f \u0441\u0430\u043c\u043e\u0441\u0442\u043e\u044f\u0442\u0435\u043b\u044c\u043d\u044b\u0445 \u0437\u0430\u0434\u0430\u043d\u0438\u0439. \u0412\u00a0\u043f\u0430\u043f\u043a\u0435 <code>Technical<\/code> \u0441\u043e\u0434\u0435\u0440\u0436\u0438\u0442\u0441\u044f \u0434\u0432\u0430 \u0444\u0430\u0439\u043b\u0430 \u0441\u043e\u00a0\u0441\u043f\u0438\u0441\u043a\u043e\u043c \u0438\u0434\u0435\u043d\u0442\u0438\u0444\u0438\u043a\u0430\u0442\u043e\u0440\u043e\u0432 \u0433\u0435\u043d\u0435\u0442\u0438\u0447\u0435\u0441\u043a\u0438\u0445 \u0432\u0430\u0440\u0438\u0430\u0446\u0438\u0439: <code>rsids_for_subsetting.txt<\/code> \u0438\u0441\u043f\u043e\u043b\u044c\u0437\u0443\u0435\u0442\u0441\u044f \u0432\u00a0\u0440\u0443\u043a\u043e\u0432\u043e\u0434\u0441\u0442\u0432\u0435 \u0438\u00a0\u0437\u0430\u0434\u0430\u043d\u0438\u044f\u0445 \u0434\u043b\u044f \u0441\u0430\u043c\u043e\u0441\u0442\u043e\u044f\u0442\u0435\u043b\u044c\u043d\u043e\u0433\u043e \u0432\u044b\u043f\u043e\u043b\u043d\u0435\u043d\u0438\u044f, <code>external_interpretation_rsids.txt<\/code> \u043c\u043e\u0436\u0435\u0442 \u043f\u043e\u043d\u0430\u0434\u043e\u0431\u0438\u0442\u044c\u0441\u044f \u0432\u00a0\u0431\u0443\u0434\u0443\u0449\u0435\u043c \u043f\u0440\u0438 \u043f\u0440\u0438\u043e\u0431\u0440\u0435\u0442\u0435\u043d\u0438\u0438 \u043f\u043e\u043b\u043d\u043e\u0433\u0435\u043d\u043e\u043c\u043d\u043e\u0433\u043e \u0441\u0435\u043a\u0432\u0435\u043d\u0438\u0440\u043e\u0432\u0430\u043d\u0438\u044f \u0432\u00a0\u0410\u0442\u043b\u0430\u0441 \u0434\u043b\u044f \u0437\u0430\u0433\u0440\u0443\u0437\u043a\u0438 \u0434\u0430\u043d\u043d\u044b\u0445 \u0433\u0435\u043d\u043e\u0442\u0438\u043f\u0438\u0440\u043e\u0432\u0430\u043d\u0438\u044f \u0432\u00a0\u0441\u0442\u043e\u0440\u043e\u043d\u043d\u0438\u0435 \u0441\u0435\u0440\u0432\u0438\u0441\u044b. \u041f\u0430\u043f\u043a\u0430 <code>Tools<\/code> \u0441\u043e\u0434\u0435\u0440\u0436\u0438\u0442 \u043f\u043e\u043c\u0438\u043c\u043e \u043f\u0440\u043e\u0447\u0435\u0433\u043e \u0434\u0432\u0430 \u0441\u043a\u0440\u0438\u043f\u0442\u0430, \u0438\u0441\u043f\u043e\u043b\u044c\u0437\u0443\u0435\u043c\u044b\u0435 \u0432\u00a0\u0437\u0430\u0434\u0430\u043d\u0438\u044f\u0445 2\u00a0\u0438\u00a03.<\/p>\n<pre><code class=\"bash\">home \u2514\u2500\u2500 ubuntu     \u251c\u2500\u2500 Data     \u2502   \u251c\u2500\u2500 Test     \u2502   \u2502   \u251c\u2500\u2500 CEI.1kg.2019.test.vcf.gz     \u2502   \u2502   \u2514\u2500\u2500 CEI.1kg.2019.test.vcf.gz.tbi     \u2502   \u2514\u2500\u2500 Tutorial     \u2502       \u251c\u2500\u2500 CEI.1kg.2019.demo.vcf.gz     \u2502       \u2514\u2500\u2500 CEI.1kg.2019.demo.vcf.gz.tbi     \u251c\u2500\u2500 Technical     \u2502   \u251c\u2500\u2500 external_interpretation_rsids.txt     \u2502   \u2514\u2500\u2500 rsids_for_subsetting.txt     \u2514\u2500\u2500 Tools         \u251c\u2500\u2500 convert_plink_delimiter.sh         \u2514\u2500\u2500 create_23andme.sh<\/code><\/pre>\n<p>  \u0412\u00a0\u043a\u0430\u0442\u0430\u043b\u043e\u0433\u0435 <code>\/home<\/code> \u043d\u0430\u00a0\u0412\u041c\u00a0\u042f\u043d\u0434\u0435\u043a\u0441.\u041e\u0431\u043b\u0430\u043a\u0430 \u0431\u0443\u0434\u0435\u0442 \u0441\u043e\u0437\u0434\u0430\u043d\u0430 \u043f\u0430\u043f\u043a\u0430, \u043d\u0430\u0437\u0432\u0430\u043d\u0438\u0435 \u043a\u043e\u0442\u043e\u0440\u043e\u0439 \u0441\u043e\u043e\u0442\u0432\u0435\u0442\u0441\u0442\u0432\u0443\u0435\u0442 \u0438\u043c\u0435\u043d\u0438 \u043f\u043e\u043b\u044c\u0437\u043e\u0432\u0430\u0442\u0435\u043b\u044f, \u0443\u043a\u0430\u0437\u0430\u043d\u043d\u043e\u043c\u0443 \u043d\u0430\u00a0\u044d\u0442\u0430\u043f\u0435 \u0441\u043e\u0437\u0434\u0430\u043d\u0438\u044f \u0412\u041c. \u0421\u043a\u043e\u043f\u0438\u0440\u0443\u0439\u0442\u0435 \u0432\u0441\u0451 \u0438\u0437\u00a0\u043a\u0430\u0442\u0430\u043b\u043e\u0433\u0430 <code>\/home\/ubuntu<\/code> \u0432\u00a0\u0441\u0432\u043e\u0439 \u043a\u0430\u0442\u0430\u043b\u043e\u0433 \u0447\u0435\u0440\u0435\u0437 \u0441\u043b\u0435\u0434\u0443\u044e\u0449\u0438\u0435 \u043a\u043e\u043c\u0430\u043d\u0434\u044b:<\/p>\n<pre><code class=\"bash\">cd ~ cp -r \/home\/ubuntu\/* .\/<\/code><\/pre>\n<p>  <\/div>\n<\/div>\n<p>  <\/p>\n<div class=\"spoiler\"><b class=\"spoiler_title\">\u0414\u043b\u044f \u043e\u0441\u0442\u0430\u043b\u044c\u043d\u044b\u0445<\/b><\/p>\n<div class=\"spoiler_text\">\u041f\u0440\u0438 \u0440\u0430\u0431\u043e\u0442\u0435 \u043d\u0430\u00a0\u043b\u0438\u0447\u043d\u043e\u043c\u00a0\u041f\u041a \u0441\u043a\u0430\u0447\u0430\u0442\u044c \u043d\u0435\u043e\u0431\u0445\u043e\u0434\u0438\u043c\u044b\u0435 \u0444\u0430\u0439\u043b\u044b \u0434\u043b\u044f \u0432\u044b\u043f\u043e\u043b\u043d\u0435\u043d\u0438\u044f \u043f\u0435\u0440\u0432\u043e\u0439 \u0437\u0430\u0434\u0430\u0447\u0438 \u0432\u044b\u00a0\u043c\u043e\u0436\u0435\u0442\u0435 \u043f\u043e\u00a0<a href=\"https:\/\/cdn.atlas.ru\/website\/contest\/atlas_wgs_contest.tar.gz\">\u0441\u0441\u044b\u043b\u043a\u0435<\/a>. \u0412\u00a0\u0441\u043a\u0430\u0447\u0438\u0432\u0430\u0435\u043c\u043e\u043c \u0430\u0440\u0445\u0438\u0432\u0435 \u043f\u043e\u0434\u0434\u0435\u0440\u0436\u0438\u0432\u0430\u0435\u0442\u0441\u044f \u0441\u0442\u0440\u0443\u043a\u0442\u0443\u0440\u0430 \u0445\u0440\u0430\u043d\u0435\u043d\u0438\u044f \u0444\u0430\u0439\u043b\u043e\u0432, \u0430\u043d\u0430\u043b\u043e\u0433\u0438\u0447\u043d\u0430\u044f \u0438\u0441\u043f\u043e\u043b\u044c\u0437\u0443\u0435\u043c\u043e\u0439 \u043d\u0430\u00a0\u042f\u043d\u0434\u0435\u043a\u0441.\u041e\u0431\u043b\u0430\u043a\u0435:<\/p>\n<pre><code class=\"bash\">home \u2514\u2500\u2500 ubuntu     \u251c\u2500\u2500 Data     \u2502   \u251c\u2500\u2500 Test     \u2502   \u2502   \u251c\u2500\u2500 CEI.1kg.2019.test.vcf.gz     \u2502   \u2502   \u2514\u2500\u2500 CEI.1kg.2019.test.vcf.gz.tbi     \u2502   \u2514\u2500\u2500 Tutorial     \u2502       \u251c\u2500\u2500 CEI.1kg.2019.demo.vcf.gz     \u2502       \u2514\u2500\u2500 CEI.1kg.2019.demo.vcf.gz.tbi     \u251c\u2500\u2500 Technical     \u2502   \u251c\u2500\u2500 external_interpretation_rsids.txt     \u2502   \u2514\u2500\u2500 rsids_for_subsetting.txt     \u2514\u2500\u2500 Tools         \u251c\u2500\u2500 convert_plink_delimiter.sh         \u2514\u2500\u2500 create_23andme.sh<\/code><\/pre>\n<p>  \u0420\u0430\u0441\u043f\u0430\u043a\u0443\u0439\u0442\u0435 <code>atlas_wgs_contest.tar.gz<\/code> \u0430\u0440\u0445\u0438\u0432 \u043a\u043e\u043c\u0430\u043d\u0434\u043e\u0439<br \/>  <code>tar -xvzf atlas_wgs_contest.tar.gz<\/code>  <\/div>\n<\/div>\n<p>  VCF \u0444\u0430\u0439\u043b\u044b \u0434\u043b\u044f \u0432\u044b\u043f\u043e\u043b\u043d\u0435\u043d\u0438\u044f \u0437\u0430\u0434\u0430\u043d\u0438\u0439 \u0432\u00a0\u043d\u0435\u0430\u0440\u0445\u0438\u0432\u0438\u0440\u043e\u0432\u0430\u043d\u043d\u043e\u043c \u0432\u0438\u0434\u0435 \u0437\u0430\u043d\u0438\u043c\u0430\u044e\u0442 \u043e\u043a\u043e\u043b\u043e 19\u00a0\u0433\u0438\u0433\u0430\u0431\u0430\u0439\u0442 \u043a\u0430\u0436\u0434\u044b\u0439, \u043f\u043e\u044d\u0442\u043e\u043c\u0443 \u0434\u043b\u044f \u044d\u043a\u043e\u043d\u043e\u043c\u0438\u0438 \u043c\u0435\u0441\u0442\u0430 \u043c\u044b\u00a0\u0440\u0435\u043a\u043e\u043c\u0435\u043d\u0434\u0443\u0435\u043c \u0440\u0430\u0431\u043e\u0442\u0430\u0442\u044c \u0442\u043e\u043b\u044c\u043a\u043e \u0441\u00a0\u0430\u0440\u0445\u0438\u0432\u0430\u043c\u0438. \u0412\u0441\u0435 \u043f\u0435\u0440\u0435\u0447\u0438\u0441\u043b\u0435\u043d\u043d\u044b\u0435 \u0432\u044b\u0448\u0435 \u043f\u0440\u043e\u0433\u0440\u0430\u043c\u043c\u044b \u0443\u0436\u0435 \u0443\u043c\u0435\u044e\u0442 \u0440\u0430\u0431\u043e\u0442\u0430\u0442\u044c \u0441\u043e\u00a0\u0441\u0436\u0430\u0442\u044b\u043c\u0438 \u0434\u0430\u043d\u043d\u044b\u043c\u0438 VCF. \u0414\u043e\u043f\u043e\u043b\u043d\u0438\u0442\u0435\u043b\u044c\u043d\u043e \u043d\u0438\u0447\u0435\u0433\u043e \u0434\u0435\u043b\u0430\u0442\u044c \u043d\u0435\u00a0\u043d\u0443\u0436\u043d\u043e.<\/p>\n<p>  \u0427\u0442\u043e\u0431\u044b \u043e\u043f\u0440\u0435\u0434\u0435\u043b\u0438\u0442\u044c \u043f\u043e\u043b \u0441\u0443\u0431\u044a\u0435\u043a\u0442\u0430, \u043d\u0443\u0436\u043d\u043e \u043f\u043e\u0441\u043c\u043e\u0442\u0440\u0435\u0442\u044c \u043d\u0430\u00a0\u0433\u0435\u043d\u043e\u0442\u0438\u043f\u044b \u043d\u0430\u00a0\u0425 \u0445\u0440\u043e\u043c\u043e\u0441\u043e\u043c\u0435 \u0438\u00a0\u0438\u0441\u043a\u043b\u044e\u0447\u0438\u0442\u044c \u0440\u0435\u0433\u0438\u043e\u043d\u044b PAR1 \u0438\u00a0PAR2, \u0440\u0430\u0441\u043f\u043e\u043b\u043e\u0436\u0435\u043d\u043d\u044b\u0435 \u0432\u00a0\u0435\u0435\u00a0\u043d\u0430\u0447\u0430\u043b\u0435 \u0438\u00a0\u043a\u043e\u043d\u0446\u0435. \u042d\u0442\u043e \u0438\u043d\u0442\u0435\u0440\u0432\u0430\u043b\u044b \u043f\u043e\u0437\u0438\u0446\u0438\u0439 60001\u20132699520 \u0438\u00a0154931044\u2013155260560\u00a0\u0432 GRCh37 \u0432\u0435\u0440\u0441\u0438\u0438 \u0433\u0435\u043d\u043e\u043c\u0430. \u0415\u0441\u043b\u0438 \u0433\u0435\u043d\u043e\u0442\u0438\u043f \u0431\u0443\u0434\u0435\u0442 \u0441\u043e\u0434\u0435\u0440\u0436\u0430\u0442\u044c \u043e\u0434\u043d\u043e \u0447\u0438\u0441\u043b\u0435\u043d\u043d\u043e\u0435 \u043e\u0431\u043e\u0437\u043d\u0430\u0447\u0435\u043d\u0438\u0435\u00a0\u2014 \u044d\u0442\u043e \u043c\u0443\u0436\u0441\u043a\u043e\u0439 \u0431\u0438\u043e\u043b\u043e\u0433\u0438\u0447\u0435\u0441\u043a\u0438\u0439 \u043f\u043e\u043b, \u0438\u043d\u0430\u0447\u0435\u00a0\u2014 \u0436\u0435\u043d\u0441\u043a\u0438\u0439. \u041d\u0443\u0436\u043d\u043e \u0438\u043c\u0435\u0442\u044c \u0432\u00a0\u0432\u0438\u0434\u0443, \u0447\u0442\u043e \u043e\u0431\u043e\u0437\u043d\u0430\u0447\u0435\u043d\u0438\u0435 \u043f\u043e\u043b\u0430 \u0432\u00a0VCF \u0444\u0430\u0439\u043b\u0435 \u0437\u0430\u0432\u0438\u0441\u0438\u0442 \u043e\u0442\u00a0\u043d\u0430\u043b\u0438\u0447\u0438\u044f \u0438\u043d\u0444\u043e\u0440\u043c\u0430\u0446\u0438\u0438 \u043e\u00a0\u0431\u0438\u043e\u043b\u043e\u0433\u0438\u0447\u0435\u0441\u043a\u043e\u043c \u043f\u043e\u043b\u0435 \u043f\u0440\u0438 \u0433\u0435\u043d\u0435\u0440\u0430\u0446\u0438\u0438 VCF, \u043f\u043e\u044d\u0442\u043e\u043c\u0443 \u0438\u0441\u043f\u043e\u043b\u044c\u0437\u043e\u0432\u0430\u0442\u044c \u0434\u0430\u043d\u043d\u044b\u0439 \u043f\u043e\u0434\u0445\u043e\u0434 \u043c\u043e\u0436\u043d\u043e \u043d\u0435\u00a0\u0432\u0441\u0435\u0433\u0434\u0430.<\/p>\n<p>  \u0418\u0441\u043f\u043e\u043b\u044c\u0437\u0443\u0439\u0442\u0435 \u0441\u043b\u0435\u0434\u0443\u044e\u0449\u0443\u044e \u043a\u043e\u043c\u0430\u043d\u0434\u0443 \u0434\u043b\u044f \u043a\u0430\u0436\u0434\u043e\u0433\u043e \u0438\u0437\u00a0\u043e\u0431\u0440\u0430\u0437\u0446\u043e\u0432 \u0432\u00a0\u0434\u0430\u0442\u0430\u0441\u0435\u0442\u0435. \u041f\u043e\u0434\u0441\u0442\u0430\u0432\u044c\u0442\u0435 \u0438\u0434\u0435\u043d\u0442\u0438\u0444\u0438\u043a\u0430\u0442\u043e\u0440 \u043e\u0431\u0440\u0430\u0437\u0446\u0430 \u043f\u043e\u0441\u043b\u0435 \u0430\u0440\u0433\u0443\u043c\u0435\u043d\u0442\u0430 <code>-s<\/code>:<\/p>\n<pre><code class=\"bash\">(\/Data\/Tutotrial\/CEI.1kg.2019.demo.vcf.gz): # \u043f\u0435\u0440\u0435\u0439\u0434\u0438\u0442\u0435 \u0432 \u043d\u0443\u0436\u043d\u0443\u044e \u0432\u0430\u043c \u0434\u0438\u0440\u0435\u043a\u0442\u043e\u0440\u0438\u044e bcftools view -O v -H -s HG00731 -r chrX:2699521-154931043 CEI.1kg.2019.demo.vcf.gz | head<\/code><\/pre>\n<p>  \u041f\u0440\u0438 \u0432\u044b\u043f\u043e\u043b\u043d\u0435\u043d\u0438\u0438 \u043a\u043e\u043c\u0430\u043d\u0434 \u0432\u044b\u00a0\u0443\u0432\u0438\u0434\u0438\u0442\u0435 \u0447\u0430\u0441\u0442\u044c \u0441\u043e\u0434\u0435\u0440\u0436\u0438\u043c\u043e\u0433\u043e VCF \u0444\u0430\u0439\u043b\u0430 \u0434\u043b\u044f \u0443\u043a\u0430\u0437\u0430\u043d\u043d\u043e\u0433\u043e \u0438\u0434\u0435\u043d\u0442\u0438\u0444\u0438\u043a\u0430\u0442\u043e\u0440\u0430 \u043e\u0431\u0440\u0430\u0437\u0446\u0430. \u041f\u0430\u0440\u0430\u043c\u0435\u0442\u0440 <code>-r chrX:2699521-154931043<\/code>\u00a0\u0432 BCFtools \u043e\u0433\u0440\u0430\u043d\u0438\u0447\u0438\u0432\u0430\u0435\u0442 \u043f\u0440\u043e\u0441\u043c\u043e\u0442\u0440 \u0441\u043e\u0434\u0435\u0440\u0436\u0438\u043c\u043e\u0433\u043e \u0444\u0430\u0439\u043b\u0430 \u0434\u043e\u00a0\u0440\u0435\u0433\u0438\u043e\u043d\u0430 \u0445\u0440\u043e\u043c\u043e\u0441\u043e\u043c\u044b\u00a0\u0425 \u0441\u00a0\u043f\u043e\u0437\u0438\u0446\u0438\u0438 2699521 \u0434\u043e\u00a0\u043f\u043e\u0437\u0438\u0446\u0438\u0438 154931043 (\u0440\u0435\u0433\u0438\u043e\u043d non-PAR \u043d\u0430\u00a0\u0420\u0438\u0441\u0443\u043d\u043a\u0435\u00a03). \u042d\u0442\u0438 \u0433\u0440\u0430\u043d\u0438\u0446\u044b \u0438\u0441\u043a\u043b\u044e\u0447\u0430\u044e\u0442 \u043d\u0435\u043d\u0443\u0436\u043d\u044b\u0435 \u0432\u00a0\u0434\u0430\u043d\u043d\u043e\u043c \u0441\u043b\u0443\u0447\u0430\u0435 \u043f\u0441\u0435\u0432\u0434\u043e\u0430\u0443\u0442\u043e\u0441\u043e\u043c\u043d\u044b\u0435 \u0440\u0435\u0433\u0438\u043e\u043d\u044b (PAR1 \u0438\u00a0PAR2). \u041f\u043e\u00a0\u0447\u0438\u0441\u043b\u0435\u043d\u043d\u044b\u043c \u0437\u043d\u0430\u0447\u0435\u043d\u0438\u044f\u043c \u0432\u00a0\u043f\u043e\u043b\u0435\u00a0GT \u043e\u043f\u0440\u0435\u0434\u0435\u043b\u0438\u0442\u0435 \u043f\u043e\u043b \u043a\u0430\u0436\u0434\u043e\u0433\u043e \u043e\u0431\u0440\u0430\u0437\u0446\u0430.<\/p>\n<p>  <img decoding=\"async\" src=\"https:\/\/habrastorage.org\/webt\/vn\/fx\/et\/vnfxetqzursuy3ltyytqj-giiko.png\"><br \/>  <b>\u0420\u0438\u0441\u0443\u043d\u043e\u043a\u00a03<\/b>. \u0420\u0430\u0441\u043f\u043e\u043b\u043e\u0436\u0435\u043d\u0438\u0435 \u043f\u0441\u0435\u0432\u0434\u043e\u0430\u0443\u0442\u043e\u0441\u043e\u043c\u043d\u044b\u0445 \u0440\u0435\u0433\u0438\u043e\u043d\u043e\u0432 PAR1 \u0438\u00a0PAR2\u00a0\u043d\u0430 \u043f\u043e\u043b\u043e\u0432\u044b\u0445 \u0445\u0440\u043e\u043c\u043e\u0441\u043e\u043c\u0430\u0445.<\/p>\n<p>  \u041f\u043e\u0441\u043c\u043e\u0442\u0440\u0435\u0442\u044c \u0441\u043f\u0438\u0441\u043e\u043a \u0432\u0441\u0435\u0445 \u0438\u0434\u0435\u043d\u0442\u0438\u0444\u0438\u043a\u0430\u0442\u043e\u0440\u043e\u0432 \u043e\u0431\u0440\u0430\u0437\u0446\u043e\u0432 \u0432\u00a0VCF \u0444\u0430\u0439\u043b\u0435 \u043c\u043e\u0436\u043d\u043e \u043d\u0430\u00a0\u0420\u0438\u0441\u0443\u043d\u043a\u0435 1\u00a0\u0438\u043b\u0438 \u0432\u00a0\u043f\u043e\u0441\u043b\u0435\u0434\u043d\u0435\u0439 \u0441\u0442\u0440\u043e\u043a\u0435 \u0448\u0430\u043f\u043a\u0438 VCF \u0444\u0430\u0439\u043b\u0430. \u041e\u043d\u0438 \u0431\u0443\u0434\u0443\u0442 \u043f\u0435\u0440\u0435\u0447\u0438\u0441\u043b\u0435\u043d\u044b \u043f\u043e\u0441\u043b\u0435 \u043d\u0430\u0438\u043c\u0435\u043d\u043e\u0432\u0430\u043d\u0438\u044f \u043a\u043e\u043b\u043e\u043d\u043a\u0438 FORMAT:<\/p>\n<pre><code class=\"bash\">#CHROM\tPOS\tID\tREF\tALT\tQUAL\tFILTER\tINFO\tFORMAT\tHG00731\tHG00732\tHG02026\tHG02025\tHG02250\tHG02373\tHG00733\tHG02024\tHG02377\tHG02381<\/code><\/pre>\n<p>  \u0418\u0441\u0442\u0438\u043d\u043d\u044b\u0439 \u043f\u043e\u043b \u0434\u0430\u043d\u043d\u044b\u0445 \u043e\u0431\u0440\u0430\u0437\u0446\u043e\u0432 \u0442\u0430\u043a\u0436\u0435 \u0443\u043a\u0430\u0437\u0430\u043d \u043d\u0430\u00a0\u0420\u0438\u0441\u0443\u043d\u043a\u0435\u00a01.<\/p>\n<p>  <\/p>\n<h2>\u041e\u043f\u0440\u0435\u0434\u0435\u043b\u044f\u0435\u043c \u0440\u043e\u0434\u0441\u0442\u0432\u043e<\/h2>\n<p>  \u0414\u043b\u044f \u043e\u043f\u0440\u0435\u0434\u0435\u043b\u0435\u043d\u0438\u044f \u0440\u043e\u0434\u0441\u0442\u0432\u0430 \u043d\u0430\u043c \u043d\u0443\u0436\u043d\u043e \u043f\u043e\u043f\u0430\u0440\u043d\u043e \u0441\u0440\u0430\u0432\u043d\u0438\u0442\u044c \u0433\u0435\u043d\u0435\u0442\u0438\u0447\u0435\u0441\u043a\u0438\u0435 \u0434\u0430\u043d\u043d\u044b\u0435 \u0432\u0441\u0435\u0445 \u043e\u0431\u0440\u0430\u0437\u0446\u043e\u0432. \u0414\u0435\u043b\u0430\u0442\u044c \u044d\u0442\u043e \u043f\u043e\u00a0\u043f\u043e\u043b\u043d\u043e\u043c\u0443 \u0433\u0435\u043d\u043e\u043c\u0443 \u0441\u043b\u043e\u0436\u043d\u043e: VCF \u0444\u0430\u0439\u043b \u0432\u00a0\u0442\u0430\u043a\u043e\u043c \u0441\u043b\u0443\u0447\u0430\u0435 \u0437\u0430\u043d\u0438\u043c\u0430\u0435\u0442 \u0434\u0435\u0441\u044f\u0442\u043a\u0438 \u0433\u0438\u0433\u0430\u0431\u0430\u0439\u0442. \u0418\u0441\u043f\u043e\u043b\u044c\u0437\u0443\u0435\u043c\u044b\u0439 \u043d\u0430\u043c\u0438 VCF \u0437\u0430\u043d\u0438\u043c\u0430\u0435\u0442 \u0432\u0441\u0435\u0433\u043e \u043e\u043a\u043e\u043b\u043e 2\u00a0\u0433\u0438\u0433\u0430\u0431\u0430\u0439\u0442, \u043d\u043e\u00a0\u043c\u044b\u00a0\u0432\u0441\u0435 \u0440\u0430\u0432\u043d\u043e \u043e\u0442\u0444\u0438\u043b\u044c\u0442\u0440\u0443\u0435\u043c \u0435\u0433\u043e \u043f\u043e\u00a0\u0441\u043f\u0438\u0441\u043a\u0443 \u0438\u0434\u0435\u043d\u0442\u0438\u0444\u0438\u043a\u0430\u0442\u043e\u0440\u043e\u0432 \u0433\u0435\u043d\u0435\u0442\u0438\u0447\u0435\u0441\u043a\u0438\u0445 \u0432\u0430\u0440\u0438\u0430\u0446\u0438\u0439 (rsIDs), \u0433\u0435\u043d\u043e\u0442\u0438\u043f\u0438\u0440\u0443\u0435\u043c\u044b\u0445 \u043d\u0430\u00a0\u0447\u0438\u043f\u0430\u0445 \u043e\u0442\u00a0\u043a\u043e\u043c\u043f\u0430\u043d\u0438\u0438 Illumina: GSA v1, GSA v2, HumanOmniExpress v1.0, HumanOmniExpress v1.3, InfiniumExome v1.1 \u0438\u00a0InfiniumOmniExpressExome v1.4. \u042d\u0442\u043e \u043d\u0430\u0438\u0431\u043e\u043b\u0435\u0435 \u043f\u043e\u043f\u0443\u043b\u044f\u0440\u043d\u044b\u0435 \u0447\u0438\u043f\u044b \u0432 \u043a\u043e\u043c\u043c\u0435\u0440\u0447\u0435\u0441\u043a\u043e\u043c \u0433\u0435\u043d\u043e\u0442\u0438\u043f\u0438\u0440\u043e\u0432\u0430\u043d\u0438\u0438.<\/p>\n<p>  \u041c\u044b\u00a0\u0441\u043e\u0431\u0440\u0430\u043b\u0438 \u0441\u043f\u0438\u0441\u043e\u043a \u0432\u0441\u0435\u0445 \u0438\u0434\u0435\u043d\u0442\u0438\u0444\u0438\u043a\u0430\u0442\u043e\u0440\u043e\u0432 \u0433\u0435\u043d\u0435\u0442\u0438\u0447\u0435\u0441\u043a\u0438\u0445 \u0432\u0430\u0440\u0438\u0430\u0446\u0438\u0439 \u0441\u00a0\u044d\u0442\u0438\u0445 \u0447\u0438\u043f\u043e\u0432 \u0432\u00a0\u043e\u0442\u0434\u0435\u043b\u044c\u043d\u044b\u0439 \u0444\u0430\u0439\u043b \u0441\u043e\u00a0\u0441\u043f\u0438\u0441\u043a\u043e\u043c rsIDs. \u041e\u043d\u00a0\u0441\u043e\u0434\u0435\u0440\u0436\u0438\u0442 1,4 \u043c\u0438\u043b\u043b\u0438\u043e\u043d\u0430 \u0438\u0434\u0435\u043d\u0442\u0438\u0444\u0438\u043a\u0430\u0442\u043e\u0440\u043e\u0432. \u0414\u043b\u044f \u0444\u0438\u043b\u044c\u0442\u0440\u0430\u0446\u0438\u0438 VCF \u0444\u0430\u0439\u043b\u0430 \u0432\u044b\u043f\u043e\u043b\u043d\u0438\u0442\u0435 \u0441\u043b\u0435\u0434\u0443\u044e\u0449\u0443\u044e \u043a\u043e\u043c\u0430\u043d\u0434\u0443:<\/p>\n<pre><code class=\"bash\">bcftools view -O z -i 'ID=@rsids_for_subsetting.txt' CEI.1kg.2019.demo.vcf.gz &gt; CEI.1kg.2019.demo.subset.vcf.gz<\/code><\/pre>\n<p>  \u041f\u0440\u0438 \u043a\u0430\u0436\u0434\u043e\u043c \u0438\u0441\u043f\u043e\u043b\u044c\u0437\u043e\u0432\u0430\u043d\u0438\u0438 BCFtools \u0438\u00a0\u0434\u0440\u0443\u0433\u0438\u0445 \u043f\u0430\u043a\u0435\u0442\u043e\u0432 \u0434\u043b\u044f \u0440\u0430\u0431\u043e\u0442\u044b \u0441\u00a0VCF \u0444\u0430\u0439\u043b\u0430\u043c\u0438 \u0432\u00a0\u0448\u0430\u043f\u043a\u0443 \u0444\u0430\u0439\u043b\u0430 \u0434\u043e\u0431\u0430\u0432\u043b\u044f\u0435\u0442\u0441\u044f \u0438\u0441\u0442\u043e\u0440\u0438\u044f \u043f\u0440\u0435\u0434\u044b\u0434\u0443\u0449\u0438\u0445 \u043a\u043e\u043c\u0430\u043d\u0434. \u041d\u0435\u0437\u0430\u0432\u0438\u0441\u0438\u043c\u043e \u043e\u0442\u00a0\u0441\u043f\u043e\u0441\u043e\u0431\u0430 \u0444\u0438\u043b\u044c\u0442\u0440\u0430\u0446\u0438\u0438 VCF \u0444\u0430\u0439\u043b\u0430 \u0438\u00a0\u0432\u044b\u043f\u043e\u043b\u043d\u0435\u043d\u043d\u044b\u0445 \u0440\u0430\u043d\u0435\u0435 \u043a\u043e\u043c\u0430\u043d\u0434, \u043c\u043e\u0436\u043d\u043e \u043f\u0440\u043e\u0432\u0435\u0440\u0438\u0442\u044c \u0446\u0435\u043b\u043e\u0441\u0442\u043d\u043e\u0441\u0442\u044c \u0438\u00a0\u0438\u0434\u0435\u043d\u0442\u0438\u0447\u043d\u043e\u0441\u0442\u044c \u043e\u0441\u043d\u043e\u0432\u043d\u043e\u0433\u043e \u0441\u043e\u0434\u0435\u0440\u0436\u0438\u043c\u043e\u0433\u043e VCF \u043f\u043e\u0434\u0441\u0447\u0435\u0442\u043e\u043c \u0445\u0435\u0448-\u0441\u0443\u043c\u043c\u044b:<\/p>\n<pre><code class=\"bash\"># \u043f\u0435\u0440\u0435\u0439\u0434\u0438\u0442\u0435 \u0432 \u043d\u0443\u0436\u043d\u0443\u044e \u0432\u0430\u043c \u0434\u0438\u0440\u0435\u043a\u0442\u043e\u0440\u0438\u044e gunzip -c CEI.1kg.2019.demo.subset.vcf.gz | grep -v \"^#\" &gt; CEI.1kg.2019.demo.subset.body.vcf md5sum --tag CEI.1kg.2019.demo.subset.body.vcf # \u0412\u044b\u0432\u043e\u0434 \u043f\u043e\u0441\u043b\u0435\u0434\u043d\u0435\u0439 \u043a\u043e\u043c\u0430\u043d\u0434\u044b \u0434\u043e\u043b\u0436\u0435\u043d \u0441\u043e\u0432\u043f\u0430\u0434\u0430\u0442\u044c \u0441 d609eb330908d4eb5feb9f1860fd508b<\/code><\/pre>\n<p>  \u041a\u043e\u043c\u0430\u043d\u0434\u0430 <code>gunzip -c<\/code> \u043f\u0440\u043e\u0438\u0437\u0432\u043e\u0434\u0438\u0442 \u0434\u0435\u043a\u043e\u043c\u043f\u0440\u0435\u0441\u0441\u0438\u044e \u0444\u0430\u0439\u043b\u0430 \u0441\u00a0\u0432\u044b\u0432\u043e\u0434\u043e\u043c \u0435\u0433\u043e \u0441\u043e\u0434\u0435\u0440\u0436\u0438\u043c\u043e\u0433\u043e \u0432\u00a0stdout, \u0438\u0437\u00a0\u043a\u043e\u0442\u043e\u0440\u043e\u0433\u043e \u0434\u0430\u043b\u0435\u0435 \u0443\u0434\u0430\u043b\u044f\u044e\u0442\u0441\u044f \u0441\u0442\u0440\u043e\u043a\u0438 \u0448\u0430\u043f\u043a\u0438 VCF \u0444\u0430\u0439\u043b\u0430, \u043d\u0430\u0447\u0438\u043d\u0430\u044e\u0449\u0438\u0435\u0441\u044f <code>\u0441 #<\/code> (\u043f\u043e\u044d\u0442\u043e\u043c\u0443 \u0438\u0441\u043f\u043e\u043b\u044c\u0437\u0443\u0435\u0442\u0441\u044f \u043a\u043e\u043c\u0430\u043d\u0434\u0430 <code>grep -v \"^#\"<\/code>). \u0428\u0430\u043f\u043a\u0430 \u0443\u0434\u0430\u043b\u044f\u0435\u0442\u0441\u044f \u0434\u043b\u044f \u0442\u043e\u0433\u043e, \u0447\u0442\u043e\u0431\u044b \u0441\u0440\u0430\u0432\u043d\u0438\u0432\u0430\u0442\u044c \u0446\u0435\u043b\u043e\u0441\u0442\u043d\u043e\u0441\u0442\u044c \u0442\u043e\u043b\u044c\u043a\u043e \u0441\u0430\u043c\u0438\u0445 \u0433\u0435\u043d\u0435\u0442\u0438\u0447\u0435\u0441\u043a\u0438\u0445 \u0434\u0430\u043d\u043d\u044b\u0445, \u0430\u00a0\u043d\u0435\u00a0\u043c\u0435\u0442\u0430\u0434\u0430\u043d\u043d\u044b\u0445 \u043e\u00a0\u0442\u043e\u043c, \u043a\u0430\u043a\u0438\u0435 \u0438\u043d\u0441\u0442\u0440\u0443\u043c\u0435\u043d\u0442\u044b \u0438\u00a0\u043a\u043e\u0433\u0434\u0430 \u0431\u044b\u043b\u0438 \u0438\u0441\u043f\u043e\u043b\u044c\u0437\u043e\u0432\u0430\u043d\u044b \u0434\u043b\u044f \u0440\u0430\u0431\u043e\u0442\u044b \u0441\u00a0\u044d\u0442\u0438\u043c VCF \u0444\u0430\u0439\u043b\u043e\u043c.<\/p>\n<p>  \u0412\u00a0\u0441\u043b\u0443\u0447\u0430\u0435 \u0441\u043e\u0432\u043f\u0430\u0434\u0435\u043d\u0438\u044f \u0445\u0435\u0448-\u0441\u0443\u043c\u043c\u044b \u043c\u043e\u0436\u043d\u043e \u0434\u0432\u0438\u0433\u0430\u0442\u044c\u0441\u044f \u0434\u0430\u043b\u044c\u0448\u0435 \u0438\u00a0\u043a\u043e\u043d\u0432\u0435\u0440\u0442\u0438\u0440\u043e\u0432\u0430\u0442\u044c VCF \u0432\u043e\u00a0\u0432\u043d\u0443\u0442\u0440\u0435\u043d\u043d\u0438\u0439 \u0444\u043e\u0440\u043c\u0430\u0442 Plink (\u043f\u043e\u00a0\u0443\u043c\u043e\u043b\u0447\u0430\u043d\u0438\u044e \u0444\u043e\u0440\u043c\u0430\u0442 Plink\u00a0\u2014 \u044d\u0442\u043e \u0442\u0440\u0438 \u0444\u0430\u0439\u043b\u0430 \u0441\u00a0\u0440\u0430\u0441\u0448\u0438\u0440\u0435\u043d\u0438\u044f\u043c\u0438 bed, bim \u0438\u00a0fam). \u0412\u00a0\u044d\u0442\u0438\u0445 \u0444\u0430\u0439\u043b\u0430\u0445 \u043e\u0441\u0442\u0430\u0435\u0442\u0441\u044f \u0442\u043e\u043b\u044c\u043a\u043e \u0433\u0435\u043d\u043e\u0442\u0438\u043f, \u0445\u0440\u043e\u043c\u043e\u0441\u043e\u043c\u0430, \u043f\u043e\u0437\u0438\u0446\u0438\u044f \u0438\u00a0\u043d\u0435\u043a\u043e\u0442\u043e\u0440\u044b\u0435 \u0434\u0440\u0443\u0433\u0438\u0435 \u0434\u0430\u043d\u043d\u044b\u0435, \u0430\u00a0\u043e\u0441\u0442\u0430\u043b\u044c\u043d\u043e\u0435\u00a0\u2014 \u043e\u0442\u0441\u0435\u0438\u0432\u0430\u0435\u0442\u0441\u044f. \u0421\u00a0\u0442\u0430\u043a\u0438\u043c \u0444\u043e\u0440\u043c\u0430\u0442\u043e\u043c \u0433\u043e\u0440\u0430\u0437\u0434\u043e \u043f\u0440\u043e\u0449\u0435 \u0440\u0430\u0431\u043e\u0442\u0430\u0442\u044c \u0438\u00a0\u0440\u0435\u0448\u0430\u0442\u044c \u0440\u0430\u0437\u043b\u0438\u0447\u043d\u044b\u0435 \u0437\u0430\u0434\u0430\u0447\u0438, \u043d\u0435\u00a0\u0442\u0440\u0435\u0431\u0443\u044e\u0449\u0438\u0435 \u0434\u043e\u043f\u043e\u043b\u043d\u0438\u0442\u0435\u043b\u044c\u043d\u043e\u0439 \u0438\u043d\u0444\u043e\u0440\u043c\u0430\u0446\u0438\u0438 \u0438\u0437\u00a0VCF. \u041d\u0430\u043f\u0440\u0438\u043c\u0435\u0440 \u043f\u0440\u043e\u0432\u043e\u0434\u0438\u0442\u044c GWAS.<\/p>\n<pre><code class=\"bash\"># \u041f\u0435\u0440\u0435\u0439\u0434\u0438\u0442\u0435 \u0432 \u043d\u0443\u0436\u043d\u0443\u044e \u0434\u0438\u0440\u0435\u043a\u0442\u043e\u0440\u0438\u044e plink --vcf CEI.1kg.2019.demo.subset.vcf.gz --make-bed --out CEI.1kg.2019.demo.subset <\/code><\/pre>\n<p>  \u042d\u0442\u0430 \u043a\u043e\u043c\u0430\u043d\u0434\u0430 \u0441\u043e\u0437\u0434\u0430\u0441\u0442 \u0432\u00a0\u043f\u0430\u043f\u043a\u0435 \u0442\u0440\u0438 \u0444\u0430\u0439\u043b\u0430:<br \/>  <code>CEI.1kg.2019.demo.subset.bed<br \/>  CEI.1kg.2019.demo.subset.bim<br \/>  CEI.1kg.2019.demo.subset.fam<\/code><\/p>\n<p>  \u041e\u043f\u0440\u0435\u0434\u0435\u043b\u0438\u0442\u044c \u043f\u043e\u043f\u0430\u0440\u043d\u043e\u0435 \u0440\u043e\u0434\u0441\u0442\u0432\u043e \u043c\u043e\u0436\u043d\u043e \u0434\u043b\u044f \u0432\u0441\u0435\u0445 10\u00a0\u043e\u0431\u0440\u0430\u0437\u0446\u043e\u0432. \u0418\u0441\u043f\u043e\u043b\u044c\u0437\u0443\u0435\u043c \u0441\u043b\u0435\u0434\u0443\u044e\u0449\u0443\u044e \u043a\u043e\u043c\u0430\u043d\u0434\u0443 \u0434\u043b\u044f \u0430\u043d\u0430\u043b\u0438\u0437\u0430 Plink \u0444\u0430\u0439\u043b\u043e\u0432:<\/p>\n<pre><code class=\"bash\">king -b CEI.1kg.2019.demo.subset.bed --kinship --prefix CEI.1kg.2019.demo.subset.kinship_analysis<\/code><\/pre>\n<p>  \u041f\u0440\u043e\u0441\u043c\u043e\u0442\u0440\u0438\u0442\u0435 \u0444\u0430\u0439\u043b <code>CEI.1kg.2019.demo.subset.kinship_analysis.kin0<\/code> \u0438\u00a0\u043e\u0431\u0440\u0430\u0442\u0438\u0442\u0435 \u0432\u043d\u0438\u043c\u0430\u043d\u0438\u0435 \u043d\u0430\u00a0\u043a\u043e\u043b\u043e\u043d\u043a\u0443 Kinship, \u0432\u00a0\u043a\u043e\u0442\u043e\u0440\u043e\u0439 \u0441\u043e\u0434\u0435\u0440\u0436\u0430\u0442\u0441\u044f kinship \u043a\u043e\u044d\u0444\u0444\u0438\u0446\u0438\u0435\u043d\u0442\u044b \u0434\u043b\u044f \u043f\u0430\u0440 \u043e\u0431\u0440\u0430\u0437\u0446\u043e\u0432, \u0443\u043a\u0430\u0437\u0430\u043d\u043d\u044b\u0445 \u0441\u043e\u043e\u0442\u0432\u0435\u0442\u0441\u0442\u0432\u0435\u043d\u043d\u043e \u0432\u00a0ID1 \u0438\u00a0ID2.<\/p>\n<p>  \u0421\u0440\u0430\u0432\u043d\u0438\u0442\u0435 \u043f\u043e\u043b\u0443\u0447\u0435\u043d\u043d\u044b\u0435 \u0432\u0430\u043c\u0438 \u043a\u043e\u044d\u0444\u0444\u0438\u0446\u0438\u0435\u043d\u0442\u044b \u0432\u00a0\u0444\u0430\u0439\u043b\u0435 <code>CEI.1kg.2019.demo.subset.kinship_analysis.kin0<\/code> \u0434\u043b\u044f \u0432\u0441\u0435\u0445 \u043f\u0430\u0440 \u043e\u0431\u0440\u0430\u0437\u0446\u043e\u0432 \u0441\u00a0\u0440\u043e\u0434\u043e\u0441\u043b\u043e\u0432\u043d\u043e\u0439, \u043f\u0440\u0435\u0434\u0441\u0442\u0430\u0432\u043b\u0435\u043d\u043d\u043e\u0439 \u043d\u0430\u00a0\u0420\u0438\u0441\u0443\u043d\u043a\u0435\u00a01 (\u043f\u0443\u043d\u043a\u0442\u0438\u0440\u043d\u0430\u044f \u043b\u0438\u043d\u0438\u044f \u0441\u043e\u043e\u0442\u0432\u0435\u0442\u0441\u0442\u0432\u0443\u0435\u0442 \u0440\u043e\u0434\u0441\u0442\u0432\u0443 \u0432\u0442\u043e\u0440\u043e\u0433\u043e \u043f\u043e\u0440\u044f\u0434\u043a\u0430, \u043e\u0434\u043d\u0430\u043a\u043e \u0442\u043e\u0447\u043d\u044b\u0435 \u0434\u0430\u043d\u043d\u044b\u0435 \u043e\u00a0\u0440\u043e\u0434\u0441\u0442\u0432\u0435 \u043e\u0442\u0441\u0443\u0442\u0441\u0442\u0432\u0443\u044e\u0442, \u0442.\u0435. \u044d\u0442\u043e \u043c\u043e\u0433\u0443\u0442 \u0431\u044b\u0442\u044c \u0434\u0432\u043e\u044e\u0440\u043e\u0434\u043d\u044b\u0435 \u0431\u0440\u0430\u0442 \u0438\u00a0\u0441\u0435\u0441\u0442\u0440\u0430, \u0442\u0435\u0442\u044f\/\u043f\u043b\u0435\u043c\u044f\u043d\u043d\u0438\u043a \u0438\u043b\u0438 \u0434\u044f\u0434\u044f\/\u043f\u043b\u0435\u043c\u044f\u043d\u043d\u0438\u0446\u0430). \u041f\u043e\u043f\u0440\u043e\u0431\u0443\u0439\u0442\u0435 \u0441\u0430\u043c\u043e\u0441\u0442\u043e\u044f\u0442\u0435\u043b\u044c\u043d\u043e \u0441\u0434\u0435\u043b\u0430\u0442\u044c \u0432\u044b\u0432\u043e\u0434 \u043e\u00a0\u0442\u043e\u043c, \u043a\u0430\u043a\u0438\u0435 \u0437\u043d\u0430\u0447\u0435\u043d\u0438\u044f kinship \u043a\u043e\u044d\u0444\u0444\u0438\u0446\u0438\u0435\u043d\u0442\u043e\u0432 \u043c\u043e\u0433\u0443\u0442 \u0441\u043e\u043e\u0442\u0432\u0435\u0442\u0441\u0442\u0432\u043e\u0432\u0430\u0442\u044c \u0440\u043e\u0434\u0441\u0442\u0432\u0443 \u043f\u0435\u0440\u0432\u043e\u0433\u043e \u0438\u00a0\u0432\u0442\u043e\u0440\u043e\u0433\u043e \u043f\u043e\u0440\u044f\u0434\u043a\u0430.<\/p>\n<div class=\"spoiler\"><b class=\"spoiler_title\">\u041f\u043e\u0434\u0441\u043a\u0430\u0437\u043a\u0430<\/b><\/p>\n<div class=\"spoiler_text\">\u0412\u044b\u0434\u0435\u0440\u0436\u043a\u0430 \u0438\u0437\u00a0\u0434\u043e\u043a\u0443\u043c\u0435\u043d\u0442\u0430\u0446\u0438\u0438 KING: \u0437\u043d\u0430\u0447\u0435\u043d\u0438\u044f kinship \u043a\u043e\u044d\u0444\u0444\u0438\u0446\u0438\u0435\u043d\u0442\u043e\u0432 &gt;0.354 \u0441\u043e\u043e\u0442\u0432\u0435\u0442\u0441\u0442\u0432\u0443\u044e\u0442 \u0434\u0443\u0431\u043b\u0438\u043a\u0430\u0442\u0430\u043c \u043e\u0431\u0440\u0430\u0437\u0446\u043e\u0432 \u043b\u0438\u0431\u043e \u043e\u0434\u043d\u043e\u044f\u0439\u0446\u0435\u0432\u044b\u043c \u0431\u043b\u0438\u0437\u043d\u0435\u0446\u0430\u043c, \u043e\u0442\u00a00.177 \u0434\u043e\u00a00.354\u00a0\u2014 \u0440\u043e\u0434\u0441\u0442\u0432\u0443 \u043f\u0435\u0440\u0432\u043e\u0433\u043e \u043f\u043e\u0440\u044f\u0434\u043a\u0430 (\u0440\u043e\u0434\u0438\u0442\u0435\u043b\u0438-\u0434\u0435\u0442\u0438, \u0431\u0440\u0430\u0442\u044c\u044f-\u0441\u0435\u0441\u0442\u0440\u044b), \u043e\u0442\u00a00.0884 \u0434\u043e\u00a00.177\u00a0\u2014 \u0440\u043e\u0434\u0441\u0442\u0432\u0443 \u0432\u0442\u043e\u0440\u043e\u0433\u043e \u043f\u043e\u0440\u044f\u0434\u043a\u0430 (\u0434\u0432\u043e\u044e\u0440\u043e\u0434\u043d\u044b\u0435 \u0431\u0440\u0430\u0442\u044c\u044f-\u0441\u0435\u0441\u0442\u0440\u044b, \u0442\u0435\u0442\u0438\/\u0434\u044f\u0434\u0438-\u043f\u043b\u0435\u043c\u044f\u043d\u043d\u0438\u043a\u0438), \u0430\u00a0\u043e\u0442\u00a00.0442 \u0434\u043e\u00a00.0884\u00a0\u2014 \u0440\u043e\u0434\u0441\u0442\u0432\u0443 \u0442\u0440\u0435\u0442\u044c\u0435\u0433\u043e \u043f\u043e\u0440\u044f\u0434\u043a\u0430 (\u0431\u0430\u0431\u0443\u0448\u043a\u0438\/\u0434\u0435\u0434\u0443\u0448\u043a\u0438-\u0432\u043d\u0443\u043a\u0438, \u0442\u0440\u043e\u044e\u0440\u043e\u0434\u043d\u044b\u0435 \u0431\u0440\u0430\u0442\u044c\u044f\/\u0441\u0435\u0441\u0442\u0440\u044b). \u0412\u0441\u0435, \u0447\u0442\u043e \u043c\u0435\u043d\u044c\u0448\u0435 0.0442, \u0441\u043b\u043e\u0436\u043d\u043e \u043e\u0434\u043d\u043e\u0437\u043d\u0430\u0447\u043d\u043e \u0438\u043d\u0442\u0435\u0440\u043f\u0440\u0435\u0442\u0438\u0440\u043e\u0432\u0430\u0442\u044c.  <\/div>\n<\/div>\n<h2>\u041f\u0435\u0440\u0432\u043e\u0435 \u0437\u0430\u0434\u0430\u043d\u0438\u0435 \u043a\u043e\u043d\u043a\u0443\u0440\u0441\u0430<\/h2>\n<p>  \u0418\u0441\u043f\u043e\u043b\u044c\u0437\u0443\u044f \u0442\u0435\u0441\u0442\u043e\u0432\u044b\u0439 \u0434\u0430\u0442\u0430\u0441\u0435\u0442 \u0438\u0437 12 \u043e\u0431\u0440\u0430\u0437\u0446\u043e\u0432 <code>Data\/Test\/CEI.1kg.2019.test.vcf.gz<\/code>, \u0441\u043e\u0441\u0442\u0430\u0432\u044c\u0442\u0435 \u0438\u0445 \u0440\u043e\u0434\u043e\u0441\u043b\u043e\u0432\u043d\u0443\u044e, \u0440\u0443\u043a\u043e\u0432\u043e\u0434\u0441\u0442\u0432\u0443\u044f\u0441\u044c \u0440\u0435\u0437\u0443\u043b\u044c\u0442\u0430\u0442\u0430\u043c\u0438 \u043e\u043f\u0440\u0435\u0434\u0435\u043b\u0435\u043d\u0438\u044f \u043f\u043e\u043b\u0430 \u0438 kinship \u0430\u043d\u0430\u043b\u0438\u0437\u0430. \u041e\u0431\u0440\u0430\u0437\u0446\u044b, \u043a\u043e\u0442\u043e\u0440\u044b\u0435 \u043f\u043e \u0440\u0435\u0437\u0443\u043b\u044c\u0442\u0430\u0442\u0430\u043c \u0430\u043d\u0430\u043b\u0438\u0437\u0430 \u043d\u0435 \u043d\u0430\u0445\u043e\u0434\u044f\u0442\u0441\u044f \u0432 \u0440\u043e\u0434\u0441\u0442\u0432\u0435\u043d\u043d\u044b\u0445 \u0441\u0432\u044f\u0437\u044f\u0445 \u0441 \u043a\u0435\u043c-\u043b\u0438\u0431\u043e, \u0437\u0430\u043f\u0438\u0448\u0438\u0442\u0435 \u0440\u044f\u0434\u043e\u043c, \u043d\u0435 \u0441\u043e\u0435\u0434\u0438\u043d\u044f\u044f \u0438\u0445 \u043b\u0438\u043d\u0438\u0435\u0439 \u0441 \u0434\u0440\u0443\u0433\u0438\u043c\u0438 \u043e\u0431\u0440\u0430\u0437\u0446\u0430\u043c\u0438. \u0420\u043e\u0434\u043e\u0441\u043b\u043e\u0432\u043d\u0430\u044f \u043c\u043e\u0436\u0435\u0442 \u0431\u044b\u0442\u044c \u0441\u043e\u0441\u0442\u0430\u0432\u043b\u0435\u043d\u0430 \u0432 \u0441\u0442\u0438\u043b\u0438\u0441\u0442\u0438\u043a\u0435, \u0430\u043d\u0430\u043b\u043e\u0433\u0438\u0447\u043d\u043e\u0439 \u0420\u0438\u0441\u0443\u043d\u043a\u0443 1, \u043e\u0434\u043d\u0430\u043a\u043e \u044d\u0442\u043e \u043e\u0441\u0442\u0430\u0435\u0442\u0441\u044f \u043d\u0430 \u0432\u0430\u0448\u0435 \u0443\u0441\u043c\u043e\u0442\u0440\u0435\u043d\u0438\u0435. \u041c\u0443\u0436\u0447\u0438\u043d\u044b \u043e\u0431\u043e\u0437\u043d\u0430\u0447\u0430\u044e\u0442\u0441\u044f \u043a\u0432\u0430\u0434\u0440\u0430\u0442\u043e\u043c, \u0436\u0435\u043d\u0449\u0438\u043d\u044b \u2014 \u043a\u0440\u0443\u0433\u043e\u043c, \u0431\u0440\u0430\u043a \u2014 \u0433\u043e\u0440\u0438\u0437\u043e\u043d\u0442\u0430\u043b\u044c\u043d\u043e\u0439 \u043b\u0438\u043d\u0438\u0435\u0439, \u0440\u0435\u0431\u0435\u043d\u043e\u043a \u2014 \u0432\u0435\u0440\u0442\u0438\u043a\u0430\u043b\u044c\u043d\u043e\u0439 \u043b\u0438\u043d\u0438\u0435\u0439, \u043d\u0435\u0441\u043a\u043e\u043b\u044c\u043a\u043e \u0434\u0435\u0442\u0435\u0439 \u2014 \u0433\u043e\u0440\u0438\u0437\u043e\u043d\u0442\u0430\u043b\u044c\u043d\u044b\u043c \u0440\u0430\u0437\u0432\u0435\u0442\u0432\u043b\u0435\u043d\u0438\u0435\u043c \u0432\u0435\u0440\u0442\u0438\u043a\u0430\u043b\u044c\u043d\u043e\u0439 \u043b\u0438\u043d\u0438\u0438 (\u0432 \u0432\u0438\u0434\u0435 \u0431\u0443\u043a\u0432\u044b \u041f). \u041f\u043e\u0434\u0440\u043e\u0431\u043d\u0435\u0435 \u043f\u0440\u043e \u044d\u0442\u0438 \u043e\u0431\u043e\u0437\u043d\u0430\u0447\u0435\u043d\u0438\u044f \u043c\u043e\u0436\u043d\u043e \u043f\u043e\u0447\u0438\u0442\u0430\u0442\u044c <a href=\"https:\/\/www.khanacademy.org\/science\/high-school-biology\/hs-classical-genetics\/hs-pedigrees\/a\/hs-pedigrees-review\">\u0437\u0434\u0435\u0441\u044c<\/a>.<\/p>\n<p>  \u041a\u0430\u043a \u043c\u044b \u043f\u0438\u0441\u0430\u043b\u0438 \u0432\u044b\u0448\u0435, kinship \u043a\u043e\u044d\u0444\u0444\u0438\u0446\u0438\u0435\u043d\u0442\u044b \u043d\u0435\u00a0\u043c\u043e\u0433\u0443\u0442 \u043e\u0434\u043d\u043e\u0437\u043d\u0430\u0447\u043d\u043e \u043e\u0445\u0430\u0440\u0430\u043a\u0442\u0435\u0440\u0438\u0437\u043e\u0432\u0430\u0442\u044c \u0440\u043e\u0434\u0441\u0442\u0432\u043e \u0442\u043e\u0433\u043e \u0438\u043b\u0438 \u0438\u043d\u043e\u0433\u043e \u043f\u043e\u0440\u044f\u0434\u043a\u0430: \u043e\u0434\u0438\u043d\u0430\u043a\u043e\u0432\u044b\u0435 kinship \u043a\u043e\u044d\u0444\u0444\u0438\u0446\u0438\u0435\u043d\u0442\u044b \u043f\u043e\u043b\u0443\u0447\u0430\u044e\u0442\u0441\u044f \u043f\u0440\u0438 \u0441\u0440\u0430\u0432\u043d\u0435\u043d\u0438\u0438 \u043f\u0430\u0440 \u0440\u043e\u0434\u0438\u0442\u0435\u043b\u044c \u2014 \u0440\u0435\u0431\u0435\u043d\u043e\u043a \u0438\u00a0\u0431\u0440\u0430\u0442 \u2014 \u0441\u0435\u0441\u0442\u0440\u0430 (\u0440\u043e\u0434\u0441\u0442\u0432\u043e \u043f\u0435\u0440\u0432\u043e\u0433\u043e \u043f\u043e\u0440\u044f\u0434\u043a\u0430). \u041f\u0440\u0438 \u043d\u0435\u0432\u043e\u0437\u043c\u043e\u0436\u043d\u043e\u0441\u0442\u0438 \u0443\u0441\u0442\u0430\u043d\u043e\u0432\u0438\u0442\u044c \u0445\u0430\u0440\u0430\u043a\u0442\u0435\u0440 \u0440\u043e\u0434\u0441\u0442\u0432\u0435\u043d\u043d\u043e\u0439 \u0441\u0432\u044f\u0437\u0438, \u0443\u043a\u0430\u0436\u0438\u0442\u0435 \u043b\u044e\u0431\u0443\u044e \u0438\u0437\u00a0\u0432\u043e\u0437\u043c\u043e\u0436\u043d\u044b\u0445. \u041e\u0431\u0440\u0430\u0442\u0438\u0442\u0435 \u0432\u043d\u0438\u043c\u0430\u043d\u0438\u0435, \u0447\u0442\u043e \u043e\u0431\u0440\u0430\u0437\u0446\u044b \u0432\u00a0\u0442\u0435\u0441\u0442\u043e\u0432\u043e\u043c \u0434\u0430\u0442\u0430\u0441\u0435\u0442\u0435 \u0438\u043c\u0435\u044e\u0442 \u043e\u0442\u043b\u0438\u0447\u043d\u044b\u0435 \u043e\u0442\u00a0\u0438\u0441\u043f\u043e\u043b\u044c\u0437\u0443\u0435\u043c\u044b\u0445 \u0432\u00a0\u0434\u0430\u0442\u0430\u0441\u0435\u0442\u0435 \u0434\u043b\u044f \u043e\u0431\u0443\u0447\u0435\u043d\u0438\u044f \u0438\u0434\u0435\u043d\u0442\u0438\u0444\u0438\u043a\u0430\u0442\u043e\u0440\u044b.<\/p>\n<p>  \u041e\u0442\u0432\u0435\u0442\u044b \u043f\u0440\u0438\u0441\u044b\u043b\u0430\u0439\u0442\u0435 \u043d\u0430\u00a0\u043f\u043e\u0447\u0442\u0443 <a href=\"mailto:wgs@atlas.ru\">wgs@atlas.ru<\/a> \u0434\u043e\u00a026\u00a0\u0434\u0435\u043a\u0430\u0431\u0440\u044f \u0434\u043e\u00a023:59. \u0415\u0449\u0435 \u0434\u0432\u0435 \u0437\u0430\u0434\u0430\u0447\u0438 \u0431\u0443\u0434\u0443\u0442 \u0441\u043a\u043e\u0440\u043e \u043e\u043f\u0443\u0431\u043b\u0438\u043a\u043e\u0432\u0430\u043d\u044b, \u0430\u00a0\u0438\u0442\u043e\u0433\u043e\u0432\u044b\u0435 \u0440\u0435\u0437\u0443\u043b\u044c\u0442\u0430\u0442\u044b \u043f\u043e\u00a0\u0437\u0430\u0434\u0430\u0447\u0430\u043c \u043f\u043e\u044f\u0432\u044f\u0442\u0441\u044f 28\u00a0\u0434\u0435\u043a\u0430\u0431\u0440\u044f. \u041f\u043e\u0431\u0435\u0434\u0438\u0442\u0435\u043b\u044c \u043f\u043e\u043b\u0443\u0447\u0438\u0442 \u0442\u0435\u0441\u0442 \u041f\u043e\u043b\u043d\u044b\u0439 \u0433\u0435\u043d\u043e\u043c, \u0430\u00a0\u0432\u0442\u043e\u0440\u043e\u0435 \u0438\u00a0\u0442\u0440\u0435\u0442\u044c\u0435 \u043c\u0435\u0441\u0442\u0430\u00a0\u2014 \u0433\u0435\u043d\u0435\u0442\u0438\u0447\u0435\u0441\u043a\u0438\u0439 \u0442\u0435\u0441\u0442 \u00ab\u0410\u0442\u043b\u0430\u0441\u00bb. \u0422\u0430\u043a\u0436\u0435 \u0431\u0443\u0434\u0443\u0442 \u0441\u043f\u0435\u0446\u0438\u0430\u043b\u044c\u043d\u044b\u0435 \u043f\u0440\u0438\u0437\u044b \u043e\u0442\u00a0<a href=\"https:\/\/cloud.yandex.ru\/\">\u042f\u043d\u0434\u0435\u043a\u0441.\u041e\u0431\u043b\u0430\u043a\u043e<\/a>. \u0411\u044b\u0432\u0448\u0438\u0435 \u0438\u00a0\u043d\u0430\u0441\u0442\u043e\u044f\u0449\u0438\u0435 \u0441\u043e\u0442\u0440\u0443\u0434\u043d\u0438\u043a\u0438 \u0410\u0442\u043b\u0430\u0441\u0430 \u0432\u00a0\u043a\u043e\u043d\u043a\u0443\u0440\u0441\u0435 \u043d\u0435\u00a0\u0443\u0447\u0430\u0441\u0442\u0432\u0443\u044e\u0442 \ud83d\ude09<\/div>\n<p>               <script class=\"js-mediator-script\">!function(e){function t(t,n){if(!(n in e)){for(var r,a=e.document,i=a.scripts,o=i.length;o--;)if(-1!==i[o].src.indexOf(t)){r=i[o];break}if(!r){r=a.createElement(\"script\"),r.type=\"text\/javascript\",r.async=!0,r.defer=!0,r.src=t,r.charset=\"UTF-8\";var d=function(){var e=a.getElementsByTagName(\"script\")[0];e.parentNode.insertBefore(r,e)};\"[object Opera]\"==e.opera?a.addEventListener?a.addEventListener(\"DOMContentLoaded\",d,!1):e.attachEvent(\"onload\",d):d() } } }t(\"\/\/mediator.mail.ru\/script\/2820404\/\",\"_mediator\")}(window);<\/script>      <br \/> \u0441\u0441\u044b\u043b\u043a\u0430 \u043d\u0430 \u043e\u0440\u0438\u0433\u0438\u043d\u0430\u043b \u0441\u0442\u0430\u0442\u044c\u0438 <a href=\"https:\/\/habr.com\/ru\/company\/atlasbiomed\/blog\/480954\/\"> https:\/\/habr.com\/ru\/company\/atlasbiomed\/blog\/480954\/<\/a><\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"\n<div class=\"post__text post__text-html js-mediator-article\" id=\"post-content-body\" data-io-article-url=\"https:\/\/habr.com\/ru\/company\/atlasbiomed\/blog\/480954\/\">\u0412\u00a0\u043f\u0440\u0435\u0434\u044b\u0434\u0443\u0449\u0435\u0439 \u043f\u043e\u0434\u0440\u043e\u0431\u043d\u043e\u0439 <a href=\"https:\/\/habr.com\/ru\/company\/atlasbiomed\/blog\/479602\/\">\u0441\u0442\u0430\u0442\u044c\u0435<\/a> \u043f\u0440\u043e <a href=\"https:\/\/atlas.ru\/wgs\">\u041f\u043e\u043b\u043d\u044b\u0439 \u0433\u0435\u043d\u043e\u043c<\/a> \u043c\u044b\u00a0\u043e\u0431\u0435\u0449\u0430\u043b\u0438 \u043e\u043f\u0443\u0431\u043b\u0438\u043a\u043e\u0432\u0430\u0442\u044c \u0442\u0440\u0438 \u0437\u0430\u0434\u0430\u0447\u0438 \u0438\u00a0\u043f\u043e\u0434\u0430\u0440\u0438\u0442\u044c \u0442\u0435\u0441\u0442 \u0442\u043e\u043c\u0443, \u043a\u0442\u043e \u043f\u0435\u0440\u0432\u044b\u043c \u0440\u0435\u0448\u0438\u0442 \u0432\u0441\u0435 \u0442\u0440\u0438 \u043f\u0440\u0430\u0432\u0438\u043b\u044c\u043d\u043e. \u0417\u0430\u043e\u0434\u043d\u043e \u0432\u00a0\u044d\u0442\u0438\u0445 \u0437\u0430\u0434\u0430\u0447\u0430\u0445 \u043c\u044b\u00a0\u0434\u0430\u0435\u043c \u043f\u0440\u0438\u043c\u0435\u0440\u044b, \u043a\u0430\u043a \u043c\u043e\u0436\u043d\u043e \u0440\u0430\u0431\u043e\u0442\u0430\u0442\u044c \u0441\u00a0\u0433\u0435\u043d\u0435\u0442\u0438\u0447\u0435\u0441\u043a\u0438\u043c\u0438 \u0434\u0430\u043d\u043d\u044b\u043c\u0438. \u0421\u0435\u0433\u043e\u0434\u043d\u044f \u043f\u0443\u0431\u043b\u0438\u043a\u0443\u0435\u043c \u043f\u0435\u0440\u0432\u0443\u044e.<\/p>\n<p>  <img decoding=\"async\" src=\"https:\/\/habrastorage.org\/webt\/qd\/mz\/ye\/qdmzye9a9sdyp82atstpktqrnu4.png\">  <\/p>\n","protected":false},"author":1,"featured_media":0,"comment_status":"open","ping_status":"open","sticky":false,"template":"","format":"standard","meta":{"footnotes":""},"categories":[],"tags":[],"class_list":["post-295996","post","type-post","status-publish","format-standard","hentry"],"_links":{"self":[{"href":"https:\/\/savepearlharbor.com\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/posts\/295996","targetHints":{"allow":["GET"]}}],"collection":[{"href":"https:\/\/savepearlharbor.com\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/posts"}],"about":[{"href":"https:\/\/savepearlharbor.com\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/types\/post"}],"author":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/savepearlharbor.com\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/users\/1"}],"replies":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/savepearlharbor.com\/index.php?rest_route=%2Fwp%2Fv2%2Fcomments&post=295996"}],"version-history":[{"count":0,"href":"https:\/\/savepearlharbor.com\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/posts\/295996\/revisions"}],"wp:attachment":[{"href":"https:\/\/savepearlharbor.com\/index.php?rest_route=%2Fwp%2Fv2%2Fmedia&parent=295996"}],"wp:term":[{"taxonomy":"category","embeddable":true,"href":"https:\/\/savepearlharbor.com\/index.php?rest_route=%2Fwp%2Fv2%2Fcategories&post=295996"},{"taxonomy":"post_tag","embeddable":true,"href":"https:\/\/savepearlharbor.com\/index.php?rest_route=%2Fwp%2Fv2%2Ftags&post=295996"}],"curies":[{"name":"wp","href":"https:\/\/api.w.org\/{rel}","templated":true}]}}