{"id":445380,"date":"2025-01-19T03:00:21","date_gmt":"2025-01-19T03:00:21","guid":{"rendered":"http:\/\/savepearlharbor.com\/?p=445380"},"modified":"-0001-11-30T00:00:00","modified_gmt":"2025-01-19T03:00:21","slug":"","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/savepearlharbor.com\/?p=445380","title":{"rendered":"\u0422\u0440\u0430\u043d\u0441\u043a\u0440\u0438\u043f\u0442\u043e\u043c\u043d\u044b\u0439 \u0430\u043d\u0430\u043b\u0438\u0437: \u043a\u0430\u043a \u043f\u043e\u0441\u0447\u0438\u0442\u0430\u0442\u044c \u0433\u0435\u043d\u044b?<\/span>"},"content":{"rendered":"
<\/div>\n
\n
\n
\n
\n

\u0412\u0441\u0435 \u0437\u043d\u0430\u044e\u0442, \u0447\u0442\u043e \u043d\u0430\u0441\u043b\u0435\u0434\u0441\u0442\u0432\u0435\u043d\u043d\u0430\u044f \u0438\u043d\u0444\u043e\u0440\u043c\u0430\u0446\u0438\u044f \u0437\u0430\u043a\u043e\u0434\u0438\u0440\u043e\u0432\u0430\u043d\u0430 \u0432 \u0414\u041d\u041a. \u041d\u043e \u043c\u0430\u043b\u043e \u043a\u0442\u043e \u0437\u0430\u0434\u0443\u043c\u044b\u0432\u0430\u0435\u0442\u0441\u044f \u043e \u0442\u043e\u043c, \u043a\u0430\u043a \u044d\u0442\u0430 \u0438\u043d\u0444\u043e\u0440\u043c\u0430\u0446\u0438\u044f \u0440\u0435\u0430\u043b\u0438\u0437\u0443\u0435\u0442\u0441\u044f \u0432\u043d\u0443\u0442\u0440\u0438 \u043d\u0430\u0441. \u041a\u0430\u043a \u0438\u043d\u0444\u043e\u0440\u043c\u0430\u0446\u0438\u044f \u0441 \u043e\u0434\u043d\u0438\u0445 \u043c\u043e\u043b\u0435\u043a\u0443\u043b \u043f\u0435\u0440\u0435\u0434\u0430\u0435\u0442\u0441\u044f \u043d\u0430 \u0434\u0440\u0443\u0433\u0438\u0435? \u0427\u0442\u043e \u043a\u0430\u0447\u0435\u0441\u0442\u0432\u0435\u043d\u043d\u043e\u0435 \u0438 \u043a\u043e\u043b\u0438\u0447\u0435\u0441\u0442\u0432\u0435\u043d\u043d\u043e\u0435 \u0441\u043e\u043e\u0442\u043d\u043e\u0448\u0435\u043d\u0438\u0435 \u0433\u0435\u043d\u043e\u0432 \u0432 \u0434\u0430\u043d\u043d\u044b\u0439 \u043c\u043e\u043c\u0435\u043d\u0442 \u043c\u043e\u0436\u0435\u0442 \u0441\u043a\u0430\u0437\u0430\u0442\u044c \u043e \u0441\u043e\u0441\u0442\u043e\u044f\u043d\u0438\u0438 \u043d\u0430\u0448\u0435\u0433\u043e \u043e\u0440\u0433\u0430\u043d\u0438\u0437\u043c\u0430? \u0421\u0435\u0439\u0447\u0430\u0441 \u043f\u043e\u043f\u0440\u043e\u0431\u0443\u0435\u043c \u0440\u0430\u0437\u043e\u0431\u0440\u0430\u0442\u044c\u0441\u044f, \u043a\u0430\u043a \u0441\u0447\u0438\u0442\u0430\u044e\u0442 \u0433\u0435\u043d\u044b, \u0438 \u0447\u0442\u043e \u044d\u0442\u043e \u0434\u0430\u0435\u0442. <\/p>\n

\"<\/p>\n
\u0420\u041d\u041a-\u043f\u043e\u043b\u0438\u043c\u0435\u0440\u0430\u0437\u0430 \u0441\u0447\u0438\u0442\u044b\u0432\u0430\u0435\u0442 \u0414\u041d\u041a \u0438 \u0441\u0438\u043d\u0442\u0435\u0437\u0438\u0440\u0443\u0435\u0442 \u0420\u041d\u041a \u0432 \u0445\u043e\u0434\u0435 \u0442\u0440\u0430\u043d\u0441\u043a\u0440\u0438\u043f\u0446\u0438\u0438.<\/figcaption><\/div>\n<\/figure>\n

\u0427\u0442\u043e \u0434\u0430\u0435\u0442 \u0441\u0435\u043a\u0432\u0435\u043d\u0438\u0440\u043e\u0432\u0430\u043d\u0438\u0435 \u0420\u041d\u041a?<\/h3>\n

\u041d\u0430 Habr \u0443\u0436\u0435 \u043f\u0440\u0438\u0441\u0443\u0442\u0441\u0442\u0432\u0443\u044e\u0442 \u0441\u0442\u0430\u0442\u044c\u0438, \u043a\u043e\u0442\u043e\u0440\u044b\u0435 \u0440\u0430\u0441\u0441\u043a\u0430\u0437\u044b\u0432\u0430\u044e\u0442 \u043e \u0442\u043e\u043c, \u043a\u0430\u043a\u0438\u0435 \u0438\u043d\u0441\u0442\u0440\u0443\u043c\u0435\u043d\u0442\u044b \u043f\u0440\u0438\u043c\u0435\u043d\u044f\u044e\u0442\u0441\u044f \u0432 \u0431\u0438\u043e\u0438\u043d\u0444\u043e\u0440\u043c\u0430\u0442\u0438\u043a\u0435 \u0434\u043b\u044f \u0440\u0435\u0448\u0435\u043d\u0438\u044f \u043d\u0430\u0443\u0447\u043d\u044b\u0445 \u0437\u0430\u0434\u0430\u0447 \u0432 \u0431\u0438\u043e\u043b\u043e\u0433\u0438\u0438. \u0422\u0430\u043a, \u043d\u0430\u043f\u0440\u0438\u043c\u0435\u0440, \u0435\u0441\u0442\u044c \u0434\u043e\u0441\u0442\u0430\u0442\u043e\u0447\u043d\u043e \u0438\u043d\u0442\u0435\u0440\u0435\u0441\u043d\u0430\u044f \u0441\u0435\u0440\u0438\u044f \u0441\u0442\u0430\u0442\u0435\u0439 \u00ab\u041f\u0440\u0430\u043a\u0442\u0438\u0447\u0435\u0441\u043a\u0430\u044f \u0431\u0438\u043e\u0438\u043d\u0444\u043e\u0440\u043c\u0430\u0442\u0438\u043a\u0430\u00bb. \u0417\u0434\u0435\u0441\u044c \u0445\u043e\u0442\u0435\u043b\u043e\u0441\u044c \u0431\u044b \u0437\u0430\u0442\u0440\u043e\u043d\u0443\u0442\u044c \u0446\u0435\u043b\u0435\u043d\u0430\u043f\u0440\u0430\u0432\u043b\u0435\u043d\u043d\u043e \u0442\u0430\u043a\u0443\u044e \u043e\u0431\u043b\u0430\u0441\u0442\u044c, \u043a\u0430\u043a \u0442\u0440\u0430\u043d\u0441\u043a\u0440\u0438\u043f\u0442\u043e\u043c\u0438\u043a\u0430 \u043d\u0430 \u044f\u0437\u044b\u043a\u0435 R. \u041c\u044b \u043f\u043e\u043f\u0440\u043e\u0431\u0443\u0435\u043c \u043c\u0430\u043a\u0441\u0438\u043c\u0430\u043b\u044c\u043d\u043e \u043d\u0430\u0433\u043b\u044f\u0434\u043d\u043e \u0438 \u0441 \u043f\u043e\u044f\u0441\u043d\u0435\u043d\u0438\u044f\u043c\u0438 \u0440\u0430\u0437\u043e\u0431\u0440\u0430\u0442\u044c \u0447\u0442\u043e \u0442\u0430\u043a\u043e\u0435 \u044d\u0442\u043e \u0437\u0430 \u0442\u0438\u043f \u0430\u043d\u0430\u043b\u0438\u0437\u0430, \u043a\u0430\u043a \u043f\u043e\u043b\u0443\u0447\u0430\u044e\u0442 \u0434\u0430\u043d\u043d\u044b\u0435 \u0438 \u0434\u043b\u044f \u043a\u0430\u043a\u0438\u0445 \u0446\u0435\u043b\u0435\u0439 \u043e\u043d \u043f\u0440\u0438\u043c\u0435\u043d\u044f\u0435\u0442\u0441\u044f. <\/p>\n

\u0421\u0435\u043a\u0432\u0435\u043d\u0438\u0440\u0443\u044f \u043e\u0431\u0440\u0430\u0437\u0435\u0446, \u043c\u044b \u043a\u0430\u043a \u0431\u044b \u0434\u0435\u043b\u0430\u0435\u043c \u00ab\u0444\u043e\u0442\u043e\u0441\u043d\u0438\u043c\u043e\u043a\u00bb \u0432\u0441\u0435\u0445 \u043f\u0440\u043e\u0446\u0435\u0441\u0441\u043e\u0432, \u043f\u0440\u043e\u0442\u0435\u043a\u0430\u044e\u0449\u0438\u0445 \u043d\u0430 \u0440\u0430\u0437\u043d\u044b\u0445 \u0441\u0442\u0430\u0434\u0438\u044f\u0445 \u043c\u0435\u0442\u0430\u0431\u043e\u043b\u0438\u0447\u0435\u0441\u043a\u0438\u0445 \u043a\u0430\u0441\u043a\u0430\u0434\u043e\u0432 \u0432\u043d\u0443\u0442\u0440\u0438 \u043a\u043b\u0435\u0442\u043a\u0438, \u0437\u0430\u0442\u0440\u0430\u0433\u0438\u0432\u0430\u044e\u0449\u0438\u0445 \u0431\u0435\u043b\u043a\u0438, \u0441\u0438\u043d\u0442\u0435\u0437\u0438\u0440\u0443\u0435\u043c\u044b\u0435 \u043d\u0430 \u043e\u0441\u043d\u043e\u0432\u0435 \u0433\u0435\u043d\u043e\u0432, \u0430 \u0437\u0430\u0442\u0435\u043c, \u0430\u043d\u0430\u043b\u0438\u0437\u0438\u0440\u0443\u044f \u043f\u043e\u043b\u0443\u0447\u0435\u043d\u043d\u0443\u044e \u0438\u043d\u0444\u043e\u0440\u043c\u0430\u0446\u0438\u044e, \u043c\u044b \u043c\u043e\u0436\u0435\u043c \u043f\u0440\u043e\u0432\u0435\u0440\u044f\u0442\u044c \u0433\u0438\u043f\u043e\u0442\u0435\u0437\u044b, \u043d\u0430\u0445\u043e\u0434\u0438\u0442\u044c \u043f\u0440\u0438\u0447\u0438\u043d\u044b \u0440\u0430\u0437\u0432\u0438\u0442\u0438\u044f \u0441\u0438\u043c\u043f\u0442\u043e\u043c\u043e\u0432 \u0440\u0430\u0437\u043b\u0438\u0447\u043d\u044b\u0445 \u0437\u0430\u0431\u043e\u043b\u0435\u0432\u0430\u043d\u0438\u0439, \u0438\u0441\u0441\u043b\u0435\u0434\u043e\u0432\u0430\u0442\u044c \u043c\u043e\u043b\u0435\u043a\u0443\u043b\u044f\u0440\u043d\u044b\u0435 \u043c\u0435\u0445\u0430\u043d\u0438\u0437\u043c\u044b, \u0441\u0432\u044f\u0437\u0430\u043d\u043d\u044b\u0435 \u0441 \u043e\u0431\u043e\u043d\u044f\u043d\u0438\u0435\u043c, \u0432\u043e\u0441\u043f\u0440\u0438\u044f\u0442\u0438\u0435\u043c \u0432\u043a\u0443\u0441\u0430 \u0438 \u043c\u043d\u043e\u0433\u043e \u043a\u0430\u043a\u0438\u0445 \u0435\u0449\u0435<\/a>. \u0412\u0441\u0435 \u044d\u0442\u043e \u043f\u043e\u0437\u0432\u043e\u043b\u044f\u0435\u0442 \u043e\u0441\u0443\u0449\u0435\u0441\u0442\u0432\u0438\u0442\u044c \u0442\u0440\u0430\u043d\u0441\u043a\u0440\u0438\u043f\u0442\u043e\u043c\u043d\u044b\u0439 \u0430\u043d\u0430\u043b\u0438\u0437. \u041e\u0434\u043d\u0430\u043a\u043e, \u0442\u0430\u043a \u043a\u0430\u043a \u043e\u0431\u043b\u0430\u0441\u0442\u044c \u0441\u0442\u043e\u0438\u0442 \u043d\u0430 \u0441\u0442\u044b\u043a\u0435 \u0441 \u0431\u0438\u043e\u043b\u043e\u0433\u0438\u0435\u0439, \u0431\u0435\u0437 \u0435\u0435 \u0442\u0435\u0440\u043c\u0438\u043d\u043e\u0432 \u043d\u0438\u043a\u0443\u0434\u0430.<\/p>\n

\u0418\u0441\u0445\u043e\u0434\u044f \u0438\u0437 \u043c\u043e\u043b\u0435\u043a\u0443\u043b\u044f\u0440\u043d\u043e\u0439 \u0434\u043e\u0433\u043c\u044b, \u0438\u0437\u0432\u0435\u0441\u0442\u043d\u043e, \u0447\u0442\u043e \u043d\u0430\u0441\u043b\u0435\u0434\u0441\u0442\u0432\u0435\u043d\u043d\u0430\u044f \u0438\u043d\u0444\u043e\u0440\u043c\u0430\u0446\u0438\u044f \u0445\u0440\u0430\u043d\u0438\u0442\u0441\u044f \u0432 \u0432\u0438\u0434\u0435 \u0414\u041d\u041a. \u0412 \u0414\u041d\u041a \u0435\u0441\u0442\u044c \u043e\u0442\u0434\u0435\u043b\u044c\u043d\u044b\u0435 \u0444\u0440\u0430\u0433\u043c\u0435\u043d\u0442\u044b \u2014 \u0433\u0435\u043d\u044b, \u043a\u043e\u0442\u043e\u0440\u044b\u0435 \u044f\u0432\u043b\u044f\u044e\u0442\u0441\u044f \u043e\u0441\u043d\u043e\u0432\u043d\u043e\u0439 \u0434\u043b\u044f \u0441\u0438\u043d\u0442\u0435\u0437\u0430 \u0431\u0435\u043b\u043a\u043e\u0432. \u041f\u0440\u043e\u043c\u0435\u0436\u0443\u0442\u043e\u0447\u043d\u044b\u043c \u044d\u0442\u0430\u043f\u043e\u043c \u0441\u0438\u043d\u0442\u0435\u0437\u0430 \u044f\u0432\u043b\u044f\u0435\u0442\u0441\u044f \u043f\u0435\u0440\u0435\u043f\u0438\u0441\u044b\u0432\u0430\u043d\u0438\u0435 \u0441\u043e\u043e\u0442\u0432\u0435\u0442\u0441\u0442\u0432\u0443\u044e\u0449\u0438\u0445 \u0431\u0435\u043b\u043a\u0430\u043c \u0433\u0435\u043d\u043e\u0432 \u0432 \u0432\u0438\u0434\u0435 \u043c\u043e\u043b\u0435\u043a\u0443\u043b \u0420\u041d\u041a, \u043a\u043e\u0442\u043e\u0440\u044b\u0435 \u0438 \u0441\u0447\u0438\u0442\u044b\u0432\u0430\u044e\u0442\u0441\u044f \u0441\u0435\u043a\u0432\u0435\u043d\u0430\u0442\u043e\u0440\u043e\u043c. \u0422\u0430\u043a\u043e\u0439 \u043f\u0440\u043e\u0446\u0435\u0441\u0441, \u0433\u0434\u0435 \u0414\u041d\u041a, \u044f\u0432\u043b\u044f\u044e\u0449\u0435\u0435\u0441\u044f \u043f\u043e\u0441\u0442\u043e\u044f\u043d\u043d\u044b\u043c \u0445\u0440\u0430\u043d\u0438\u043b\u0438\u0449\u0435\u043c \u0433\u0435\u043d\u0435\u0442\u0438\u0447\u0435\u0441\u043a\u043e\u0439 \u0438\u043d\u0444\u043e\u0440\u043c\u0430\u0446\u0438\u0438, \u0432\u044b\u0441\u0442\u0443\u043f\u0430\u0435\u0442 \u043c\u0430\u0442\u0440\u0438\u0446\u0435\u0439 \u0434\u043b\u044f \u0441\u0438\u043d\u0442\u0435\u0437\u0430 \u0420\u041d\u041a, \u043d\u0430 \u043a\u043e\u0442\u043e\u0440\u043e\u0439, \u0432 \u0441\u0432\u043e\u044e \u043e\u0447\u0435\u0440\u0435\u0434\u044c, \u043f\u0440\u0438 \u043f\u043e\u043c\u043e\u0449\u0438 \u0440\u0438\u0431\u043e\u0441\u043e\u043c \u0441\u043e\u0431\u0438\u0440\u0430\u0435\u0442\u0441\u044f \u0431\u0435\u043b\u043e\u043a, \u0443\u043d\u0438\u0432\u0435\u0440\u0441\u0430\u043b\u0435\u043d \u0434\u043b\u044f \u0432\u0441\u0435\u0445 \u043a\u043b\u0435\u0442\u043e\u0447\u043d\u044b\u0445 \u043e\u0440\u0433\u0430\u043d\u0438\u0437\u043c\u043e\u0432. \u041f\u0440\u043e\u0446\u0435\u0441\u0441 \u0441\u0447\u0438\u0442\u044b\u0432\u0430\u043d\u0438\u044f \u0414\u041d\u041a \u0438 \u0437\u0430\u043f\u0438\u0441\u0438 \u0438\u043d\u0444\u043e\u0440\u043c\u0430\u0446\u0438\u0438 \u0432 \u0433\u0435\u043d\u0430\u0445 \u043f\u043e \u043f\u0440\u0438\u043d\u0446\u0438\u043f\u0443 \u043a\u043e\u043c\u043f\u043b\u0435\u043c\u0435\u043d\u0442\u0430\u0440\u043d\u043e\u0441\u0442\u0438 \u0432 \u0432\u0438\u0434\u0435 \u043c\u043e\u043b\u0435\u043a\u0443\u043b\u044b \u0438\u043d\u0444\u043e\u0440\u043c\u0430\u0446\u0438\u043e\u043d\u043d\u043e\u0439 \u0420\u041d\u041a (\u0438\u0420\u041d\u041a) \u043d\u043e\u0441\u0438\u0442 \u043d\u0430\u0437\u0432\u0430\u043d\u0438\u0435 \u00ab\u0442\u0440\u0430\u043d\u0441\u043a\u0440\u0438\u043f\u0446\u0438\u044f\u00bb, \u0430 \u0441\u043e\u0432\u043e\u043a\u0443\u043f\u043d\u043e\u0441\u0442\u044c \u0432\u0441\u0435\u0445 \u0442\u0430\u043a\u0438\u0445 \u0420\u041d\u041a \u0432 \u043a\u043b\u0435\u0442\u043a\u0435 — \u0442\u0440\u0430\u043d\u0441\u043a\u0440\u0438\u043f\u0442\u043e\u043c. \u041f\u0440\u043e\u0446\u0435\u0441\u0441, \u0432 \u0445\u043e\u0434\u0435 \u043a\u043e\u0442\u043e\u0440\u043e\u0433\u043e \u0441\u0447\u0438\u0442\u044b\u0432\u0430\u0435\u0442\u0441\u044f \u0438\u0420\u041d\u041a \u0438 \u043d\u0430 \u043d\u0435\u0439 \u0441\u0438\u043d\u0442\u0435\u0437\u0438\u0440\u0443\u0435\u0442\u0441\u044f \u0431\u0435\u043b\u043e\u043a, \u043d\u043e\u0441\u0438\u0442 \u043d\u0430\u0437\u0432\u0430\u043d\u0438\u0435 \u00ab\u0442\u0440\u0430\u043d\u0441\u043b\u044f\u0446\u0438\u044f\u00bb, \u0430 \u0441\u043e\u0432\u043e\u043a\u0443\u043f\u043d\u043e\u0441\u0442\u044c \u0431\u0435\u043b\u043a\u043e\u0432 — \u043f\u0440\u043e\u0442\u0435\u043e\u043c (\u041a\u0430\u0440\u0442\u0438\u043d\u043a\u0430 1). \u041e\u0447\u0435\u0432\u0438\u0434\u043d\u043e, \u0435\u0441\u043b\u0438 \u043d\u0430 \u0414\u041d\u041a \u0441\u0438\u043d\u0442\u0435\u0437\u0438\u0440\u043e\u0432\u0430\u043b\u0430\u0441\u044c \u0420\u041d\u041a, \u043a\u043e\u0442\u043e\u0440\u0430\u044f \u043a\u043e\u0434\u0438\u0440\u0443\u0435\u0442 \u0431\u0435\u043b\u043e\u043a, \u0442\u043e \u043d\u0430 \u043c\u0430\u0442\u0440\u0438\u0446\u0435 \u044d\u0442\u043e\u0439 \u0420\u041d\u041a \u0437\u0430\u0442\u0435\u043c \u0431\u0443\u0434\u0435\u0442 \u0441\u043e\u0431\u0440\u0430\u043d \u0438 \u0441\u0430\u043c \u0431\u0435\u043b\u043e\u043a. \u0418\u043d\u044b\u043c\u0438 \u0441\u043b\u043e\u0432\u0430\u043c\u0438, \u0441 \u043e\u043f\u0440\u0435\u0434\u0435\u043b\u0435\u043d\u043d\u044b\u043c\u0438 \u043e\u0433\u043e\u0432\u043e\u0440\u043a\u0430\u043c\u0438, \u043a\u043e\u043b\u0438\u0447\u0435\u0441\u0442\u0432\u043e \u0420\u041d\u041a \u043c\u043e\u0436\u0435\u0442 \u0441\u043a\u0430\u0437\u0430\u0442\u044c \u043d\u0430\u043c \u043e \u0442\u043e\u043c, \u0447\u0442\u043e \u00ab\u0445\u043e\u0447\u0435\u0442\u00bb \u0441\u0434\u0435\u043b\u0430\u0442\u044c \u043a\u043b\u0435\u0442\u043a\u0430, \u043a\u0430\u043a\u0438\u0435 \u0431\u0435\u043b\u043a\u0438 \u0441\u0438\u043d\u0442\u0435\u0437\u0438\u0440\u043e\u0432\u0430\u0442\u044c \u0438 \u0432 \u043a\u0430\u043a\u043e\u043c \u043a\u043e\u043b\u0438\u0447\u0435\u0441\u0442\u0432\u0435. \u0422\u0430\u043a, \u0435\u0441\u043b\u0438 \u043e\u043d\u0430 \u0441\u0438\u043d\u0442\u0435\u0437\u0438\u0440\u0443\u0435\u0442 \u0431\u0435\u043b\u043a\u0438, \u0441\u0432\u044f\u0437\u0430\u043d\u043d\u044b\u0435 \u0441 \u0431\u043e\u0440\u044c\u0431\u043e\u0439 \u0441 \u0440\u0430\u043a\u043e\u043c, \u043b\u043e\u0433\u0438\u0447\u043d\u043e \u043f\u0440\u0435\u0434\u043f\u043e\u043b\u043e\u0436\u0438\u0442\u044c, \u0447\u0442\u043e \u0432 \u043e\u0440\u0433\u0430\u043d\u0438\u0437\u043c\u0435 \u043f\u0440\u043e\u0438\u0441\u0445\u043e\u0434\u044f\u0442 \u0437\u043b\u043e\u043a\u0430\u0447\u0435\u0441\u0442\u0432\u0435\u043d\u043d\u044b\u0435 \u0438\u0437\u043c\u0435\u043d\u0435\u043d\u0438\u044f \u0438 \u043e\u043d \u0441\u043e\u0431\u0438\u0440\u0430\u0435\u0442\u0441\u044f \u0441 \u043d\u0438\u043c\u0438 \u0431\u043e\u0440\u043e\u0442\u044c\u0441\u044f. \u0418 \u0442\u0430\u043a \u0434\u0430\u043b\u0435\u0435. \u0417\u0434\u0435\u0441\u044c \u0435\u0441\u0442\u044c \u043f\u0440\u044f\u043c\u0430\u044f, \u043f\u0443\u0441\u0442\u044c \u0438 \u043d\u0435 100%, \u043a\u043e\u0440\u0440\u0435\u043b\u044f\u0446\u0438\u044f \u043c\u0435\u0436\u0434\u0443 \u043a\u043e\u043b\u0438\u0447\u0435\u0441\u0442\u0432\u043e\u043c \u043c\u043e\u043b\u0435\u043a\u0443\u043b \u0420\u041d\u041a \u0438 \u043a\u043e\u043b\u0438\u0447\u0435\u0441\u0442\u0432\u043e\u043c \u0431\u0435\u043b\u043a\u0430, \u043a\u043e\u0442\u043e\u0440\u043e\u0435 \u043e\u043d\u043e \u043a\u043e\u0434\u0438\u0440\u0443\u0435\u0442, \u0432\u043d\u0443\u0442\u0440\u0438 \u043a\u043b\u0435\u0442\u043a\u0438 \u0432 \u0434\u0430\u043d\u043d\u044b\u0439 \u043c\u043e\u043c\u0435\u043d\u0442.<\/p>\n

\"\u041a\u0430\u0440\u0442\u0438\u043d\u043a\u0430<\/p>\n
\u041a\u0430\u0440\u0442\u0438\u043d\u043a\u0430 1. \u041c\u043e\u043b\u0435\u043a\u0443\u043b\u044f\u0440\u043d\u0430\u044f \u0434\u043e\u0433\u043c\u0430, \u0441\u0445\u0435\u043c\u0430.<\/figcaption><\/div>\n<\/figure>\n

\u0422\u0440\u0430\u043d\u0441\u043a\u0440\u0438\u043f\u0442\u043e\u043c\u0438\u043a\u0430 \u0434\u0435\u043b\u0438\u0442\u0441\u044f \u043d\u0430 \u0434\u0432\u0430 \u0431\u043e\u043b\u044c\u0448\u0438\u0445 \u0440\u0430\u0437\u0434\u0435\u043b\u0430 \u2014 bulk RNA-seq \u0438 single-cell RNA-seq. \u0412 \u043d\u0430\u0437\u0432\u0430\u043d\u0438\u0438 \u043e\u0442\u0440\u0430\u0436\u0435\u043d\u0430 \u0438 \u0441\u0443\u0442\u044c \u0434\u0430\u043d\u043d\u044b\u0445 \u043c\u0435\u0442\u043e\u0434\u043e\u0432: bulk RNA-seq — \u044d\u0442\u043e \u0441\u0435\u043a\u0432\u0435\u043d\u0438\u0440\u043e\u0432\u0430\u043d\u0438\u0435 \u0442\u043a\u0430\u043d\u0438 \u0446\u0435\u043b\u0438\u043a\u043e\u043c, \u0442\u043e\u0433\u0434\u0430 \u043a\u0430\u043a single-cell RNA-seq — \u043a\u0430\u0436\u0434\u043e\u0439 \u043e\u0442\u0434\u0435\u043b\u044c\u043d\u043e\u0439 \u043a\u043b\u0435\u0442\u043a\u0438 \u0438 \u0441\u043e\u0445\u0440\u0430\u043d\u0435\u043d\u0438\u0435 \u0438\u043d\u0444\u043e\u0440\u043c\u0430\u0446\u0438\u0438 \u043e\u0431 \u044d\u043a\u0441\u043f\u0440\u0435\u0441\u0441\u0438\u0438. \u0417\u0434\u0435\u0441\u044c \u0431\u0443\u0434\u0435\u0442 \u043f\u043e\u0434\u0440\u043e\u0431\u043d\u043e \u043e\u0441\u0432\u0435\u0449\u0435\u043d \u043f\u0430\u0439\u043f\u043b\u0430\u0439\u043d \u0440\u0430\u0431\u043e\u0442\u044b \u0441 bulk RNA-seq.\u00a0 <\/p>\n

\u0427\u0442\u043e \u044d\u0442\u043e \u0432\u043e\u043e\u0431\u0449\u0435 \u0442\u0430\u043a\u043e\u0435? \u0424\u0430\u043a\u0442\u0438\u0447\u0435\u0441\u043a\u0438, \u043c\u044b \u0431\u0435\u0440\u0435\u043c \u0434\u043b\u044f \u0441\u0435\u043a\u0432\u0435\u043d\u0438\u0440\u043e\u0432\u0430\u043d\u0438\u044f \u0432\u0435\u0441\u044c \u043e\u0431\u0440\u0430\u0437\u0435\u0446 \u0442\u043a\u0430\u043d\u0438, \u0432\u0441\u044e \u0441\u043e\u0432\u043e\u043a\u0443\u043f\u043d\u043e\u0441\u0442\u044c \u043a\u043b\u0435\u0442\u043e\u043a, \u043c\u043e\u043b\u0435\u043a\u0443\u043b\u044b \u0420\u041d\u041a \u0437\u0430\u043f\u0438\u0441\u044b\u0432\u0430\u044e\u0442\u0441\u044f \u0432 \u0441\u0442\u0440\u043e\u043a\u043e\u0432\u043e\u043c \u0432\u0438\u0434\u0435 \u0444\u0440\u0430\u0433\u043c\u0435\u043d\u0442\u043e\u0432 \u043f\u043e 100-200 \u043d\u0443\u043a\u043b\u0435\u043e\u0442\u0438\u0434\u043e\u0432. \u0417\u0430\u0442\u0435\u043c \u043c\u044b \u0441\u043e\u0431\u0438\u0440\u0430\u0435\u043c \u0438\u0437 \u043d\u0438\u0445 \u0446\u0435\u043b\u043e\u0441\u0442\u043d\u044b\u0435 \u0420\u041d\u041a \u0438 \u0441\u0447\u0438\u0442\u0430\u0435\u043c \u044d\u043a\u0437\u0435\u043c\u043f\u043b\u044f\u0440\u044b \u043f\u043e\u0432\u0442\u043e\u0440\u044f\u044e\u0449\u0438\u0445\u0441\u044f \u0441\u0442\u0440\u043e\u043a. \u041f\u043e\u0442\u043e\u043c \u043e\u0431\u044a\u0435\u0434\u0438\u043d\u044f\u0435\u043c \u0432\u0441\u0435 \u043e\u0431\u0440\u0430\u0437\u0446\u044b \u0441 \u043f\u043e\u0441\u0447\u0438\u0442\u0430\u043d\u043d\u044b\u043c\u0438 \u0433\u0435\u043d\u0430\u043c\u0438 \u0432 \u043e\u0434\u043d\u0443 \u043c\u0430\u0442\u0440\u0438\u0446\u0443, \u043a\u043e\u043b\u0438\u0447\u0435\u0441\u0442\u0432\u043e \u0441\u0442\u043e\u043b\u0431\u0446\u043e\u0432 \u0432 \u043a\u043e\u0442\u043e\u0440\u043e\u0439 \u0440\u0430\u0432\u043d\u043e \u043a\u043e\u043b\u0438\u0447\u0435\u0441\u0442\u0432\u0443 \u043e\u0431\u0440\u0430\u0437\u0446\u043e\u0432, \u0430 \u0441\u0442\u0440\u043e\u043a \u2014 \u0433\u0435\u043d\u0430\u043c. \u0423 \u0447\u0435\u043b\u043e\u0432\u0435\u043a\u0430 \u0431\u0443\u0434\u0435\u0442 \u043e\u043a\u043e\u043b\u043e 40 \u0442\u044b\u0441. \u0441\u0442\u0440\u043e\u043a \u0432 \u043c\u0430\u0442\u0440\u0438\u0446\u0435.<\/p>\n

\u0412 \u0440\u0430\u043c\u043a\u0430\u0445 \u0442\u0440\u0430\u043d\u0441\u043a\u0440\u0438\u043f\u0442\u043e\u043c\u0438\u043a\u0438 \u0438\u0437\u043c\u0435\u0440\u044f\u0435\u0442\u0441\u044f \u0434\u0438\u0444\u0444\u0435\u0440\u0435\u043d\u0446\u0438\u0430\u043b\u044c\u043d\u0430\u044f \u044d\u043a\u0441\u043f\u0440\u0435\u0441\u0441\u0438\u044f \u0433\u0435\u043d\u043e\u0432. \u0422\u043e \u0435\u0441\u0442\u044c \u043d\u0430\u0445\u043e\u0434\u0438\u0442\u0441\u044f \u0440\u0430\u0437\u043d\u0438\u0446\u0430 \u0432 \u043a\u043e\u043b\u0438\u0447\u0435\u0441\u0442\u0432\u0435 \u043c\u043e\u043b\u0435\u043a\u0443\u043b \u0420\u041d\u041a \u0443 \u043a\u043e\u043d\u0442\u0440\u043e\u043b\u044f \u0438 \u044d\u043a\u0441\u043f\u0435\u0440\u0438\u043c\u0435\u043d\u0442\u0430, \u0438\u043b\u0438 \u0443 \u043e\u0434\u043d\u043e\u0433\u043e \u043e\u0431\u0440\u0430\u0437\u0446\u0430 \u043f\u043e \u0441\u0440\u0430\u0432\u043d\u0435\u043d\u0438\u044e \u0441 \u0434\u0440\u0443\u0433\u0438\u043c, \u0435\u0441\u043b\u0438, \u043d\u0430\u043f\u0440\u0438\u043c\u0435\u0440, \u0430\u043d\u0430\u043b\u0438\u0437\u0438\u0440\u0443\u0435\u0442\u0441\u044f \u0434\u0438\u043d\u0430\u043c\u0438\u043a\u0430 \u0437\u0430\u0431\u043e\u043b\u0435\u0432\u0430\u043d\u0438\u044f. \u041f\u0440\u0438 \u044d\u0442\u043e\u043c \u0438\u0437\u043c\u0435\u043d\u0435\u043d\u0438\u0435 \u044d\u043a\u0441\u043f\u0440\u0435\u0441\u0441\u0438\u0438 \u043e\u043f\u0438\u0441\u044b\u0432\u0430\u0435\u0442\u0441\u044f \u043b\u043e\u0433\u0430\u0440\u0438\u0444\u043c\u0438\u0447\u0435\u0441\u043a\u043e\u0439 \u0444\u0443\u043d\u043a\u0446\u0438\u0435\u0439, \u0438\u0437 \u0447\u0435\u0433\u043e \u0441\u043b\u0435\u0434\u0443\u0435\u0442, \u0447\u0442\u043e, \u043f\u0440\u0438 \u0435\u0433\u043e \u043e\u0442\u0440\u0438\u0446\u0430\u0442\u0435\u043b\u044c\u043d\u043e\u043c \u0437\u043d\u0430\u0447\u0435\u043d\u0438\u0438, \u043e\u0431\u0440\u0430\u0437\u0435\u0446 \u043f\u043e\u043a\u0430\u0437\u044b\u0432\u0430\u0435\u0442 \u0441\u043d\u0438\u0436\u0435\u043d\u0438\u0435 \u0441\u0438\u043d\u0442\u0435\u0437\u0430 \u0441\u043e\u043e\u0442\u0432\u0435\u0442\u0441\u0442\u0432\u0443\u044e\u0449\u0435\u0433\u043e \u0433\u0435\u043d\u0430, \u0430 \u043f\u0440\u0438 \u043f\u043e\u043b\u043e\u0436\u0438\u0442\u0435\u043b\u044c\u043d\u043e\u043c \u2014 \u043f\u043e\u0432\u044b\u0448\u0435\u043d\u0438\u0435. \u041f\u0440\u0438 \u044d\u0442\u043e\u043c bulk RNA-seq \u0434\u0430\u0435\u0442 \u0438\u043d\u0444\u043e\u0440\u043c\u0430\u0446\u0438\u044e \u043b\u0438\u0448\u044c \u043e \u0442\u043a\u0430\u043d\u0438 \u0438\u043b\u0438 \u043e\u0431\u0440\u0430\u0437\u0446\u0435 \u0432 \u0441\u0440\u0435\u0434\u043d\u0435\u043c, \u0445\u043e\u0442\u044f \u0442\u0430\u043a\u043e\u0439 \u0430\u043d\u0430\u043b\u0438\u0437 \u043c\u043e\u0436\u043d\u043e \u043f\u0440\u043e\u0432\u0435\u0441\u0442\u0438 \u0434\u0430\u0436\u0435 \u043d\u0430 \u0441\u043b\u0430\u0431\u043e\u043c \u043d\u043e\u0443\u0442\u0431\u0443\u043a\u0435, \u0442\u043e\u0433\u0434\u0430 \u043a\u0430\u043a single-cell \u043e\u0445\u0432\u0430\u0442\u044b\u0432\u0430\u0435\u0442 \u0434\u0430\u043d\u043d\u044b\u0435 \u043e \u043a\u0430\u0436\u0434\u043e\u0439 \u0438\u043d\u0434\u0438\u0432\u0438\u0434\u0443\u0430\u043b\u044c\u043d\u043e\u0439 \u043a\u043b\u0435\u0442\u043a\u0435, \u043a\u043e\u0442\u043e\u0440\u044b\u0445 \u043c\u043e\u0433\u0443\u0442 \u0431\u044b\u0442\u044c \u0442\u044b\u0441\u044f\u0447\u0438. \u041a\u043e\u043b\u0438\u0447\u0435\u0441\u0442\u0432\u043e \u0438\u043d\u0444\u043e\u0440\u043c\u0430\u0446\u0438\u0438 \u0431 \u043f\u043e\u043b\u0443\u0447\u0435\u043d\u043d\u043e\u0439 \u0432 \u0445\u043e\u0434\u0435 single-cell \u0430\u043d\u0430\u043b\u0438\u0437\u0430 \u0442\u0430\u043a\u0436\u0435 \u0432 \u0442\u044b\u0441\u044f\u0447\u0438 \u0440\u0430\u0437 \u0431\u043e\u043b\u044c\u0448\u0435, \u0438 \u043f\u043e\u0442\u043e\u043c\u0443 \u0442\u0430\u043a\u043e\u0439 \u0430\u043d\u0430\u043b\u0438\u0437 \u043f\u0440\u0435\u0434\u043f\u043e\u0447\u0442\u0438\u0442\u0435\u043b\u044c\u043d\u043e \u043f\u0440\u043e\u0432\u043e\u0434\u0438\u0442\u044c \u043d\u0430 \u0441\u0435\u0440\u0432\u0435\u0440\u0435, \u043b\u0438\u0431\u043e, \u0435\u0441\u043b\u0438 \u0434\u0430\u043d\u043d\u044b\u0445 \u043d\u0435 \u043e\u0447\u0435\u043d\u044c \u043c\u043d\u043e\u0433\u043e (\u043d\u0430\u043f\u0440\u0438\u043c\u0435\u0440, \u043d\u0435\u0441\u043a\u043e\u043b\u044c\u043a\u043e \u0441\u043e\u0442\u0435\u043d \u043a\u043b\u0435\u0442\u043e\u043a) — \u043d\u0430 \u043c\u043e\u0449\u043d\u043e\u043c \u043a\u043e\u043c\u043f\u044c\u044e\u0442\u0435\u0440\u0435.<\/p>\n

\u041a\u0440\u0430\u0442\u043a\u043e \u0440\u0435\u0437\u044e\u043c\u0438\u0440\u0443\u0435\u043c \u043d\u0435\u043e\u0431\u0445\u043e\u0434\u0438\u043c\u0443\u044e \u0442\u0435\u0440\u043c\u0438\u043d\u043e\u043b\u043e\u0433\u0438\u044e<\/h3>\n

\u0425\u043e\u0442\u044c \u043c\u044b \u0438 \u0431\u0443\u0434\u0435\u043c \u0433\u043e\u0432\u043e\u0440\u0438\u0442\u044c \u0432 \u043e\u0441\u043d\u043e\u0432\u043d\u043e\u043c \u043e \u0442\u043e\u043c, \u00ab\u043a\u0430\u043a \u0434\u0435\u043b\u0430\u0442\u044c?\u00bb \u0441 \u0442\u043e\u0447\u043a\u0438 \u0437\u0440\u0435\u043d\u0438\u044f \u043d\u0430\u043f\u0438\u0441\u0430\u043d\u0438\u044f \u043a\u043e\u0434\u0430 \u0438 \u0432\u0438\u0437\u0443\u0430\u043b\u0438\u0437\u0430\u0446\u0438\u0439, \u043d\u0443\u0436\u043d\u043e \u0432\u0441\u0451 \u0436\u0435 \u043f\u043e\u044f\u0441\u043d\u0438\u0442\u044c \u043d\u0435\u043a\u043e\u0442\u043e\u0440\u044b\u0435 \u0431\u0438\u043e\u043b\u043e\u0433\u0438\u0447\u0435\u0441\u043a\u0438\u0435 \u0442\u0435\u0440\u043c\u0438\u043d\u044b, \u0447\u0442\u043e\u0431\u044b \u043d\u0435 \u0442\u0435\u0440\u044f\u0442\u044c\u0441\u044f \u0432 \u0445\u043e\u0434\u0435 \u043f\u043e\u0432\u0435\u0441\u0442\u0432\u043e\u0432\u0430\u043d\u0438\u044f. \u0418\u0445 \u043d\u0435\u043c\u043d\u043e\u0433\u043e: <\/p>\n

    \n
  1. \n

    \u0421\u0435\u043a\u0432\u0435\u043d\u0438\u0440\u043e\u0432\u0430\u043d\u0438\u0435 \u2014 \u0444\u0430\u043a\u0442\u0438\u0447\u0435\u0441\u043a\u0438, \u0447\u0442\u0435\u043d\u0438\u0435 \u0433\u0435\u043d\u043e\u043c\u043d\u044b\u0445 \u0434\u0430\u043d\u043d\u044b\u0445 \u043e\u0431\u0440\u0430\u0437\u0446\u0430, \u043f\u0440\u0435\u0432\u0440\u0430\u0449\u0435\u043d\u0438\u0435 \u0431\u0438\u043e\u043b\u043e\u0433\u0438\u0447\u0435\u0441\u043a\u0438\u0445 \u043c\u043e\u043b\u0435\u043a\u0443\u043b \u0432 \u0441\u0442\u0440\u043e\u043a\u043e\u0432\u0443\u044e \u0438\u043d\u0444\u043e\u0440\u043c\u0430\u0446\u0438\u044e;<\/p>\n<\/li>\n

  2. \n

    RNA-seq \u2014 \u043a\u0430\u043a \u043d\u0438 \u0441\u0442\u0440\u0430\u043d\u043d\u043e, \u0441\u0435\u043a\u0432\u0435\u043d\u0438\u0440\u043e\u0432\u0430\u043d\u0438\u0435 \u0420\u041d\u041a;<\/p>\n<\/li>\n

  3. \n

    bulkRNA-seq \u2014 \u0441\u0435\u043a\u0432\u0435\u043d\u0438\u0440\u043e\u0432\u0430\u043d\u0438\u0435 \u043e\u0431\u0440\u0430\u0437\u0446\u0430 \u0442\u043a\u0430\u043d\u0438 \u0446\u0435\u043b\u0438\u043a\u043e\u043c, \u0431\u0435\u0437 \u0440\u0430\u0437\u0434\u0435\u043b\u0435\u043d\u0438\u044f \u043d\u0430 \u043e\u0442\u0434\u0435\u043b\u044c\u043d\u044b\u0435 \u043a\u043b\u0435\u0442\u043a\u0438. \u041c\u0435\u043d\u0435\u0435 \u0432\u044b\u0447\u0438\u0441\u043b\u0438\u0442\u0435\u043b\u044c\u043d\u043e \u0437\u0430\u0442\u0440\u0430\u0442\u0435\u043d, \u0442.\u043a. \u0443 \u043d\u0430\u0441 \u0435\u0441\u0442\u044c \u043e\u0434\u0438\u043d \u044d\u043a\u0437\u0435\u043c\u043f\u043b\u044f\u0440 \u043c\u0430\u0442\u0440\u0438\u0446\u044b \u044d\u043a\u0441\u043f\u0440\u0435\u0441\u0441\u0438\u0438. \u0424\u0430\u043a\u0442\u0438\u0447\u0435\u0441\u043a\u0438, \u00ab\u0441\u0440\u0435\u0434\u043d\u0435\u0435 \u043f\u043e \u0431\u043e\u043b\u044c\u043d\u0438\u0446\u0435\u00bb \u043a\u043e\u043b\u0438\u0447\u0435\u0441\u0442\u0432\u043e \u0433\u0435\u043d\u043e\u0432 \u0434\u043b\u044f \u0432\u0441\u0435\u0433\u043e \u043e\u0431\u0440\u0430\u0437\u0446\u0430;<\/p>\n<\/li>\n

  4. \n

    \u042d\u043a\u0441\u043f\u0440\u0435\u0441\u0441\u0438\u044f \u2014 \u043f\u0440\u043e\u0446\u0435\u0441\u0441 \u043f\u0440\u0435\u0432\u0440\u0430\u0449\u0435\u043d\u0438\u044f \u0438\u043d\u0444\u043e\u0440\u043c\u0430\u0446\u0438\u0438 \u0432 \u0431\u0435\u043b\u043a\u0438 \u0432\u043d\u0443\u0442\u0440\u0438 \u043a\u043b\u0435\u0442\u043a\u0438. \u0412 \u043d\u0430\u0448\u0435\u043c \u0441\u043b\u0443\u0447\u0430\u0435, \u0440\u0435\u0447\u044c \u0438\u0434\u0435\u0442 \u0438\u043c\u0435\u043d\u043d\u043e \u043e \u0442\u0440\u0430\u043d\u0441\u043a\u0440\u0438\u043f\u0446\u0438\u0438, \u0430 \u043a\u043e\u043b\u0438\u0447\u0435\u0441\u0442\u0432\u0435\u043d\u043d\u044b\u0439 \u0430\u043d\u0430\u043b\u0438\u0437 \u043f\u0440\u043e\u0432\u043e\u0434\u0438\u0442\u0441\u044f \u0434\u043b\u044f \u0420\u041d\u041a. \u041b\u044e\u0431\u043e\u0439 \u0441\u0442\u0438\u043c\u0443\u043b, \u043b\u044e\u0431\u043e\u0435 \u0432\u043e\u0437\u0434\u0435\u0439\u0441\u0442\u0432\u0438\u0435 \u0438\u043b\u0438 \u043f\u0440\u043e\u0446\u0435\u0441\u0441 \u0440\u0435\u0433\u0443\u043b\u0438\u0440\u0443\u0435\u0442\u0441\u044f \u0431\u0435\u043b\u043a\u0430\u043c\u0438. \u042d\u043a\u0441\u043f\u0440\u0435\u0441\u0441\u0438\u044f \u0433\u0435\u043d\u043e\u0432, \u043a\u043e\u0434\u0438\u0440\u0443\u044e\u0449\u0438\u0445 \u0438\u0445 \u0441\u0442\u0440\u0443\u043a\u0442\u0443\u0440\u0443, \u043c\u0435\u043d\u044f\u0435\u0442\u0441\u044f \u0432 \u043e\u0442\u0432\u0435\u0442 \u043d\u0430 \u0442\u0430\u043a\u0438\u0435 \u0432\u043e\u0437\u0434\u0435\u0439\u0441\u0442\u0432\u0438\u044f;<\/p>\n<\/li>\n

  5. \n

    Single-cell RNA-seq \u2014 \u0442\u043e \u0436\u0435 \u0441\u0430\u043c\u043e\u0435, \u0442\u043e\u043b\u044c\u043a\u043e \u0434\u043b\u044f \u043a\u0430\u0436\u0434\u043e\u0439 \u043a\u043b\u0435\u0442\u043a\u0438 \u0435\u0441\u0442\u044c \u0438\u043d\u0444\u043e\u0440\u043c\u0430\u0446\u0438\u044f \u043e\u0431 \u044d\u043a\u0441\u043f\u0440\u0435\u0441\u0441\u0438\u0438. \u0424\u0430\u043a\u0442\u0438\u0447\u0435\u0441\u043a\u0438, \u043e\u0431\u044a\u0435\u043c \u0434\u0430\u043d\u043d\u044b\u0445 bulkRNA-seq \u0443\u043c\u043d\u043e\u0436\u0430\u0435\u0442\u0441\u044f \u043d\u0430 \u043a\u043e\u043b\u0438\u0447\u0435\u0441\u0442\u0432\u043e \u043a\u043b\u0435\u0442\u043e\u043a \u0432 \u043e\u0431\u0440\u0430\u0437\u0446\u0435;<\/p>\n<\/li>\n

  6. \n

    \u0414\u0438\u0444\u0444\u0435\u0440\u0435\u043d\u0446\u0438\u0430\u043b\u044c\u043d\u0430\u044f \u044d\u043a\u0441\u043f\u0440\u0435\u0441\u0441\u0438\u044f \u2014 \u043b\u043e\u0433\u0430\u0440\u0438\u0444\u043c\u0438\u0447\u0435\u0441\u043a\u0438\u0439 \u043f\u043e\u043a\u0430\u0437\u0430\u0442\u0435\u043b\u044c \u0438\u0437\u043c\u0435\u043d\u0435\u043d\u0438\u044f \u044d\u043a\u0441\u043f\u0440\u0435\u0441\u0441\u0438\u0438 \u0432 \u043e\u0431\u0440\u0430\u0437\u0446\u0435 \u043f\u043e \u0441\u0440\u0430\u0432\u043d\u0435\u043d\u0438\u044e \u0441 \u043a\u043e\u043d\u0442\u0440\u043e\u043b\u0435\u043c. \u041c\u043e\u0436\u0435\u0442 \u0431\u044b\u0442\u044c \u043a\u0430\u043a \u043e\u0442\u0440\u0438\u0446\u0430\u0442\u0435\u043b\u044c\u043d\u044b\u043c (\u044d\u043a\u0441\u043f\u0440\u0435\u0441\u0441\u0438\u044f \u0441\u043d\u0438\u0436\u0430\u0435\u0442\u0441\u044f), \u0442\u0430\u043a \u0438 \u043f\u043e\u043b\u043e\u0436\u0438\u0442\u0435\u043b\u044c\u043d\u044b\u043c;<\/p>\n<\/li>\n

  7. \n

    \u041f\u0440\u043e\u0447\u0442\u0435\u043d\u0438\u044f, \u043e\u043d\u0438 \u0436\u0435 «\u0440\u0438\u0434\u044b» (\u043e\u0442 «read») — \u043a\u043e\u0440\u043e\u0442\u043a\u0438\u0435 \u0444\u0440\u0430\u0433\u043c\u0435\u043d\u0442\u044b \u0420\u041d\u041a, \u043a\u043e\u0442\u043e\u0440\u044b\u0435 \u0437\u0430\u043f\u0438\u0441\u044b\u0432\u0430\u044e\u0442\u0441\u044f \u0432 FASTQ \u0444\u0430\u0439\u043b\u0430\u0445 \u0432 \u0432\u0438\u0434\u0435 4-\u0441\u0442\u0440\u043e\u0447\u043d\u044b\u0445 \u043f\u043e\u0441\u043b\u0435\u0434\u043e\u0432\u0430\u0442\u0435\u043b\u044c\u043d\u043e\u0441\u0442\u0435\u0439 \u0441\u0438\u043c\u0432\u043e\u043b\u043e\u0432 (\u0432 \u0441\u0442\u0430\u0442\u044c\u0435 \u0434\u0430\u043b\u0435\u0435 \u043f\u0440\u0438\u043c\u0435\u0440);<\/p>\n<\/li>\n

  8. \n

    \u0420\u0435\u0444\u0435\u0440\u0435\u043d\u0441 — \u044d\u0442\u0430\u043b\u043e\u043d, \u0437\u0430\u0440\u0430\u043d\u0435\u0435 \u0438\u0437\u0432\u0435\u0441\u0442\u043d\u044b\u0439 \u0433\u0435\u043d\u043e\u043c \u0438\u0441\u0441\u043b\u0435\u0434\u0443\u0435\u043c\u043e\u0433\u043e \u043e\u0440\u0433\u0430\u043d\u0438\u0437\u043c\u0430, \u0441 \u043a\u043e\u0442\u043e\u0440\u044b\u043c \u043f\u0440\u043e\u0438\u0441\u0445\u043e\u0434\u0438\u0442 \u0441\u0440\u0430\u0432\u043d\u0435\u043d\u0438\u0435, \u043d\u0430 \u043e\u0441\u043d\u043e\u0432\u0435 \u043a\u043e\u0442\u043e\u0440\u043e\u0433\u043e \u0438\u0437 \u0440\u0438\u0434\u043e\u0432 \u0441\u043e\u0431\u0438\u0440\u0430\u0435\u0442\u0441\u044f \u0443\u0436\u0435 \u0441\u0435\u043a\u0432\u0435\u043d\u0438\u0440\u043e\u0432\u0430\u043d\u043d\u044b\u0439 \u0433\u0435\u043d\u043e\u043c \u043f\u0443\u0442\u0435\u043c \u0441\u043e\u043f\u043e\u0441\u0442\u0430\u0432\u043b\u0435\u043d\u0438\u044f.<\/p>\n<\/li>\n<\/ol>\n

    \u0427\u0442\u043e \u0438\u0441\u043f\u043e\u043b\u044c\u0437\u0443\u044e\u0442 \u0434\u043b\u044f \u0430\u043d\u0430\u043b\u0438\u0437\u0430 \u044d\u043a\u0441\u043f\u0440\u0435\u0441\u0441\u0438\u0438?<\/h3>\n

    \u041e\u0441\u043d\u043e\u0432\u043d\u044b\u043c \u044f\u0437\u044b\u043a\u043e\u043c \u0432 \u0434\u0435\u043b\u0435 \u0430\u043d\u0430\u043b\u0438\u0437\u0430 \u0434\u0430\u043d\u043d\u044b\u0445 \u0434\u043e\u043b\u0433\u043e\u0435 \u0432\u0440\u0435\u043c\u044f \u0431\u044b\u043b R. \u041f\u0430\u043a\u0435\u0442\u044b, \u043a\u043e\u0442\u043e\u0440\u044b\u0435 \u043f\u043e\u043d\u0430\u0434\u043e\u0431\u044f\u0442\u0441\u044f:\u00a0 <\/p>\n

    \u0412\u0438\u0437\u0443\u0430\u043b\u0438\u0437\u0430\u0446\u0438\u044f:<\/em> gplots, ggplot2, plotly, ComplexHeatmap, EnhancedVolcano, RColorBrewer, circlize;<\/p>\n

    \u0420\u0430\u0431\u043e\u0442\u0430 \u0441 \u0438\u043d\u0444\u043e\u0440\u043c\u0430\u0446\u0438\u0435\u0439 \u043d\u0435\u043f\u043e\u0441\u0440\u0435\u0434\u0441\u0442\u0432\u0435\u043d\u043d\u043e:<\/em> org.Hs.eg.db, DESeq2, edgeR, ReactomePA, clusterProfiler.\u00a0<\/p>\n

    \u0414\u043b\u044f bulkRNA-seq \u0434\u0430\u043d\u043d\u044b\u0445 \u043e\u0431\u044b\u0447\u043d\u043e \u0442\u0440\u0435\u0431\u0443\u044e\u0442\u0441\u044f \u0441\u043e\u0432\u0441\u0435\u043c \u043d\u0435\u0431\u043e\u043b\u044c\u0448\u0438\u0435 \u0440\u0435\u0441\u0443\u0440\u0441\u044b \u2014 \u0434\u043e 16 \u0413\u0411 \u041e\u0417\u0423 \u0445\u0432\u0430\u0442\u0438\u0442 \u0434\u043b\u044f \u0431\u043e\u043b\u044c\u0448\u0438\u043d\u0441\u0442\u0432\u0430 \u043e\u043f\u0435\u0440\u0430\u0446\u0438\u0439. \u0414\u043b\u044f scRNA-seq \u0438\u0441\u043f\u043e\u043b\u044c\u0437\u0443\u044e\u0442 \u0441\u0435\u0440\u0432\u0435\u0440 \u0438\u043b\u0438 \u043a\u043b\u0430\u0441\u0442\u0435\u0440, \u0438 \u043f\u0430\u043a\u0435\u0442\u044b Seurat, Matrix, celldex, SingleR \u0438 \u0434\u0440\u0443\u0433\u0438\u0435. \u0415\u0441\u043b\u0438 \u043e\u0434\u043d\u0430 \u043c\u0430\u0442\u0440\u0438\u0446\u0430 bulkRNA-seq — \u044d\u0442\u043e \u043e\u043a\u043e\u043b\u043e 40 \u0442\u044b\u0441. \u0441\u0442\u0440\u043e\u043a (\u041a\u0430\u0440\u0442\u0438\u043d\u043a\u0430 2) \u0441 \u0434\u0435\u0441\u044f\u0442\u043a\u0430\u043c\u0438 \u0441\u0442\u043e\u043b\u0431\u0446\u043e\u0432, \u0442\u043e \u0434\u0430\u0436\u0435 \u043f\u0440\u043e\u0441\u0442\u043e \u0432\u0445\u043e\u0434\u043d\u044b\u0435 \u0434\u0430\u043d\u043d\u044b\u0435 scRNA-seq — \u0442\u0435 \u0436\u0435 \u0434\u0430\u043d\u043d\u044b\u0435, \u0443\u043c\u043d\u043e\u0436\u0435\u043d\u043d\u044b\u0435 \u043d\u0430 \u043a\u043e\u043b\u0438\u0447\u0435\u0441\u0442\u0432\u043e \u043a\u043b\u0435\u0442\u043e\u043a, \u043a\u043e\u0442\u043e\u0440\u044b\u0445 \u043c\u043e\u0436\u0435\u0442 \u0431\u044b\u0442\u044c \u0431\u043e\u043b\u0435\u0435 100 \u0442\u044b\u0441.\u00a0<\/p>\n

    \"\u041a\u0430\u0440\u0442\u0438\u043d\u043a\u0430<\/p>\n
    \u041a\u0430\u0440\u0442\u0438\u043d\u043a\u0430 2. \u041f\u0440\u0438\u043c\u0435\u0440 \u043c\u0430\u0442\u0440\u0438\u0446\u044b \u044d\u043a\u0441\u043f\u0440\u0435\u0441\u0441\u0438\u0438<\/a>, \u0444\u0440\u0430\u0433\u043c\u0435\u043d\u0442.\u00a0<\/figcaption><\/div>\n<\/figure>\n

    \u0421\u0442\u043e\u043b\u0431\u0446\u044b \u2014 \u043d\u0430\u0437\u0432\u0430\u043d\u0438\u044f \u043e\u0431\u0440\u0430\u0437\u0446\u043e\u0432, \u0441\u0442\u0440\u043e\u043a\u0438 — entrez id \u0433\u0435\u043d\u043e\u0432, \u0432 \u044f\u0447\u0435\u0439\u043a\u0430\u0445 — \u043a\u043e\u043b\u0438\u0447\u0435\u0441\u0442\u0432\u043e \u043c\u043e\u043b\u0435\u043a\u0443\u043b \u0420\u041d\u041a \u043a\u0430\u0436\u0434\u043e\u0433\u043e \u0433\u0435\u043d\u0430 \u0434\u043b\u044f \u043a\u0430\u0436\u0434\u043e\u0433\u043e \u043e\u0431\u0440\u0430\u0437\u0446\u0430. <\/p>\n

    \u041e\u0431\u044a\u0435\u043c \u0432\u0445\u043e\u0434\u043d\u043e\u0439 \u043c\u0430\u0442\u0440\u0438\u0446\u044b bulkRNA-seq \u043e\u0431\u044b\u0447\u043d\u043e < 1 \u041c\u0411, \u0430 \u0434\u043b\u044f scRNA-seq \u043c\u043e\u0436\u0435\u0442 \u0431\u044b\u0442\u044c >1 \u0413\u0411.<\/p>\n

    \u0421\u0440\u0430\u0432\u043d\u0435\u043d\u0438\u0435 \u043f\u0440\u043e\u0438\u0441\u0445\u043e\u0434\u0438\u0442 \u043c\u0435\u0436\u0434\u0443 \u0441\u0442\u043e\u043b\u0431\u0446\u0430\u043c\u0438 \u043c\u0430\u0442\u0440\u0438\u0446\u044b. \u041a\u0430\u043a \u043f\u0440\u0430\u0432\u0438\u043b\u043e, \u043d\u0435\u0441\u043a\u043e\u043b\u044c\u043a\u043e \u0438\u0437 \u043d\u0438\u0445 \u2014 \u043a\u043e\u043d\u0442\u0440\u043e\u043b\u044c, \u043f\u043e\u043b\u0443\u0447\u0435\u043d\u043d\u044b\u0439 \u0443 \u0437\u0434\u043e\u0440\u043e\u0432\u044b\u0445 \u043b\u044e\u0434\u0435\u0439. \u041e\u0441\u0442\u0430\u043b\u044c\u043d\u044b\u0435 — \u044d\u043a\u0441\u043f\u0435\u0440\u0438\u043c\u0435\u043d\u0442\u0430\u043b\u044c\u043d\u044b\u0435 \u043e\u0431\u0440\u0430\u0437\u0446\u044b. \u041d\u0430\u043f\u0440\u0438\u043c\u0435\u0440, \u0442\u043a\u0430\u043d\u0438, \u043f\u043e\u0434\u0432\u0435\u0440\u0436\u0435\u043d\u043d\u043e\u0439 \u0431\u043e\u043b\u0435\u0437\u043d\u0438, \u0438\u043b\u0438 \u043a\u0430\u043a\u043e\u043c\u0443-\u043b\u0438\u0431\u043e \u0434\u0440\u0443\u0433\u043e\u043c\u0443 \u0432\u043e\u0437\u0434\u0435\u0439\u0441\u0442\u0432\u0438\u044e.\u00a0<\/p>\n

    \u041f\u0440\u043e\u0432\u043e\u0434\u0438\u0442\u0441\u044f \u0441\u0440\u0430\u0432\u043d\u0435\u043d\u0438\u0435 \u0441 \u0438\u0441\u043f\u043e\u043b\u044c\u0437\u043e\u0432\u0430\u043d\u0438\u0435\u043c \u0442\u0435\u0441\u0442\u0430 \u0412\u0430\u043b\u044c\u0434\u0430 \u0441 \u043f\u043e\u043f\u0440\u0430\u0432\u043a\u043e\u0439 \u043d\u0430 \u043c\u043d\u043e\u0436\u0435\u0441\u0442\u0432\u0435\u043d\u043d\u044b\u0435 \u0441\u0440\u0430\u0432\u043d\u0435\u043d\u0438\u044f \u0411\u0435\u043d\u0434\u0436\u0430\u043c\u0438\u043d\u0438-\u0425\u043e\u0445\u0431\u0435\u0440\u0433\u0430. \u0412\u043f\u0440\u043e\u0447\u0435\u043c, \u044d\u0442\u043e \u0440\u0435\u0433\u0443\u043b\u0438\u0440\u0443\u0435\u0442\u0441\u044f, \u0432\u0430\u0440\u0438\u0430\u043d\u0442 \u043f\u043e\u043f\u0440\u0430\u0432\u043a\u0438 \u043c\u043e\u0436\u0435\u0442 \u0431\u044b\u0442\u044c \u0437\u0430\u0434\u0430\u043d \u0432 \u0430\u0440\u0433\u0443\u043c\u0435\u043d\u0442\u0435 \u0444\u0443\u043d\u043a\u0446\u0438\u0438 DESeq<\/a>:<\/p>\n

    DESeq(object,\u00a0test = c(\u00abWald\u00bb, \u00abLRT\u00bb),\u00a0       fitType = c(\u00abparametric\u00bb, \u00ablocal\u00bb, \u00abmean\u00bb, \u00abglmGamPoi\u00bb),\u00a0       sfType = c(\u00abratio\u00bb, \u00abposcounts\u00bb, \u00abiterate\u00bb),\u00a0       betaPrior,\u00a0       full = design(object),\u00a0       reduced,\u00a0       quiet = FALSE,\u00a0       minReplicatesForReplace = 7,\u00a0       modelMatrixType,\u00a0       useT = FALSE,       minmu = if (fitType == \u00abglmGamPoi\u00bb) 1e-06 else 0.5,\u00a0       parallel = FALSE,\u00a0       BPPARAM = bpparam())<\/code><\/pre>\n
    \u041a\u0430\u043a \u043f\u043e\u043b\u0443\u0447\u0430\u044e\u0442 \u0434\u0430\u043d\u043d\u044b\u0435? \u0418 \u043e\u0447\u0435\u043d\u044c \u043a\u043e\u0440\u043e\u0442\u043a\u043e \u043f\u0440\u043e \u043f\u0440\u0435\u0434\u043e\u0431\u0440\u0430\u0431\u043e\u0442\u043a\u0443\u2026<\/h3>\n
    \u0414\u043b\u044f \u043e\u043f\u0438\u0441\u0430\u043d\u043d\u043e\u0433\u043e \u0432\u044b\u0448\u0435 \u043d\u0435\u043e\u0431\u0445\u043e\u0434\u0438\u043c\u044b, \u043a\u0430\u043a \u043d\u0438 \u0441\u0442\u0440\u0430\u043d\u043d\u043e, \u0442\u0440\u0430\u043d\u0441\u043a\u0440\u0438\u043f\u0442\u043e\u043c\u043d\u044b\u0435 \u0434\u0430\u043d\u043d\u044b\u0435. \u0414\u0430\u043d\u043d\u044b\u0435 \u0420\u041d\u041a-\u0441\u0435\u043a\u0432\u0435\u043d\u0438\u0440\u043e\u0432\u0430\u043d\u0438\u044f \u0438\u043d\u0442\u0435\u0440\u0435\u0441\u0443\u044e\u0449\u0435\u0439 \u0442\u043a\u0430\u043d\u0438. \u0418\u0437\u043d\u0430\u0447\u0430\u043b\u044c\u043d\u043e \u044d\u0442\u043e \u043c\u0438\u043b\u043b\u0438\u043e\u043d\u044b \u0444\u0440\u0430\u0433\u043c\u0435\u043d\u0442\u043e\u0432 \u043c\u043e\u043b\u0435\u043a\u0443\u043b \u0420\u041d\u041a \u0432 \u0444\u043e\u0440\u043c\u0430\u0442\u0435 FASTQ.\u00a0 <\/p>\n
    \u0412 \u0438\u0442\u043e\u0433\u0435 \u043f\u043e\u043b\u0443\u0447\u0430\u0435\u0442\u0441\u044f \u0431\u043e\u043b\u044c\u0448\u043e\u0439 \u043d\u0435\u0443\u043f\u043e\u0440\u044f\u0434\u043e\u0447\u0435\u043d\u043d\u044b\u0439 \u0442\u0435\u043a\u0441\u0442\u043e\u0432\u044b\u0439 \u0444\u0430\u0439\u043b \u00ab\u043f\u0440\u043e\u0447\u0442\u0435\u043d\u0438\u0439\u00bb \u0441\u0443\u043c\u043c\u0430\u0440\u043d\u044b\u043c \u0440\u0430\u0437\u043c\u0435\u0440\u043e\u043c \u0434\u043e \u0441\u043e\u0442\u043d\u0438 \u0433\u0438\u0433\u0430\u0431\u0430\u0439\u0442. \u041a\u0430\u0436\u0434\u044b\u0439 \u0442\u0430\u043a\u043e\u0439 \u00ab\u0440\u0438\u0434\u00bb \u0441\u043e\u0441\u0442\u043e\u0438\u0442 \u0438\u0437 \u043d\u0430\u0438\u043c\u0435\u043d\u043e\u0432\u0430\u043d\u0438\u044f \u043e\u0431\u0440\u0430\u0437\u0446\u0430, \u0441\u0430\u043c\u043e\u0439 \u043f\u043e\u0441\u043b\u0435\u0434\u043e\u0432\u0430\u0442\u0435\u043b\u044c\u043d\u043e\u0441\u0442\u0438 (\u0432\u0442\u043e\u0440\u0430\u044f \u0441\u0442\u0440\u043e\u0447\u043a\u0430) \u0438 \u043e\u0431\u043e\u0437\u043d\u0430\u0447\u0435\u043d\u0438\u044f \u043a\u0430\u0447\u0435\u0441\u0442\u0432\u0430 \u043f\u0440\u043e\u0447\u0442\u0435\u043d\u0438\u044f \u043a\u0430\u0436\u0434\u043e\u0433\u043e \u043d\u0443\u043a\u043b\u0435\u043e\u0442\u0438\u0434\u0430, \u043f\u0440\u0438\u0441\u0432\u043e\u0435\u043d\u043d\u043e\u0433\u043e \u0441\u0435\u043a\u0432\u0435\u043d\u0430\u0442\u043e\u0440\u043e\u043c (\u0447\u0435\u0442\u0432\u0435\u0440\u0442\u0430\u044f \u0441\u0442\u0440\u043e\u0447\u043a\u0430). \u041d\u043e\u043c\u0435\u0440 \u0431\u0443\u043a\u0432\u044b \u0432\u043e \u0432\u0442\u043e\u0440\u043e\u0439 \u0441\u0442\u0440\u043e\u043a\u0435 \u0441\u043e\u043e\u0442\u0432\u0435\u0442\u0441\u0442\u0432\u0443\u0435\u0442 \u043d\u043e\u043c\u0435\u0440 \u0441\u0438\u043c\u0432\u043e\u043b\u0430 \u0432 \u0447\u0435\u0442\u0432\u0435\u0440\u0442\u043e\u0439, \u0430 \u0441\u0438\u043c\u0432\u043e\u043b\u044b \u0432 \u0422\u0430\u0431\u043b\u0438\u0446\u0435 \u043e\u0442\u0440\u0430\u0436\u0430\u044e\u0442 \u043a\u0430\u0447\u0435\u0441\u0442\u0432\u043e \u043f\u0440\u043e\u0447\u0442\u0435\u043d\u0438\u044f \u043a\u0430\u0436\u0434\u043e\u0433\u043e \u043d\u0443\u043a\u043b\u0435\u043e\u0442\u0438\u0434\u0430:<\/p>\n
    @Some RNA-seq sample 1 CGUAGCUGCUCGAUCGAUCGAUCGAUCAGU + ()(&&*III#II@@+++\/\/%$$#(&A<\/code><\/pre>\n
    \"\u0422\u0430\u0431\u043b\u0438\u0446\u0430<\/p>\n
    \u0422\u0430\u0431\u043b\u0438\u0446\u0430<\/a> \u043a\u043e\u0434\u0438\u0440\u043e\u0432\u0430\u043d\u0438\u044f quality score \u0432 4 \u0441\u0442\u0440\u043e\u0447\u043a\u0435 FASTQ-\u0440\u0438\u0434\u0430<\/figcaption><\/div>\n<\/figure>\n
    \u041f\u0430\u0439\u043f\u043b\u0430\u0439\u043d \u0440\u0430\u0431\u043e\u0442\u044b \u0437\u0430\u043a\u043b\u044e\u0447\u0430\u0435\u0442\u0441\u044f \u0432 \u0442\u043e\u043c, \u0447\u0442\u043e\u0431\u044b \u0441\u043e\u0431\u0440\u0430\u0442\u044c \u0438\u0437 \u044d\u0442\u0438\u0445 \u043f\u0440\u043e\u0447\u0442\u0435\u043d\u0438\u0439 \u0446\u0435\u043b\u043e\u0441\u0442\u043d\u044b\u0435 \u0433\u0435\u043d\u044b, \u0442.\u0435. \u0441\u043e\u0432\u043c\u0435\u0441\u0442\u0438\u0442\u044c \u0438\u0445 \u0432 \u043d\u0443\u0436\u043d\u043e\u043c \u043f\u043e\u0440\u044f\u0434\u043a\u0435 \u0442\u0430\u043a\u0438\u043c \u043e\u0431\u0440\u0430\u0437\u043e\u043c, \u0447\u0442\u043e\u0431\u044b \u0438\u0442\u043e\u0433\u043e\u0432\u0430\u044f \u0441\u0442\u0440\u043e\u043a\u0430 \u0438\u0437 \u043d\u0435\u0441\u043a\u043e\u043b\u044c\u043a\u0438\u0445 \u0442\u044b\u0441\u044f\u0447 \u0442\u0430\u043a\u0438\u0445 \u0431\u0443\u043a\u0432 \u0441\u043e\u0441\u0442\u0430\u0432\u0438\u043b\u0430 \u0433\u0435\u043d.\u00a0 <\/p>\n
    \u041e\u0434\u043d\u0430\u043a\u043e, \u043f\u0435\u0440\u0432\u044b\u043c \u0448\u0430\u0433\u043e\u043c \u0431\u0443\u0434\u0435\u0442 \u043e\u0447\u0438\u0441\u0442\u0438\u0442\u044c \u0434\u0430\u043d\u043d\u044b\u0435 \u043e\u0442 \u043d\u0438\u0437\u043a\u043e\u043a\u0430\u0447\u0435\u0441\u0442\u0432\u0435\u043d\u043d\u044b\u0445 \u043f\u0440\u043e\u0447\u0442\u0435\u043d\u0438\u0439. \u0421\u0435\u043a\u0432\u0435\u043d\u0430\u0442\u043e\u0440 \u0437\u0430\u0440\u0430\u043d\u0435\u0435 \u0437\u0430\u043f\u0438\u0441\u044b\u0432\u0430\u0435\u0442, \u043a\u0430\u043a\u0438\u0435 \u043d\u0443\u043a\u043b\u0435\u043e\u0442\u0438\u0434\u044b \u0443\u0434\u0430\u043b\u043e\u0441\u044c \u0441\u0447\u0438\u0442\u0430\u0442\u044c \u0445\u043e\u0440\u043e\u0448\u043e, \u0430 \u043a\u0430\u043a\u0438\u0435 \u2014 \u043d\u0435 \u043e\u0447\u0435\u043d\u044c. \u0422\u0430\u043a\u0438\u0435 \u0438\u043d\u0441\u0442\u0440\u0443\u043c\u0435\u043d\u0442\u044b, \u043a\u0430\u043a FastQC \u0438 MultiQC \u043f\u043e\u0437\u0432\u043e\u043b\u044f\u044e\u0442 \u043e\u0446\u0435\u043d\u0438\u0442\u044c \u043a\u0430\u0447\u0435\u0441\u0442\u0432\u043e. \u041a\u0440\u043e\u043c\u0435 \u0442\u043e\u0433\u043e, \u043d\u0443\u0436\u043d\u043e \u0443\u0434\u0430\u043b\u0438\u0442\u044c \u0432\u0441\u043f\u043e\u043c\u043e\u0433\u0430\u0442\u0435\u043b\u044c\u043d\u044b\u0435 \u0446\u0435\u043f\u043e\u0447\u043a\u0438 — \u0430\u0434\u0430\u043f\u0442\u0435\u0440\u044b. \u041e\u043d\u0438 \u0441\u0442\u0430\u043d\u0434\u0430\u0440\u0442\u043d\u044b\u0435, \u043f\u043e\u044d\u0442\u043e\u043c\u0443 \u043c\u043e\u0436\u043d\u043e \u043d\u0430\u043f\u0440\u044f\u043c\u0443\u044e \u0438\u0441\u043f\u043e\u043b\u044c\u0437\u043e\u0432\u0430\u0442\u044c \u0437\u0430\u0440\u0430\u043d\u0435\u0435 \u0438\u0437\u0432\u0435\u0441\u0442\u043d\u0443\u044e \u0441\u0442\u0440\u043e\u043a\u043e\u0432\u0443\u044e \u043f\u043e\u0441\u043b\u0435\u0434\u043e\u0432\u0430\u0442\u0435\u043b\u044c\u043d\u043e\u0441\u0442\u044c \u0438\u0437 \u0434\u0430\u043d\u043d\u044b\u0445 \u043f\u0440\u0438 \u043f\u043e\u043c\u043e\u0449\u0438, \u043d\u0430\u043f\u0440\u0438\u043c\u0435\u0440, cutadapt. \u041e\u0442\u0444\u0438\u043b\u044c\u0442\u0440\u043e\u0432\u0430\u0432 \u043d\u0438\u0437\u043a\u043e\u043a\u0430\u0447\u0435\u0441\u0442\u0432\u0435\u043d\u043d\u044b\u0435 \u043f\u0440\u043e\u0447\u0442\u0435\u043d\u0438\u044f, \u0430 \u0442\u0430\u043a\u0436\u0435 \u043e\u0442\u0440\u0435\u0437\u0430\u0432 \u0430\u0434\u0430\u043f\u0442\u0435\u0440\u044b, \u043d\u043e \u043e\u0441\u0442\u0430\u0432\u0438\u0432 \u0434\u0443\u043f\u043b\u0438\u043a\u0430\u0442\u044b (\u0434\u0430\u043b\u0435\u0435 \u0441\u0442\u0430\u043d\u0435\u0442 \u044f\u0441\u043d\u043e, \u043f\u043e\u0447\u0435\u043c\u0443), \u043c\u043e\u0436\u043d\u043e \u043f\u0435\u0440\u0435\u0445\u043e\u0434\u0438\u0442\u044c \u043a \u0432\u044b\u0440\u0430\u0432\u043d\u0438\u0432\u0430\u043d\u0438\u044e — \u043f\u0440\u043e\u0446\u0435\u0441\u0441\u0443 \u0441\u043e\u0431\u0438\u0440\u0430\u043d\u0438\u044f \u0438\u0437 \u0440\u0430\u0437\u0440\u043e\u0437\u043d\u0435\u043d\u043d\u044b\u0445 \u043f\u0440\u043e\u0447\u0442\u0435\u043d\u0438\u0439 \u0446\u0435\u043b\u043e\u0441\u0442\u043d\u044b\u0445 \u0433\u0435\u043d\u043e\u0432, \u043a\u043e\u0442\u043e\u0440\u044b\u0435 \u0441\u043e\u043e\u0442\u0432\u0435\u0442\u0441\u0442\u0432\u0443\u044e\u0442 \u0438\u043d\u0444\u043e\u0440\u043c\u0430\u0446\u0438\u0438 \u0432 \u0431\u0430\u0437\u0430\u0445. \u0414\u043b\u044f \u044d\u0442\u043e\u0433\u043e \u0438\u0441\u043f\u043e\u043b\u044c\u0437\u0443\u044e\u0442 \u0440\u0435\u0444\u0435\u0440\u0435\u043d\u0441\u043d\u044b\u0435 \u043f\u043e\u0441\u043b\u0435\u0434\u043e\u0432\u0430\u0442\u0435\u043b\u044c\u043d\u043e\u0441\u0442\u0438 \u0438\u0437 NCBI, \u043d\u0430\u043f\u0440\u0438\u043c\u0435\u0440, \u0433\u0435\u043d\u043e\u043c\u0430 \u0447\u0435\u043b\u043e\u0432\u0435\u043a\u0430<\/a>, \u0438 \u0438\u043d\u0441\u0442\u0440\u0443\u043c\u0435\u043d\u0442\u044b \u0434\u043b\u044f \u0432\u044b\u0440\u0430\u0432\u043d\u0438\u0432\u0430\u043d\u0438\u044f. \u042d\u0442\u043e \u043c\u043e\u0436\u0435\u0442 \u0431\u044b\u0442\u044c \u043a\u0430\u043a Kallisto, \u043e\u0441\u043d\u043e\u0432\u0430\u043d\u043d\u043e\u0435 \u043d\u0430 ML, \u0442\u0430\u043a \u0438, \u043d\u0430\u043f\u0440\u0438\u043c\u0435\u0440, minimap2, bowtie2 \u0438 \u0434\u0440\u0443\u0433\u0438\u0435 \u0438\u043d\u0441\u0442\u0440\u0443\u043c\u0435\u043d\u0442\u044b. \u041a\u0430\u043a \u0432\u044b\u0433\u043b\u044f\u0434\u0438\u0442 \u0432\u044b\u0440\u0430\u0432\u043d\u0438\u0432\u0430\u043d\u0438\u0435, \u043c\u043e\u0436\u043d\u043e \u0443\u0432\u0438\u0434\u0435\u0442\u044c \u043d\u0430 \u041a\u0430\u0440\u0442\u0438\u043d\u043a\u0435 3.<\/p>\n
    \"\u041a\u0430\u0440\u0442\u0438\u043d\u043a\u0430<\/p>\n
    \u041a\u0430\u0440\u0442\u0438\u043d\u043a\u0430 3. \u0421\u0445\u0435\u043c\u0430 \u043f\u0440\u043e\u0446\u0435\u0441\u0441\u0430 \u0432\u044b\u0440\u0430\u0432\u043d\u0438\u0432\u0430\u043d\u0438\u044f \u0440\u0438\u0434\u0430 \u043d\u0430 \u0440\u0435\u0444\u0435\u0440\u0435\u043d\u0441<\/a>.<\/figcaption><\/div>\n<\/figure>\n
    \u0412\u043a\u0440\u0430\u0442\u0446\u0435, \u043d\u0430\u0448\u0438 \u0440\u0438\u0434\u044b \u0441\u043e\u043f\u043e\u0441\u0442\u0430\u0432\u043b\u044f\u044e\u0442\u0441\u044f \u0441 \u0440\u0435\u0444\u0435\u0440\u0435\u043d\u0441\u043e\u043c. \u041d\u0430\u043f\u0440\u0438\u043c\u0435\u0440, \u0443 \u043d\u0430\u0441 \u0435\u0441\u0442\u044c \u0433\u0435\u043d\u043e\u043c \u0447\u0435\u043b\u043e\u0432\u0435\u043a\u0430 \u2014 \u0434\u043b\u0438\u043d\u043d\u0430\u044f \u0446\u0435\u043f\u044c \u0438\u0437 \u043d\u0443\u043a\u043b\u0435\u043e\u0442\u0438\u0434\u043e\u0432. \u0420\u0438\u0434\u044b \u043d\u0430\u043a\u043b\u0430\u0434\u044b\u0432\u0430\u044e\u0442\u0441\u044f \u043d\u0430 \u043d\u0435\u0433\u043e, \u0431\u043b\u0430\u0433\u043e\u0434\u0430\u0440\u044f \u0447\u0435\u043c\u0443 \u043c\u043e\u0436\u043d\u043e \u043f\u043e\u043d\u044f\u0442\u044c, \u0432 \u043a\u0430\u043a\u043e\u043c \u043f\u043e\u0440\u044f\u0434\u043a\u0435 \u043e\u043d\u0438 \u0438\u0437\u043d\u0430\u0447\u0430\u043b\u044c\u043d\u043e \u0431\u044b\u043b\u0438 \u0440\u0430\u0441\u043f\u043e\u043b\u043e\u0436\u0435\u043d\u044b \u0432 \u0433\u0435\u043d\u043e\u043c\u0435, \u0438 \u0441\u043e\u0431\u0440\u0430\u0442\u044c \u0442\u0430\u043a\u0438\u0435 \u0436\u0435 \u0446\u0435\u043b\u043e\u0441\u0442\u043d\u044b\u0435 \u0433\u0435\u043d\u044b, \u043a\u0430\u043a \u0432 \u0433\u0435\u043d\u043e\u043c\u0435, \u043d\u043e \u0443\u0436\u0435 \u0441 \u043d\u0430\u0448\u0435\u0433\u043e \u043e\u0431\u0440\u0430\u0437\u0446\u0430. <\/p>\n
    \u041d\u0430 \u0432\u044b\u0445\u043e\u0434\u0435 \u043f\u043e\u043b\u0443\u0447\u0430\u044e\u0442\u0441\u044f \u0444\u0430\u0439\u043b\u044b \u0444\u043e\u0440\u043c\u0430\u0442\u0430 BAM, \u0432 \u043a\u043e\u0442\u043e\u0440\u044b\u0445 \u0442\u0435 \u0436\u0435 \u043f\u043e\u0441\u043b\u0435\u0434\u043e\u0432\u0430\u0442\u0435\u043b\u044c\u043d\u043e\u0441\u0442\u0438, \u043d\u043e \u0442\u0435\u043f\u0435\u0440\u044c \u0437\u0430\u043c\u0435\u0442\u043d\u043e \u0431\u043e\u043b\u0435\u0435 \u0434\u043b\u0438\u043d\u043d\u044b\u0435. \u042d\u0442\u043e \u0438 \u0435\u0441\u0442\u044c \u0433\u0435\u043d\u044b. \u0427\u0442\u043e\u0431\u044b \u0441\u043e\u0431\u0440\u0430\u0442\u044c \u0438\u0445 \u0432 \u043c\u0430\u0442\u0440\u0438\u0446\u0443, \u0438\u0445 \u043d\u0443\u0436\u043d\u043e \u043f\u0440\u043e\u0441\u0442\u043e \u0441\u043e\u0441\u0447\u0438\u0442\u0430\u0442\u044c. \u0422\u0430\u043a \u043a\u0430\u043a \u043c\u044b \u0441\u0447\u0438\u0442\u0430\u0435\u043c \u043a\u043e\u043b\u0438\u0447\u0435\u0441\u0442\u0432\u043e \u044d\u043a\u0437\u0435\u043c\u043f\u043b\u044f\u0440\u043e\u0432 \u043f\u043e\u0432\u0442\u043e\u0440\u044f\u044e\u0449\u0438\u0445\u0441\u044f \u0441\u0442\u0440\u043e\u043a, \u043d\u0435\u043b\u044c\u0437\u044f \u0443\u0434\u0430\u043b\u044f\u0442\u044c \u0434\u0443\u0431\u043b\u0438\u043a\u0430\u0442\u044b, \u043a\u0430\u043a \u044d\u0442\u043e \u043e\u0431\u044b\u0447\u043d\u043e \u0434\u0435\u043b\u0430\u0435\u0442\u0441\u044f \u2014 \u043d\u0430\u043c \u043d\u0443\u0436\u043d\u043e \u043a\u043e\u043b\u0438\u0447\u0435\u0441\u0442\u0432\u0435\u043d\u043d\u043e \u043e\u0446\u0435\u043d\u0438\u0442\u044c \u044d\u043a\u0441\u043f\u0440\u0435\u0441\u0441\u0438\u044e, \u0430 \u0437\u043d\u0430\u0447\u0438\u0442\u044c, \u043f\u043e \u043e\u043f\u0440\u0435\u0434\u0435\u043b\u0435\u043d\u0438\u044e, \u043a\u0430\u043a\u0438\u0445-\u0442\u043e \u0433\u0435\u043d\u043e\u0432 \u0431\u044b\u043b\u043e \u044d\u043a\u0441\u043f\u0440\u0435\u0441\u0441\u0438\u0440\u043e\u0432\u0430\u043d\u043e \u0431\u043e\u043b\u044c\u0448\u0435, \u0430 \u043a\u0430\u043a\u0438\u0445-\u0442\u043e — \u043c\u0435\u043d\u044c\u0448\u0435. \u041f\u043e\u0434\u0441\u0447\u0435\u0442 \u043c\u043e\u0436\u043d\u043e \u043f\u0440\u043e\u0438\u0437\u0432\u043e\u0434\u0438\u0442\u044c, \u043d\u0430\u043f\u0440\u0438\u043c\u0435\u0440, \u043f\u0440\u0438 \u043f\u043e\u043c\u043e\u0449\u0438 Kallisto quant \u0438\u043b\u0438 Salmon quant. \u0412 \u0438\u0442\u043e\u0433\u0435, \u0434\u043b\u044f \u043a\u0430\u0436\u0434\u043e\u0433\u043e \u043e\u0431\u0440\u0430\u0437\u0446\u0430 \u043f\u043e\u043b\u0443\u0447\u0430\u0435\u0442\u0441\u044f \u0432\u0435\u043a\u0442\u043e\u0440, \u0430 \u0442\u043e\u0447\u043d\u0435\u0435, \u043c\u0430\u0442\u0440\u0438\u0446\u0430 \u0441 \u043e\u0434\u043d\u0438\u043c \u0441\u0442\u043e\u043b\u0431\u0446\u043e\u043c. \u041d\u0430\u0437\u0432\u0430\u043d\u0438\u0435\u043c \u0441\u0442\u043e\u043b\u0431\u0446\u0430 \u044f\u0432\u043b\u044f\u0435\u0442\u0441\u044f \u043d\u0430\u0437\u0432\u0430\u043d\u0438\u0435 \u043e\u0431\u0440\u0430\u0437\u0446\u0430, \u0441\u0442\u0440\u043e\u043a\u0438 — \u0433\u0435\u043d. \u041f\u043e\u043d\u044f\u0442\u043d\u043e, \u0447\u0442\u043e \u0442\u0430\u043a \u043a\u0430\u043a \u0441\u0435\u043a\u0432\u0435\u043d\u0438\u0440\u0443\u044e\u0442 \u0432 \u043e\u0434\u043d\u043e\u043c \u044d\u043a\u0441\u043f\u0435\u0440\u0438\u043c\u0435\u043d\u0442\u0435 \u043e\u0431\u044b\u0447\u043d\u043e \u043e\u0434\u043d\u0438 \u0438 \u0442\u0435 \u0436\u0435 \u043e\u0440\u0433\u0430\u043d\u0438\u0437\u043c\u044b, \u043a\u043e\u043b\u0438\u0447\u0435\u0441\u0442\u0432\u043e \u0433\u0435\u043d\u043e\u0432 \u0443 \u043d\u0438\u0445 \u043e\u0434\u0438\u043d\u0430\u043a\u043e\u0432\u043e\u0435, \u0430 \u0437\u043d\u0430\u0447\u0438\u0442, \u0434\u043b\u044f \u043a\u0430\u0436\u0434\u043e\u0433\u043e \u043e\u0431\u0440\u0430\u0437\u0446\u0430 \u0434\u043b\u0438\u043d\u0430 \u0432\u0435\u043a\u0442\u043e\u0440\u0430 \u043d\u0430\u0437\u0432\u0430\u043d\u0438\u0439 \u0433\u0435\u043d\u043e\u0432 \u0431\u0443\u0434\u0435\u0442 \u043e\u0434\u0438\u043d\u0430\u043a\u043e\u0432\u043e\u0439. \u0418\u0445 \u0441\u043e\u0432\u043c\u0435\u0449\u0430\u044e\u0442, \u0442\u0430\u043a\u0438\u043c \u043e\u0431\u0440\u0430\u0437\u043e\u043c, \u043f\u043e\u043b\u0443\u0447\u0430\u0435\u0442\u0441\u044f \u043c\u0430\u0442\u0440\u0438\u0446\u0430, \u0433\u0434\u0435 \u0441\u0442\u043e\u043b\u0431\u0446\u0430\u043c\u0438 \u044f\u0432\u043b\u044f\u044e\u0442\u0441\u044f \u043e\u0431\u0440\u0430\u0437\u0446\u044b, \u0441\u0442\u0440\u043e\u043a\u0430\u043c\u0438 — \u0433\u0435\u043d\u044b. (\u041a\u0430\u0440\u0442\u0438\u043d\u043a\u0430 2) \u0410 \u0432 \u044f\u0447\u0435\u0439\u043a\u0430\u0445 \u043f\u0440\u0435\u0434\u0441\u0442\u0430\u0432\u043b\u0435\u043d\u044b \u043a\u043e\u043b\u0438\u0447\u0435\u0441\u0442\u0432\u0430 \u0420\u041d\u041a-\u043c\u043e\u043b\u0435\u043a\u0443\u043b \u043a\u0430\u0436\u0434\u043e\u0433\u043e \u0433\u0435\u043d\u0430 \u0434\u043b\u044f \u043a\u0430\u0436\u0434\u043e\u0433\u043e \u043e\u0431\u0440\u0430\u0437\u0446\u0430. \u0422\u0430\u043a \u0438 \u043f\u043e\u043b\u0443\u0447\u0430\u044e\u0442\u0441\u044f \u043c\u0430\u0442\u0440\u0438\u0446\u044b \u044d\u043a\u0441\u043f\u0440\u0435\u0441\u0441\u0438\u0438. \u0411\u043e\u043b\u0435\u0435 \u043f\u043e\u0434\u0440\u043e\u0431\u043d\u043e \u043e \u043f\u0440\u0435\u0434\u043e\u0431\u0440\u0430\u0431\u043e\u0442\u043a\u0435 — \u0432 \u044d\u0442\u043e\u0439 \u0441\u0442\u0430\u0442\u044c\u0435 \u043d\u0430 Habr<\/a>. \u041f\u043e\u0434\u0440\u043e\u0431\u043d\u044b\u0439 \u0436\u0435 \u0442\u0443\u0442\u043e\u0440\u0438\u0430\u043b \u043e\u0431\u0440\u0430\u0431\u043e\u0442\u043a\u0438 \u0434\u0430\u043d\u043d\u044b\u0445 \u0441\u0435\u043a\u0432\u0435\u043d\u0438\u0440\u043e\u0432\u0430\u043d\u0438\u044f \u0420\u041d\u041a \u043c\u043e\u0436\u043d\u043e \u043d\u0430\u0439\u0442\u0438 \u0437\u0434\u0435\u0441\u044c<\/a>.<\/p>\n
    \u0410\u043d\u0430\u043b\u0438\u0437 \u0434\u0438\u0444\u0444\u0435\u0440\u0435\u043d\u0446\u0438\u0430\u043b\u044c\u043d\u043e\u0439 \u044d\u043a\u0441\u043f\u0440\u0435\u0441\u0441\u0438\u0438<\/h3>\n
    \u0418\u0442\u0430\u043a, \u0437\u0430\u043a\u043e\u043d\u0447\u0438\u043b\u0438 \u0441 \u043f\u043e\u044f\u0441\u043d\u0435\u043d\u0438\u044f\u043c\u0438 \u043f\u0440\u043e\u0446\u0435\u0441\u0441\u0430, \u043f\u0435\u0440\u0435\u0439\u0434\u0435\u043c \u043a \u043a\u043e\u0434\u0443. \u0414\u043b\u044f \u043d\u0430\u0448\u0435\u0433\u043e \u043f\u0440\u0438\u043c\u0435\u0440\u0430, \u0432\u043e\u0437\u044c\u043c\u0435\u043c \u0434\u0430\u043d\u043d\u044b\u0435<\/a> \u0441\u0435\u043a\u0432\u0435\u043d\u0438\u0440\u043e\u0432\u0430\u043d\u0438\u044f \u0443 \u043f\u0430\u0446\u0438\u0435\u043d\u0442\u043e\u0432 \u0441 \u043d\u0430\u0440\u0443\u0448\u0435\u043d\u0438\u0435\u043c \u043e\u0431\u043e\u043d\u044f\u0442\u0435\u043b\u044c\u043d\u043e\u0439 \u0444\u0443\u043d\u043a\u0446\u0438\u0438 \u043f\u043e\u0441\u043b\u0435 \u043a\u043e\u0440\u043e\u043d\u0430\u0432\u0438\u0440\u0443\u0441\u0430. \u0421\u0440\u0430\u0432\u043d\u0438\u0432\u0430\u0442\u044c \u0431\u0443\u0434\u0435\u043c \u043e\u0431\u0440\u0430\u0437\u0446\u044b \u0443 \u043f\u0435\u0440\u0435\u0431\u043e\u043b\u0435\u0432\u0448\u0438\u0445 (\u044d\u0442\u043e \u00ab\u044d\u043a\u0441\u043f\u0435\u0440\u0438\u043c\u0435\u043d\u0442\u00bb, COVID-19 Positive) \u0441\u043e \u0437\u0434\u043e\u0440\u043e\u0432\u044b\u043c\u0438 (\u00bb\u043a\u043e\u043d\u0442\u0440\u043e\u043b\u044c\u00bb, COVID-19 Negative) <\/p>\n
    # \u0421\u0447\u0438\u0442\u044b\u0432\u0430\u043d\u0438\u0435 \u043c\u0430\u0442\u0440\u0438\u0446\u044b \u044d\u043a\u0441\u043f\u0440\u0435\u0441\u0441\u0438\u0438 df <- read.csv('raw_counts.tsv', sep = '\\t') names <- colnames(df[,-1])  # \u041c\u0435\u0442\u0430\u0434\u0430\u043d\u043d\u044b\u0435 \u044d\u043a\u0441\u043f\u0435\u0440\u0438\u043c\u0435\u043d\u0442\u0430 meta <- read.csv('metadata.txt', sep = ',')  # \u041f\u0435\u0440\u0435\u0438\u043c\u0435\u043d\u043e\u0432\u0430\u043d\u0438\u0435 \u0441\u0442\u043e\u043b\u0431\u0446\u043e\u0432 \u0434\u043b\u044f \u0443\u0434\u043e\u0431\u0441\u0442\u0432\u0430 colnames(meta) <- c('sample', 'status') metastatus) genes <- df$GeneID rownames(df) <- genes df$GeneID <- NULL genes <- as.character(genes)  # \u0421\u043e\u0437\u0434\u0430\u043d\u0438\u0435 \u043e\u0431\u044a\u0435\u043a\u0442\u0430 \u0434\u043b\u044f \u0434\u0430\u043b\u044c\u043d\u0435\u0439\u0448\u0435\u0433\u043e \u0440\u0430\u0441\u0447\u0435\u0442\u0430 \u0434\u0438\u0444\u0444\u0435\u0440\u0435\u043d\u0446\u0438\u0430\u043b\u044c\u043d\u043e\u0439 \u044d\u043a\u0441\u043f\u0440\u0435\u0441\u0441\u0438\u0438 dds <- DESeqDataSetFromMatrix(countData = df, \u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0colData = meta, \u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0design = ~ status)  # \u0418\u0441\u043f\u043e\u043b\u044c\u0437\u0443\u0435\u043c \u043e\u0431\u0449\u0435\u043f\u0440\u0438\u043d\u044f\u0442\u044b\u0435 \u043d\u0430\u0438\u043c\u0435\u043d\u043e\u0432\u0430\u043d\u0438\u044f \u0433\u0435\u043d\u043e\u0432 symbols <- mapIds(org.Hs.eg.db, keys = genes, \u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0column = c('SYMBOL'),\u00a0 \u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0keytype = 'ENTREZID')  # \u0424\u0438\u043b\u044c\u0442\u0440\u0443\u0435\u043c \u043f\u0440\u043e\u043f\u0443\u0449\u0435\u043d\u043d\u044b\u0435 \u0437\u043d\u0430\u0447\u0435\u043d\u0438\u044f dds <- dds[!is.na(rownames(dds)),]  # \u0417\u0430\u043f\u0443\u0441\u043a \u0430\u043d\u0430\u043b\u0438\u0437\u0430 dds <- DESeq(dds) res <- results(dds)  # \u0421\u043e\u0445\u0440\u0430\u043d\u0435\u043d\u0438\u0435 \u0437\u043d\u0430\u0447\u0438\u043c\u044b\u0445 \u0434\u0438\u0444\u0444\u0435\u0440\u0435\u043d\u0446\u0438\u0430\u043b\u044c\u043d\u043e-\u044d\u043a\u0441\u043f\u0440\u0435\u0441\u0441\u0438\u0440\u0443\u044e\u0449\u0438\u0445\u0441\u044f \u0433\u0435\u043d\u043e\u0432 \u0434\u043b\u044f \u0432\u0438\u0437\u0443\u0430\u043b\u0438\u0437\u0430\u0446\u0438\u0438 significant_genes <- res[!is.na(respadj < 0.05 &\u00a0 \u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0!is.na(res$log2FoldChange) &\u00a0 \u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0abs(res$log2FoldChange) > 1, ]<\/code><\/pre>\n
    \u0427\u0430\u0441\u0442\u0438 \u0441\u043e \u0441\u0447\u0438\u0442\u044b\u0432\u0430\u043d\u0438\u0435\u043c \u0434\u0430\u043d\u043d\u044b\u0445 \u0438 \u0441\u043e\u0445\u0440\u0430\u043d\u0435\u043d\u0438\u0435\u043c \u0432 \u043f\u0435\u0440\u0435\u043c\u0435\u043d\u043d\u0443\u044e \u0432\u0440\u044f\u0434 \u043b\u0438 \u043d\u0443\u0436\u0434\u0430\u044e\u0442\u0441\u044f \u0432 \u043f\u043e\u044f\u0441\u043d\u0435\u043d\u0438\u0438. \u0422\u043e, \u0447\u0442\u043e \u0438\u0434\u0435\u0442 \u043f\u043e\u0441\u043b\u0435 \u0441\u0447\u0438\u0442\u044b\u0432\u0430\u043d\u0438\u044f \u2014 \u0441\u043e\u0437\u0434\u0430\u043d\u0438\u044f \u043e\u0431\u044a\u0435\u043a\u0442\u0430 \u00abdds\u00bb \u0434\u043b\u044f \u0440\u0430\u0441\u0447\u0435\u0442\u0430 \u0434\u0438\u0444\u0444\u0435\u0440\u0435\u043d\u0446\u0438\u0430\u043b\u044c\u043d\u043e\u0439 \u044d\u043a\u0441\u043f\u0440\u0435\u0441\u0441\u0438\u0438, \u043a\u0430\u043a \u044d\u0442\u043e \u043f\u0440\u0435\u0434\u0443\u0441\u043c\u043e\u0442\u0440\u0435\u043d\u043e \u0432 DESeq2. \u0421\u0442\u0440\u0443\u043a\u0442\u0443\u0440\u0430 \u00abdds\u00bb \u0432\u044b\u0433\u043b\u044f\u0434\u0438\u0442 \u0442\u0430\u043a:<\/p>\n
    Formal class 'DESeqDataSet' [package \"DESeq2\"] with 8 slots \u00a0\u00a0..@ design\u00a0 \u00a0 \u00a0 \u00a0 \u00a0 \u00a0 :Class 'formula'\u00a0 language ~status \u00a0\u00a0.. .. ..- attr(*, \".Environment\")=\u00a0 \u00a0\u00a0..@ dispersionFunction:function ()\u00a0\u00a0 \u00a0\u00a0..@ rowRanges \u00a0 \u00a0 \u00a0 \u00a0 :Formal class 'CompressedGRangesList' [package \"GenomicRanges\"] with 5 slots \u00a0\u00a0.. .. ..@ unlistData \u00a0 \u00a0 :Formal class 'GRanges' [package \"GenomicRanges\"] with 7 slots \u00a0\u00a0.. .. .. .. ..@ seqnames \u00a0 \u00a0 \u00a0 :Formal class 'Rle' [package \"S4Vectors\"] with 4 slots \u00a0\u00a0.. .. .. .. .. .. ..@ values \u00a0 \u00a0 \u00a0 \u00a0 : Factor w\/ 0 levels:\u00a0 \u00a0\u00a0.. .. .. .. .. .. ..@ lengths\u00a0 \u00a0 \u00a0 \u00a0 : int(0)\u00a0 \u00a0\u00a0.. .. .. .. .. .. ..@ elementMetadata: NULL \u00a0\u00a0.. .. .. .. .. .. ..@ metadata \u00a0 \u00a0 \u00a0 : list() \u00a0\u00a0.. .. .. .. ..@ ranges \u00a0 \u00a0 \u00a0 \u00a0 :Formal class 'IRanges' [package \"IRanges\"] with 6 slots \u00a0\u00a0.. .. .. .. .. .. ..@ start\u00a0 \u00a0 \u00a0 \u00a0 \u00a0 : int(0)\u00a0 \u00a0\u00a0.. .. .. .. .. .. ..@ width\u00a0 \u00a0 \u00a0 \u00a0 \u00a0 : int(0)\u00a0 \u00a0\u00a0.. .. .. .. .. .. ..@ NAMES\u00a0 \u00a0 \u00a0 \u00a0 \u00a0 : NULL \u00a0\u00a0.. .. .. .. .. .. ..@ elementType\u00a0 \u00a0 : chr \"ANY\" \u00a0\u00a0.. .. .. .. .. .. ..@ elementMetadata: NULL \u00a0\u00a0.. .. .. .. .. .. ..@ metadata \u00a0 \u00a0 \u00a0 : list() \u00a0\u00a0.. .. .. .. ..@ strand \u00a0 \u00a0 \u00a0 \u00a0 :Formal class 'Rle' [package \"S4Vectors\"] with 4 slots \u00a0\u00a0.. .. .. .. .. .. ..@ values \u00a0 \u00a0 \u00a0 \u00a0 : Factor w\/ 3 levels \"+\",\"-\",\"*\":\u00a0 \u00a0\u00a0.. .. .. .. .. .. ..@ lengths\u00a0 \u00a0 \u00a0 \u00a0 : int(0)\u00a0 \u00a0\u00a0.. .. .. .. .. .. ..@ elementMetadata: NULL \u00a0\u00a0.. .. .. .. .. .. ..@ metadata \u00a0 \u00a0 \u00a0 : list() \u00a0\u00a0.. .. .. .. ..@ seqinfo\u00a0 \u00a0 \u00a0 \u00a0 :Formal class 'Seqinfo' [package \"GenomeInfoDb\"] with 4 slots \u00a0\u00a0.. .. .. .. .. .. ..@ seqnames \u00a0 : chr(0)\u00a0 \u00a0\u00a0.. .. .. .. .. .. ..@ seqlengths : int(0)\u00a0 \u00a0\u00a0.. .. .. .. .. .. ..@ is_circular: logi(0)\u00a0 \u00a0\u00a0.. .. .. .. .. .. ..@ genome \u00a0 \u00a0 : chr(0)\u00a0 \u00a0\u00a0.. .. .. .. ..@ elementMetadata:Formal class 'DFrame' [package \"S4Vectors\"] with 6 slots \u00a0\u00a0.. .. .. .. .. .. ..@ rownames \u00a0 \u00a0 \u00a0 : NULL \u00a0\u00a0.. .. .. .. .. .. ..@ nrows\u00a0 \u00a0 \u00a0 \u00a0 \u00a0 : int 0 \u00a0\u00a0.. .. .. .. .. .. ..@ elementType\u00a0 \u00a0 : chr \"ANY\" \u00a0\u00a0.. .. .. .. .. .. ..@ elementMetadata: NULL \u00a0\u00a0.. .. .. .. .. .. ..@ metadata \u00a0 \u00a0 \u00a0 : list() \u00a0\u00a0.. .. .. .. .. .. ..@ listData \u00a0 \u00a0 \u00a0 : Named list() \u00a0\u00a0.. .. .. .. ..@ elementType\u00a0 \u00a0 : chr \"ANY\" \u00a0\u00a0.. .. .. .. ..@ metadata \u00a0 \u00a0 \u00a0 : list() \u00a0\u00a0.. .. ..@ elementMetadata:Formal class 'DFrame' [package \"S4Vectors\"] with 6 slots \u00a0\u00a0.. .. .. .. ..@ rownames \u00a0 \u00a0 \u00a0 : NULL \u00a0\u00a0.. .. .. .. ..@ nrows\u00a0 \u00a0 \u00a0 \u00a0 \u00a0 : int 39376 \u00a0\u00a0.. .. .. .. ..@ elementType\u00a0 \u00a0 : chr \"ANY\" \u00a0\u00a0.. .. .. .. ..@ elementMetadata:Formal class 'DFrame' [package \"S4Vectors\"] with 6 slots \u00a0\u00a0.. .. .. .. .. .. ..@ rownames \u00a0 \u00a0 \u00a0 : NULL \u00a0\u00a0.. .. .. .. .. .. ..@ nrows\u00a0 \u00a0 \u00a0 \u00a0 \u00a0 : int 0 \u00a0\u00a0.. .. .. .. .. .. ..@ elementType\u00a0 \u00a0 : chr \"ANY\" \u00a0\u00a0.. .. .. .. .. .. ..@ elementMetadata: NULL \u00a0\u00a0.. .. .. .. .. .. ..@ metadata \u00a0 \u00a0 \u00a0 : list() \u00a0\u00a0.. .. .. .. .. .. ..@ listData \u00a0 \u00a0 \u00a0 :List of 2 \u00a0\u00a0.. .. .. .. .. .. .. ..$ type \u00a0 \u00a0 \u00a0 : chr(0)\u00a0 \u00a0\u00a0.. .. .. .. .. .. .. ..$ description: chr(0)\u00a0 \u00a0\u00a0.. .. .. .. ..@ metadata \u00a0 \u00a0 \u00a0 : list() \u00a0\u00a0.. .. .. .. ..@ listData \u00a0 \u00a0 \u00a0 : Named list() \u00a0\u00a0.. .. ..@ elementType\u00a0 \u00a0 : chr \"GRanges\" \u00a0\u00a0.. .. ..@ metadata \u00a0 \u00a0 \u00a0 : list() \u00a0\u00a0.. .. ..@ partitioning \u00a0 :Formal class 'PartitioningByEnd' [package \"IRanges\"] with 5 slots \u00a0\u00a0.. .. .. .. ..@ end\u00a0 \u00a0 \u00a0 \u00a0 \u00a0 \u00a0 : int [1:39376] 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 ... \u00a0\u00a0.. .. .. .. ..@ NAMES\u00a0 \u00a0 \u00a0 \u00a0 \u00a0 : chr [1:39376] \"100287102\" \"653635\" \"102466751\" \"107985730\" ... \u00a0\u00a0.. .. .. .. ..@ elementType\u00a0 \u00a0 : chr \"ANY\" \u00a0\u00a0.. .. .. .. ..@ elementMetadata: NULL \u00a0\u00a0.. .. .. .. ..@ metadata \u00a0 \u00a0 \u00a0 : list() \u00a0\u00a0..@ colData \u00a0 \u00a0 \u00a0 \u00a0 \u00a0 :Formal class 'DFrame' [package \"S4Vectors\"] with 6 slots \u00a0\u00a0.. .. ..@ rownames \u00a0 \u00a0 \u00a0 : chr [1:34] \"GSM5073707\" \"GSM5073709\" \"GSM5073710\" \"GSM5073711\" ... \u00a0\u00a0.. .. ..@ nrows\u00a0 \u00a0 \u00a0 \u00a0 \u00a0 : int 34 \u00a0\u00a0.. .. ..@ elementType\u00a0 \u00a0 : chr \"ANY\" \u00a0\u00a0.. .. ..@ elementMetadata:Formal class 'DFrame' [package \"S4Vectors\"] with 6 slots \u00a0\u00a0.. .. .. .. ..@ rownames \u00a0 \u00a0 \u00a0 : NULL \u00a0\u00a0.. .. .. .. ..@ nrows\u00a0 \u00a0 \u00a0 \u00a0 \u00a0 : int 2 \u00a0\u00a0.. .. .. .. ..@ elementType\u00a0 \u00a0 : chr \"ANY\" \u00a0\u00a0.. .. .. .. ..@ elementMetadata: NULL \u00a0\u00a0.. .. .. .. ..@ metadata \u00a0 \u00a0 \u00a0 : list() \u00a0\u00a0.. .. .. .. ..@ listData \u00a0 \u00a0 \u00a0 :List of 2 \u00a0\u00a0.. .. .. .. .. ..$ type \u00a0 \u00a0 \u00a0 : chr [1:2] \"input\" \"input\" \u00a0\u00a0.. .. .. .. .. ..$ description: chr [1:2] \"\" \"\" \u00a0\u00a0.. .. ..@ metadata \u00a0 \u00a0 \u00a0 : list() \u00a0\u00a0.. .. ..@ listData \u00a0 \u00a0 \u00a0 :List of 2 \u00a0\u00a0.. .. .. ..$ sample: chr [1:34] \"GSM5073707\" \"GSM5073709\" \"GSM5073710\" \"GSM5073711\" ... \u00a0\u00a0.. .. .. ..$ status: Factor w\/ 2 levels \"COVID-19 Negative\",..: 1 1 1 1 2 2 2 2 2 2 ... \u00a0\u00a0..@ assays\u00a0 \u00a0 \u00a0 \u00a0 \u00a0 \u00a0 :Formal class 'SimpleAssays' [package \"SummarizedExperiment\"] with 1 slot \u00a0\u00a0.. .. ..@ data:Formal class 'SimpleList' [package \"S4Vectors\"] with 4 slots \u00a0\u00a0.. .. .. .. ..@ listData \u00a0 \u00a0 \u00a0 :List of 1 \u00a0\u00a0.. .. .. .. .. ..$ counts: int [1:39376, 1:34] 8 26 2 4 3 6 0 15 36 9 ... \u00a0\u00a0.. .. .. .. .. .. ..- attr(*, \"dimnames\")=List of 2 \u00a0\u00a0.. .. .. .. .. .. .. ..$ : chr [1:39376] \"100287102\" \"653635\" \"102466751\" \"107985730\" ... \u00a0\u00a0.. .. .. .. .. .. .. ..$ : chr [1:34] \"GSM5073707\" \"GSM5073709\" \"GSM5073710\" \"GSM5073711\" ... \u00a0\u00a0.. .. .. .. ..@ elementType\u00a0 \u00a0 : chr \"ANY\" \u00a0\u00a0.. .. .. .. ..@ elementMetadata: NULL \u00a0\u00a0.. .. .. .. ..@ metadata \u00a0 \u00a0 \u00a0 : list() \u00a0\u00a0..@ NAMES \u00a0 \u00a0 \u00a0 \u00a0 \u00a0 \u00a0 : NULL \u00a0\u00a0..@ elementMetadata \u00a0 :Formal class 'DFrame' [package \"S4Vectors\"] with 6 slots \u00a0\u00a0.. .. ..@ rownames \u00a0 \u00a0 \u00a0 : NULL \u00a0\u00a0.. .. ..@ nrows\u00a0 \u00a0 \u00a0 \u00a0 \u00a0 : int 39376 \u00a0\u00a0.. .. ..@ elementType\u00a0 \u00a0 : chr \"ANY\" \u00a0\u00a0.. .. ..@ elementMetadata: NULL \u00a0\u00a0.. .. ..@ metadata \u00a0 \u00a0 \u00a0 : list() \u00a0\u00a0.. .. ..@ listData \u00a0 \u00a0 \u00a0 : Named list() \u00a0\u00a0..@ metadata\u00a0 \u00a0 \u00a0 \u00a0 \u00a0 :List of 1 \u00a0\u00a0.. ..$ version:Classes 'package_version', 'numeric_version'\u00a0 hidden list of 1 \u00a0\u00a0.. .. ..$ : int [1:3] 1 44 0 <\/code><\/pre>\n
    \u042d\u0442\u043e \u0434\u043e\u0432\u043e\u043b\u044c\u043d\u043e \u0441\u043b\u043e\u0436\u043d\u0430\u044f \u0441\u0442\u0440\u0443\u043a\u0442\u0443\u0440\u0430, \u0441\u043e\u0434\u0435\u0440\u0436\u0430\u0449\u0430\u044f \u043a\u0430\u043a \u043c\u0430\u0442\u0440\u0438\u0446\u044b \u0441 \u0434\u0430\u043d\u043d\u044b\u043c\u0438, \u0442\u0430\u043a \u0438 \u0432\u0435\u043a\u0442\u043e\u0440\u044b \u0432\u0441\u0435\u0445 \u043d\u0430\u0438\u043c\u0435\u043d\u043e\u0432\u0430\u043d\u0438\u0439 \u0441\u0442\u043e\u043b\u0431\u0446\u043e\u0432 \u0438 \u0441\u0442\u0440\u043e\u043a, \u043c\u0435\u0442\u0430\u0434\u0430\u043d\u043d\u044b\u0435 \u0441 \u0443\u043a\u0430\u0437\u0430\u043d\u0438\u044f\u043c\u0438 \u043e \u0442\u043e\u043c, \u043a\u0430\u043a\u0438\u0435 \u043e\u0431\u0440\u0430\u0437\u0446\u044b \u043c\u044b \u0441\u0447\u0438\u0442\u0430\u0435\u043c \u00ab\u044d\u043a\u0441\u043f\u0435\u0440\u0438\u043c\u0435\u043d\u0442\u0430\u043b\u044c\u043d\u044b\u043c\u0438\u00bb, \u0430 \u043a\u0430\u043a\u0438\u0435 \u2014 \u00ab\u043a\u043e\u043d\u0442\u0440\u043e\u043b\u0435\u043c\u00bb. \u0412 \u0442\u0430\u043a\u043e\u043c \u0432\u0438\u0434\u0435 \u043e\u0431\u044a\u0435\u043a\u0442 \u043c\u043e\u0436\u0435\u0442 \u0431\u044b\u0442\u044c \u043f\u0440\u0438\u043d\u044f\u0442 \u0444\u0443\u043d\u043a\u0446\u0438\u0435\u0439 DESeq. \u0412 \u043d\u0430\u0448\u0435\u043c \u0441\u043b\u0443\u0447\u0430\u0435, \u043d\u0435 \u0442\u0440\u0435\u0431\u0443\u0435\u0442\u0441\u044f \u0440\u0435\u0433\u0443\u043b\u0438\u0440\u043e\u0432\u0430\u0442\u044c \u0435\u0435 \u043f\u0430\u0440\u0430\u043c\u0435\u0442\u0440\u044b, \u043f\u043e\u044d\u0442\u043e\u043c\u0443 \u0432 \u043a\u043e\u0434\u0435 \u043d\u0438\u043a\u0430\u043a\u0438\u0445 \u0430\u0440\u0433\u0443\u043c\u0435\u043d\u0442\u043e\u0432 \u043d\u0435 \u0438\u0441\u043f\u043e\u043b\u044c\u0437\u043e\u0432\u0430\u043d\u043e (\u0441\u043c\u043e\u0442\u0440\u0438 \u0432\u044b\u0448\u0435 \u043f\u0440\u0438\u043c\u0435\u0440 \u043a\u043e\u0434\u0430, \u0441\u0442\u0440\u043e\u0447\u043a\u0443 DESeq(dds)).<\/p>\n
    \u0414\u0440\u0443\u0433\u043e\u0439 \u043c\u043e\u043c\u0435\u043d\u0442 \u2014 \u043f\u0435\u0440\u0435\u0438\u043c\u0435\u043d\u043e\u0432\u0430\u043d\u0438\u0435 \u0441\u0442\u0440\u043e\u043a. \u0425\u043e\u0442\u044f \u0432 \u0441\u0442\u0440\u0443\u043a\u0442\u0443\u0440\u0435 \u043e\u0431\u044a\u0435\u043a\u0442\u0430 \u0442\u0440\u0443\u0434\u043d\u043e \u043f\u043e\u043d\u044f\u0442\u044c \u043d\u0430\u0432\u0435\u0440\u043d\u044f\u043a\u0430, \u0433\u0434\u0435 \u0440\u0430\u0441\u043f\u043e\u043b\u043e\u0436\u0435\u043d\u044b \u0438\u0441\u043a\u043e\u043c\u044b\u0435 \u0441\u0442\u0440\u043e\u043a\u0438, \u043d\u043e \u043d\u0430\u043c \u044d\u0442\u043e \u0438 \u043d\u0435 \u043d\u0443\u0436\u043d\u043e. \u0412 \u043e\u0431\u0449\u0435\u043c \u0441\u043b\u0443\u0447\u0430\u0435 \u0434\u043e\u0441\u0442\u0430\u0442\u043e\u0447\u043d\u043e \u0438\u0441\u043f\u043e\u043b\u044c\u0437\u043e\u0432\u0430\u0442\u044c rownames(dds), \u0447\u0442\u043e\u0431\u044b \u0438\u0445 \u0438\u0437\u0432\u043b\u0435\u0447\u044c. \u041d\u0430\u0447\u0430\u043b\u044c\u043d\u0430\u044f \u043c\u0430\u0442\u0440\u0438\u0446\u0430, \u0443 \u043a\u043e\u0442\u043e\u0440\u043e\u0439 \u0435\u0441\u0442\u044c \u0438\u043c\u0435\u043d\u0430 \u0441\u0442\u0440\u043e\u043a, \u043d\u0438\u043a\u0443\u0434\u0430 \u043d\u0435 \u0434\u0435\u043b\u0430\u0441\u044c (\u041a\u0430\u0440\u0442\u0438\u043d\u043a\u0430 2). \u0412 \u043a\u043e\u0434\u0435 \u0432\u044b \u043c\u043e\u0436\u0435\u0442\u0435 \u0437\u0430\u043c\u0435\u0442\u0438\u0442\u044c, \u0447\u0442\u043e \u043c\u044b \u043d\u0435 \u043f\u0435\u0440\u0435\u0438\u043c\u0435\u043d\u043e\u0432\u044b\u0432\u0430\u0435\u043c \u0441\u0442\u0440\u043e\u043a\u0438, \u0442\u0430\u043a \u043a\u0430\u043a \u0438\u043c\u0435\u043d\u0430 \u0432 \u0442\u0430\u043a\u043e\u043c \u0447\u0438\u0441\u043b\u0435\u043d\u043d\u043e\u043c \u0444\u043e\u0440\u043c\u0430\u0442\u0435 entrez id, \u043a\u0430\u043a \u043d\u0430 \u041a\u0430\u0440\u0442\u0438\u043d\u043a\u0435 2, \u043d\u0430\u043c \u0435\u0449\u0435 \u043f\u0440\u0438\u0433\u043e\u0434\u044f\u0442\u0441\u044f. \u0415\u0441\u043b\u0438 \u0436\u0435 \u0442\u0440\u0435\u0431\u0443\u0435\u0442\u0441\u044f \u043b\u0438\u0448\u044c \u0440\u0430\u0441\u0441\u0447\u0438\u0442\u0430\u0442\u044c \u0434\u0438\u0444\u0444\u0435\u0440\u0435\u043d\u0446\u0438\u0430\u043b\u044c\u043d\u0443\u044e \u044d\u043a\u0441\u043f\u0440\u0435\u0441\u0441\u0438\u044e \u0438 \u043f\u043e\u0441\u0442\u0440\u043e\u0438\u0442\u044c \u0432\u0438\u0437\u0443\u0430\u043b\u0438\u0437\u0430\u0446\u0438\u044e, \u0442\u043e:<\/p>\n
    if (length(rownames(dds) == length(symbols))){       rownames(dds) <- symbols } else {       print(\u00bb\u0414\u043b\u0438\u043d\u044b \u0432\u0435\u043a\u0442\u043e\u0440\u043e\u0432 \u043d\u0430\u0437\u0432\u0430\u043d\u0438\u0439 \u0433\u0435\u043d\u043e\u0432 \u043d\u0435 \u0441\u043e\u0432\u043f\u0430\u0434\u0430\u044e\u0442\u00bb) }<\/code><\/pre>\n
    \u0418 \u0441\u043c\u0435\u043b\u043e \u0438\u0441\u043f\u043e\u043b\u044c\u0437\u0443\u0435\u043c \u043a\u043e\u0434 \u0434\u043b\u044f \u0432\u0438\u0437\u0443\u0430\u043b\u0438\u0437\u0430\u0446\u0438\u0438 \u043f\u043e\u0441\u043b\u0435 DESeq \u0438 results, \u043d\u0430\u043f\u0440\u0438\u043c\u0435\u0440:<\/p>\n
    DESeq2::plotMA(dds, ylim = c(-5,5))  <\/code><\/pre>\n
    \"\u041a\u0430\u0440\u0442\u0438\u043d\u043a\u0430<\/p>\n
    \u041a\u0430\u0440\u0442\u0438\u043d\u043a\u0430 4. \u041f\u0440\u0438\u043c\u0435\u0440 MA-plot.<\/figcaption><\/div>\n<\/figure>\n
    \u041a\u0430\u0436\u0434\u0430\u044f \u0442\u043e\u0447\u043a\u0430 \u041a\u0430\u0440\u0442\u0438\u043d\u043a\u0435 4 \u2014 \u0433\u0435\u043d. \u0422\u0430\u043a\u0438\u0445 \u0442\u043e\u0447\u0435\u043a \u0441\u0442\u043e\u043b\u044c\u043a\u043e, \u0441\u043a\u043e\u043b\u044c\u043a\u043e \u0441\u0442\u0440\u043e\u043a \u0432 \u043c\u0430\u0442\u0440\u0438\u0446\u0435 \u043d\u0430 \u041a\u0430\u0440\u0442\u0438\u043d\u043a\u0435 2. \u041f\u043e\u043b\u043e\u0436\u0435\u043d\u0438\u0435 \u0442\u043e\u0447\u043a\u0438 \u043f\u043e \u043e\u0441\u0438 Y \u043e\u0442\u0440\u0430\u0436\u0430\u0435\u0442, \u0447\u0442\u043e \u043f\u0440\u043e\u0438\u0441\u0445\u043e\u0434\u0438\u0442 \u0441 \u0433\u0435\u043d\u043e\u043c \u0432 \u044d\u043a\u0441\u043f\u0435\u0440\u0438\u043c\u0435\u043d\u0442\u0435 \u043f\u043e \u043e\u0442\u043d\u043e\u0448\u0435\u043d\u0438\u044e \u043a \u043a\u043e\u043d\u0442\u0440\u043e\u043b\u044e — \u0435\u0433\u043e \u044d\u043a\u0441\u043f\u0440\u0435\u0441\u0441\u0438\u044f \u043f\u0430\u0434\u0430\u0435\u0442 \u043b\u0438\u0431\u043e \u0432\u043e\u0437\u0440\u0430\u0441\u0442\u0430\u0435\u0442. \u041f\u0440\u0438\u0442\u043e\u043c, \u0437\u0434\u0435\u0441\u044c \u044d\u043a\u0441\u043f\u0440\u0435\u0441\u0441\u0438\u044f \u044d\u0442\u043e \u043b\u043e\u0433\u0430\u0440\u0438\u0444\u043c\u0438\u0447\u0435\u0441\u043a\u0438\u0439, \u0442.\u0435. \u0431\u0435\u0437\u0440\u0430\u0437\u043c\u0435\u0440\u043d\u044b\u0439 \u043f\u043e\u043a\u0430\u0437\u0430\u0442\u0435\u043b\u044c. \u041f\u043e\u043b\u043e\u0436\u0435\u043d\u0438\u0435 \u043f\u043e \u043e\u0441\u0438 X — \u044d\u0442\u043e \u0441\u0440\u0435\u0434\u043d\u0435\u0435 \u043a\u043e\u043b\u0438\u0447\u0435\u0441\u0442\u0432\u043e \u0442\u0440\u0430\u043d\u0441\u043a\u0440\u0438\u043f\u0442\u043e\u0432 (\u044d\u043a\u0437\u0435\u043c\u043f\u043b\u044f\u0440\u043e\u0432 \u0433\u0435\u043d\u0430) \u0432 \u043a\u043e\u043d\u0442\u0440\u043e\u043b\u0435. \u0422\u0430\u043a\u0438\u043c \u0441\u043f\u043e\u0441\u043e\u0431\u043e\u043c \u043c\u044b \u043c\u043e\u0436\u0435\u043c \u0431\u044b\u0441\u0442\u0440\u043e \u043e\u0446\u0435\u043d\u0438\u0442\u044c, \u043f\u0440\u043e\u0438\u0441\u0445\u043e\u0434\u0438\u0442 \u043b\u0438 \u0432 \u043d\u0430\u0448\u0435\u043c \u044d\u043a\u0441\u043f\u0435\u0440\u0438\u043c\u0435\u043d\u0442\u0435 \u0447\u0442\u043e-\u0442\u043e, \u0432\u043b\u0438\u044f\u044e\u0449\u0435\u0435 \u043d\u0430 \u044d\u043a\u0441\u043f\u0440\u0435\u0441\u0441\u0438\u044e \u0433\u0435\u043d\u043e\u0432. \u041a\u0430\u043a \u0432\u0438\u0434\u0438\u043c, \u043c\u043d\u043e\u0433\u043e \u0441\u0438\u043d\u0438\u0445 \u0442\u043e\u0447\u0435\u043a — \u0437\u043d\u0430\u0447\u0438\u043c\u043e \u0434\u0438\u0444\u0444\u0435\u0440\u0435\u043d\u0446\u0438\u0430\u043b\u044c\u043d\u043e-\u044d\u043a\u0441\u043f\u0440\u0435\u0441\u0441\u0438\u0440\u0443\u044e\u0449\u0438\u0445\u0441\u044f \u0433\u0435\u043d\u043e\u0432. <\/p>\n
    \u0414\u043b\u044f \u0431\u043e\u043b\u0435\u0435 \u043a\u043e\u043c\u043f\u043b\u0435\u043a\u0441\u043d\u044b\u0445 \u0432\u0438\u0437\u0443\u0430\u043b\u0438\u0437\u0430\u0446\u0438\u0439 \u2014 Heatmap:<\/p>\n
    # \u0418\u0437\u0432\u043b\u0435\u0447\u0435\u043d\u0438\u0435 \u043d\u043e\u0440\u043c\u0430\u043b\u0438\u0437\u043e\u0432\u0430\u043d\u043d\u044b\u0445 \u0434\u0430\u043d\u043d\u044b\u0445 \u0434\u043b\u044f \u0437\u043d\u0430\u0447\u0438\u043c\u044b\u0445 \u0433\u0435\u043d\u043e\u0432 significant_gene_names <- rownames(significant_genes) normalized_counts <- counts(dds, normalized = TRUE)[significant_gene_names, ]  # \u041b\u043e\u0433\u0430\u0440\u0438\u0444\u043c\u0438\u0440\u043e\u0432\u0430\u043d\u0438\u0435 \u0434\u043b\u044f \u0443\u043c\u0435\u043d\u044c\u0448\u0435\u043d\u0438\u044f \u044d\u0444\u0444\u0435\u043a\u0442\u0430 \u0432\u044b\u0431\u0440\u043e\u0441\u043e\u0432 log_normalized_counts <- log2(normalized_counts + 1)  # \u0421\u043e\u0437\u0434\u0430\u043d\u0438\u0435 \u0430\u043d\u043d\u043e\u0442\u0430\u0446\u0438\u0438 \u043e\u0431\u0440\u0430\u0437\u0446\u043e\u0432 sample_annotation <- HeatmapAnnotation(   status = meta$status,   col = list(status = c(\u00abcontrol\u00bb = \u00abblue\u00bb, \u00abcase\u00bb = \u00abred\u00bb)) )  # \u0426\u0432\u0435\u0442\u043e\u0432\u0430\u044f \u0448\u043a\u0430\u043b\u0430 \u0434\u043b\u044f \u0442\u0435\u043f\u043b\u043e\u0432\u043e\u0439 \u043a\u0430\u0440\u0442\u044b col_fun <- colorRamp2(c(-2, 0, 2), c(\u00abblue\u00bb, \u00abwhite\u00bb, \u00abred\u00bb))  # \u041f\u043e\u0441\u0442\u0440\u043e\u0435\u043d\u0438\u0435 \u0442\u0435\u043f\u043b\u043e\u0432\u043e\u0439 \u043a\u0430\u0440\u0442\u044b Heatmap( \u00a0\u00a0log_normalized_counts, \u00a0\u00a0name = \u00abExpression\u00bb, \u00a0\u00a0top_annotation = sample_annotation, \u00a0\u00a0col = col_fun, \u00a0\u00a0show_row_names = TRUE, \u00a0\u00a0show_column_names = TRUE, \u00a0\u00a0row_names_gp = gpar(fontsize = 8), \u00a0\u00a0column_names_gp = gpar(fontsize = 8), \u00a0\u00a0cluster_rows = TRUE, \u00a0\u00a0cluster_columns = TRUE, \u00a0\u00a0row_title = \u00abSignificant Genes\u00bb, \u00a0\u00a0column_title = \u00abSamples\u00bb, \u00a0\u00a0heatmap_legend_param = list( \u00a0\u00a0\u00a0\u00a0title = \u00abExpression\u00bb, \u00a0\u00a0\u00a0\u00a0at = c(-2, 0, 2), \u00a0\u00a0\u00a0\u00a0labels = c(\u00abLow\u00bb, \u00abMedium\u00bb, \u00abHigh\u00bb) \u00a0\u00a0) )<\/code><\/pre>\n
    ComplexHeatmap \u043f\u043e\u0432\u0437\u043e\u043b\u044f\u0435\u0442 \u0441\u0442\u0440\u043e\u0438\u0442\u044c \u0432\u0438\u0437\u0443\u0430\u043b\u0438\u0437\u0430\u0446\u0438\u0438 \u0434\u0438\u0444\u0444\u0435\u0440\u0435\u043d\u0446\u0438\u0430\u043b\u044c\u043d\u043e\u0439 \u044d\u043a\u0441\u043f\u0440\u0435\u0441\u0441\u0438\u0438. \u041f\u0440\u0438 \u043f\u043e\u0441\u0442\u0440\u043e\u0435\u043d\u0438\u0438 \u043f\u0440\u043e\u0438\u0441\u0445\u043e\u0434\u0438\u0442 \u0438 \u0438\u0435\u0440\u0430\u0440\u0445\u0438\u0447\u0435\u0441\u043a\u0430\u044f \u043a\u043b\u0430\u0441\u0442\u0435\u0440\u0438\u0437\u0430\u0446\u0438\u044f. \u0420\u0435\u0437\u0443\u043b\u044c\u0442\u0430\u0442 \u043c\u043e\u0436\u043d\u043e \u0443\u0432\u0438\u0434\u0435\u0442\u044c \u043d\u0430 \u041a\u0430\u0440\u0442\u0438\u043d\u043a\u0435 5. \u041d\u0430 \u043d\u0435\u0439 \u0433\u0435\u043d\u044b (\u0441\u0442\u0440\u043e\u043a\u0438) \u0441\u0433\u0440\u0443\u043f\u043f\u0438\u0440\u043e\u0432\u0430\u043d\u044b \u043f\u043e \u043f\u0430\u0442\u0442\u0435\u0440\u043d\u0443 \u0438\u0437\u043c\u0435\u043d\u0435\u043d\u0438\u044f \u044d\u043a\u0441\u043f\u0440\u0435\u0441\u0441\u0438\u0438. \u041e\u0431\u0440\u0430\u0437\u0446\u044b (\u0441\u0442\u043e\u043b\u0431\u0446\u044b) \u0442\u043e\u0436\u0435. \u041a\u043e\u043d\u0442\u0440\u043e\u043b\u044c \u2014 \u043b\u044e\u0434\u0438, \u043d\u0435 \u043f\u0435\u0440\u0435\u0431\u043e\u043b\u0435\u0432\u0448\u0438\u0435 \u043a\u043e\u0440\u043e\u043d\u0430\u0432\u0438\u0440\u0443\u0441\u043e\u043c — \u043f\u043e\u043c\u0435\u0447\u0435\u043d\u044b \u043d\u0430\u0434 \u0434\u0438\u0430\u0433\u0440\u0430\u043c\u043c\u043e\u0439 \u0441\u0438\u0440\u0435\u043d\u0435\u0432\u044b\u043c\u0438 \u043f\u0440\u044f\u043c\u043e\u0443\u0433\u043e\u043b\u044c\u043d\u0438\u043a\u0430\u043c\u0438. \u0412\u0441\u0435 \u043e\u0441\u0442\u0430\u043b\u044c\u043d\u044b\u0435 — \u043f\u0435\u0440\u0435\u0431\u043e\u043b\u0435\u0432\u0448\u0438\u0435.<\/p>\n
    \"\u041a\u0430\u0440\u0442\u0438\u043d\u043a\u0430<\/p>\n
    \u041a\u0430\u0440\u0442\u0438\u043d\u043a\u0430 5. \u041f\u0440\u0438\u043c\u0435\u0440 Heatmap.<\/figcaption><\/div>\n<\/figure>\n
    \u041a\u0440\u0430\u0441\u043d\u044b\u043c \u043d\u0430 \u041a\u0430\u0440\u0442\u0438\u043d\u043a\u0435 5 \u2014 \u043f\u043e\u0432\u044b\u0448\u0435\u043d\u0438\u0435 \u044d\u043a\u0441\u043f\u0440\u0435\u0441\u0441\u0438\u0438, \u0441\u0438\u043d\u0438\u043c — \u043f\u043e\u043d\u0438\u0436\u0435\u043d\u0438\u0435. \u0421\u0442\u043e\u043b\u0431\u0446\u044b — \u043e\u0442\u0434\u0435\u043b\u044c\u043d\u044b\u0435 \u043e\u0431\u0440\u0430\u0437\u0446\u044b, \u043f\u0440\u0438\u0442\u043e\u043c \u0441\u0438\u0440\u0435\u043d\u0435\u0432\u044b\u0435 — \u044d\u0442\u043e \u043a\u043e\u043d\u0442\u0440\u043e\u043b\u044c\u043d\u044b\u0435, \u043e\u0431\u0440\u0430\u0437\u0446\u044b \u0437\u0434\u043e\u0440\u043e\u0432\u044b\u0445 \u043b\u044e\u0434\u0435\u0439,, \u0430 \u0436\u0435\u043b\u0442\u044b\u0435 — \u044d\u043a\u0441\u043f\u0435\u0440\u0438\u043c\u0435\u043d\u0442, \u043e\u0431\u0440\u0430\u0437\u0446\u044b \u043b\u044e\u0434\u0435\u0439 \u0441 \u043f\u043e\u0434\u0442\u0432\u0435\u0440\u0436\u0434\u0435\u043d\u043d\u043e\u0439 \u043a\u043e\u0440\u043e\u043d\u0430\u0432\u0438\u0440\u0443\u0441\u043d\u043e\u0439 \u0438\u043d\u0444\u0435\u043a\u0446\u0438\u0435\u0439.. \u0421\u0442\u0440\u043e\u043a\u0438 — \u044d\u0442\u043e \u0433\u0435\u043d\u044b, \u043a\u043b\u0430\u0441\u0442\u0435\u0440\u0438\u0437\u043e\u0432\u0430\u043d\u043d\u044b\u0435 \u043f\u043e \u0445\u0430\u0440\u0430\u043a\u0442\u0435\u0440\u0443 \u044d\u043a\u0441\u043f\u0440\u0435\u0441\u0441\u0438\u0438. \u041c\u043e\u0436\u043d\u043e \u043d\u0430\u0433\u043b\u044f\u0434\u043d\u043e \u0437\u0430\u043c\u0435\u0442\u0438\u0442\u044c, \u043d\u0430\u0441\u043a\u043e\u043b\u044c\u043a\u043e \u044d\u043a\u0441\u043f\u0440\u0435\u0441\u0441\u0438\u044f \u043e\u0442\u043b\u0438\u0447\u0430\u0435\u0442\u0441\u044f \u043c\u0435\u0436\u0434\u0443 \u043a\u043e\u043d\u0442\u0440\u043e\u043b\u0435\u043c \u0438 \u044d\u043a\u0441\u043f\u0435\u0440\u0438\u043c\u0435\u043d\u0442\u043e\u043c, \u043a\u043e\u043d\u0442\u0440\u043e\u043b\u044c\u043d\u044b\u0435 \u043e\u0431\u0440\u0430\u0437\u0446\u044b (\u0438 \u043e\u0434\u0438\u043d \u043e\u0431\u0440\u0430\u0437\u0435\u0446 \u043f\u0435\u0440\u0435\u0431\u043e\u043b\u0435\u0432\u0448\u0435\u0433\u043e \u0447\u0435\u043b\u043e\u0432\u0435\u043a\u0430, \u043f\u043e-\u0432\u0438\u0434\u0438\u043c\u043e\u043c\u0443, \u0432\u044b\u0431\u0440\u043e\u0441) \u0447\u0435\u0442\u043a\u043e \u0441\u0433\u0440\u0443\u043f\u043f\u0438\u0440\u043e\u0432\u0430\u043b\u0438\u0441\u044c \u043f\u043e \u0445\u0430\u0440\u0430\u043a\u0442\u0435\u0440\u0443 \u044d\u043a\u0441\u043f\u0440\u0435\u0441\u0441\u0438\u0438 \u0441\u043b\u0435\u0432\u0430. \u041c\u043e\u0436\u0435\u043c \u0432\u0438\u0434\u0435\u0442\u044c, \u0447\u0442\u043e \u044d\u043a\u0441\u043f\u0440\u0435\u0441\u0441\u0438\u044f \u0433\u0435\u043d\u043e\u0432 \u0432\u0432\u0435\u0440\u0445\u0443 \u0434\u0438\u0430\u0433\u0440\u0430\u043c\u043c\u044b \u0432 \u043a\u043e\u043d\u0442\u0440\u043e\u043b\u044c\u043d\u044b\u0445 \u043e\u0431\u0440\u0430\u0437\u0446\u0430\u0445 \u0437\u0430\u043c\u0435\u0442\u043d\u043e \u0432\u044b\u0448\u0435, \u0447\u0435\u043c \u043e\u0431\u0440\u0430\u0437\u0446\u0430\u0445 \u043b\u044e\u0434\u0435\u0439, \u043f\u0435\u0440\u0435\u0431\u043e\u043b\u0435\u0432\u0448\u0438\u0445 \u043a\u043e\u0440\u043e\u043d\u0430\u0432\u0438\u0440\u0443\u0441\u043e\u043c (\u0433\u0440\u0443\u043f\u043f\u0430 \u044f\u0440\u043a\u043e \u043a\u0440\u0430\u0441\u043d\u044b\u0445 \u044f\u0447\u0435\u0435\u043a \u043d\u0430 \u0434\u0438\u0430\u0433\u0440\u0430\u043c\u043c\u0435). \u0412 \u0441\u0430\u043c\u043e\u043c \u043d\u0438\u0437\u0443 \u0433\u0440\u0443\u043f\u043f\u0430 \u0433\u0435\u043d\u043e\u0432 \u043d\u0430\u043e\u0431\u043e\u0440\u043e\u0442 \u044d\u043a\u0441\u043f\u0440\u0435\u0441\u0441\u0438\u0440\u0443\u0435\u0442\u0441\u044f \u0443 \u0437\u0434\u043e\u0440\u043e\u0432\u044b\u0445 \u043b\u044e\u0434\u0435\u0439 \u043d\u0438\u0436\u0435, \u0447\u0435\u043c \u0443 \u043f\u0435\u0440\u0435\u0431\u043e\u043b\u0435\u0432\u0448\u0438\u0445. <\/p>\n
    \u041e\u0431\u0440\u0430\u0437\u0446\u044b \u0442\u043e\u0436\u0435 \u043a\u043b\u0430\u0441\u0442\u0435\u0440\u0438\u0437\u0443\u044e\u0442\u0441\u044f \u0434\u043b\u044f \u0443\u0434\u043e\u0431\u0441\u0442\u0432\u0430, \u0447\u0442\u043e\u0431\u044b \u043c\u043e\u0436\u043d\u043e \u0431\u044b\u043b\u043e \u0447\u0435\u0442\u043a\u043e \u043e\u0442\u043b\u0438\u0447\u0438\u0442\u044c \u043a\u043e\u043d\u0442\u0440\u043e\u043b\u044c \u043e\u0442 \u044d\u043a\u0441\u043f\u0435\u0440\u0438\u043c\u0435\u043d\u0442\u0430. \u041a\u0430\u043a \u043c\u044b \u0432\u0438\u0434\u0438\u043c, \u0440\u0430\u0437\u043b\u0438\u0447\u0438\u044f \u0432 \u044d\u043a\u0441\u043f\u0440\u0435\u0441\u0441\u0438\u0438 \u043a\u0430\u0436\u0434\u043e\u0433\u043e \u0433\u0435\u043d\u0430, \u043f\u043e\u043f\u0430\u0432\u0448\u0435\u0433\u043e \u043d\u0430 \u0432\u0438\u0437\u0443\u0430\u043b\u0438\u0437\u0430\u0446\u0438\u044e, \u0432\u0435\u0441\u044c\u043c\u0430 \u0441\u0443\u0449\u0435\u0441\u0442\u0432\u0435\u043d\u043d\u044b. \u041a\u043e\u043d\u0435\u0447\u043d\u043e, \u044d\u0442\u043e \u043d\u0435 \u0432\u0441\u0435 \u0433\u0435\u043d\u044b, \u0430 \u043b\u0438\u0448\u044c \u0441\u0442\u0430\u0442\u0438\u0441\u0442\u0438\u0447\u0435\u0441\u043a\u0438 \u0437\u043d\u0430\u0447\u0438\u043c\u043e \u0438\u0437\u043c\u0435\u043d\u044f\u044e\u0449\u0438\u0435\u0441\u044f. \u0411\u043e\u043b\u044c\u0448\u0430\u044f \u0447\u0430\u0441\u0442\u044c \u043c\u0430\u0442\u0440\u0438\u0446\u044b, \u0435\u0441\u043b\u0438 \u0432\u0438\u0437\u0443\u0430\u043b\u0438\u0437\u0438\u0440\u043e\u0432\u0430\u0442\u044c \u0432\u0441\u0435, \u0431\u0443\u0434\u0435\u0442 \u0441\u043e\u0441\u0442\u043e\u044f\u0442\u044c \u0438\u0437 \u0431\u0435\u043b\u044b\u0445 \u043a\u0432\u0430\u0434\u0440\u0430\u0442\u043e\u0432, \u0442.\u043a. \u043a\u043b\u0435\u0442\u043a\u0438 \u043d\u0435 \u044d\u043a\u0441\u043f\u0440\u0435\u0441\u0441\u0438\u0440\u0443\u044e\u0442 \u0432 \u043a\u0430\u0436\u0434\u044b\u0439 \u043c\u043e\u043c\u0435\u043d\u0442 \u0432\u0440\u0435\u043c\u0435\u043d\u0438 \u0432\u0441\u044e \u0441\u043e\u0432\u043e\u043a\u0443\u043f\u043d\u043e\u0441\u0442\u044c \u0441\u0432\u043e\u0438\u0445 \u0433\u0435\u043d\u043e\u0432. \u041f\u0440\u0438 \u0436\u0435\u043b\u0430\u043d\u0438\u0438, \u0442\u0430\u043a\u0430\u044f \u043c\u0430\u0442\u0440\u0438\u0446\u0430 \u043c\u043e\u0436\u0435\u0442 \u0431\u044b\u0442\u044c \u043f\u043e\u0441\u0442\u0440\u043e\u0435\u043d\u0430 \u0438 \u0434\u043b\u044f \u0432\u0441\u0435\u0445 40 \u0442\u044b\u0441. \u0433\u0435\u043d\u043e\u0432, \u043d\u043e \u044d\u0442\u043e \u043d\u0435\u0443\u0434\u043e\u0431\u043d\u043e \u0438 \u043d\u0435 \u043d\u0443\u0436\u043d\u043e.<\/p>\n
    \u0414\u0440\u0443\u0433\u043e\u0439 \u0441\u043f\u043e\u0441\u043e\u0431 \u0432\u0438\u0437\u0443\u0430\u043b\u0438\u0437\u0430\u0446\u0438\u0438 — VolcanoPlot:<\/p>\n
    EnhancedVolcano( \u00a0\u00a0res, \u00a0\u00a0lab = rownames(res),\u00a0 \u00a0 \u00a0 \u00a0 \u00a0 \u00a0 \u00a0 \u00a0 \u00a0 # \u041c\u0435\u0442\u043a\u0438 \u0433\u0435\u043d\u043e\u0432 \u00a0\u00a0x = 'log2FoldChange', \u00a0 \u00a0 \u00a0 \u00a0 \u00a0 \u00a0 \u00a0 \u00a0 # \u041e\u0441\u044c X \u2014 log2FoldChange \u00a0\u00a0y = 'pvalue', \u00a0 \u00a0 \u00a0 \u00a0 \u00a0 \u00a0 \u00a0 \u00a0 \u00a0 \u00a0 \u00a0 \u00a0 # \u041e\u0441\u044c Y \u2014 P-value (\u0438\u043b\u0438 \u043c\u043e\u0436\u043d\u043e \u0438\u0441\u043f\u043e\u043b\u044c\u0437\u043e\u0432\u0430\u0442\u044c padj \u0434\u043b\u044f \u0441\u043a\u043e\u0440\u0440\u0435\u043a\u0442\u0438\u0440\u043e\u0432\u0430\u043d\u043d\u044b\u0445 \u0437\u043d\u0430\u0447\u0435\u043d\u0438\u0439) \u00a0\u00a0pCutoff = 0.005, \u00a0 \u00a0 \u00a0 \u00a0 \u00a0 \u00a0 \u00a0 \u00a0 \u00a0 \u00a0 \u00a0 # \u041f\u043e\u0440\u043e\u0433\u043e\u0432\u043e\u0435 \u0437\u043d\u0430\u0447\u0435\u043d\u0438\u0435 p-value \u00a0\u00a0FCcutoff = 1, \u00a0 \u00a0 \u00a0 \u00a0 \u00a0 \u00a0 \u00a0 \u00a0 \u00a0 \u00a0 \u00a0 \u00a0 # \u041f\u043e\u0440\u043e\u0433 log2FoldChange \u0434\u043b\u044f \u043e\u0442\u043e\u0431\u0440\u0430\u0436\u0435\u043d\u0438\u044f \u0437\u043d\u0430\u0447\u0438\u0442\u0435\u043b\u044c\u043d\u044b\u0445 \u0433\u0435\u043d\u043e\u0432 \u00a0\u00a0title = 'Volcano plot of differentially expressed genes', \u00a0\u00a0xlim = c(-5, 5),\u00a0 \u00a0 \u00a0 \u00a0 \u00a0 \u00a0 \u00a0 \u00a0 \u00a0 \u00a0 \u00a0 # \u041e\u0433\u0440\u0430\u043d\u0438\u0447\u0435\u043d\u0438\u0435 \u0434\u043b\u044f X (log2FoldChange) \u00a0\u00a0ylim = c(0, -log10(min(res$pvalue, na.rm = TRUE)))\u00a0 # \u041e\u0433\u0440\u0430\u043d\u0438\u0447\u0435\u043d\u0438\u0435 \u0434\u043b\u044f Y (p-value) )<\/code><\/pre>\n
    \"\u041a\u0430\u0440\u0442\u0438\u043d\u043a\u0430<\/p>\n
    \u041a\u0430\u0440\u0442\u0438\u043d\u043a\u0430 6. \u041f\u0440\u0438\u043c\u0435\u0440 Volcano plot.<\/figcaption><\/div>\n<\/figure>\n
    X \u2014 \u043d\u0430\u0441\u043a\u043e\u043b\u044c\u043a\u043e \u0437\u043d\u0430\u0447\u0438\u0442\u0435\u043b\u044c\u043d\u043e \u043c\u0435\u043d\u044f\u0435\u0442\u0441\u044f \u044d\u043a\u0441\u043f\u0440\u0435\u0441\u0441\u0438\u044f \u043f\u043e \u043c\u043e\u0434\u0443\u043b\u044e (\u0441\u0438\u043b\u044c\u043d\u043e, \u0441\u043b\u0430\u0431\u043e, \u0443\u043c\u0435\u043d\u044c\u0448\u0430\u0435\u0442\u0441\u044f \u0438\u043b\u0438 \u0443\u0432\u0435\u043b\u0438\u0447\u0438\u0432\u0430\u0435\u0442\u0441\u044f \u0432 \u044d\u043a\u0441\u043f\u0435\u0440\u0438\u043c\u0435\u043d\u0442\u0435 \u043f\u043e \u0441\u0440\u0430\u0432\u043d\u0435\u043d\u0438\u044e \u0441 \u043a\u043e\u043d\u0442\u0440\u043e\u043b\u0435\u043c), Y — \u0441\u0442\u0430\u0442\u0438\u0441\u0442\u0438\u0447\u0435\u0441\u043a\u0430\u044f \u0437\u043d\u0430\u0447\u0438\u043c\u043e\u0441\u0442\u044c. \u0412\u0435\u0440\u0442\u0438\u043a\u0430\u043b\u044c\u043d\u044b\u0435 \u043e\u0442\u0441\u0435\u0447\u043a\u0438 — \u043e\u0442\u0441\u0435\u0447\u043a\u0438 \u043f\u043e \u043c\u043e\u0434\u0443\u043b\u044e \u0438\u0437\u043c\u0435\u043d\u0435\u043d\u0438\u044f \u044d\u043a\u0441\u043f\u0440\u0435\u0441\u0441\u0438\u0438, \u043a\u043e\u0442\u043e\u0440\u044b\u0439 \u0438\u0441\u0441\u043b\u0435\u0434\u043e\u0432\u0430\u0442\u0435\u043b\u044c \u0441\u0447\u0438\u0442\u0430\u0435\u0442 \u0441\u0443\u0449\u0435\u0441\u0442\u0432\u0435\u043d\u043d\u044b\u043c, \u0432 \u0434\u0430\u043d\u043d\u043e\u043c \u0441\u043b\u0443\u0447\u0430\u0435 2 (\u0448\u043a\u0430\u043b\u0430 \u0431\u0435\u0437\u0440\u0430\u0437\u043c\u0435\u0440\u043d\u0430\u044f). \u0413\u043e\u0440\u0438\u0437\u043e\u043d\u0442\u0430\u043b\u044c\u043d\u0430\u044f \u043e\u0442\u0441\u0435\u0447\u043a\u0430 — p-value = 0.005 \u043f\u043e \u043e\u0441\u0438 Y. \u0418\u0442\u043e\u0433\u043e \u043a\u0440\u0430\u0441\u043d\u044b\u0435 \u0442\u043e\u0447\u043a\u0438 — \u0441\u0442\u0430\u0442\u0438\u0441\u0442\u0438\u0447\u0435\u0441\u043a\u0438 \u0437\u043d\u0430\u0447\u0438\u043c\u043e \u0438 \u0441\u0438\u043b\u044c\u043d\u043e \u0438\u0437\u043c\u0435\u043d\u0438\u0432\u0448\u0438\u0435 \u0441\u0432\u043e\u044e \u044d\u043a\u0441\u043f\u0440\u0435\u0441\u0441\u0438\u044e \u0433\u0435\u043d\u044b \u0432 \u043e \u043f\u0435\u0440\u0435\u0431\u043e\u043b\u0435\u0432\u0448\u0438\u0445 \u0441 \u0441\u0438\u043c\u043f\u0442\u043e\u043c\u0430\u043c\u0438 \u043d\u0430\u0440\u0443\u0448\u0435\u043d\u0438\u044f \u043e\u0431\u043e\u043d\u044f\u043d\u0438\u044f \u043f\u043e \u0441\u0440\u0430\u0432\u043d\u0435\u043d\u0438\u044e \u0441\u043e \u0437\u0434\u043e\u0440\u043e\u0432\u044b\u043c\u0438 \u043b\u044e\u0434\u044c\u043c\u0438, \u0437\u0435\u043b\u0435\u043d\u044b\u043c — \u0441\u0438\u043b\u044c\u043d\u043e, \u043d\u043e \u0441\u0442\u0430\u0442\u0438\u0441\u0442\u0438\u0447\u0435\u0441\u043a\u0438 \u043d\u0435\u0437\u043d\u0430\u0447\u0438\u043c\u043e, \u0441\u0438\u043d\u0438\u043c — \u0441\u0442\u0430\u0442\u0438\u0441\u0442\u0438\u0447\u0435\u0441\u043a\u0438 \u0437\u043d\u0430\u0447\u0438\u043c\u043e, \u043d\u043e \u043e\u0447\u0435\u043d\u044c \u0441\u043b\u0430\u0431\u043e (\u0441\u0442\u0430\u0442\u0438\u0441\u0442\u0438\u0447\u0435\u0441\u043a\u0438 \u0437\u043d\u0430\u0447\u0438\u043c\u043e \u0438\u0437\u043c\u0435\u043d\u0435\u043d\u0438\u0439 \u041d\u0415\u0422), \u0441\u0435\u0440\u044b\u043c — \u043d\u0438 \u0442\u043e, \u043d\u0438 \u0434\u0440\u0443\u0433\u043e\u0435<\/p>\n
    Volcano plot \u0432 \u0434\u0430\u043d\u043d\u043e\u043c \u0441\u043b\u0443\u0447\u0430\u0435 \u0431\u043e\u043b\u0435\u0435 \u0438\u043d\u0444\u043e\u0440\u043c\u0430\u0442\u0438\u0432\u0435\u043d, \u0442.\u043a. \u043e\u0442\u0440\u0430\u0436\u0430\u0435\u0442 \u043a\u0430\u043a \u0441\u0442\u0430\u0442\u0438\u0441\u0442\u0438\u0447\u0435\u0441\u043a\u0443\u044e \u0437\u043d\u0430\u0447\u0438\u043c\u043e\u0441\u0442\u044c, \u0442\u0430\u043a \u0438 \u0442\u043e, \u043d\u0430\u0441\u043a\u043e\u043b\u044c\u043a\u043e \u0438\u0437\u043c\u0435\u043d\u0438\u043b\u0430\u0441\u044c \u044d\u043a\u0441\u043f\u0440\u0435\u0441\u0441\u0438\u044f \u0432 \u0442\u0443 \u0438\u043b\u0438 \u0438\u043d\u0443\u044e \u0441\u0442\u043e\u0440\u043e\u043d\u0443, \u043f\u043e\u0434\u0441\u0432\u0435\u0447\u0438\u0432\u0430\u0435\u0442 30 \u043d\u0430\u0438\u0431\u043e\u043b\u0435\u0435 \u0437\u043d\u0430\u0447\u0438\u043c\u043e \u0438 \u0437\u043d\u0430\u0447\u0438\u0442\u0435\u043b\u044c\u043d\u043e \u0438\u0437\u043c\u0435\u043d\u0438\u0432\u0448\u0438\u0445 \u044d\u043a\u0441\u043f\u0440\u0435\u0441\u0441\u0438\u044e \u0433\u0435\u043d\u043e\u0432.<\/p>\n
    \u0427\u0442\u043e \u0434\u0430\u043b\u044c\u0448\u0435? \u0423 \u043d\u0430\u0441 \u0435\u0441\u0442\u044c \u0441\u043f\u0438\u0441\u043e\u043a \u0433\u0435\u043d\u043e\u0432, \u043a\u043e\u0442\u043e\u0440\u044b\u0435 \u0441\u0443\u0449\u0435\u0441\u0442\u0432\u0435\u043d\u043d\u043e \u0438\u0437\u043c\u0435\u043d\u0438\u043b\u0438 \u0441\u0432\u043e\u044e \u044d\u043a\u0441\u043f\u0440\u0435\u0441\u0441\u0438\u044e \u0443 \u043b\u044e\u0434\u0435\u0439, \u043a\u043e\u0442\u043e\u0440\u044b\u0435 \u043f\u0435\u0440\u0435\u0431\u043e\u043b\u0435\u043b\u0438 \u043a\u043e\u0440\u043e\u043d\u0430\u0432\u0438\u0440\u0443\u0441\u043e\u043c. \u041e\u0447\u0435\u0432\u0438\u0434\u043d\u043e, \u043d\u0443\u0436\u043d\u043e \u043f\u043e\u043d\u044f\u0442\u044c, \u0434\u043b\u044f \u0447\u0435\u0433\u043e \u043e\u043d\u0438 \u043d\u0443\u0436\u043d\u044b \u043e\u0440\u0433\u0430\u043d\u0438\u0437\u043c\u0443, \u043a\u0430\u043a\u0443\u044e \u0444\u0443\u043d\u043a\u0446\u0438\u044e \u043e\u043d\u0438 \u0432\u044b\u043f\u043e\u043b\u043d\u044f\u044e\u0442. \u0412 \u0442\u0430\u043a\u043e\u043c \u0441\u043b\u0443\u0447\u0430\u0435 \u043c\u044b \u043c\u043e\u0436\u0435\u043c \u043f\u043e\u043d\u044f\u0442\u044c, \u0433\u0434\u0435 \u0441\u043b\u0443\u0447\u0430\u0435\u0442\u0441\u044f \u043f\u043e\u043b\u043e\u043c\u043a\u0430 \u043f\u0440\u0438 \u0432\u043e\u0437\u0434\u0435\u0439\u0441\u0442\u0432\u0438\u0438 \u0432\u0438\u0440\u0443\u0441\u0430 \u043d\u0430 \u043a\u043b\u0435\u0442\u043a\u0443,\u0430 \u0442\u0430\u043a\u0436\u0435 \u043d\u0430\u0439\u0442\u0438 \u0447\u0435\u0442\u043a\u0438\u0435 \u043c\u0438\u0448\u0435\u043d\u0438 \u0434\u043b\u044f \u043b\u0435\u0447\u0435\u043d\u0438\u044f \u0438\u043d\u0444\u0435\u043a\u0446\u0438\u0438. \u0414\u043b\u044f \u044d\u0442\u043e\u0433\u043e \u043f\u0440\u0438\u043c\u0435\u043d\u044f\u0435\u0442\u0441\u044f \u043e\u0431\u043e\u0433\u0430\u0449\u0435\u043d\u0438\u0435 \u043f\u043e \u0441\u0438\u0433\u043d\u0430\u043b\u044c\u043d\u044b\u043c \u0438 \u043c\u0435\u0442\u0430\u0431\u043e\u043b\u0438\u0447\u0435\u0441\u043a\u0438\u043c \u043f\u0443\u0442\u044f\u043c.<\/p>\n
    \u0421\u0438\u0433\u043d\u0430\u043b\u044c\u043d\u044b\u0439 \u043f\u0443\u0442\u044c \u2014 \u044d\u0442\u043e \u043a\u0430\u0441\u043a\u0430\u0434 \u0431\u0435\u043b\u043a\u043e\u0432, \u043a\u043e\u0442\u043e\u0440\u044b\u0439 \u0432 \u043d\u0430\u0448\u0438\u0445 \u043a\u043b\u0435\u0442\u043a\u0430\u0445 \u043f\u0435\u0440\u0435\u0434\u0430\u0435\u0442 \u0441\u0438\u0433\u043d\u0430\u043b. \u0422\u0430\u043a\u043e\u0439 \u043f\u0440\u043e\u0432\u043e\u0434, \u0433\u0434\u0435 \u0441\u0438\u0433\u043d\u0430\u043b \u043f\u0435\u0440\u0435\u0434\u0430\u0435\u0442\u0441\u044f \u043e\u0442 \u0431\u0435\u043b\u043a\u0430 \u043a \u0431\u0435\u043b\u043a\u0443, \u0431\u043b\u0430\u0433\u043e\u0434\u0430\u0440\u044f \u0447\u0435\u043c\u0443 \u043c\u043e\u0433\u0443\u0442 \u0432\u043e\u0437\u043d\u0438\u043a\u0430\u0442\u044c \u043e\u0442\u0432\u0435\u0442\u043d\u044b\u0435 \u0440\u0435\u0430\u043a\u0446\u0438\u0438. \u041c\u044b \u043c\u043e\u0436\u0435\u043c \u043f\u043e\u0441\u043c\u043e\u0442\u0440\u0435\u0442\u044c, \u043a \u043a\u0430\u043a\u0438\u043c \u0441\u0438\u0433\u043d\u0430\u043b\u044c\u043d\u044b\u043c \u043f\u0443\u0442\u044f\u043c \u043f\u0440\u0438\u043d\u0430\u0434\u043b\u0435\u0436\u0430\u0442 \u043d\u0430\u0439\u0434\u0435\u043d\u043d\u044b\u0435 \u043d\u0430\u043c\u0438 \u0431\u0435\u043b\u043a\u0438, \u0438 \u0443\u0441\u0442\u0430\u043d\u043e\u0432\u0438\u0442\u044c, \u0433\u0434\u0435 \u0441\u043b\u0443\u0447\u0430\u0435\u0442\u0441\u044f \u0438\u0437\u043c\u0435\u043d\u0435\u043d\u0438\u0435. \u0414\u043b\u044f \u044d\u0442\u043e\u0433\u043e \u043d\u0435\u043e\u0431\u0445\u043e\u0434\u0438\u043c\u044b \u0431\u0430\u0437\u044b Reactome \u0438 KEGG. \u0418\u043c\u0435\u043d\u043d\u043e \u043f\u043e\u044d\u0442\u043e\u043c\u0443 \u0432\u044b\u0448\u0435 \u0431\u044b\u043b\u043e \u043d\u0430\u043f\u0438\u0441\u0430\u043d\u043e, \u0447\u0442\u043e \u043c\u044b \u043f\u043e\u043a\u0430 \u043d\u0435 \u0431\u0443\u0434\u0435\u043c \u043c\u0435\u043d\u044f\u0442\u044c \u043d\u0430\u0438\u043c\u0435\u043d\u043e\u0432\u0430\u043d\u0438\u044f \u043d\u0430 \u043e\u0431\u0449\u0435\u043f\u0440\u0438\u043d\u044f\u0442\u044b\u0435 \u0441\u0438\u043c\u0432\u043e\u043b\u044b. \u0411\u0430\u0437\u0430 Reactome \u0442\u0440\u0435\u0431\u0443\u0435\u0442 \u0438\u043c\u0435\u043d\u043d\u043e \u0446\u0438\u0444\u0435\u0440\u043d\u044b\u0445 \u043e\u0431\u043e\u0437\u043d\u0430\u0447\u0435\u043d\u0438\u0439 \u0433\u0435\u043d\u043e\u0432, \u043a\u0430\u043a \u043d\u0430 \u041a\u0430\u0440\u0442\u0438\u043d\u043a\u0435 2:<\/p>\n
    # \u041f\u043e\u0441\u043a\u043e\u043b\u044c\u043a\u0443 \u0432\u0430\u0448\u0438 \u0433\u0435\u043d\u044b \u0443\u0436\u0435 \u0432 \u0444\u043e\u0440\u043c\u0430\u0442\u0435 ENTREZ ID, \u0438\u0441\u043f\u043e\u043b\u044c\u0437\u0443\u0435\u043c rownames \u043d\u0430\u043f\u0440\u044f\u043c\u0443\u044e entrez_ids <- rownames(significant_genes) entrez_ids <- na.omit(entrez_ids)\u00a0 # \u0423\u0431\u0438\u0440\u0430\u0435\u043c NA \u0437\u043d\u0430\u0447\u0435\u043d\u0438\u044f  # \u0412\u044b\u043f\u043e\u043b\u043d\u044f\u0435\u043c \u043e\u0431\u043e\u0433\u0430\u0449\u0435\u043d\u0438\u0435 \u043f\u043e \u0441\u0438\u0433\u043d\u0430\u043b\u044c\u043d\u044b\u043c \u0438 \u043c\u0435\u0442\u0430\u0431\u043e\u043b\u0438\u0447\u0435\u0441\u043a\u0438\u043c \u043f\u0443\u0442\u044f\u043c \u0441 \u043f\u043e\u043c\u043e\u0449\u044c\u044e KEGG kegg_enrich <- enrichKEGG(gene = entrez_ids, \u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0organism = 'hsa', \u00a0 # hsa \u0434\u043b\u044f \u0447\u0435\u043b\u043e\u0432\u0435\u043a\u0430 \u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0pvalueCutoff = 0.05)  # \u0410\u043d\u0430\u043b\u0438\u0437 \u043e\u0431\u043e\u0433\u0430\u0449\u0435\u043d\u0438\u044f \u043f\u043e \u043f\u0443\u0442\u044f\u043c Reactome reactome_enrich <- enrichPathway(gene = entrez_ids, \u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0organism = \u00abhuman\u00bb, \u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0pvalueCutoff = 0.05, \u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0readable = TRUE)\u00a0   # \u0412\u0438\u0437\u0443\u0430\u043b\u0438\u0437\u0430\u0446\u0438\u044f \u0440\u0435\u0437\u0443\u043b\u044c\u0442\u0430\u0442\u043e\u0432 \u043e\u0431\u043e\u0433\u0430\u0449\u0435\u043d\u0438\u044f   ## Reactome pathways dotplot(reactome_enrich, showCategory = 20) + ggtitle(\u00abReactome Pathway Enrichment\u00bb)  ## KEGG pathways dotplot(kegg_enrich, showCategory = 20) + ggtitle(\u00abKEGG Pathway Enrichment\u00bb)<\/code><\/pre>\n
    \"\u041a\u0430\u0440\u0442\u0438\u043d\u043a\u0430<\/p>\n
    \u041a\u0430\u0440\u0442\u0438\u043d\u043a\u0430 7. \u041f\u0440\u0438\u043c\u0435\u0440 \u043e\u0431\u043e\u0433\u0430\u0449\u0435\u043d\u0438\u044f \u043f\u0443\u0442\u0435\u0439 \u043f\u043e Reactome.<\/figcaption><\/div>\n<\/figure>\n
    \"\u041a\u0430\u0440\u0442\u0438\u043d\u043a\u0430<\/p>\n
    \u041a\u0430\u0440\u0442\u0438\u043d\u043a\u0430 8. \u041f\u0440\u0438\u043c\u0435\u0440 \u043e\u0431\u043e\u0433\u0430\u0449\u0435\u043d\u0438\u044f \u043f\u0443\u0442\u0435\u0439 \u043f\u043e KEGG. <\/figcaption><\/div>\n<\/figure>\n
    \u041d\u0430 \u043e\u0431\u0435\u0438\u0445 \u043a\u0430\u0440\u0442\u0438\u043d\u043a\u0430\u0445, \u0440\u0430\u0437\u043c\u0435\u0440\u043e\u043c \u0442\u043e\u0447\u043a\u0438 \u043e\u0431\u043e\u0437\u043d\u0430\u0447\u0430\u0435\u0442\u0441\u044f \u043a\u043e\u043b\u0438\u0447\u0435\u0441\u0442\u0432\u043e \u0433\u0435\u043d\u043e\u0432, \u043a\u043e\u0442\u043e\u0440\u044b\u0435 \u0443\u0447\u0430\u0441\u0442\u0432\u0443\u044e\u0442 \u0432 \u0441\u043e\u043e\u0442\u0432\u0435\u0442\u0441\u0442\u0432\u0443\u044e\u0449\u0435\u043c \u0441\u0438\u0433\u043d\u0430\u043b\u044c\u043d\u043e\u043c \u0438\u043b\u0438 \u043c\u0435\u0442\u0430\u0431\u043e\u043b\u0438\u0447\u0435\u0441\u043a\u043e\u043c \u043f\u0443\u0442\u0438. <\/p>\n
    \u0414\u0430\u043b\u0435\u0435, \u0438\u0441\u0445\u043e\u0434\u044f \u0438\u0437 \u0446\u0435\u043b\u0435\u0439 \u0438\u0441\u0441\u043b\u0435\u0434\u043e\u0432\u0430\u043d\u0438\u044f, \u043c\u043e\u0436\u043d\u043e \u0430\u043d\u0430\u043b\u0438\u0437\u0438\u0440\u043e\u0432\u0430\u0442\u044c \u043f\u043e\u0434\u043e\u0431\u043d\u044b\u0435 \u0434\u0438\u0430\u0433\u0440\u0430\u043c\u043c\u044b. \u0414\u0432\u0435 \u0432\u044b\u0448\u0435\u0443\u043f\u043e\u043c\u044f\u043d\u0443\u0442\u044b\u0435 \u043a\u0430\u0440\u0442\u0438\u043d\u043a\u0438 \u0434\u0435\u043c\u043e\u043d\u0441\u0442\u0440\u0438\u0440\u0443\u044e\u0442, \u0447\u0442\u043e \u0441\u0443\u0449\u0435\u0441\u0442\u0432\u0435\u043d\u043d\u043e \u0438\u0437\u043c\u0435\u043d\u044f\u0435\u0442\u0441\u044f \u044d\u043a\u0441\u043f\u0440\u0435\u0441\u0441\u0438\u044f \u0431\u0435\u043b\u043a\u043e\u0432, \u0441\u0432\u044f\u0437\u0430\u043d\u043d\u044b\u0445 \u0441 \u043f\u0435\u0440\u0435\u0434\u0430\u0447\u0435\u0439 \u0440\u0435\u0446\u0435\u043f\u0442\u043e\u0440\u043d\u043e\u0433\u043e \u0441\u0438\u0433\u043d\u0430\u043b\u0430. \u0422\u043e \u0435\u0441\u0442\u044c \u043f\u0440\u043e\u0438\u0441\u0445\u043e\u0434\u0438\u0442 \u043d\u0430\u0440\u0443\u0448\u0435\u043d\u0438\u0435 \u043e\u0431\u043e\u043d\u044f\u043d\u0438\u044f, \u0442\u0430\u043a \u043a\u0430\u043a \u0430\u043d\u0430\u043b\u0438\u0437\u0438\u0440\u043e\u0432\u0430\u043b\u0438\u0441\u044c \u0434\u0430\u043d\u043d\u044b\u0435 \u043e\u0431\u043e\u043d\u044f\u0442\u0435\u043b\u044c\u043d\u043e\u0433\u043e \u044d\u043f\u0438\u0442\u0435\u043b\u0438\u044f. \u0411\u0430\u0437\u0430 \u0434\u0430\u043d\u043d\u044b\u0445 Reactome \u043f\u043e\u0437\u0432\u043e\u043b\u044f\u0435\u0442 \u0443\u0441\u0442\u0430\u043d\u043e\u0432\u0438\u0442\u044c, \u043a\u0430\u043a\u0438\u0435 \u043a\u043e\u043d\u043a\u0440\u0435\u0442\u043d\u043e \u0441\u0438\u0433\u043d\u0430\u043b\u044c\u043d\u044b\u0435 \u043f\u0443\u0442\u0438 \u0437\u0430\u0434\u0435\u0439\u0441\u0442\u0432\u0443\u044e\u0442\u0441\u044f, \u043b\u0438\u0431\u043e \u0431\u044b\u0441\u0442\u0440\u043e \u043f\u043e\u043b\u0443\u0447\u0438\u0442\u044c \u0434\u043e\u0441\u0442\u0443\u043f \u043a \u0444\u0443\u043d\u043a\u0446\u0438\u044f\u043c \u043a\u043e\u043d\u043a\u0440\u0435\u0442\u043d\u044b\u0445 \u0431\u0435\u043b\u043a\u043e\u0432, \u0430 \u0442\u0430\u043a\u0436\u0435 \u043d\u0430\u0439\u0442\u0438 \u043f\u0443\u0431\u043b\u0438\u043a\u0430\u0446\u0438\u0438 \u043f\u043e \u0434\u0430\u043d\u043d\u043e\u0439 \u0442\u0435\u043c\u0435. \u0422\u0430\u043a\u0438\u043c \u043e\u0431\u0440\u0430\u0437\u043e\u043c, \u043e\u0431\u043b\u0430\u0434\u0430\u044f \u0431\u043e\u043b\u044c\u0448\u0438\u043c \u043c\u0430\u0441\u0441\u0438\u0432\u043e\u043c \u0434\u0430\u043d\u043d\u044b\u0445 \u0441\u0435\u043a\u0432\u0435\u043d\u0438\u0440\u043e\u0432\u0430\u043d\u0438\u044f \u0442\u0440\u0430\u043d\u0441\u043a\u0440\u0438\u043f\u0442\u043e\u043c\u0430, \u043c\u044b \u043c\u043e\u0436\u0435\u043c \u043f\u0440\u043e\u0430\u043d\u0430\u043b\u0438\u0437\u0438\u0440\u043e\u0432\u0430\u0442\u044c, \u043a\u0430\u043a \u043a\u043b\u0435\u0442\u043a\u0438 \u043e\u0442\u0432\u0435\u0447\u0430\u044e\u0442 \u043d\u0430 \u0432\u043d\u0435\u0448\u043d\u0438\u0435 \u0441\u0442\u0438\u043c\u0443\u043b\u044b \u0438 \u043f\u043e\u0441\u0440\u0435\u0434\u0441\u0442\u0432\u043e\u043c \u043a\u0430\u043a\u0438\u0435 \u0441\u0438\u0433\u043d\u0430\u043b\u043e\u0432 \u043e\u043d\u0438 \u044d\u0442\u043e \u043e\u0441\u0443\u0449\u0435\u0441\u0442\u0432\u043b\u044f\u044e\u0442. \u0418\u0441\u0445\u043e\u0434\u044f \u0438\u0437 \u0434\u0438\u0437\u0430\u0439\u043d\u0430 \u044d\u043a\u0441\u043f\u0435\u0440\u0438\u043c\u0435\u043d\u0442\u0430, \u043c\u043e\u0436\u043d\u043e \u043f\u0440\u043e\u0432\u0435\u0440\u044f\u0442\u044c \u0433\u0438\u043f\u043e\u0442\u0435\u0437\u044b \u043f\u043e \u0442\u0438\u043f\u0443 \u00ab\u041d\u0430\u0440\u0443\u0448\u0435\u043d\u0438\u0435 \u0444\u0443\u043d\u043a\u0446\u0438\u0438 A \u0441\u0432\u044f\u0437\u0430\u043d\u043e \u0441 \u0438\u0437\u043c\u0435\u043d\u0435\u043d\u0438\u0435\u043c \u044d\u043a\u0441\u043f\u0440\u0435\u0441\u0441\u0438\u0438 \u0441\u0438\u0433\u043d\u0430\u043b\u044c\u043d\u044b\u0445 \u043f\u0443\u0442\u0435\u0439 \u043f\u0440\u043e\u0446\u0435\u0441\u0441\u0430 B \u0432\u043d\u0443\u0442\u0440\u0438 \u043a\u043b\u0435\u0442\u043a\u0438, \u0430 \u043d\u0435 \u043f\u0440\u043e\u0446\u0435\u0441\u0441\u0430 C \u00ab \u0438 \u0434\u0440\u0443\u0433\u0438\u0435.<\/p>\n
    \u0417\u0430\u043a\u043b\u044e\u0447\u0435\u043d\u0438\u0435<\/h3>\n
    \u0422\u0440\u0430\u043d\u0441\u043a\u0440\u0438\u043f\u0442\u043e\u043c\u043d\u044b\u0439 \u0430\u043d\u0430\u043b\u0438\u0437 bulk RNA-seq \u2014 \u043e\u0442\u043d\u043e\u0441\u0438\u0442\u0435\u043b\u044c\u043d\u043e \u043f\u0440\u043e\u0441\u0442\u0430\u044f \u0437\u0430\u0434\u0430\u0447\u0430, \u043e\u0434\u043d\u0430\u043a\u043e \u0442\u0440\u0435\u0431\u0443\u0435\u0442 \u0431\u0430\u0437\u043e\u0432\u044b\u0445 \u0437\u043d\u0430\u043d\u0438\u0439 \u0432 \u0441\u0442\u0430\u0442\u0438\u0441\u0442\u0438\u043a\u0435, \u0430 \u0442\u0430\u043a\u0436\u0435 \u043f\u043e\u043d\u0438\u043c\u0430\u043d\u0438\u0438 \u0441\u0438\u043d\u0442\u0430\u043a\u0441\u0438\u0441\u0430 R. \u041e\u043d \u043f\u0440\u043e\u0441\u0442 \u0435\u0449\u0435 \u0432 \u0442\u043e\u043c, \u0447\u0442\u043e, \u043a\u0430\u043a \u043f\u0440\u0430\u0432\u0438\u043b\u043e, \u043f\u0440\u0435\u0434\u043e\u0431\u0440\u0430\u0431\u043e\u0442\u0430\u043d\u043d\u044b\u0435 \u043c\u0430\u0442\u0440\u0438\u0446\u044b \u044d\u043a\u0441\u043f\u0440\u0435\u0441\u0441\u0438\u0438, \u043a\u043e\u0442\u043e\u0440\u044b\u0435 \u043c\u043e\u0436\u043d\u043e \u043d\u0435\u043f\u043e\u0441\u0440\u0435\u0434\u0441\u0442\u0432\u0435\u043d\u043d\u043e \u0437\u0430\u043f\u0443\u0441\u0442\u0438\u0442\u044c \u0432 \u0430\u043d\u0430\u043b\u0438\u0437, \u043d\u0430\u0445\u043e\u0434\u044f\u0442\u0441\u044f \u0432 \u043e\u0442\u043a\u0440\u044b\u0442\u043e\u043c \u0434\u043e\u0441\u0442\u0443\u043f\u0435 \u0432 Gene Expression Omnibus<\/a>. \u0412 \u043e\u0442\u043b\u0438\u0447\u0438\u0435 \u043e\u0442 single-cell, \u043f\u043e\u0440\u043e\u0433 \u0432\u0445\u043e\u0434\u0430 \u0432 bulk RNA-seq \u0433\u043e\u0440\u0430\u0437\u0434\u043e \u043d\u0438\u0436\u0435. \u041d\u0430 \u043f\u0440\u0438\u043c\u0435\u0440\u0435 \u043e\u0434\u043d\u043e\u0433\u043e \u0438\u0437 \u0434\u0430\u0442\u0430\u0441\u0435\u0442\u043e\u0432, \u043c\u044b \u0440\u0430\u0441\u0441\u043c\u043e\u0442\u0440\u0435\u043b\u0438 \u043f\u043e\u044d\u0442\u0430\u043f\u043d\u043e\u0435 \u043f\u0440\u043e\u0432\u0435\u0434\u0435\u043d\u0438\u0435 \u0442\u0430\u043a\u043e\u0433\u043e \u0430\u043d\u0430\u043b\u0438\u0437\u0430. \u041a\u043e\u043d\u0435\u0447\u043d\u043e, \u043c\u043e\u0436\u043d\u043e \u0432\u044b\u0434\u0432\u0438\u0433\u0430\u0442\u044c \u0440\u0430\u0437\u043d\u044b\u0435 \u0433\u0438\u043f\u043e\u0442\u0435\u0437\u044b \u0434\u043b\u044f \u043f\u0440\u043e\u0432\u0435\u0440\u043a\u0438, \u043f\u043e\u0441\u043b\u0435 \u0447\u0435\u0433\u043e \u043a\u043e\u0434 \u0431\u0443\u0434\u0435\u0442 \u043f\u0440\u0435\u0442\u0435\u0440\u043f\u0435\u0432\u0430\u0442\u044c \u0438\u0437\u043c\u0435\u043d\u0435\u043d\u0438\u044f.\u00a0 <\/p>\n
    \u0411\u0438\u043e\u0438\u043d\u0444\u043e\u0440\u043c\u0430\u0442\u0438\u043a\u0430 \u0432 \u0446\u0435\u043b\u043e\u043c \u2014 \u043e\u0447\u0435\u043d\u044c \u0438\u043d\u0442\u0435\u0440\u0435\u0441\u043d\u044b\u0439 \u0440\u0430\u0437\u0434\u0435\u043b \u0431\u0438\u043e\u043b\u043e\u0433\u0438\u0438, \u043a\u043e\u0442\u043e\u0440\u044b\u0439 \u043f\u043e\u0437\u0432\u043e\u043b\u044f\u0435\u0442 \u043d\u0430\u0445\u043e\u0434\u0438\u0442\u044c \u0437\u0430\u043a\u043e\u043d\u043e\u043c\u0435\u0440\u043d\u043e\u0441\u0442\u0438 \u0432 \u043f\u0440\u043e\u0446\u0435\u0441\u0441\u0430\u0445 \u0432\u043d\u0443\u0442\u0440\u0438 \u043a\u043b\u0435\u0442\u043a\u0438, \u0440\u0430\u0437\u0432\u0438\u0442\u0438\u0438 \u0436\u0438\u0432\u044b\u0445 \u043e\u0440\u0433\u0430\u043d\u0438\u0437\u043c\u043e\u0432, \u0440\u0430\u0437\u0440\u0430\u0431\u0430\u0442\u044b\u0432\u0430\u0442\u044c \u0438 \u0442\u0435\u0441\u0442\u0438\u0440\u043e\u0432\u0430\u0442\u044c \u043d\u043e\u0432\u044b\u0435 \u043b\u0435\u043a\u0430\u0440\u0441\u0442\u0432\u0430 \u0438 \u043d\u0430\u0445\u043e\u0434\u0438\u0442\u044c \u0434\u043b\u044f \u043d\u0438\u0445 \u043c\u0438\u0448\u0435\u043d\u0438. \u0412 \u043d\u0435\u0439 \u0435\u0441\u0442\u044c \u043c\u0435\u0441\u0442\u043e \u043a\u0430\u043a \u0434\u043b\u044f \u0430\u043d\u0430\u043b\u0438\u0442\u0438\u043a\u0438 \u0434\u0430\u043d\u043d\u044b\u0445, \u0442\u0430\u043a \u0438 \u0434\u043b\u044f \u0440\u0430\u0437\u0440\u0430\u0431\u043e\u0442\u043a\u0438 \u043d\u043e\u0432\u044b\u0445 \u0438\u043d\u0441\u0442\u0440\u0443\u043c\u0435\u043d\u0442\u043e\u0432. \u0411\u0438\u043e\u0438\u043d\u0444\u043e\u0440\u043c\u0430\u0442\u0438\u043a\u0430 — \u044d\u0442\u043e \u043c\u043e\u0441\u0442\u0438\u043a, \u0441\u043e\u0435\u0434\u0438\u043d\u044f\u044e\u0449\u0438\u0439 IT \u0438 \u0431\u0438\u043e\u043b\u043e\u0433\u0438\u044e. \u041d\u0430\u0434\u0435\u044e\u0441\u044c,\u00a0 \u043d\u0430\u0433\u043b\u044f\u0434\u043d\u0430\u044f \u0434\u0435\u043c\u043e\u043d\u0441\u0442\u0440\u0430\u0446\u0438\u044f \u0435\u0435 \u043c\u0430\u043b\u0435\u043d\u044c\u043a\u043e\u0433\u043e \u0440\u0430\u0437\u0434\u0435\u043b\u0430 \u043f\u043e\u043c\u043e\u0436\u0435\u0442 \u043a\u043e\u043c\u0443-\u0442\u043e \u0435\u0449\u0435 \u043f\u0440\u043e\u0439\u0442\u0438 \u043f\u043e \u044d\u0442\u043e\u043c\u0443 \u043c\u043e\u0441\u0442\u0438\u043a\u0443.<\/p>\n<\/div>\n<\/div>\n<\/div>\n
    <\/div>\n

     \u0441\u0441\u044b\u043b\u043a\u0430 \u043d\u0430 \u043e\u0440\u0438\u0433\u0438\u043d\u0430\u043b \u0441\u0442\u0430\u0442\u044c\u0438      https:\/\/habr.com\/ru\/articles\/874558\/<\/a><\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"
    <\/div>\n
    \n
    \n
    \n
    \n
    \u0412\u0441\u0435 \u0437\u043d\u0430\u044e\u0442, \u0447\u0442\u043e \u043d\u0430\u0441\u043b\u0435\u0434\u0441\u0442\u0432\u0435\u043d\u043d\u0430\u044f \u0438\u043d\u0444\u043e\u0440\u043c\u0430\u0446\u0438\u044f \u0437\u0430\u043a\u043e\u0434\u0438\u0440\u043e\u0432\u0430\u043d\u0430 \u0432 \u0414\u041d\u041a. \u041d\u043e \u043c\u0430\u043b\u043e \u043a\u0442\u043e \u0437\u0430\u0434\u0443\u043c\u044b\u0432\u0430\u0435\u0442\u0441\u044f \u043e \u0442\u043e\u043c, \u043a\u0430\u043a \u044d\u0442\u0430 \u0438\u043d\u0444\u043e\u0440\u043c\u0430\u0446\u0438\u044f \u0440\u0435\u0430\u043b\u0438\u0437\u0443\u0435\u0442\u0441\u044f \u0432\u043d\u0443\u0442\u0440\u0438 \u043d\u0430\u0441. \u041a\u0430\u043a \u0438\u043d\u0444\u043e\u0440\u043c\u0430\u0446\u0438\u044f \u0441 \u043e\u0434\u043d\u0438\u0445 \u043c\u043e\u043b\u0435\u043a\u0443\u043b \u043f\u0435\u0440\u0435\u0434\u0430\u0435\u0442\u0441\u044f \u043d\u0430 \u0434\u0440\u0443\u0433\u0438\u0435? \u0427\u0442\u043e \u043a\u0430\u0447\u0435\u0441\u0442\u0432\u0435\u043d\u043d\u043e\u0435 \u0438 \u043a\u043e\u043b\u0438\u0447\u0435\u0441\u0442\u0432\u0435\u043d\u043d\u043e\u0435 \u0441\u043e\u043e\u0442\u043d\u043e\u0448\u0435\u043d\u0438\u0435 \u0433\u0435\u043d\u043e\u0432 \u0432 \u0434\u0430\u043d\u043d\u044b\u0439 \u043c\u043e\u043c\u0435\u043d\u0442 \u043c\u043e\u0436\u0435\u0442 \u0441\u043a\u0430\u0437\u0430\u0442\u044c \u043e \u0441\u043e\u0441\u0442\u043e\u044f\u043d\u0438\u0438 \u043d\u0430\u0448\u0435\u0433\u043e \u043e\u0440\u0433\u0430\u043d\u0438\u0437\u043c\u0430? \u0421\u0435\u0439\u0447\u0430\u0441 \u043f\u043e\u043f\u0440\u043e\u0431\u0443\u0435\u043c \u0440\u0430\u0437\u043e\u0431\u0440\u0430\u0442\u044c\u0441\u044f, \u043a\u0430\u043a \u0441\u0447\u0438\u0442\u0430\u044e\u0442 \u0433\u0435\u043d\u044b, \u0438 \u0447\u0442\u043e \u044d\u0442\u043e \u0434\u0430\u0435\u0442. <\/p>\n
    \n
     \u0420\u041d\u041a-\u043f\u043e\u043b\u0438\u043c\u0435\u0440\u0430\u0437\u0430 \u0441\u0447\u0438\u0442\u044b\u0432\u0430\u0435\u0442 \u0414\u041d\u041a \u0438 \u0441\u0438\u043d\u0442\u0435\u0437\u0438\u0440\u0443\u0435\u0442 \u0420\u041d\u041a \u0432 \u0445\u043e\u0434\u0435 \u0442\u0440\u0430\u043d\u0441\u043a\u0440\u0438\u043f\u0446\u0438\u0438.<\/figcaption><\/div>\n<\/figure>\n
    \u0427\u0442\u043e \u0434\u0430\u0435\u0442 \u0441\u0435\u043a\u0432\u0435\u043d\u0438\u0440\u043e\u0432\u0430\u043d\u0438\u0435 \u0420\u041d\u041a?<\/h3>\n
    \u041d\u0430 Habr \u0443\u0436\u0435 \u043f\u0440\u0438\u0441\u0443\u0442\u0441\u0442\u0432\u0443\u044e\u0442 \u0441\u0442\u0430\u0442\u044c\u0438, \u043a\u043e\u0442\u043e\u0440\u044b\u0435 \u0440\u0430\u0441\u0441\u043a\u0430\u0437\u044b\u0432\u0430\u044e\u0442 \u043e \u0442\u043e\u043c, \u043a\u0430\u043a\u0438\u0435 \u0438\u043d\u0441\u0442\u0440\u0443\u043c\u0435\u043d\u0442\u044b \u043f\u0440\u0438\u043c\u0435\u043d\u044f\u044e\u0442\u0441\u044f \u0432 \u0431\u0438\u043e\u0438\u043d\u0444\u043e\u0440\u043c\u0430\u0442\u0438\u043a\u0435 \u0434\u043b\u044f \u0440\u0435\u0448\u0435\u043d\u0438\u044f \u043d\u0430\u0443\u0447\u043d\u044b\u0445 \u0437\u0430\u0434\u0430\u0447 \u0432 \u0431\u0438\u043e\u043b\u043e\u0433\u0438\u0438. \u0422\u0430\u043a, \u043d\u0430\u043f\u0440\u0438\u043c\u0435\u0440, \u0435\u0441\u0442\u044c \u0434\u043e\u0441\u0442\u0430\u0442\u043e\u0447\u043d\u043e \u0438\u043d\u0442\u0435\u0440\u0435\u0441\u043d\u0430\u044f \u0441\u0435\u0440\u0438\u044f \u0441\u0442\u0430\u0442\u0435\u0439 \u00ab\u041f\u0440\u0430\u043a\u0442\u0438\u0447\u0435\u0441\u043a\u0430\u044f \u0431\u0438\u043e\u0438\u043d\u0444\u043e\u0440\u043c\u0430\u0442\u0438\u043a\u0430\u00bb. \u0417\u0434\u0435\u0441\u044c \u0445\u043e\u0442\u0435\u043b\u043e\u0441\u044c \u0431\u044b \u0437\u0430\u0442\u0440\u043e\u043d\u0443\u0442\u044c \u0446\u0435\u043b\u0435\u043d\u0430\u043f\u0440\u0430\u0432\u043b\u0435\u043d\u043d\u043e \u0442\u0430\u043a\u0443\u044e \u043e\u0431\u043b\u0430\u0441\u0442\u044c, \u043a\u0430\u043a \u0442\u0440\u0430\u043d\u0441\u043a\u0440\u0438\u043f\u0442\u043e\u043c\u0438\u043a\u0430 \u043d\u0430 \u044f\u0437\u044b\u043a\u0435 R. \u041c\u044b \u043f\u043e\u043f\u0440\u043e\u0431\u0443\u0435\u043c \u043c\u0430\u043a\u0441\u0438\u043c\u0430\u043b\u044c\u043d\u043e \u043d\u0430\u0433\u043b\u044f\u0434\u043d\u043e \u0438 \u0441 \u043f\u043e\u044f\u0441\u043d\u0435\u043d\u0438\u044f\u043c\u0438 \u0440\u0430\u0437\u043e\u0431\u0440\u0430\u0442\u044c \u0447\u0442\u043e \u0442\u0430\u043a\u043e\u0435 \u044d\u0442\u043e \u0437\u0430 \u0442\u0438\u043f \u0430\u043d\u0430\u043b\u0438\u0437\u0430, \u043a\u0430\u043a \u043f\u043e\u043b\u0443\u0447\u0430\u044e\u0442 \u0434\u0430\u043d\u043d\u044b\u0435 \u0438 \u0434\u043b\u044f \u043a\u0430\u043a\u0438\u0445 \u0446\u0435\u043b\u0435\u0439 \u043e\u043d \u043f\u0440\u0438\u043c\u0435\u043d\u044f\u0435\u0442\u0441\u044f. <\/p>\n
    \u0421\u0435\u043a\u0432\u0435\u043d\u0438\u0440\u0443\u044f \u043e\u0431\u0440\u0430\u0437\u0435\u0446, \u043c\u044b \u043a\u0430\u043a \u0431\u044b \u0434\u0435\u043b\u0430\u0435\u043c \u00ab\u0444\u043e\u0442\u043e\u0441\u043d\u0438\u043c\u043e\u043a\u00bb \u0432\u0441\u0435\u0445 \u043f\u0440\u043e\u0446\u0435\u0441\u0441\u043e\u0432, \u043f\u0440\u043e\u0442\u0435\u043a\u0430\u044e\u0449\u0438\u0445 \u043d\u0430 \u0440\u0430\u0437\u043d\u044b\u0445 \u0441\u0442\u0430\u0434\u0438\u044f\u0445 \u043c\u0435\u0442\u0430\u0431\u043e\u043b\u0438\u0447\u0435\u0441\u043a\u0438\u0445 \u043a\u0430\u0441\u043a\u0430\u0434\u043e\u0432 \u0432\u043d\u0443\u0442\u0440\u0438 \u043a\u043b\u0435\u0442\u043a\u0438, \u0437\u0430\u0442\u0440\u0430\u0433\u0438\u0432\u0430\u044e\u0449\u0438\u0445 \u0431\u0435\u043b\u043a\u0438, \u0441\u0438\u043d\u0442\u0435\u0437\u0438\u0440\u0443\u0435\u043c\u044b\u0435 \u043d\u0430 \u043e\u0441\u043d\u043e\u0432\u0435 \u0433\u0435\u043d\u043e\u0432, \u0430 \u0437\u0430\u0442\u0435\u043c, \u0430\u043d\u0430\u043b\u0438\u0437\u0438\u0440\u0443\u044f \u043f\u043e\u043b\u0443\u0447\u0435\u043d\u043d\u0443\u044e \u0438\u043d\u0444\u043e\u0440\u043c\u0430\u0446\u0438\u044e, \u043c\u044b \u043c\u043e\u0436\u0435\u043c \u043f\u0440\u043e\u0432\u0435\u0440\u044f\u0442\u044c \u0433\u0438\u043f\u043e\u0442\u0435\u0437\u044b, \u043d\u0430\u0445\u043e\u0434\u0438\u0442\u044c \u043f\u0440\u0438\u0447\u0438\u043d\u044b \u0440\u0430\u0437\u0432\u0438\u0442\u0438\u044f \u0441\u0438\u043c\u043f\u0442\u043e\u043c\u043e\u0432 \u0440\u0430\u0437\u043b\u0438\u0447\u043d\u044b\u0445 \u0437\u0430\u0431\u043e\u043b\u0435\u0432\u0430\u043d\u0438\u0439, \u0438\u0441\u0441\u043b\u0435\u0434\u043e\u0432\u0430\u0442\u044c \u043c\u043e\u043b\u0435\u043a\u0443\u043b\u044f\u0440\u043d\u044b\u0435 \u043c\u0435\u0445\u0430\u043d\u0438\u0437\u043c\u044b, \u0441\u0432\u044f\u0437\u0430\u043d\u043d\u044b\u0435 \u0441 \u043e\u0431\u043e\u043d\u044f\u043d\u0438\u0435\u043c, \u0432\u043e\u0441\u043f\u0440\u0438\u044f\u0442\u0438\u0435\u043c \u0432\u043a\u0443\u0441\u0430 \u0438 \u043c\u043d\u043e\u0433\u043e \u043a\u0430\u043a\u0438\u0445 \u0435\u0449\u0435<\/a>. \u0412\u0441\u0435 \u044d\u0442\u043e \u043f\u043e\u0437\u0432\u043e\u043b\u044f\u0435\u0442 \u043e\u0441\u0443\u0449\u0435\u0441\u0442\u0432\u0438\u0442\u044c \u0442\u0440\u0430\u043d\u0441\u043a\u0440\u0438\u043f\u0442\u043e\u043c\u043d\u044b\u0439 \u0430\u043d\u0430\u043b\u0438\u0437. \u041e\u0434\u043d\u0430\u043a\u043e, \u0442\u0430\u043a \u043a\u0430\u043a \u043e\u0431\u043b\u0430\u0441\u0442\u044c \u0441\u0442\u043e\u0438\u0442 \u043d\u0430 \u0441\u0442\u044b\u043a\u0435 \u0441 \u0431\u0438\u043e\u043b\u043e\u0433\u0438\u0435\u0439, \u0431\u0435\u0437 \u0435\u0435 \u0442\u0435\u0440\u043c\u0438\u043d\u043e\u0432 \u043d\u0438\u043a\u0443\u0434\u0430.<\/p>\n
    \u0418\u0441\u0445\u043e\u0434\u044f \u0438\u0437 \u043c\u043e\u043b\u0435\u043a\u0443\u043b\u044f\u0440\u043d\u043e\u0439 \u0434\u043e\u0433\u043c\u044b, \u0438\u0437\u0432\u0435\u0441\u0442\u043d\u043e, \u0447\u0442\u043e \u043d\u0430\u0441\u043b\u0435\u0434\u0441\u0442\u0432\u0435\u043d\u043d\u0430\u044f \u0438\u043d\u0444\u043e\u0440\u043c\u0430\u0446\u0438\u044f \u0445\u0440\u0430\u043d\u0438\u0442\u0441\u044f \u0432 \u0432\u0438\u0434\u0435 \u0414\u041d\u041a. \u0412 \u0414\u041d\u041a \u0435\u0441\u0442\u044c \u043e\u0442\u0434\u0435\u043b\u044c\u043d\u044b\u0435 \u0444\u0440\u0430\u0433\u043c\u0435\u043d\u0442\u044b \u2014 \u0433\u0435\u043d\u044b, \u043a\u043e\u0442\u043e\u0440\u044b\u0435 \u044f\u0432\u043b\u044f\u044e\u0442\u0441\u044f \u043e\u0441\u043d\u043e\u0432\u043d\u043e\u0439 \u0434\u043b\u044f \u0441\u0438\u043d\u0442\u0435\u0437\u0430 \u0431\u0435\u043b\u043a\u043e\u0432. \u041f\u0440\u043e\u043c\u0435\u0436\u0443\u0442\u043e\u0447\u043d\u044b\u043c \u044d\u0442\u0430\u043f\u043e\u043c \u0441\u0438\u043d\u0442\u0435\u0437\u0430 \u044f\u0432\u043b\u044f\u0435\u0442\u0441\u044f \u043f\u0435\u0440\u0435\u043f\u0438\u0441\u044b\u0432\u0430\u043d\u0438\u0435 \u0441\u043e\u043e\u0442\u0432\u0435\u0442\u0441\u0442\u0432\u0443\u044e\u0449\u0438\u0445 \u0431\u0435\u043b\u043a\u0430\u043c \u0433\u0435\u043d\u043e\u0432 \u0432 \u0432\u0438\u0434\u0435 \u043c\u043e\u043b\u0435\u043a\u0443\u043b \u0420\u041d\u041a, \u043a\u043e\u0442\u043e\u0440\u044b\u0435 \u0438 \u0441\u0447\u0438\u0442\u044b\u0432\u0430\u044e\u0442\u0441\u044f \u0441\u0435\u043a\u0432\u0435\u043d\u0430\u0442\u043e\u0440\u043e\u043c. \u0422\u0430\u043a\u043e\u0439 \u043f\u0440\u043e\u0446\u0435\u0441\u0441, \u0433\u0434\u0435 \u0414\u041d\u041a, \u044f\u0432\u043b\u044f\u044e\u0449\u0435\u0435\u0441\u044f \u043f\u043e\u0441\u0442\u043e\u044f\u043d\u043d\u044b\u043c \u0445\u0440\u0430\u043d\u0438\u043b\u0438\u0449\u0435\u043c \u0433\u0435\u043d\u0435\u0442\u0438\u0447\u0435\u0441\u043a\u043e\u0439 \u0438\u043d\u0444\u043e\u0440\u043c\u0430\u0446\u0438\u0438, \u0432\u044b\u0441\u0442\u0443\u043f\u0430\u0435\u0442 \u043c\u0430\u0442\u0440\u0438\u0446\u0435\u0439 \u0434\u043b\u044f \u0441\u0438\u043d\u0442\u0435\u0437\u0430 \u0420\u041d\u041a, \u043d\u0430 \u043a\u043e\u0442\u043e\u0440\u043e\u0439, \u0432 \u0441\u0432\u043e\u044e \u043e\u0447\u0435\u0440\u0435\u0434\u044c, \u043f\u0440\u0438 \u043f\u043e\u043c\u043e\u0449\u0438 \u0440\u0438\u0431\u043e\u0441\u043e\u043c \u0441\u043e\u0431\u0438\u0440\u0430\u0435\u0442\u0441\u044f \u0431\u0435\u043b\u043e\u043a, \u0443\u043d\u0438\u0432\u0435\u0440\u0441\u0430\u043b\u0435\u043d \u0434\u043b\u044f \u0432\u0441\u0435\u0445 \u043a\u043b\u0435\u0442\u043e\u0447\u043d\u044b\u0445 \u043e\u0440\u0433\u0430\u043d\u0438\u0437\u043c\u043e\u0432. \u041f\u0440\u043e\u0446\u0435\u0441\u0441 \u0441\u0447\u0438\u0442\u044b\u0432\u0430\u043d\u0438\u044f \u0414\u041d\u041a \u0438 \u0437\u0430\u043f\u0438\u0441\u0438 \u0438\u043d\u0444\u043e\u0440\u043c\u0430\u0446\u0438\u0438 \u0432 \u0433\u0435\u043d\u0430\u0445 \u043f\u043e \u043f\u0440\u0438\u043d\u0446\u0438\u043f\u0443 \u043a\u043e\u043c\u043f\u043b\u0435\u043c\u0435\u043d\u0442\u0430\u0440\u043d\u043e\u0441\u0442\u0438 \u0432 \u0432\u0438\u0434\u0435 \u043c\u043e\u043b\u0435\u043a\u0443\u043b\u044b \u0438\u043d\u0444\u043e\u0440\u043c\u0430\u0446\u0438\u043e\u043d\u043d\u043e\u0439 \u0420\u041d\u041a (\u0438\u0420\u041d\u041a) \u043d\u043e\u0441\u0438\u0442 \u043d\u0430\u0437\u0432\u0430\u043d\u0438\u0435 \u00ab\u0442\u0440\u0430\u043d\u0441\u043a\u0440\u0438\u043f\u0446\u0438\u044f\u00bb, \u0430 \u0441\u043e\u0432\u043e\u043a\u0443\u043f\u043d\u043e\u0441\u0442\u044c \u0432\u0441\u0435\u0445 \u0442\u0430\u043a\u0438\u0445 \u0420\u041d\u041a \u0432 \u043a\u043b\u0435\u0442\u043a\u0435 — \u0442\u0440\u0430\u043d\u0441\u043a\u0440\u0438\u043f\u0442\u043e\u043c. \u041f\u0440\u043e\u0446\u0435\u0441\u0441, \u0432 \u0445\u043e\u0434\u0435 \u043a\u043e\u0442\u043e\u0440\u043e\u0433\u043e \u0441\u0447\u0438\u0442\u044b\u0432\u0430\u0435\u0442\u0441\u044f \u0438\u0420\u041d\u041a \u0438 \u043d\u0430 \u043d\u0435\u0439 \u0441\u0438\u043d\u0442\u0435\u0437\u0438\u0440\u0443\u0435\u0442\u0441\u044f \u0431\u0435\u043b\u043e\u043a, \u043d\u043e\u0441\u0438\u0442 \u043d\u0430\u0437\u0432\u0430\u043d\u0438\u0435 \u00ab\u0442\u0440\u0430\u043d\u0441\u043b\u044f\u0446\u0438\u044f\u00bb, \u0430 \u0441\u043e\u0432\u043e\u043a\u0443\u043f\u043d\u043e\u0441\u0442\u044c \u0431\u0435\u043b\u043a\u043e\u0432 — \u043f\u0440\u043e\u0442\u0435\u043e\u043c (\u041a\u0430\u0440\u0442\u0438\u043d\u043a\u0430 1). \u041e\u0447\u0435\u0432\u0438\u0434\u043d\u043e, \u0435\u0441\u043b\u0438 \u043d\u0430 \u0414\u041d\u041a \u0441\u0438\u043d\u0442\u0435\u0437\u0438\u0440\u043e\u0432\u0430\u043b\u0430\u0441\u044c \u0420\u041d\u041a, \u043a\u043e\u0442\u043e\u0440\u0430\u044f \u043a\u043e\u0434\u0438\u0440\u0443\u0435\u0442 \u0431\u0435\u043b\u043e\u043a, \u0442\u043e \u043d\u0430 \u043c\u0430\u0442\u0440\u0438\u0446\u0435 \u044d\u0442\u043e\u0439 \u0420\u041d\u041a \u0437\u0430\u0442\u0435\u043c \u0431\u0443\u0434\u0435\u0442 \u0441\u043e\u0431\u0440\u0430\u043d \u0438 \u0441\u0430\u043c \u0431\u0435\u043b\u043e\u043a. \u0418\u043d\u044b\u043c\u0438 \u0441\u043b\u043e\u0432\u0430\u043c\u0438, \u0441 \u043e\u043f\u0440\u0435\u0434\u0435\u043b\u0435\u043d\u043d\u044b\u043c\u0438 \u043e\u0433\u043e\u0432\u043e\u0440\u043a\u0430\u043c\u0438, \u043a\u043e\u043b\u0438\u0447\u0435\u0441\u0442\u0432\u043e \u0420\u041d\u041a \u043c\u043e\u0436\u0435\u0442 \u0441\u043a\u0430\u0437\u0430\u0442\u044c \u043d\u0430\u043c \u043e \u0442\u043e\u043c, \u0447\u0442\u043e \u00ab\u0445\u043e\u0447\u0435\u0442\u00bb \u0441\u0434\u0435\u043b\u0430\u0442\u044c \u043a\u043b\u0435\u0442\u043a\u0430, \u043a\u0430\u043a\u0438\u0435 \u0431\u0435\u043b\u043a\u0438 \u0441\u0438\u043d\u0442\u0435\u0437\u0438\u0440\u043e\u0432\u0430\u0442\u044c \u0438 \u0432 \u043a\u0430\u043a\u043e\u043c \u043a\u043e\u043b\u0438\u0447\u0435\u0441\u0442\u0432\u0435. \u0422\u0430\u043a, \u0435\u0441\u043b\u0438 \u043e\u043d\u0430 \u0441\u0438\u043d\u0442\u0435\u0437\u0438\u0440\u0443\u0435\u0442 \u0431\u0435\u043b\u043a\u0438, \u0441\u0432\u044f\u0437\u0430\u043d\u043d\u044b\u0435 \u0441 \u0431\u043e\u0440\u044c\u0431\u043e\u0439 \u0441 \u0440\u0430\u043a\u043e\u043c, \u043b\u043e\u0433\u0438\u0447\u043d\u043e \u043f\u0440\u0435\u0434\u043f\u043e\u043b\u043e\u0436\u0438\u0442\u044c, \u0447\u0442\u043e \u0432 \u043e\u0440\u0433\u0430\u043d\u0438\u0437\u043c\u0435 \u043f\u0440\u043e\u0438\u0441\u0445\u043e\u0434\u044f\u0442 \u0437\u043b\u043e\u043a\u0430\u0447\u0435\u0441\u0442\u0432\u0435\u043d\u043d\u044b\u0435 \u0438\u0437\u043c\u0435\u043d\u0435\u043d\u0438\u044f \u0438 \u043e\u043d \u0441\u043e\u0431\u0438\u0440\u0430\u0435\u0442\u0441\u044f \u0441 \u043d\u0438\u043c\u0438 \u0431\u043e\u0440\u043e\u0442\u044c\u0441\u044f. \u0418 \u0442\u0430\u043a \u0434\u0430\u043b\u0435\u0435. \u0417\u0434\u0435\u0441\u044c \u0435\u0441\u0442\u044c \u043f\u0440\u044f\u043c\u0430\u044f, \u043f\u0443\u0441\u0442\u044c \u0438 \u043d\u0435 100%, \u043a\u043e\u0440\u0440\u0435\u043b\u044f\u0446\u0438\u044f \u043c\u0435\u0436\u0434\u0443 \u043a\u043e\u043b\u0438\u0447\u0435\u0441\u0442\u0432\u043e\u043c \u043c\u043e\u043b\u0435\u043a\u0443\u043b \u0420\u041d\u041a \u0438 \u043a\u043e\u043b\u0438\u0447\u0435\u0441\u0442\u0432\u043e\u043c \u0431\u0435\u043b\u043a\u0430, \u043a\u043e\u0442\u043e\u0440\u043e\u0435 \u043e\u043d\u043e \u043a\u043e\u0434\u0438\u0440\u0443\u0435\u0442, \u0432\u043d\u0443\u0442\u0440\u0438 \u043a\u043b\u0435\u0442\u043a\u0438 \u0432 \u0434\u0430\u043d\u043d\u044b\u0439 \u043c\u043e\u043c\u0435\u043d\u0442.<\/p>\n
    \n
    \u041a\u0430\u0440\u0442\u0438\u043d\u043a\u0430 1. \u041c\u043e\u043b\u0435\u043a\u0443\u043b\u044f\u0440\u043d\u0430\u044f \u0434\u043e\u0433\u043c\u0430, \u0441\u0445\u0435\u043c\u0430.<\/figcaption><\/div>\n<\/figure>\n
    \u0422\u0440\u0430\u043d\u0441\u043a\u0440\u0438\u043f\u0442\u043e\u043c\u0438\u043a\u0430 \u0434\u0435\u043b\u0438\u0442\u0441\u044f \u043d\u0430 \u0434\u0432\u0430 \u0431\u043e\u043b\u044c\u0448\u0438\u0445 \u0440\u0430\u0437\u0434\u0435\u043b\u0430 \u2014 bulk RNA-seq \u0438 single-cell RNA-seq. \u0412 \u043d\u0430\u0437\u0432\u0430\u043d\u0438\u0438 \u043e\u0442\u0440\u0430\u0436\u0435\u043d\u0430 \u0438 \u0441\u0443\u0442\u044c \u0434\u0430\u043d\u043d\u044b\u0445 \u043c\u0435\u0442\u043e\u0434\u043e\u0432: bulk RNA-seq — \u044d\u0442\u043e \u0441\u0435\u043a\u0432\u0435\u043d\u0438\u0440\u043e\u0432\u0430\u043d\u0438\u0435 \u0442\u043a\u0430\u043d\u0438 \u0446\u0435\u043b\u0438\u043a\u043e\u043c, \u0442\u043e\u0433\u0434\u0430 \u043a\u0430\u043a single-cell RNA-seq — \u043a\u0430\u0436\u0434\u043e\u0439 \u043e\u0442\u0434\u0435\u043b\u044c\u043d\u043e\u0439 \u043a\u043b\u0435\u0442\u043a\u0438 \u0438 \u0441\u043e\u0445\u0440\u0430\u043d\u0435\u043d\u0438\u0435 \u0438\u043d\u0444\u043e\u0440\u043c\u0430\u0446\u0438\u0438 \u043e\u0431 \u044d\u043a\u0441\u043f\u0440\u0435\u0441\u0441\u0438\u0438. \u0417\u0434\u0435\u0441\u044c \u0431\u0443\u0434\u0435\u0442 \u043f\u043e\u0434\u0440\u043e\u0431\u043d\u043e \u043e\u0441\u0432\u0435\u0449\u0435\u043d \u043f\u0430\u0439\u043f\u043b\u0430\u0439\u043d \u0440\u0430\u0431\u043e\u0442\u044b \u0441 bulk RNA-seq.\u00a0 <\/p>\n
    \u0427\u0442\u043e \u044d\u0442\u043e \u0432\u043e\u043e\u0431\u0449\u0435 \u0442\u0430\u043a\u043e\u0435? \u0424\u0430\u043a\u0442\u0438\u0447\u0435\u0441\u043a\u0438, \u043c\u044b \u0431\u0435\u0440\u0435\u043c \u0434\u043b\u044f \u0441\u0435\u043a\u0432\u0435\u043d\u0438\u0440\u043e\u0432\u0430\u043d\u0438\u044f \u0432\u0435\u0441\u044c \u043e\u0431\u0440\u0430\u0437\u0435\u0446 \u0442\u043a\u0430\u043d\u0438, \u0432\u0441\u044e \u0441\u043e\u0432\u043e\u043a\u0443\u043f\u043d\u043e\u0441\u0442\u044c \u043a\u043b\u0435\u0442\u043e\u043a, \u043c\u043e\u043b\u0435\u043a\u0443\u043b\u044b \u0420\u041d\u041a \u0437\u0430\u043f\u0438\u0441\u044b\u0432\u0430\u044e\u0442\u0441\u044f \u0432 \u0441\u0442\u0440\u043e\u043a\u043e\u0432\u043e\u043c \u0432\u0438\u0434\u0435 \u0444\u0440\u0430\u0433\u043c\u0435\u043d\u0442\u043e\u0432 \u043f\u043e 100-200 \u043d\u0443\u043a\u043b\u0435\u043e\u0442\u0438\u0434\u043e\u0432. \u0417\u0430\u0442\u0435\u043c \u043c\u044b \u0441\u043e\u0431\u0438\u0440\u0430\u0435\u043c \u0438\u0437 \u043d\u0438\u0445 \u0446\u0435\u043b\u043e\u0441\u0442\u043d\u044b\u0435 \u0420\u041d\u041a \u0438 \u0441\u0447\u0438\u0442\u0430\u0435\u043c \u044d\u043a\u0437\u0435\u043c\u043f\u043b\u044f\u0440\u044b \u043f\u043e\u0432\u0442\u043e\u0440\u044f\u044e\u0449\u0438\u0445\u0441\u044f \u0441\u0442\u0440\u043e\u043a. \u041f\u043e\u0442\u043e\u043c \u043e\u0431\u044a\u0435\u0434\u0438\u043d\u044f\u0435\u043c \u0432\u0441\u0435 \u043e\u0431\u0440\u0430\u0437\u0446\u044b \u0441 \u043f\u043e\u0441\u0447\u0438\u0442\u0430\u043d\u043d\u044b\u043c\u0438 \u0433\u0435\u043d\u0430\u043c\u0438 \u0432 \u043e\u0434\u043d\u0443 \u043c\u0430\u0442\u0440\u0438\u0446\u0443, \u043a\u043e\u043b\u0438\u0447\u0435\u0441\u0442\u0432\u043e \u0441\u0442\u043e\u043b\u0431\u0446\u043e\u0432 \u0432 \u043a\u043e\u0442\u043e\u0440\u043e\u0439 \u0440\u0430\u0432\u043d\u043e \u043a\u043e\u043b\u0438\u0447\u0435\u0441\u0442\u0432\u0443 \u043e\u0431\u0440\u0430\u0437\u0446\u043e\u0432, \u0430 \u0441\u0442\u0440\u043e\u043a \u2014 \u0433\u0435\u043d\u0430\u043c. \u0423 \u0447\u0435\u043b\u043e\u0432\u0435\u043a\u0430 \u0431\u0443\u0434\u0435\u0442 \u043e\u043a\u043e\u043b\u043e 40 \u0442\u044b\u0441. \u0441\u0442\u0440\u043e\u043a \u0432 \u043c\u0430\u0442\u0440\u0438\u0446\u0435.<\/p>\n
    \u0412 \u0440\u0430\u043c\u043a\u0430\u0445 \u0442\u0440\u0430\u043d\u0441\u043a\u0440\u0438\u043f\u0442\u043e\u043c\u0438\u043a\u0438 \u0438\u0437\u043c\u0435\u0440\u044f\u0435\u0442\u0441\u044f \u0434\u0438\u0444\u0444\u0435\u0440\u0435\u043d\u0446\u0438\u0430\u043b\u044c\u043d\u0430\u044f \u044d\u043a\u0441\u043f\u0440\u0435\u0441\u0441\u0438\u044f \u0433\u0435\u043d\u043e\u0432. \u0422\u043e \u0435\u0441\u0442\u044c \u043d\u0430\u0445\u043e\u0434\u0438\u0442\u0441\u044f \u0440\u0430\u0437\u043d\u0438\u0446\u0430 \u0432 \u043a\u043e\u043b\u0438\u0447\u0435\u0441\u0442\u0432\u0435 \u043c\u043e\u043b\u0435\u043a\u0443\u043b \u0420\u041d\u041a \u0443 \u043a\u043e\u043d\u0442\u0440\u043e\u043b\u044f \u0438 \u044d\u043a\u0441\u043f\u0435\u0440\u0438\u043c\u0435\u043d\u0442\u0430, \u0438\u043b\u0438 \u0443 \u043e\u0434\u043d\u043e\u0433\u043e \u043e\u0431\u0440\u0430\u0437\u0446\u0430 \u043f\u043e \u0441\u0440\u0430\u0432\u043d\u0435\u043d\u0438\u044e \u0441 \u0434\u0440\u0443\u0433\u0438\u043c, \u0435\u0441\u043b\u0438, \u043d\u0430\u043f\u0440\u0438\u043c\u0435\u0440, \u0430\u043d\u0430\u043b\u0438\u0437\u0438\u0440\u0443\u0435\u0442\u0441\u044f \u0434\u0438\u043d\u0430\u043c\u0438\u043a\u0430 \u0437\u0430\u0431\u043e\u043b\u0435\u0432\u0430\u043d\u0438\u044f. \u041f\u0440\u0438 \u044d\u0442\u043e\u043c \u0438\u0437\u043c\u0435\u043d\u0435\u043d\u0438\u0435 \u044d\u043a\u0441\u043f\u0440\u0435\u0441\u0441\u0438\u0438 \u043e\u043f\u0438\u0441\u044b\u0432\u0430\u0435\u0442\u0441\u044f \u043b\u043e\u0433\u0430\u0440\u0438\u0444\u043c\u0438\u0447\u0435\u0441\u043a\u043e\u0439 \u0444\u0443\u043d\u043a\u0446\u0438\u0435\u0439, \u0438\u0437 \u0447\u0435\u0433\u043e \u0441\u043b\u0435\u0434\u0443\u0435\u0442, \u0447\u0442\u043e, \u043f\u0440\u0438 \u0435\u0433\u043e \u043e\u0442\u0440\u0438\u0446\u0430\u0442\u0435\u043b\u044c\u043d\u043e\u043c \u0437\u043d\u0430\u0447\u0435\u043d\u0438\u0438, \u043e\u0431\u0440\u0430\u0437\u0435\u0446 \u043f\u043e\u043a\u0430\u0437\u044b\u0432\u0430\u0435\u0442 \u0441\u043d\u0438\u0436\u0435\u043d\u0438\u0435 \u0441\u0438\u043d\u0442\u0435\u0437\u0430 \u0441\u043e\u043e\u0442\u0432\u0435\u0442\u0441\u0442\u0432\u0443\u044e\u0449\u0435\u0433\u043e \u0433\u0435\u043d\u0430, \u0430 \u043f\u0440\u0438 \u043f\u043e\u043b\u043e\u0436\u0438\u0442\u0435\u043b\u044c\u043d\u043e\u043c \u2014 \u043f\u043e\u0432\u044b\u0448\u0435\u043d\u0438\u0435. \u041f\u0440\u0438 \u044d\u0442\u043e\u043c bulk RNA-seq \u0434\u0430\u0435\u0442 \u0438\u043d\u0444\u043e\u0440\u043c\u0430\u0446\u0438\u044e \u043b\u0438\u0448\u044c \u043e \u0442\u043a\u0430\u043d\u0438 \u0438\u043b\u0438 \u043e\u0431\u0440\u0430\u0437\u0446\u0435 \u0432 \u0441\u0440\u0435\u0434\u043d\u0435\u043c, \u0445\u043e\u0442\u044f \u0442\u0430\u043a\u043e\u0439 \u0430\u043d\u0430\u043b\u0438\u0437 \u043c\u043e\u0436\u043d\u043e \u043f\u0440\u043e\u0432\u0435\u0441\u0442\u0438 \u0434\u0430\u0436\u0435 \u043d\u0430 \u0441\u043b\u0430\u0431\u043e\u043c \u043d\u043e\u0443\u0442\u0431\u0443\u043a\u0435, \u0442\u043e\u0433\u0434\u0430 \u043a\u0430\u043a single-cell \u043e\u0445\u0432\u0430\u0442\u044b\u0432\u0430\u0435\u0442 \u0434\u0430\u043d\u043d\u044b\u0435 \u043e \u043a\u0430\u0436\u0434\u043e\u0439 \u0438\u043d\u0434\u0438\u0432\u0438\u0434\u0443\u0430\u043b\u044c\u043d\u043e\u0439 \u043a\u043b\u0435\u0442\u043a\u0435, \u043a\u043e\u0442\u043e\u0440\u044b\u0445 \u043c\u043e\u0433\u0443\u0442 \u0431\u044b\u0442\u044c \u0442\u044b\u0441\u044f\u0447\u0438. \u041a\u043e\u043b\u0438\u0447\u0435\u0441\u0442\u0432\u043e \u0438\u043d\u0444\u043e\u0440\u043c\u0430\u0446\u0438\u0438 \u0431 \u043f\u043e\u043b\u0443\u0447\u0435\u043d\u043d\u043e\u0439 \u0432 \u0445\u043e\u0434\u0435 single-cell \u0430\u043d\u0430\u043b\u0438\u0437\u0430 \u0442\u0430\u043a\u0436\u0435 \u0432 \u0442\u044b\u0441\u044f\u0447\u0438 \u0440\u0430\u0437 \u0431\u043e\u043b\u044c\u0448\u0435, \u0438 \u043f\u043e\u0442\u043e\u043c\u0443 \u0442\u0430\u043a\u043e\u0439 \u0430\u043d\u0430\u043b\u0438\u0437 \u043f\u0440\u0435\u0434\u043f\u043e\u0447\u0442\u0438\u0442\u0435\u043b\u044c\u043d\u043e \u043f\u0440\u043e\u0432\u043e\u0434\u0438\u0442\u044c \u043d\u0430 \u0441\u0435\u0440\u0432\u0435\u0440\u0435, \u043b\u0438\u0431\u043e, \u0435\u0441\u043b\u0438 \u0434\u0430\u043d\u043d\u044b\u0445 \u043d\u0435 \u043e\u0447\u0435\u043d\u044c \u043c\u043d\u043e\u0433\u043e (\u043d\u0430\u043f\u0440\u0438\u043c\u0435\u0440, \u043d\u0435\u0441\u043a\u043e\u043b\u044c\u043a\u043e \u0441\u043e\u0442\u0435\u043d \u043a\u043b\u0435\u0442\u043e\u043a) — \u043d\u0430 \u043c\u043e\u0449\u043d\u043e\u043c \u043a\u043e\u043c\u043f\u044c\u044e\u0442\u0435\u0440\u0435.<\/p>\n
    \u041a\u0440\u0430\u0442\u043a\u043e \u0440\u0435\u0437\u044e\u043c\u0438\u0440\u0443\u0435\u043c \u043d\u0435\u043e\u0431\u0445\u043e\u0434\u0438\u043c\u0443\u044e \u0442\u0435\u0440\u043c\u0438\u043d\u043e\u043b\u043e\u0433\u0438\u044e<\/h3>\n
    \u0425\u043e\u0442\u044c \u043c\u044b \u0438 \u0431\u0443\u0434\u0435\u043c \u0433\u043e\u0432\u043e\u0440\u0438\u0442\u044c \u0432 \u043e\u0441\u043d\u043e\u0432\u043d\u043e\u043c \u043e \u0442\u043e\u043c, \u00ab\u043a\u0430\u043a \u0434\u0435\u043b\u0430\u0442\u044c?\u00bb \u0441 \u0442\u043e\u0447\u043a\u0438 \u0437\u0440\u0435\u043d\u0438\u044f \u043d\u0430\u043f\u0438\u0441\u0430\u043d\u0438\u044f \u043a\u043e\u0434\u0430 \u0438 \u0432\u0438\u0437\u0443\u0430\u043b\u0438\u0437\u0430\u0446\u0438\u0439, \u043d\u0443\u0436\u043d\u043e \u0432\u0441\u0451 \u0436\u0435 \u043f\u043e\u044f\u0441\u043d\u0438\u0442\u044c \u043d\u0435\u043a\u043e\u0442\u043e\u0440\u044b\u0435 \u0431\u0438\u043e\u043b\u043e\u0433\u0438\u0447\u0435\u0441\u043a\u0438\u0435 \u0442\u0435\u0440\u043c\u0438\u043d\u044b, \u0447\u0442\u043e\u0431\u044b \u043d\u0435 \u0442\u0435\u0440\u044f\u0442\u044c\u0441\u044f \u0432 \u0445\u043e\u0434\u0435 \u043f\u043e\u0432\u0435\u0441\u0442\u0432\u043e\u0432\u0430\u043d\u0438\u044f. \u0418\u0445 \u043d\u0435\u043c\u043d\u043e\u0433\u043e: <\/p>\n
      \n
    1. \n
      \u0421\u0435\u043a\u0432\u0435\u043d\u0438\u0440\u043e\u0432\u0430\u043d\u0438\u0435 \u2014 \u0444\u0430\u043a\u0442\u0438\u0447\u0435\u0441\u043a\u0438, \u0447\u0442\u0435\u043d\u0438\u0435 \u0433\u0435\u043d\u043e\u043c\u043d\u044b\u0445 \u0434\u0430\u043d\u043d\u044b\u0445 \u043e\u0431\u0440\u0430\u0437\u0446\u0430, \u043f\u0440\u0435\u0432\u0440\u0430\u0449\u0435\u043d\u0438\u0435 \u0431\u0438\u043e\u043b\u043e\u0433\u0438\u0447\u0435\u0441\u043a\u0438\u0445 \u043c\u043e\u043b\u0435\u043a\u0443\u043b \u0432 \u0441\u0442\u0440\u043e\u043a\u043e\u0432\u0443\u044e \u0438\u043d\u0444\u043e\u0440\u043c\u0430\u0446\u0438\u044e;<\/p>\n<\/li>\n
    2. \n
      RNA-seq \u2014 \u043a\u0430\u043a \u043d\u0438 \u0441\u0442\u0440\u0430\u043d\u043d\u043e, \u0441\u0435\u043a\u0432\u0435\u043d\u0438\u0440\u043e\u0432\u0430\u043d\u0438\u0435 \u0420\u041d\u041a;<\/p>\n<\/li>\n
    3. \n
      bulkRNA-seq \u2014 \u0441\u0435\u043a\u0432\u0435\u043d\u0438\u0440\u043e\u0432\u0430\u043d\u0438\u0435 \u043e\u0431\u0440\u0430\u0437\u0446\u0430 \u0442\u043a\u0430\u043d\u0438 \u0446\u0435\u043b\u0438\u043a\u043e\u043c, \u0431\u0435\u0437 \u0440\u0430\u0437\u0434\u0435\u043b\u0435\u043d\u0438\u044f \u043d\u0430 \u043e\u0442\u0434\u0435\u043b\u044c\u043d\u044b\u0435 \u043a\u043b\u0435\u0442\u043a\u0438. \u041c\u0435\u043d\u0435\u0435 \u0432\u044b\u0447\u0438\u0441\u043b\u0438\u0442\u0435\u043b\u044c\u043d\u043e \u0437\u0430\u0442\u0440\u0430\u0442\u0435\u043d, \u0442.\u043a. \u0443 \u043d\u0430\u0441 \u0435\u0441\u0442\u044c \u043e\u0434\u0438\u043d \u044d\u043a\u0437\u0435\u043c\u043f\u043b\u044f\u0440 \u043c\u0430\u0442\u0440\u0438\u0446\u044b \u044d\u043a\u0441\u043f\u0440\u0435\u0441\u0441\u0438\u0438. \u0424\u0430\u043a\u0442\u0438\u0447\u0435\u0441\u043a\u0438, \u00ab\u0441\u0440\u0435\u0434\u043d\u0435\u0435 \u043f\u043e \u0431\u043e\u043b\u044c\u043d\u0438\u0446\u0435\u00bb \u043a\u043e\u043b\u0438\u0447\u0435\u0441\u0442\u0432\u043e \u0433\u0435\u043d\u043e\u0432 \u0434\u043b\u044f \u0432\u0441\u0435\u0433\u043e \u043e\u0431\u0440\u0430\u0437\u0446\u0430;<\/p>\n<\/li>\n
    4. \n
      \u042d\u043a\u0441\u043f\u0440\u0435\u0441\u0441\u0438\u044f \u2014 \u043f\u0440\u043e\u0446\u0435\u0441\u0441 \u043f\u0440\u0435\u0432\u0440\u0430\u0449\u0435\u043d\u0438\u044f \u0438\u043d\u0444\u043e\u0440\u043c\u0430\u0446\u0438\u0438 \u0432 \u0431\u0435\u043b\u043a\u0438 \u0432\u043d\u0443\u0442\u0440\u0438 \u043a\u043b\u0435\u0442\u043a\u0438. \u0412 \u043d\u0430\u0448\u0435\u043c \u0441\u043b\u0443\u0447\u0430\u0435, \u0440\u0435\u0447\u044c \u0438\u0434\u0435\u0442 \u0438\u043c\u0435\u043d\u043d\u043e \u043e \u0442\u0440\u0430\u043d\u0441\u043a\u0440\u0438\u043f\u0446\u0438\u0438, \u0430 \u043a\u043e\u043b\u0438\u0447\u0435\u0441\u0442\u0432\u0435\u043d\u043d\u044b\u0439 \u0430\u043d\u0430\u043b\u0438\u0437 \u043f\u0440\u043e\u0432\u043e\u0434\u0438\u0442\u0441\u044f \u0434\u043b\u044f \u0420\u041d\u041a. \u041b\u044e\u0431\u043e\u0439 \u0441\u0442\u0438\u043c\u0443\u043b, \u043b\u044e\u0431\u043e\u0435 \u0432\u043e\u0437\u0434\u0435\u0439\u0441\u0442\u0432\u0438\u0435 \u0438\u043b\u0438 \u043f\u0440\u043e\u0446\u0435\u0441\u0441 \u0440\u0435\u0433\u0443\u043b\u0438\u0440\u0443\u0435\u0442\u0441\u044f \u0431\u0435\u043b\u043a\u0430\u043c\u0438. \u042d\u043a\u0441\u043f\u0440\u0435\u0441\u0441\u0438\u044f \u0433\u0435\u043d\u043e\u0432, \u043a\u043e\u0434\u0438\u0440\u0443\u044e\u0449\u0438\u0445 \u0438\u0445 \u0441\u0442\u0440\u0443\u043a\u0442\u0443\u0440\u0443, \u043c\u0435\u043d\u044f\u0435\u0442\u0441\u044f \u0432 \u043e\u0442\u0432\u0435\u0442 \u043d\u0430 \u0442\u0430\u043a\u0438\u0435 \u0432\u043e\u0437\u0434\u0435\u0439\u0441\u0442\u0432\u0438\u044f;<\/p>\n<\/li>\n
    5. \n
      Single-cell RNA-seq \u2014 \u0442\u043e \u0436\u0435 \u0441\u0430\u043c\u043e\u0435, \u0442\u043e\u043b\u044c\u043a\u043e \u0434\u043b\u044f \u043a\u0430\u0436\u0434\u043e\u0439 \u043a\u043b\u0435\u0442\u043a\u0438 \u0435\u0441\u0442\u044c \u0438\u043d\u0444\u043e\u0440\u043c\u0430\u0446\u0438\u044f \u043e\u0431 \u044d\u043a\u0441\u043f\u0440\u0435\u0441\u0441\u0438\u0438. \u0424\u0430\u043a\u0442\u0438\u0447\u0435\u0441\u043a\u0438, \u043e\u0431\u044a\u0435\u043c \u0434\u0430\u043d\u043d\u044b\u0445 bulkRNA-seq \u0443\u043c\u043d\u043e\u0436\u0430\u0435\u0442\u0441\u044f \u043d\u0430 \u043a\u043e\u043b\u0438\u0447\u0435\u0441\u0442\u0432\u043e \u043a\u043b\u0435\u0442\u043e\u043a \u0432 \u043e\u0431\u0440\u0430\u0437\u0446\u0435;<\/p>\n<\/li>\n
    6. \n
      \u0414\u0438\u0444\u0444\u0435\u0440\u0435\u043d\u0446\u0438\u0430\u043b\u044c\u043d\u0430\u044f \u044d\u043a\u0441\u043f\u0440\u0435\u0441\u0441\u0438\u044f \u2014 \u043b\u043e\u0433\u0430\u0440\u0438\u0444\u043c\u0438\u0447\u0435\u0441\u043a\u0438\u0439 \u043f\u043e\u043a\u0430\u0437\u0430\u0442\u0435\u043b\u044c \u0438\u0437\u043c\u0435\u043d\u0435\u043d\u0438\u044f \u044d\u043a\u0441\u043f\u0440\u0435\u0441\u0441\u0438\u0438 \u0432 \u043e\u0431\u0440\u0430\u0437\u0446\u0435 \u043f\u043e \u0441\u0440\u0430\u0432\u043d\u0435\u043d\u0438\u044e \u0441 \u043a\u043e\u043d\u0442\u0440\u043e\u043b\u0435\u043c. \u041c\u043e\u0436\u0435\u0442 \u0431\u044b\u0442\u044c \u043a\u0430\u043a \u043e\u0442\u0440\u0438\u0446\u0430\u0442\u0435\u043b\u044c\u043d\u044b\u043c (\u044d\u043a\u0441\u043f\u0440\u0435\u0441\u0441\u0438\u044f \u0441\u043d\u0438\u0436\u0430\u0435\u0442\u0441\u044f), \u0442\u0430\u043a \u0438 \u043f\u043e\u043b\u043e\u0436\u0438\u0442\u0435\u043b\u044c\u043d\u044b\u043c;<\/p>\n<\/li>\n
    7. \n
      \u041f\u0440\u043e\u0447\u0442\u0435\u043d\u0438\u044f, \u043e\u043d\u0438 \u0436\u0435 «\u0440\u0438\u0434\u044b» (\u043e\u0442 «read») — \u043a\u043e\u0440\u043e\u0442\u043a\u0438\u0435 \u0444\u0440\u0430\u0433\u043c\u0435\u043d\u0442\u044b \u0420\u041d\u041a, \u043a\u043e\u0442\u043e\u0440\u044b\u0435 \u0437\u0430\u043f\u0438\u0441\u044b\u0432\u0430\u044e\u0442\u0441\u044f \u0432 FASTQ \u0444\u0430\u0439\u043b\u0430\u0445 \u0432 \u0432\u0438\u0434\u0435 4-\u0441\u0442\u0440\u043e\u0447\u043d\u044b\u0445 \u043f\u043e\u0441\u043b\u0435\u0434\u043e\u0432\u0430\u0442\u0435\u043b\u044c\u043d\u043e\u0441\u0442\u0435\u0439 \u0441\u0438\u043c\u0432\u043e\u043b\u043e\u0432 (\u0432 \u0441\u0442\u0430\u0442\u044c\u0435 \u0434\u0430\u043b\u0435\u0435 \u043f\u0440\u0438\u043c\u0435\u0440);<\/p>\n<\/li>\n
    8. \n
      \u0420\u0435\u0444\u0435\u0440\u0435\u043d\u0441 — \u044d\u0442\u0430\u043b\u043e\u043d, \u0437\u0430\u0440\u0430\u043d\u0435\u0435 \u0438\u0437\u0432\u0435\u0441\u0442\u043d\u044b\u0439 \u0433\u0435\u043d\u043e\u043c \u0438\u0441\u0441\u043b\u0435\u0434\u0443\u0435\u043c\u043e\u0433\u043e \u043e\u0440\u0433\u0430\u043d\u0438\u0437\u043c\u0430, \u0441 \u043a\u043e\u0442\u043e\u0440\u044b\u043c \u043f\u0440\u043e\u0438\u0441\u0445\u043e\u0434\u0438\u0442 \u0441\u0440\u0430\u0432\u043d\u0435\u043d\u0438\u0435, \u043d\u0430 \u043e\u0441\u043d\u043e\u0432\u0435 \u043a\u043e\u0442\u043e\u0440\u043e\u0433\u043e \u0438\u0437 \u0440\u0438\u0434\u043e\u0432 \u0441\u043e\u0431\u0438\u0440\u0430\u0435\u0442\u0441\u044f \u0443\u0436\u0435 \u0441\u0435\u043a\u0432\u0435\u043d\u0438\u0440\u043e\u0432\u0430\u043d\u043d\u044b\u0439 \u0433\u0435\u043d\u043e\u043c \u043f\u0443\u0442\u0435\u043c \u0441\u043e\u043f\u043e\u0441\u0442\u0430\u0432\u043b\u0435\u043d\u0438\u044f.<\/p>\n<\/li>\n<\/ol>\n
      \u0427\u0442\u043e \u0438\u0441\u043f\u043e\u043b\u044c\u0437\u0443\u044e\u0442 \u0434\u043b\u044f \u0430\u043d\u0430\u043b\u0438\u0437\u0430 \u044d\u043a\u0441\u043f\u0440\u0435\u0441\u0441\u0438\u0438?<\/h3>\n
      \u041e\u0441\u043d\u043e\u0432\u043d\u044b\u043c \u044f\u0437\u044b\u043a\u043e\u043c \u0432 \u0434\u0435\u043b\u0435 \u0430\u043d\u0430\u043b\u0438\u0437\u0430 \u0434\u0430\u043d\u043d\u044b\u0445 \u0434\u043e\u043b\u0433\u043e\u0435 \u0432\u0440\u0435\u043c\u044f \u0431\u044b\u043b R. \u041f\u0430\u043a\u0435\u0442\u044b, \u043a\u043e\u0442\u043e\u0440\u044b\u0435 \u043f\u043e\u043d\u0430\u0434\u043e\u0431\u044f\u0442\u0441\u044f:\u00a0 <\/p>\n
      \u0412\u0438\u0437\u0443\u0430\u043b\u0438\u0437\u0430\u0446\u0438\u044f:<\/em> gplots, ggplot2, plotly, ComplexHeatmap, EnhancedVolcano, RColorBrewer, circlize;<\/p>\n
      \u0420\u0430\u0431\u043e\u0442\u0430 \u0441 \u0438\u043d\u0444\u043e\u0440\u043c\u0430\u0446\u0438\u0435\u0439 \u043d\u0435\u043f\u043e\u0441\u0440\u0435\u0434\u0441\u0442\u0432\u0435\u043d\u043d\u043e:<\/em> org.Hs.eg.db, DESeq2, edgeR, ReactomePA, clusterProfiler.\u00a0<\/p>\n
      \u0414\u043b\u044f bulkRNA-seq \u0434\u0430\u043d\u043d\u044b\u0445 \u043e\u0431\u044b\u0447\u043d\u043e \u0442\u0440\u0435\u0431\u0443\u044e\u0442\u0441\u044f \u0441\u043e\u0432\u0441\u0435\u043c \u043d\u0435\u0431\u043e\u043b\u044c\u0448\u0438\u0435 \u0440\u0435\u0441\u0443\u0440\u0441\u044b \u2014 \u0434\u043e 16 \u0413\u0411 \u041e\u0417\u0423 \u0445\u0432\u0430\u0442\u0438\u0442 \u0434\u043b\u044f \u0431\u043e\u043b\u044c\u0448\u0438\u043d\u0441\u0442\u0432\u0430 \u043e\u043f\u0435\u0440\u0430\u0446\u0438\u0439. \u0414\u043b\u044f scRNA-seq \u0438\u0441\u043f\u043e\u043b\u044c\u0437\u0443\u044e\u0442 \u0441\u0435\u0440\u0432\u0435\u0440 \u0438\u043b\u0438 \u043a\u043b\u0430\u0441\u0442\u0435\u0440, \u0438 \u043f\u0430\u043a\u0435\u0442\u044b Seurat, Matrix, celldex, SingleR \u0438 \u0434\u0440\u0443\u0433\u0438\u0435. \u0415\u0441\u043b\u0438 \u043e\u0434\u043d\u0430 \u043c\u0430\u0442\u0440\u0438\u0446\u0430 bulkRNA-seq — \u044d\u0442\u043e \u043e\u043a\u043e\u043b\u043e 40 \u0442\u044b\u0441. \u0441\u0442\u0440\u043e\u043a (\u041a\u0430\u0440\u0442\u0438\u043d\u043a\u0430 2) \u0441 \u0434\u0435\u0441\u044f\u0442\u043a\u0430\u043c\u0438 \u0441\u0442\u043e\u043b\u0431\u0446\u043e\u0432, \u0442\u043e \u0434\u0430\u0436\u0435 \u043f\u0440\u043e\u0441\u0442\u043e \u0432\u0445\u043e\u0434\u043d\u044b\u0435 \u0434\u0430\u043d\u043d\u044b\u0435 scRNA-seq — \u0442\u0435 \u0436\u0435 \u0434\u0430\u043d\u043d\u044b\u0435, \u0443\u043c\u043d\u043e\u0436\u0435\u043d\u043d\u044b\u0435 \u043d\u0430 \u043a\u043e\u043b\u0438\u0447\u0435\u0441\u0442\u0432\u043e \u043a\u043b\u0435\u0442\u043e\u043a, \u043a\u043e\u0442\u043e\u0440\u044b\u0445 \u043c\u043e\u0436\u0435\u0442 \u0431\u044b\u0442\u044c \u0431\u043e\u043b\u0435\u0435 100 \u0442\u044b\u0441.\u00a0<\/p>\n
      \n
      \u041a\u0430\u0440\u0442\u0438\u043d\u043a\u0430 2. \u041f\u0440\u0438\u043c\u0435\u0440 \u043c\u0430\u0442\u0440\u0438\u0446\u044b \u044d\u043a\u0441\u043f\u0440\u0435\u0441\u0441\u0438\u0438<\/a>, \u0444\u0440\u0430\u0433\u043c\u0435\u043d\u0442.\u00a0<\/figcaption><\/div>\n<\/figure>\n
      \u0421\u0442\u043e\u043b\u0431\u0446\u044b \u2014 \u043d\u0430\u0437\u0432\u0430\u043d\u0438\u044f \u043e\u0431\u0440\u0430\u0437\u0446\u043e\u0432, \u0441\u0442\u0440\u043e\u043a\u0438 — entrez id \u0433\u0435\u043d\u043e\u0432, \u0432 \u044f\u0447\u0435\u0439\u043a\u0430\u0445 — \u043a\u043e\u043b\u0438\u0447\u0435\u0441\u0442\u0432\u043e \u043c\u043e\u043b\u0435\u043a\u0443\u043b \u0420\u041d\u041a \u043a\u0430\u0436\u0434\u043e\u0433\u043e \u0433\u0435\u043d\u0430 \u0434\u043b\u044f \u043a\u0430\u0436\u0434\u043e\u0433\u043e \u043e\u0431\u0440\u0430\u0437\u0446\u0430. <\/p>\n
      \u041e\u0431\u044a\u0435\u043c \u0432\u0445\u043e\u0434\u043d\u043e\u0439 \u043c\u0430\u0442\u0440\u0438\u0446\u044b bulkRNA-seq \u043e\u0431\u044b\u0447\u043d\u043e < 1 \u041c\u0411, \u0430 \u0434\u043b\u044f scRNA-seq \u043c\u043e\u0436\u0435\u0442 \u0431\u044b\u0442\u044c >1 \u0413\u0411.<\/p>\n
      \u0421\u0440\u0430\u0432\u043d\u0435\u043d\u0438\u0435 \u043f\u0440\u043e\u0438\u0441\u0445\u043e\u0434\u0438\u0442 \u043c\u0435\u0436\u0434\u0443 \u0441\u0442\u043e\u043b\u0431\u0446\u0430\u043c\u0438 \u043c\u0430\u0442\u0440\u0438\u0446\u044b. \u041a\u0430\u043a \u043f\u0440\u0430\u0432\u0438\u043b\u043e, \u043d\u0435\u0441\u043a\u043e\u043b\u044c\u043a\u043e \u0438\u0437 \u043d\u0438\u0445 \u2014 \u043a\u043e\u043d\u0442\u0440\u043e\u043b\u044c, \u043f\u043e\u043b\u0443\u0447\u0435\u043d\u043d\u044b\u0439 \u0443 \u0437\u0434\u043e\u0440\u043e\u0432\u044b\u0445 \u043b\u044e\u0434\u0435\u0439. \u041e\u0441\u0442\u0430\u043b\u044c\u043d\u044b\u0435 — \u044d\u043a\u0441\u043f\u0435\u0440\u0438\u043c\u0435\u043d\u0442\u0430\u043b\u044c\u043d\u044b\u0435 \u043e\u0431\u0440\u0430\u0437\u0446\u044b. \u041d\u0430\u043f\u0440\u0438\u043c\u0435\u0440, \u0442\u043a\u0430\u043d\u0438, \u043f\u043e\u0434\u0432\u0435\u0440\u0436\u0435\u043d\u043d\u043e\u0439 \u0431\u043e\u043b\u0435\u0437\u043d\u0438, \u0438\u043b\u0438 \u043a\u0430\u043a\u043e\u043c\u0443-\u043b\u0438\u0431\u043e \u0434\u0440\u0443\u0433\u043e\u043c\u0443 \u0432\u043e\u0437\u0434\u0435\u0439\u0441\u0442\u0432\u0438\u044e.\u00a0<\/p>\n
      \u041f\u0440\u043e\u0432\u043e\u0434\u0438\u0442\u0441\u044f \u0441\u0440\u0430\u0432\u043d\u0435\u043d\u0438\u0435 \u0441 \u0438\u0441\u043f\u043e\u043b\u044c\u0437\u043e\u0432\u0430\u043d\u0438\u0435\u043c \u0442\u0435\u0441\u0442\u0430 \u0412\u0430\u043b\u044c\u0434\u0430 \u0441 \u043f\u043e\u043f\u0440\u0430\u0432\u043a\u043e\u0439 \u043d\u0430 \u043c\u043d\u043e\u0436\u0435\u0441\u0442\u0432\u0435\u043d\u043d\u044b\u0435 \u0441\u0440\u0430\u0432\u043d\u0435\u043d\u0438\u044f \u0411\u0435\u043d\u0434\u0436\u0430\u043c\u0438\u043d\u0438-\u0425\u043e\u0445\u0431\u0435\u0440\u0433\u0430. \u0412\u043f\u0440\u043e\u0447\u0435\u043c, \u044d\u0442\u043e \u0440\u0435\u0433\u0443\u043b\u0438\u0440\u0443\u0435\u0442\u0441\u044f, \u0432\u0430\u0440\u0438\u0430\u043d\u0442 \u043f\u043e\u043f\u0440\u0430\u0432\u043a\u0438 \u043c\u043e\u0436\u0435\u0442 \u0431\u044b\u0442\u044c \u0437\u0430\u0434\u0430\u043d \u0432 \u0430\u0440\u0433\u0443\u043c\u0435\u043d\u0442\u0435 \u0444\u0443\u043d\u043a\u0446\u0438\u0438 DESeq<\/a>:<\/p>\n
      DESeq(object,\u00a0test = c(\u00abWald\u00bb, \u00abLRT\u00bb),\u00a0       fitType = c(\u00abparametric\u00bb, \u00ablocal\u00bb, \u00abmean\u00bb, \u00abglmGamPoi\u00bb),\u00a0       sfType = c(\u00abratio\u00bb, \u00abposcounts\u00bb, \u00abiterate\u00bb),\u00a0       betaPrior,\u00a0       full = design(object),\u00a0       reduced,\u00a0       quiet = FALSE,\u00a0       minReplicatesForReplace = 7,\u00a0       modelMatrixType,\u00a0       useT = FALSE,       minmu = if (fitType == \u00abglmGamPoi\u00bb) 1e-06 else 0.5,\u00a0       parallel = FALSE,\u00a0       BPPARAM = bpparam())<\/code><\/pre>\n
      \u041a\u0430\u043a \u043f\u043e\u043b\u0443\u0447\u0430\u044e\u0442 \u0434\u0430\u043d\u043d\u044b\u0435? \u0418 \u043e\u0447\u0435\u043d\u044c \u043a\u043e\u0440\u043e\u0442\u043a\u043e \u043f\u0440\u043e \u043f\u0440\u0435\u0434\u043e\u0431\u0440\u0430\u0431\u043e\u0442\u043a\u0443\u2026<\/h3>\n
      \u0414\u043b\u044f \u043e\u043f\u0438\u0441\u0430\u043d\u043d\u043e\u0433\u043e \u0432\u044b\u0448\u0435 \u043d\u0435\u043e\u0431\u0445\u043e\u0434\u0438\u043c\u044b, \u043a\u0430\u043a \u043d\u0438 \u0441\u0442\u0440\u0430\u043d\u043d\u043e, \u0442\u0440\u0430\u043d\u0441\u043a\u0440\u0438\u043f\u0442\u043e\u043c\u043d\u044b\u0435 \u0434\u0430\u043d\u043d\u044b\u0435. \u0414\u0430\u043d\u043d\u044b\u0435 \u0420\u041d\u041a-\u0441\u0435\u043a\u0432\u0435\u043d\u0438\u0440\u043e\u0432\u0430\u043d\u0438\u044f \u0438\u043d\u0442\u0435\u0440\u0435\u0441\u0443\u044e\u0449\u0435\u0439 \u0442\u043a\u0430\u043d\u0438. \u0418\u0437\u043d\u0430\u0447\u0430\u043b\u044c\u043d\u043e \u044d\u0442\u043e \u043c\u0438\u043b\u043b\u0438\u043e\u043d\u044b \u0444\u0440\u0430\u0433\u043c\u0435\u043d\u0442\u043e\u0432 \u043c\u043e\u043b\u0435\u043a\u0443\u043b \u0420\u041d\u041a \u0432 \u0444\u043e\u0440\u043c\u0430\u0442\u0435 FASTQ.\u00a0 <\/p>\n
      \u0412 \u0438\u0442\u043e\u0433\u0435 \u043f\u043e\u043b\u0443\u0447\u0430\u0435\u0442\u0441\u044f \u0431\u043e\u043b\u044c\u0448\u043e\u0439 \u043d\u0435\u0443\u043f\u043e\u0440\u044f\u0434\u043e\u0447\u0435\u043d\u043d\u044b\u0439 \u0442\u0435\u043a\u0441\u0442\u043e\u0432\u044b\u0439 \u0444\u0430\u0439\u043b \u00ab\u043f\u0440\u043e\u0447\u0442\u0435\u043d\u0438\u0439\u00bb \u0441\u0443\u043c\u043c\u0430\u0440\u043d\u044b\u043c \u0440\u0430\u0437\u043c\u0435\u0440\u043e\u043c \u0434\u043e \u0441\u043e\u0442\u043d\u0438 \u0433\u0438\u0433\u0430\u0431\u0430\u0439\u0442. \u041a\u0430\u0436\u0434\u044b\u0439 \u0442\u0430\u043a\u043e\u0439 \u00ab\u0440\u0438\u0434\u00bb \u0441\u043e\u0441\u0442\u043e\u0438\u0442 \u0438\u0437 \u043d\u0430\u0438\u043c\u0435\u043d\u043e\u0432\u0430\u043d\u0438\u044f \u043e\u0431\u0440\u0430\u0437\u0446\u0430, \u0441\u0430\u043c\u043e\u0439 \u043f\u043e\u0441\u043b\u0435\u0434\u043e\u0432\u0430\u0442\u0435\u043b\u044c\u043d\u043e\u0441\u0442\u0438 (\u0432\u0442\u043e\u0440\u0430\u044f \u0441\u0442\u0440\u043e\u0447\u043a\u0430) \u0438 \u043e\u0431\u043e\u0437\u043d\u0430\u0447\u0435\u043d\u0438\u044f \u043a\u0430\u0447\u0435\u0441\u0442\u0432\u0430 \u043f\u0440\u043e\u0447\u0442\u0435\u043d\u0438\u044f \u043a\u0430\u0436\u0434\u043e\u0433\u043e \u043d\u0443\u043a\u043b\u0435\u043e\u0442\u0438\u0434\u0430, \u043f\u0440\u0438\u0441\u0432\u043e\u0435\u043d\u043d\u043e\u0433\u043e \u0441\u0435\u043a\u0432\u0435\u043d\u0430\u0442\u043e\u0440\u043e\u043c (\u0447\u0435\u0442\u0432\u0435\u0440\u0442\u0430\u044f \u0441\u0442\u0440\u043e\u0447\u043a\u0430). \u041d\u043e\u043c\u0435\u0440 \u0431\u0443\u043a\u0432\u044b \u0432\u043e \u0432\u0442\u043e\u0440\u043e\u0439 \u0441\u0442\u0440\u043e\u043a\u0435 \u0441\u043e\u043e\u0442\u0432\u0435\u0442\u0441\u0442\u0432\u0443\u0435\u0442 \u043d\u043e\u043c\u0435\u0440 \u0441\u0438\u043c\u0432\u043e\u043b\u0430 \u0432 \u0447\u0435\u0442\u0432\u0435\u0440\u0442\u043e\u0439, \u0430 \u0441\u0438\u043c\u0432\u043e\u043b\u044b \u0432 \u0422\u0430\u0431\u043b\u0438\u0446\u0435 \u043e\u0442\u0440\u0430\u0436\u0430\u044e\u0442 \u043a\u0430\u0447\u0435\u0441\u0442\u0432\u043e \u043f\u0440\u043e\u0447\u0442\u0435\u043d\u0438\u044f \u043a\u0430\u0436\u0434\u043e\u0433\u043e \u043d\u0443\u043a\u043b\u0435\u043e\u0442\u0438\u0434\u0430:<\/p>\n
      @Some RNA-seq sample 1 CGUAGCUGCUCGAUCGAUCGAUCGAUCAGU + ()(&&*III#II@@+++\/\/%$$#(&A<\/code><\/pre>\n
      \n
      \u0422\u0430\u0431\u043b\u0438\u0446\u0430<\/a> \u043a\u043e\u0434\u0438\u0440\u043e\u0432\u0430\u043d\u0438\u044f quality score \u0432 4 \u0441\u0442\u0440\u043e\u0447\u043a\u0435 FASTQ-\u0440\u0438\u0434\u0430<\/figcaption><\/div>\n<\/figure>\n
      \u041f\u0430\u0439\u043f\u043b\u0430\u0439\u043d \u0440\u0430\u0431\u043e\u0442\u044b \u0437\u0430\u043a\u043b\u044e\u0447\u0430\u0435\u0442\u0441\u044f \u0432 \u0442\u043e\u043c, \u0447\u0442\u043e\u0431\u044b \u0441\u043e\u0431\u0440\u0430\u0442\u044c \u0438\u0437 \u044d\u0442\u0438\u0445 \u043f\u0440\u043e\u0447\u0442\u0435\u043d\u0438\u0439 \u0446\u0435\u043b\u043e\u0441\u0442\u043d\u044b\u0435 \u0433\u0435\u043d\u044b, \u0442.\u0435. \u0441\u043e\u0432\u043c\u0435\u0441\u0442\u0438\u0442\u044c \u0438\u0445 \u0432 \u043d\u0443\u0436\u043d\u043e\u043c \u043f\u043e\u0440\u044f\u0434\u043a\u0435 \u0442\u0430\u043a\u0438\u043c \u043e\u0431\u0440\u0430\u0437\u043e\u043c, \u0447\u0442\u043e\u0431\u044b \u0438\u0442\u043e\u0433\u043e\u0432\u0430\u044f \u0441\u0442\u0440\u043e\u043a\u0430 \u0438\u0437 \u043d\u0435\u0441\u043a\u043e\u043b\u044c\u043a\u0438\u0445 \u0442\u044b\u0441\u044f\u0447 \u0442\u0430\u043a\u0438\u0445 \u0431\u0443\u043a\u0432 \u0441\u043e\u0441\u0442\u0430\u0432\u0438\u043b\u0430 \u0433\u0435\u043d.\u00a0 <\/p>\n
      \u041e\u0434\u043d\u0430\u043a\u043e, \u043f\u0435\u0440\u0432\u044b\u043c \u0448\u0430\u0433\u043e\u043c \u0431\u0443\u0434\u0435\u0442 \u043e\u0447\u0438\u0441\u0442\u0438\u0442\u044c \u0434\u0430\u043d\u043d\u044b\u0435 \u043e\u0442 \u043d\u0438\u0437\u043a\u043e\u043a\u0430\u0447\u0435\u0441\u0442\u0432\u0435\u043d\u043d\u044b\u0445 \u043f\u0440\u043e\u0447\u0442\u0435\u043d\u0438\u0439. \u0421\u0435\u043a\u0432\u0435\u043d\u0430\u0442\u043e\u0440 \u0437\u0430\u0440\u0430\u043d\u0435\u0435 \u0437\u0430\u043f\u0438\u0441\u044b\u0432\u0430\u0435\u0442, \u043a\u0430\u043a\u0438\u0435 \u043d\u0443\u043a\u043b\u0435\u043e\u0442\u0438\u0434\u044b \u0443\u0434\u0430\u043b\u043e\u0441\u044c \u0441\u0447\u0438\u0442\u0430\u0442\u044c \u0445\u043e\u0440\u043e\u0448\u043e, \u0430 \u043a\u0430\u043a\u0438\u0435 \u2014 \u043d\u0435 \u043e\u0447\u0435\u043d\u044c. \u0422\u0430\u043a\u0438\u0435 \u0438\u043d\u0441\u0442\u0440\u0443\u043c\u0435\u043d\u0442\u044b, \u043a\u0430\u043a FastQC \u0438 MultiQC \u043f\u043e\u0437\u0432\u043e\u043b\u044f\u044e\u0442 \u043e\u0446\u0435\u043d\u0438\u0442\u044c \u043a\u0430\u0447\u0435\u0441\u0442\u0432\u043e. \u041a\u0440\u043e\u043c\u0435 \u0442\u043e\u0433\u043e, \u043d\u0443\u0436\u043d\u043e \u0443\u0434\u0430\u043b\u0438\u0442\u044c \u0432\u0441\u043f\u043e\u043c\u043e\u0433\u0430\u0442\u0435\u043b\u044c\u043d\u044b\u0435 \u0446\u0435\u043f\u043e\u0447\u043a\u0438 — \u0430\u0434\u0430\u043f\u0442\u0435\u0440\u044b. \u041e\u043d\u0438 \u0441\u0442\u0430\u043d\u0434\u0430\u0440\u0442\u043d\u044b\u0435, \u043f\u043e\u044d\u0442\u043e\u043c\u0443 \u043c\u043e\u0436\u043d\u043e \u043d\u0430\u043f\u0440\u044f\u043c\u0443\u044e \u0438\u0441\u043f\u043e\u043b\u044c\u0437\u043e\u0432\u0430\u0442\u044c \u0437\u0430\u0440\u0430\u043d\u0435\u0435 \u0438\u0437\u0432\u0435\u0441\u0442\u043d\u0443\u044e \u0441\u0442\u0440\u043e\u043a\u043e\u0432\u0443\u044e<\/p>\n<\/div>\n<\/div>\n<\/div>\n<\/div>\n","protected":false},"author":1,"featured_media":0,"comment_status":"open","ping_status":"open","sticky":false,"template":"","format":"standard","meta":{"footnotes":""},"categories":[],"tags":[],"class_list":["post-445380","post","type-post","status-publish","format-standard","hentry"],"_links":{"self":[{"href":"https:\/\/savepearlharbor.com\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/posts\/445380","targetHints":{"allow":["GET"]}}],"collection":[{"href":"https:\/\/savepearlharbor.com\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/posts"}],"about":[{"href":"https:\/\/savepearlharbor.com\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/types\/post"}],"author":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/savepearlharbor.com\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/users\/1"}],"replies":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/savepearlharbor.com\/index.php?rest_route=%2Fwp%2Fv2%2Fcomments&post=445380"}],"version-history":[{"count":0,"href":"https:\/\/savepearlharbor.com\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/posts\/445380\/revisions"}],"wp:attachment":[{"href":"https:\/\/savepearlharbor.com\/index.php?rest_route=%2Fwp%2Fv2%2Fmedia&parent=445380"}],"wp:term":[{"taxonomy":"category","embeddable":true,"href":"https:\/\/savepearlharbor.com\/index.php?rest_route=%2Fwp%2Fv2%2Fcategories&post=445380"},{"taxonomy":"post_tag","embeddable":true,"href":"https:\/\/savepearlharbor.com\/index.php?rest_route=%2Fwp%2Fv2%2Ftags&post=445380"}],"curies":[{"name":"wp","href":"https:\/\/api.w.org\/{rel}","templated":true}]}}