— поговорим о том, когда и зачем следует проводить множественные тесты;
— рассмотрим основные методы расчёта результатов тестов и математические принципы, на которых основаны методы;
— приведём примеры программной реализации методов; эти примеры вы сможете использовать в своих проектах.
Итак, приступим.
Множественные эксперименты: когда и зачем
Очевидно, что любое техническое усложнение эксперимента должно быть обосновано практической необходимостью. Это касается и множественных тестов. Если аудитория разбивается более чем на две подгруппы, вероятность получить ошибку первого рода при эксперименте нарастает экспоненциально:
где — число подгрупп, — заданный уровень статистической значимости.
Таким образом, при добавлении всего одной дополнительной подгруппы в привычный парный тест () при заданном стандартном уровне мы получаем вероятность ошибки первого рода , что значительно превышает наш заданный .
Зачем же проводить множественные эксперименты, если они снижают точность результатов исследования? Причин может быть несколько:
1. Требуется протестировать несколько изменений и их кумулятивное воздействие на продуктовые метрики. Пример — показ пользователю на странице сервиса двух новых элементов, которые по-разному расположены относительно друг друга.
2. Изменения можно протестировать только в одном временно́м промежутке, поскольку они и взаимозависимы, и чувствительны к недельной сезонности. Пример — отключение рекламных каналов для расчёта эффекта межканальной каннибализации.
3. Заказчик хочет как можно скорее и дешевле получить ответ, какой из вариантов следует выбрать, сэкономив при этом время разработки и внедрения эксперимента.
Если мы столкнулись с одной из таких задач и нам предстоит рассчитать статистическую значимость для теста — нужно учитывать необходимость поправки на множественное тестирование. О том, что же это такое и как это правильно сделать, и пойдёт речь ниже.
Множественные эксперименты: особенности расчёта
Основные понятия
Рассмотрим общий случай, когда мы имеем дело с гипотезами , о попарном равенстве медианы или среднего подгрупп. В таком случае возможен и верный, и неверный результат исхода для каждой из гипотез. Представим результаты в виде confusion matrix эксперимента:
не отклонена | отклонена | ||
верна |
|||
неверна | |||
Таким образом, неверно отклонены из отклонённых основных гипотез.
Исходя из этих параметров, мы введём два важных понятия ошибок, которые контролируются при множественном тестировании: и .
Групповая вероятность ошибки (Family-Wise Error Rate) представляет собой вероятность получить по крайней мере одну ошибку первого рода и определяется формулой:
(False Discovery Rate) — это математическое ожидание отношения ошибок первого рода к общему количеству отклонений основной гипотезы:
Рассмотрим методы контроля этих ошибок на примере стандартного продуктового кейса.
Описание кейса
В качестве простого примера рассмотрим эксперимент, в котором трём изолированным, непересекающимся группам пользователей показали три варианта страницы с предложением нажать на кнопку звонка по объявлению. В качестве основной метрики для простоты расчёта возьмём суммарное количество звонков в каждой группе.
Посмотрим на то, как же менялась исследуемая метрика:
Рис. 1. График динамики нажатий на кнопку звонка
Воспользуемся стандартным методом , чтобы привести распределение целевой метрики в выборках к нормальному виду, и посмотрим на гистограммы и диаграммы размаха средних значений в выборках:
Рис. 2. Гистограмма распределения средних значений в группах
Рис. 3. Диаграмма размаха средних значений в группах
Судя по графикам, группа C выигрывает по количеству нажатий на кнопку звонка. Однако необходимо убедиться в статистической значимости результатов. Для этого приведём оцениваемую метрику к виду нормального распределения и воспользуемся привычным t-критерием Стьюдента для попарного сравнения групп в эксперименте, а затем — методами контроля и для учёта поправки на множественное сравнение.
Контроль FWER
Существует множество методов контроля данной ошибки, однако наиболее распространены два: 1) одношаговая процедура с одновременной корректировкой для всех тестируемых гипотез методом Бонферрони; 2) последовательная, итеративная корректировка c принятием решения на каждом шаге в соответствии с результатом методом Холма.
1. Поправка Бонферрони
Эта одношаговая процедура позволяет снизить вероятность ложноположительного результата эксперимента. Суть метода — принять альтернативную гипотезу, если:
где — количество тестируемых гипотез.
Реализовать метод можно достаточно просто при помощи стандартной библиотеки :
from bootstrapped import bootstrap as bs from bootstrapped import compare_functions as bs_cmp from bootstrapped import stats_functions as bs_st bs_ab_estims = bs.bootstrap_ab(np.array(group_A), np.array(group_B), bs_st.mean bs_cmp.difference, num_iterations=5000, alpha=0.05/3, iteration_batch_size=100, scale_test_by=1, num_threads=4) bs_bc_estims = bs.bootstrap_ab(np.array(group_B), np.array(group_C), bs_st.mean bs_cmp.difference, num_iterations=5000, alpha=0.05/3, iteration_batch_size=100, scale_test_by=1, num_threads=4) bs_ac_estims = bs.bootstrap_ab(np.array(group_A), np.array(group_C), bs_st.mean bs_cmp.difference, num_iterations=5000, alpha=0.05/3, iteration_batch_size=100, scale_test_by=1, num_threads=4)
Получив результаты статистической оценки, можно сделать выводы, различаются группы или нет.
Основной минус подхода: чем больше подгрупп — тем меньше мощность критерия, что увеличивает вероятность принять неверную гипотезу. Например, для десяти тестов и необходимо получить , чтобы сказать, что разница значимая. Чтобы нивелировать эти недостатки, можно выбрать метод Холма.
2. Метод Холма
Это нисходящая процедура последовательного изменения . На первом шаге алгоритма метода реальные сортируются по возрастанию:
затем корректируется исходно заданный -уровень:
после чего проверяется условие и делается заключение, верна ли основная гипотеза .
Точка останова алгоритма — момент i, когда принята первая основная гипотеза , при этом принимаются и все последующие .
Реализовать данный метод можно при помощи процедуры из библиотеки с параметром :
from bootstrapped import bootstrap as bs from bootstrapped import stats_functions as bs_st from scipy.stats import ttest_ind from statsmodels.sandbox.stats.multicomp import multipletests bs_a = bs.bootstrap(np.array(group_A), stat_func=bs_st.mean, num_iterations=10000, iteration_batch_size=300, return_distribution=True) bs_b = bs.bootstrap(np.array(group_B), stat_func=bs_st.mean, num_iterations=10000, iteration_batch_size=300, return_distribution=True) bs_c = bs.bootstrap(np.array(group_C), stat_func=bs_st.mean, num_iterations=10000, iteration_batch_size=300, return_distribution=True) stat_ab, p_ab = stats.ttest_ind(pd.DataFrame(bs_a), pd.DataFrame(bs_b)) stat_bc, p_bc = stats.ttest_ind(pd.DataFrame(bs_b), pd.DataFrame(bs_c)) stat_ac, p_ac = stats.ttest_ind(pd.DataFrame(bs_a), pd.DataFrame(bs_c)) print(sorted([p_ab, p_bc, p_ac])) print("FWER: " + str(multipletests(sorted([p_ab, p_bc, p_ac]), alpha=0.05, method='holm', is_sorted = True)))
Контроль FDR
Контроль означает, что выполняется условие . При этом , т. е. вероятность получить ошибку первого рода при контроле снижается.
Метод Бенджамини — Хохберга
Эта восходящая процедура предполагает последовательное изменение , предварительно отсортированных по возрастанию:
Затем исходный -уровень корректируется по формуле:
затем, как и в методе Холма, проверяется условие и делается заключение, верна ли основная гипотеза и все последующие .
Метод Бенджамини — Хохберга, как и метод Холма, можно реализовать при помощи процедуры :
print("FDR: " + str(multipletests([p_ab, p_bc, p_ac], alpha=0.05, method='fdr_bh', is_sorted = False)))
Заключение
В статье мы рассказали об основных методах оценки результатов множественных тестов и привели примеры программного кода, реализующего эти методы. Мы надеемся, что вы с пользой и интересом провели время и сможете применить описанные процедуры на практике. А если у вас возникли вопросы — мы с радостью ответим на них.
Спасибо за внимание!
ссылка на оригинал статьи https://habr.com/ru/company/yandex/blog/476826/
Добавить комментарий