Диаграмма Сэнкей (Sankey diagram) на Python

от автора

Я занимаюсь аналитикой данных в Aliradar. Мы не представлены на Хабре, но у меня поднакопился материал, которым хотелось бы поделиться. Написать эту статью меня сподвигло отсутствие годных гайдов по построению диаграммы Сэнкей с использованием python на русском языке.

В моей работе часто возникают различные задачи по анализу консистентности и полноты данных, а также по визуализации. Одна из таких задач, которую решал относительно недавно — необходимость визуализировать действия пользователей нашего мобильного приложения. Нужно было понять, какие сценарии работы с приложением существуют и внимательнее рассмотреть действия пользователей на каждом шаге для дальнейшего улучшения стабильности работы приложения.

Так как пользователей у нас много, то анализировать действия каждого — трудная и дорогая задача. Поэтому было решено визуализировать события пользователей, используя диаграмму Сэнкей (Sankey diagram).

Забегая вперед, покажу, что получится в итоге. Для подготовки данных и построения диаграммы использовал python, pandas и plotly. Надеюсь, что эта статья будет полезна аналитикам данных, код можно запустить в colab, либо взять в репозитории на github.

А теперь разберем пошагово.

Что это такое?

Первая публикация этой диаграммы появилась в 1898 году. Ее создатель, Мэтью Сенкей (Matthew H. Sankey), показал сравнение парового двигателя и двигателя без энергопотерь.

Тепловая эффективность парового двигателя
Тепловая эффективность парового двигателя

Определение, что такое диаграмма Сэнкей для действий пользователей, может быть следующее — это визуализация потоков от одного целевого действия пользователя к другому. Вот упрощенная схема, того, что в итоге должно получиться:

Упрощенная схема диаграммы Сэнкей
Упрощенная схема диаграммы Сэнкей

Разберем эту схему:

  • есть событие event_1, которое происходит раньше других и находится левее других на схеме. Такое событие будем считать источником (source);

  • далее происходит «переход» уникальных пользователей от event_1 (source) к событиям event_1, event_2, event_3, которые будем считать на первом шаге (step_1) целевыми действиями (target). Количество уникальных пользователей, совершивших переход от source к target показано с помощью ширины канала между source и target;

  • на шаге step_2 уже event_1, event_2, event_3 будут являться источниками, а event_3 и event_4 целевыми действиями;

  • от шага к шагу выполняются подобные изменения source на target. Самое первое действие — это только source, а последнее — это target, так как в первый source нет входящих потоков, а из последнего таргета нет исходящих.

Эта схема — упрощение, так как на ней указаны только один первоначальный source, и один заключительный target. В реальной жизни source и target на каждом шаге, как и самих шагов, может быть сколько угодно.

Подготовка данных

В качестве исходных данных для построения я сгенерировал искусственные данные.

Загрузка подготовленных данных
PATH_TO_CSV = 'https://raw.githubusercontent.com/rusantsovsv/senkey_tutorial/main/csv/senkey_data_tutorial.csv'  # подгружаем данные в таблицу и выводим первые 5 строк table = pd.read_csv(PATH_TO_CSV) table.head()

Первые 5 строк исходной таблицы имеют следующий вид:

В этой таблице:

  • user_id — сгенерированный id пользователя;

  • event_timestamp — время события;

  • event_name — имя события.

Для построения диаграммы нужно определить пары source-target, а также пронумеровать эти пары в соответствии с временем наступления события — это будет шаг между событиями.

Преобразование исходной таблицы
def add_features(df):          """Функция генерации новых столбцов для исходной таблицы      Args:         df (pd.DataFrame): исходная таблица.     Returns:         pd.DataFrame: таблица с новыми признаками.     """          # сортируем по id и времени     sorted_df = df.sort_values(by=['user_id', 'event_timestamp']).copy()     # добавляем шаги событий     sorted_df['step'] = sorted_df.groupby('user_id').cumcount() + 1          # добавляем узлы-источники и целевые узлы     # узлы-источники - это сами события     sorted_df['source'] = sorted_df['event_name']     # добавляем целевые узлы     sorted_df['target'] = sorted_df.groupby('user_id')['source'].shift(-1)          # возврат таблицы без имени событий     return sorted_df.drop(['event_name'], axis=1)    # преобразуем таблицу table = add_features(table) table.head()

Первые 5 строк таблицы после преобразования:

Что получили в итоговой таблице:

  • события каждого id отсортированы по времени;

  • созданы пары событий source — target;

  • добавлен шаг между этими событиями для построения диаграммы;

  • удален столбец event_name, так как в дальнейших преобразованиях он использоваться не будет.

Следующее, что нужно сделать — это выбрать количество шагов на нашей будущей диаграмме. Чем больше шагов, тем больше графических объектов в итоге будет отображено, но так как это пример, ограничимся количеством шагов, например, равным 7.

Ограничение количества шагов до 7
# удалим все пары source-target, шаг которых превышает 7 # и сохраним полученную таблицу в отдельную переменную df_comp = table[table['step'] <= 7].copy().reset_index(drop=True)

Создание индексов для source

Важным следующим шагом в подготовке данных является создание индексов для source. На каждом следующем шаге target становится source, и чтобы диаграмма коррректно генерировалась нужна правильная индексация source на каждом шаге.

Создадим словарь, в котором ключи — это шаги, а значения — словари со списком названий source и соответствующих им индексов. Обратите внимание, что на следующем шаге индексы source продолжают нумерацию, а не начинают с 0, при том, что имена событий могут повторяться.

Затем для каждого шага объединяем имена и индексы в еще один вложенный словарь. Все вложенные списки и словари потребуются в дальнейшем для генерации меток, подписей и размера каналов между source и target.

Создание словаря с индексами source
def get_source_index(df):          """Функция генерации индексов source      Args:         df (pd.DataFrame): исходная таблица с признаками step, source, target.     Returns:         dict: словарь с индексами, именами и соответсвиями индексов именам source.     """          res_dict = {}          count = 0     # получаем индексы источников     for no, step in enumerate(df['step'].unique().tolist()):         # получаем уникальные наименования для шага         res_dict[no+1] = {}         res_dict[no+1]['sources'] = df[df['step'] == step]['source'].unique().tolist()         res_dict[no+1]['sources_index'] = []         for i in range(len(res_dict[no+1]['sources'])):             res_dict[no+1]['sources_index'].append(count)             count += 1                  # соединим списки     for key in res_dict:         res_dict[key]['sources_dict'] = {}         for name, no in zip(res_dict[key]['sources'], res_dict[key]['sources_index']):             res_dict[key]['sources_dict'][name] = no     return res_dict     # создаем словарь source_indexes = get_source_index(df_comp)
Пример записи в словаре для шага 2
sources  ['history_opened', 'app_opened_from_market', 'sales_category_selected', 'favorites_opened', 'item_opened', 'app_opened_via_icon', 'market_opened_without_referral', 'price_history_opened', 'search_tab_opened', 'seller_info_opened', 'item_loaded_from_store', 'marketApp_opened', 'chart_click', 'item_opened_from_history', 'similar_tab_opened', 'reviews_tab_opened', 'app_remove', 'similar_item_opened', 'marketApp_opened_from_item', 'sales_item_opened_from_main', 'auth_opened', 'search_request_entered', 'item_info_click', 'sales_opened', 'settings_opened', 'similars_not_fetched_from_server', 'auth_user_succeeded', 'search_results_loaded']   sources_index  [20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35, 36, 37, 38, 39, 40, 41, 42, 43, 44, 45, 46, 47]   sources_dict  {'history_opened': 20, 'app_opened_from_market': 21, 'sales_category_selected': 22, 'favorites_opened': 23, 'item_opened': 24, 'app_opened_via_icon': 25, 'market_opened_without_referral': 26, 'price_history_opened': 27, 'search_tab_opened': 28, 'seller_info_opened': 29, 'item_loaded_from_store': 30, 'marketApp_opened': 31, 'chart_click': 32, 'item_opened_from_history': 33, 'similar_tab_opened': 34, 'reviews_tab_opened': 35, 'app_remove': 36, 'similar_item_opened': 37, 'marketApp_opened_from_item': 38, 'sales_item_opened_from_main': 39, 'auth_opened': 40, 'search_request_entered': 41, 'item_info_click': 42, 'sales_opened': 43, 'settings_opened': 44, 'similars_not_fetched_from_server': 45, 'auth_user_succeeded': 46, 'search_results_loaded': 47}

Генерация цветов для source

Для более наглядного представления можно разукрасить каждый source-target в разные цвета. Я рассмотрел 2 способа — случайная генерация и ручной выбор цветов.

Цвета выберем в цветовой модели RGBA. Это необходимо, чтобы сделать каналы source-target более прозрачными, по отношению к блокам для лучшей читаемости схемы.

Цвет будем генерировать для каждого уникального источника. Для этого создадим еще один словарь, в котором будут храниться соответствия source:color. По личному субъективному мнению, автоматически сгенерированные цвета не очень нравятся. Поэтому потратив немного времени выбрал те цвета, которые интереснее выглядят на белом фоне. Их можно загрузить, указав в функции colors_for_sources значение mode=’custom’ (‘random’ для случайной генерации цвета).

Функция случайной генерации цветов
def generate_random_color():          """Случайная генерация цветов rgba      Args:              Returns:         str: Строка со сгенерированными параметрами цвета     """          # сгенерим значение для каждого канала     r, g, b = np.random.randint(255, size=3)     return f'rgba({r}, {g}, {b}, 1)'
Создание словаря с соответствиями source: color
def colors_for_sources(mode):          """Генерация цветов rgba      Args:         mode (str): сгенерировать случайные цвета, если 'random', а если 'custom' -                      использовать заранее подготовленные     Returns:         dict: словарь с цветами, соответствующими каждому индексу     """     # словарь, в который сложим цвета в соответствии с индексом     colors_dict = {}          if mode == 'random':         # генерим случайные цвета         for label in df_comp['source'].unique():             r, g, b = np.random.randint(255, size=3)                         colors_dict[label] = f'rgba({r}, {g}, {b}, 1)'                  elif mode == 'custom':         # присваиваем ранее подготовленные цвета         colors = requests.get('https://raw.githubusercontent.com/rusantsovsv/senkey_tutorial/main/json/colors_senkey.json').json()         for no, label in enumerate(df_comp['source'].unique()):             colors_dict[label] = colors['custom_colors'][no]                  return colors_dict       # генерю цвета из своего списка colors_dict = colors_for_sources(mode='custom')

Создаем словарь с данными

Диаграмму будем отрисовывать с помощью Plotly. Для корректной (и более полной) отрисовки нужны следующие данные:

  • sources — список с индексами source;

  • targets — список с индексами target;

  • values — количество уникальных пользователей, совершивших переход между узлами source-target («объем» потока между узлами);

  • labels — названия узлов;

  • colors_labels — цвет узлов;

  • link_color — цвет потоков между узлами;

  • link_text — дополнительная информация.

Следующие 2 функции помогут создать словарь этих списков:

Расчет количества уникальных пользователей в процентах
def percent_users(sources, targets, values):          """     Расчет уникальных id в процентах (для вывода в hover text каждого узла)          Args:         sources (list): список с индексами source.         targets (list): список с индексами target.         values (list): список с "объемами" потоков.              Returns:         list: список с "объемами" потоков в процентах     """          # объединим источники и метки и найдем пары     zip_lists = list(zip(sources, targets, values))          new_list = []          # подготовим список словарь с общим объемом трафика в узлах     unique_dict = {}          # проходим по каждому узлу     for source, target, value in zip_lists:         if source not in unique_dict:             # находим все источники и считаем общий трафик             unique_dict[source] = 0             for sr, tg, vl in zip_lists:                 if sr == source:                     unique_dict[source] += vl                          # считаем проценты     for source, target, value in zip_lists:         new_list.append(round(100 * value / unique_dict[source], 1))          return new_list
Создание словаря с данными для отрисовки диаграммы
def lists_for_plot(source_indexes=source_indexes, colors=colors_dict, frac=10):          """     Создаем необходимые для отрисовки диаграммы переменные списков и возвращаем     их в виде словаря          Args:         source_indexes (dict): словарь с именами и индексами source.         colors (dict): словарь с цветами source.         frac (int): ограничение на минимальный "объем" между узлами.              Returns:         dict: словарь со списками, необходимыми для диаграммы.     """          sources = []     targets = []     values = []     labels = []     link_color = []     link_text = []      # проходим по каждому шагу     for step in tqdm(sorted(df_comp['step'].unique()), desc='Шаг'):         if step + 1 not in source_indexes:             continue          # получаем индекс источника         temp_dict_source = source_indexes[step]['sources_dict']          # получаем индексы цели         temp_dict_target = source_indexes[step+1]['sources_dict']          # проходим по каждой возможной паре, считаем количество таких пар         for source, index_source in tqdm(temp_dict_source.items()):             for target, index_target in temp_dict_target.items():                 # делаем срез данных и считаем количество id                             temp_df = df_comp[(df_comp['step'] == step)&(df_comp['source'] == source)&(df_comp['target'] == target)]                 value = len(temp_df)                 # проверяем минимальный объем потока и добавляем нужные данные                 if value > frac:                     sources.append(index_source)                     targets.append(index_target)                     values.append(value)                     # делаем поток прозрачным для лучшего отображения                     link_color.append(colors[source].replace(', 1)', ', 0.2)'))                          labels = []     colors_labels = []     for key in source_indexes:         for name in source_indexes[key]['sources']:             labels.append(name)             colors_labels.append(colors[name])                  # посчитаем проценты всех потоков     perc_values = percent_users(sources, targets, values)          # добавим значения процентов для howertext     link_text = []     for perc in perc_values:         link_text.append(f"{perc}%")          # возвратим словарь с вложенными списками     return {'sources': sources,              'targets': targets,              'values': values,              'labels': labels,              'colors_labels': colors_labels,              'link_color': link_color,              'link_text': link_text}     # создаем словарь data_for_plot = lists_for_plot()

Совсем не обязательно генерировать все эти списки — для построения диаграммы в одном цвете достаточно только списков sources, targets, values.

Обратите внимание на аргумент frac функции lists_for_plot. Бывают случаи, когда узлов слишком много и объем потока между узлами может быть мал. Эта переменная ограничивает минимальный поток между узлами (по умолчанию — шаг не менее 10 уникальных id между узлами). Всё что меньше будет отсечено и отображаться не будет.

После подготовки данных приступим к созданию объекта диаграммы. Сохраним его в отдельную переменную senkey_diagram для дальнейшего сохранения или публикации:

Создание объекта диаграммы
def plot_senkey_diagram(data_dict=data_for_plot):              """     Функция для генерации объекта диаграммы Сенкей           Args:         data_dict (dict): словарь со списками данных для построения.              Returns:         plotly.graph_objs._figure.Figure: объект изображения.     """          fig = go.Figure(data=[go.Sankey(         domain = dict(           x =  [0,1],           y =  [0,1]         ),         orientation = "h",         valueformat = ".0f",         node = dict(           pad = 50,           thickness = 15,           line = dict(color = "black", width = 0.1),           label = data_dict['labels'],           color = data_dict['colors_labels']         ),         link = dict(           source = data_dict['sources'],           target = data_dict['targets'],           value = data_dict['values'],           label = data_dict['link_text'],           color = data_dict['link_color']       ))])     fig.update_layout(title_text="Sankey Diagram", font_size=10, width=3000, height=1200)          # возвращаем объект диаграммы     return fig     # сохраняем диаграмму в переменную senkey_diagram = plot_senkey_diagram()

Чтобы ее отобразить нужно выполнить:

senkey_diagram.show()

Приведу фрагмент полученной диаграммы:

Что с этим делать?

Сохранение в html

Диаграмма, в зависимости от количества выбранных шагов, может получиться довольно большой. Для удобства анализа можно сохранить ее в html, а затем открыть в любом браузере. Так будет удобнее скроллить.

Сохранение диаграммы в html
senkey_diagram.write_html('demo_senkey.html', auto_open=True)

Задайте любое имя html файлу. При использовании auto_open диаграмма автоматически откроется в браузере по умолчанию.

Публикация в Plotly Chart Studio

Можно опубликовать полученную диаграмму в Plotly Chart Studio для онлайн доступа с любых устройств. Для этого нужно зарегистрировать бесплатный аккаунт. После этого выполнить следующую настройку (более подробные действия описаны здесь):

Предварительная настройка chart_studio
import chart_studio chart_studio.tools.set_credentials_file(username='YOU_LOGIN', api_key='YOU_API_KEY')

После настройки загрузите вашу диаграмму:

Загрузка диаграммы в chart_studio
py.plot(senkey_diagram, filename = 'NAME_FIG', auto_open=True)

Ссылка, приведённая в начале статьи, сгенерирована именно этим способом.

Заключение

Мы рассмотрели, как пошагово можно создать диаграмму Сэнкей — от загрузки и генерирования необходимых данных до сохранения полученной диаграммы. Надеюсь, что приведенный гайд будет полезен и поможет расширить представление о возможностях визуализации данных с помощью Python и библиотеки Plotly.
Спасибо за внимание!

ссылка на оригинал статьи https://habr.com/ru/post/566568/


Комментарии

Добавить комментарий

Ваш адрес email не будет опубликован. Обязательные поля помечены *