FAQ Сколково: 100 ответов на вопросы резидентов (от смены директора до налоговых льгот и отчётности)

от автора

Статус резидента «Сколково» дает компании налоговые льготы и доступ к мерам поддержки. А вместе с ними — десятки вопросов, которые возникают уже после получения статуса. Нужно ли сообщать Фонду о смене директора? Что делать, если пропустили срок отчета? Можно ли получать непрофильный доход, выплачивать дивиденды и одновременно сохранять IT-аккредитацию? Когда применять налоговые льготы и что произойдет с ними при утрате статуса?

На связи Евгений Яковенко, юрист AG-LEGAL. Я собрал 100 вопросов, с которыми резиденты «Сколково» сталкиваются на практике, и коротко ответил на каждый. Получился FAQ, который можно не читать от начала до конца, а сохранить и возвращаться к нужному разделу, когда возникает конкретная ситуация.

Вопросы разделены на девять тематических блоков:

1. Корпоративные изменения.

2. Статус участника и проекты.

3. Персонал и миграция.

4. Отчётность в Фонд.

5. Деятельность, выручка и финансирование.

6. Налоги, таможенные льготы и страховые взносы.

7. Гранты и меры поддержки.

8. Бухгалтерский учёт, НИОКР и нематериальные активы.

9. Личный кабинет и коммуникации.

Корпоративные изменения

1.Нужно ли уведомлять Фонд при смене юридического адреса?

Формальной обязанности нет, но участнику стоит сообщить об изменении путем направления письма в свободной форме с адреса участника (ОРН@members.sk.ru) на Skcontrol@sk.ru

2. Что делать при смене директора или его контактных данных?

О смене единоличного исполнительного органа нужно сообщить Фонду не позднее 14 дней с даты регистрации изменений в ЕГРЮЛ. В письме указать новый телефон и персональный e-mail руководителя. Сообщение направить с почты участника на ConsultingCenter@sk.ru.   

Источник: Фонд «Сколково»: действующим участникам

3. Как сообщить о новой редакции устава или новом учредителе?

Новую редакцию устава отражают при подаче очередного годового отчёта и прикладывают предусмотренные формой документы. Если появление нового учредителя повлекло изменение устава, сведения также включают в годовой отчёт.

При сложной структуре сделки или владения лучше заранее запросить письменную позицию Skcontrol.

4. Что нужно знать об ОКВЭД и коде класса 72?

Отдельно уведомлять Фонд о смене или добавлении ОКВЭД не требуется. Источник: Правила исследовательской деятельности Фонда «Сколково» (ст. 5, подп. 3.1)

Участнику требуется иметь в ЕГРЮЛ код класса 72 или его подкласса. Такой код может быть как основным, так и дополнительным; конкретный подвид должен соответствовать деятельности компании.

5. Что происходит при ликвидации компании-участника?

После регистрации ликвидации в ЕГРЮЛ компания исключается из реестра участников автоматически. При этом о принятом решении о ликвидации Фонд также следует уведомить с почты участника на Skcontrol@sk.ru .

6. Может ли иностранная компания быть учредителем участника «Сколково»?

В целом иностранное участие допустимо. Однако участником или акционером не должно быть иностранное юридическое лицо из государств и территорий, включённых в применимые перечни Минфина России об офшорных зонах и промежуточном владении активами. Перед изменением состава участников рекомендуется проверить непосредственного учредителя и цепочку владения. 

Источник: Правила исследовательской деятельности Фонда «Сколково» (ст. 8, п. 3, подп. 7)

7. Сохраняется ли статус «Сколково» при реорганизации юридического лица?

По общему правилу реорганизация приводит к утрате статуса. Исключение предусмотрено для преобразования, а также для слияния, если все участвующие в слиянии юридические лица на дату государственной регистрации правопреемника имели статус участника. О планируемой реорганизации Фонд следует уведомить заранее. 

Источник: Правила исследовательской деятельности Фонда «Сколково» (ст. 5, подп. 6; ст. 8, п. 1, подп. 3)

8. Что делать стартапу, если выручка учредителя с долей более 50% превысила 4 млрд рублей?

Для участника со статусом стартапа это создаёт риск досрочного исключения. По действующим Правилам статус может быть утрачен не ранее чем через шесть месяцев после возникновения соответствующего обстоятельства; исключение не производится, если к этому сроку вид участия изменён со стартапа на ИЦП. Лучше привести структуру владения в соответствие до годовой камеральной проверки, предпочтительно до окончания отчётного года. 

Источник: Правила исследовательской деятельности Фонда «Сколково» (ст. 8, п. 3, подп. 10.1)

Статус участника и проекты

9. Можно ли изменить название инновационного проекта?

Да. Заявление можно подать в личном кабинете в любое время. Практический ориентир для верификации проектным менеджером  около 10 рабочих дней. Новое название не должно менять суть проекта. Если меняется содержание, технологии или коммерческая модель, одной смены названия недостаточно.

Источник: Фонд «Сколково»: действующим участникам

10. Нужна ли экспертиза второго или последующего проекта?

Экспертиза необходима. Без неё доход от нового проекта может быть квалифицирован как непрофильный.

 Источник: Правила исследовательской деятельности Фонда «Сколково» (ст. 2, п. 1; ст. 4, подп. 12)

11. Меняется ли основной регистрационный номер (далее ОРН) при изменении проекта и сколько действует статус?

ОРН присваивается один раз и действует в течение 10-летнего срока участия. Номера записей об изменениях проекта не заменяют основной регистрационный номер. В договорах, письмах и отчётности следует использовать ОРН участника. 

Источник: Правила исследовательской деятельности Фонда «Сколково» (ст. 1, п. 4; ст. 2, п. 1)

12. Как добровольно выйти из проекта?

Заявление подают в разделе «Процессы участников» личного кабинета. Обычно, рассмотрение занимает 5 рабочих дней без учёта дня отправки.  Источник: Фонд «Сколково»: действующим участникам

После подачи нужно дождаться записи об исключении и электронного уведомления. Перед выходом следует оценить налоговые последствия и учесть, что досрочный выход или исключение могут повлечь ограничение на повторную заявку в течение пяти лет.

13. Когда назначают проектного менеджера и где найти его контакты?

Контакты отображаются в личном кабинете: «Сервисы» — «Профиль компании» — «Контакты Сколково». Обычно, проектный менеджер назначается через 14 дней после получения статуса, но это не регламентированный срок. Если менеджер не появился, обратитесь в свой центр развития и проверьте профиль в личном кабинете.

14. «Резидент» и «участник проекта» — это одно и то же?

В бытовой речи эти слова часто используют как синонимы.  По факту это одно и то же, разница лишь в терминологии: «участник проекта Сколково» — термин используемый в Федеральном законе «Об инновационном центре «Сколково» от 28.09.2010 N 244-ФЗ.

«Резидент Сколково» — общепринятое название, используемое в СМИ, практике и самим Фондом.

15. Можно ли отказаться от одного из нескольких проектов «Сколково»?

Да. Отказ оформляется через личный кабинет участника. Если в реестре остаётся хотя бы один реализуемый инновационный проект, сам по себе отказ от другого проекта не прекращает статус. Отказ от единственного зарегистрированного проекта приводит к досрочной утрате статуса.

16. Может ли компания потерять статус из-за отсутствия деятельности по проекту?

Да. Неосуществление исследовательской деятельности и коммерциализации хотя бы по одному проекту в течение 12 месяцев подряд создаёт риск досрочного исключения. Такой же риск возникает при существенных отклонениях от описания единственного или всех зарегистрированных проектов. Компании следует документировать НИОКР, доработки, испытания, договоры и иные результаты работы.

Источник: Правила исследовательской деятельности Фонда «Сколково» (ст. 8, п. 5, подп. 1-2)

17. Что делать после получения предупреждения или предписания Фонда?

Нужно выполнить указанные требования в установленный срок, прекратить деятельность, которую Фонд не признал исследовательской или коммерциализацией, и направить подтверждающий ответ. Срок устранения отдельных нарушений не может быть менее семи рабочих дней. Неисполнение предупреждения или несвоевременный ответ на предписание может стать самостоятельным основанием для исключения. 

Источник: Правила исследовательской деятельности Фонда «Сколково» (ст. 5, подп. 7; ст. 8, п. 3, подп. 11-12, пп. 4, 6)

18. Обязательно ли иметь действующий патент для сохранения статуса участника?

Нет. Само по себе отсутствие патента не является основанием для утраты статуса. Однако участник должен законно владеть результатами интеллектуальной деятельности или иметь необходимые права их использования, а отдельные грантовые программы могут устанавливать собственные требования к зарегистрированным правам. 

Источник: Правила исследовательской деятельности Фонда «Сколково» (ст. 6, пп. 1-3)

Персонал и миграция

19. Есть ли требования к численности и зарплате сотрудников?

Требования к минимальной численности штата или обязательному уровню зарплаты отсутствуют. Однако такие показатели могут появляться в условиях конкретной грантовой программы, ИТ-аккредитации или миграционного режима. 

Источник: Правила исследовательской деятельности Фонда «Сколково» (ст. 5)

20. Куда обращаться по оформлению иностранных сотрудников?

Вопросы разрешений, приглашений, миграционного учёта и уведомлений МВД следует направлять в визово-миграционный сервис Фонда: visa@sk.ru Инструкции опубликованы на https://visa.sk.ru/

21. Нужно ли оформлять разрешение на работу иностранному высококвалифицированному специалисту?

Да. Статус участника «Сколково» не заменяет миграционное оформление. Для ВКС необходимо оформить разрешение на работу, заключить трудовой договор и выполнить установленные уведомления МВД. За сопровождением процедуры можно обратиться в визово-миграционный сервис Фонда по адресу visa@sk.ru. 

Источник: Визово-миграционный центр «Сколково»: услуги участникам

Отчётность в Фонд

22. Где смотреть актуальные формы и сроки отчётности?

Общие сроки закреплены в Правилах исследовательской деятельности, а формы открываются в личном кабинете в разделе «Сервисы». Инструкции к годовому отчёту обновляются ежегодно. Перед каждым периодом проверяйте личный кабинет, уведомления Фонда и приказ за соответствующий год. Старый календарь нельзя автоматически переносить на следующий период. 

Источник: Фонд «Сколково»: действующим участникам

23. Какие сроки действовали для отчётов в 2026 году?

— отчёт за I квартал 2026 года с 1 по 13 апреля 2026 года включительно (Источник: Фонд «Сколково»: действующим участникам);

— отчёт за полугодие 2026 года 1 по 13 июля 2026 года включительно;

— отчёт за III квартал 2026 года будут сдавать 1 по 12 октября 2026 года включительно;

— отчёт за IV квартал 2025 года 1 по 5 рабочий день января 2026 года;

— годовой отчёт за 2025 года с 1 февраля по 6 апреля 2026 года включительно.

Это исторические ориентиры, а не постоянный календарь. Годовой отчёт лучше подавать заранее: его верификация может занимать до двух рабочих дней, а форму могут вернуть на исправление.

24. Нужно ли отчитываться без грантов, льгот и выручки?

Да. Квартальная и годовая отчётность это самостоятельная обязанность участника. Она не зависит от получения грантов, применения налоговых льгот или наличия операций. Нулевые показатели не освобождают от подачи формы. Грантовая отчётность существует отдельно и подчиняется условиям конкретного соглашения.

25. Как отчитываться компании, которая получила статус в течение года?

В квартальном отчёте показатели указывают с даты внесения компании в реестр до конца отчётного периода, даже если участие длилось один день и все значения равны нулю.

Если статус получен в ноябре или декабре, годовой отчёт всё равно подаётся за период участия до 31 декабря. В отдельных финансовых полях форма может запрашивать данные за календарный год целиком, поэтому нужно следовать подсказкам к конкретному пункту.

26. Квартальные отчёты подаются за три месяца или нарастающим итогом?

Нарастающим итогом с начала календарного года. Для нового участника отсчёт начинается с даты получения статуса. То есть полугодовой отчёт охватывает период по 30 июня, отчёт за девять месяцев по 30 сентября, а не только три последних месяца.

27. Отчётность заполняется по проекту или по всей компании?

Показатели квартального отчёта указываются по юридическому лицу в целом, а не только по проекту, внесённому в реестр. В поле общей выручки отражается вся выручка компании. Профильную, международную или иную часть раскрывают в специальных полях. Общий показатель необходимо сверять с бухгалтерскими данными и инструкцией к форме.

28. Какие статусы означают, что отчёт подан?

Для квартального отчёта достаточным считается статус «Отправлен»; переход в статус «Получен Фондом» может занять рабочий день.

Для годового отчёта ориентир другой — «Верифицирован». Этот статус означает выполнение обязанности по подаче, но не завершение последующей камеральной проверки деятельности.

29. Что делать, если пропущен срок или обнаружена ошибка в квартальном отчёте?

После дедлайна форма закрывается и не открывается для первичной подачи. Следующий отчёт нужно подать нарастающим итогом, включив исправленные данные.

Если ошибка существенная, можно написать с почты участника просьбу открыть текущую форму и объяснить причину. Фонд может отказать после закрытия периода. Отсутствие немедленной санкции за пропуск не отменяет саму обязанность отчитаться.

30. Можно ли исправить уже верифицированный годовой отчёт?

Да, если обнаружены неполные или недостоверные сведения либо скорректирована бухгалтерская отчётность. Запрос на открытие формы направляют с почты участника на ConsultingCenter@sk.ru с указанием основания.

31. Нужно ли отчитываться после утраты статуса?

После исключения из реестра обязанность подачи отчётов участника прекращается. При этом могут сохраняться обязательства по грантовым соглашениям, а Фонд иногда просит добровольно представить сведения за прошлый год.

32. Что делать, если технический сбой мешает сдать отчёт?

Сразу зафиксируйте скриншоты, URL страницы, время ошибки, браузер и номер заявки. Обращение направьте в sitehelp@sk.ru  или через чат-бот на sk.ru; официальное письмо можно продублировать на SKFoundation@sk.ru   ( Источник: Фонд «Сколково»: действующим участникам)

Фиксация сбоя не гарантирует продление срока, но подтверждает, что участник обратился до дедлайна.

33. Какие суммы включать в показатель «Объём выручки» квартального отчёта?

Используют выручку от обычных видов деятельности по бухгалтерскому учёту. В показатель не включают гранты, пожертвования, продажу основных средств и другие поступления, которые не являются выручкой по ПБУ 9/99.

34. Включаются ли проценты по банковскому депозиту в квартальный показатель выручки?

Нет. Проценты по банковским депозитам относятся к внереализационным (простите за длинное слово) или прочим доходам по счёту 91.01, а не к выручке по счёту 90. При этом для контроля правила 70/30 такой доход анализируется отдельно.

35. Годовой отчёт в Фонд — это обычная бухгалтерская отчётность?

Нет. Это отдельная форма в личном кабинете участника с собственными показателями и приложениями. Бухгалтерская отчётность является одним из документов, который прикладывают к годовому отчёту.

36. Могут ли показатели годового отчёта отличаться от ранее поданного квартального?

Да. Квартальный отчёт можно рассматривать как оперативный, а в годовом отражают окончательные корректные данные бухгалтерского учёта. Расхождение должно объясняться документами и исправлениями учёта.

37. Что включать в оценочный объём затрат на исследования и разработки?

Включают прямые и иные обоснованно относимые к разработке затраты: оплату труда и взносы исследовательской команды, заказные НИОКР, материалы и другие расходы. В показателе учитывают как списанные на расходы, так и капитализированные в течение года суммы.

38. Можно ли приложить предварительный ОФР, если годовая бухгалтерская отчётность ещё не сдана?

Можно приложить предварительный ОФР, подписанный руководителем, а после утверждения и сдачи бухгалтерской отчётности сохраняют окончательную версию. Реквизиты организации и отчётный период должны позволять однозначно идентифицировать документ.

39. Какие бухгалтерские документы проверить перед первым годовым отчётом?

Практический чек-лист: ОСВ и отчёт по проводкам за период участия, аналитику выручки по проекту, реестр договоров по счёту 90, документы по прочей реализации через счёт 91 и учёт затрат или НМА на счёте 08. Для продажи имущества полезна справка, подтверждающая цену и отсутствие запрещённой наценки.

40. Должен ли исправленный годовой отчёт пройти повторную верификацию до окончания срока корректировки?

Нет. До указанного Фондом времени участник должен отправить исправленный отчёт из личного кабинета. Повторная проверка и верификация могут завершиться позже. После отправки следует сохранить подтверждение и проверить изменение статуса формы.

Деятельность, выручка и финансирование

41. Как в целом работает правило 70/30?

Отдельное разрешение на непрофильную деятельность в пределах допустимой доли не требуется. Резидент должен осуществлять деятельность только в рамках заявленного проекта. В настоящее время перечень иных видов деятельности отсутствует, но доход от них не должен превышать 30% общей суммы доходов. Соотношение оценивается по итогам года, хотя контролировать его разумно ежеквартально. Компании нужен раздельный аналитический учёт профильных и иных доходов.

42. Опубликован ли детальный порядок расчёта для правила 70/30?

На 21 августа 2026 года отдельный приказ о порядке определения суммы доходов ещё не был опубликован, а точная дата выпуска не называлась. До появления документа следует фиксировать подход к классификации доходов и по спорным операциям запрашивать письменную позицию Skcontrol. Также можно ознакомиться с нашей статье по прогнозу приказа «Сколково» по ссылке https://habr.com/ru/companies/aglegal/articles/1072708/

43. Можно ли получать непрофильный доход при нулевом профильном доходе?

Нет. Если доход от основной деятельности равен нулю, доход от иных видов деятельности считался недопустимым. Перед такой операцией нужно рассчитать годовое соотношение и получить письменную консультацию, особенно пока не опубликована детальная методика. 

Источник: Правила исследовательской деятельности Фонда «Сколково» (ст. 4, подп. 12)

44. Можно ли выплачивать дивиденды?

Запреты на дивиденды из профильной прибыли отсутствуют. Но прибыль, сформированную за счёт непрофильной деятельности, распределять нельзя. До принятия решения о дивидендах нужно подтвердить происхождение прибыли и обеспечить бухгалтерскую аналитику, которая отделяет профильную часть от иной. 

Источник: Правила исследовательской деятельности Фонда «Сколково» (ст. 4, подп. 11-12)

45. Как учитывается доход от второго проекта без экспертизы?

Без экспертизы доход от второго проекта относится к непрофильному. После положительной экспертизы и внесения проекта в реестр он может стать профильным. Практически это означает, что экспертизу лучше завершить до существенной коммерциализации нового направления.

46. Куда направить вопрос о соответствии сделки Правилам проекта?

Письменный запрос направляют с адреса участника на Skcontrol@sk.ru.  В обращении нужно подробно описать деятельность и приложить проекты договоров и другие документы. Регламентный срок ответа до 30 дней, поэтому сложные сделки лучше выносить на консультацию заранее.

Источник: Фонд «Сколково»: действующим участникам

47. Можно ли компании получать и выдавать займы?

Ограничений на получение займов в Правилах проекта отсутствуют. При выдаче займа важен процентный доход: он может попасть в категорию иных доходов и повлиять на соотношение 70/30. Налоговые, корпоративные и взаимозависимые аспекты сделки проверяются отдельно.

Источник: Правила исследовательской деятельности Фонда «Сколково» (ст. 4, подп. 12)

48. Какие займы отражаются как внешнее финансирование?

В квартальном отчёте в качестве внешнего финансирования отражаются долгосрочные займы со сроком более одного года. Краткосрочные займы в это поле не включаются. 

Источник: Правила исследовательской деятельности Фонда «Сколково» (ст. 8, п. 5, подп. 7)

49. Опасен ли квартал без деятельности?

Нулевая деятельность в отдельном квартале сама по себе не приводит к лишению статуса. Однако компания всё равно должна подать нулевой отчёт и продолжать соблюдать остальные требования. Причины отсутствия операций лучше документировать, особенно если пауза длится несколько периодов.

Источник: Правила исследовательской деятельности Фонда «Сколково» (ст. 7, пп. 1, 3; ст. 8, п. 5, подп. 2)

50. Можно ли передать производство продукции стороннему контрактному производителю?

Да. Участник может оставаться разработчиком технологии, правообладателем, проектировщиком и продавцом, а изготовление по его техническому заданию поручить сторонней организации. В такой модели приказ о локализации не применяется, если привлечённая компания выполняет только производственные работы и не передаёт участнику собственный результат интеллектуальной деятельности для включения в продукт. 

Источник: Правила исследовательской деятельности Фонда «Сколково» (ст. 3, п. 2, подп. 3; п. 3, подп. 1, 3)

51. Считается ли доход по уступке права требования профильным доходом?

Как правило, нет. Доход от продажи или приобретения права требования с последующим получением платежа относится к иной финансово-хозяйственной деятельности и учитывается в непрофильной доле 30%. Если цессия используется как технический способ расчёта по профильному договору и сумма существенна, безопаснее заранее запросить письменную квалификацию Фонда. 

Источник: Правила исследовательской деятельности Фонда «Сколково» (ст. 4, подп. 12)

Налоги, таможенные льготы и страховые взносы

52. С какой даты можно применять льготы?

Льготы можно начинать применять с первого числа месяца, следующего за месяцем получения статуса. Компании нужно своевременно направить требуемые уведомления и заявления в ИФНС и сохранить подтверждение их приёма. 

Источник: Фонд «Сколково»: налоговые и таможенные льготы

53. Нужно ли ждать подтверждения ИФНС, прежде чем применять освобождение?

Предварительное разрешение инспекции не требуется: порядок носит уведомительный характер. Однако до отражения операций без налога нужно убедиться, что выполнены все условия, а после подачи сохранить квитанцию о приёме документов.

54. Какие документы нужны для льгот по НДС и налогу на прибыль?

Потребуются заявление или уведомление по соответствующей льготе и пакет документов по НК РФ. Со стороны Фонда участник получает выписку из реестра. Комплект следует сверять с применимыми статьями НК РФ и требованиями своей инспекции.   

Источник: ФНС России: документы для подтверждения льгот участника «Сколково»

55. Нужно ли готовить отдельный комплект документов по каждому налогу?

К уведомлению по каждому виду освобождения формируют свой комплект: уведомление, выписка из реестра участников и ОФР; для НДС допустима также выписка из книги учёта доходов и расходов. Даже если используется единая форма КНД, приложения лучше привязать к конкретному налогу. 

Источник: ФНС России: документы для подтверждения льгот участника «Сколково»

56. Какую форму уведомления об освобождении использовать в 2026 году?

Для участников проекта применяется форма КНД 1150017. Перед отправкой следует проверить актуальную редакцию формы и формат в сервисе ФНС или у оператора ЭДО. 

Источник: ФНС России: форматы уведомлений участников «Сколково»

57. Насколько свежей должна быть выписка из реестра для налогового уведомления?

Рекомендуем прикладывать актуальную выписку, полученную непосредственно перед подачей, чтобы подтвердить действующий статус на эту дату. Если документ не приложен, комплект может считаться неполным.

58. Когда ежегодно подтверждать освобождение по налогу на прибыль?

Не позднее 20 января года, следующего за истекшим налоговым периодом. Например, если освобождение применялось в 2026 году, уведомление о продлении и подтверждающие документы нужно представить не позднее 20 января 2027 года. К уведомлению прилагают документ о статусе участника и отчет о финансовых результатах, подтверждающий объем выручки. 

Источник: Фонд «Сколково»: налоговые и таможенные льготы

59. Когда продлевать освобождение по НДС?

По НДС срок не привязан к 20 января. Продление подтверждают после каждых 12 календарных месяцев использования освобождения — не позднее 20-го числа месяца, следующего за окончанием этого периода. Если освобождение применяется с 1 апреля 2026 года, первые 12 месяцев заканчиваются 31 марта 2027 года, поэтому документы нужно подать не позднее 20 апреля 2027 года. У каждой компании контрольная дата может быть своей. 

Источник: Фонд «Сколково»: налоговые и таможенные льготы

60. Нужно ли сдавать нулевые декларации по НДС и налогу на прибыль во время освобождения?

После надлежащего уведомления декларации за периоды, начинающиеся с даты применения освобождения, не подают. Исключения возникают, в частности, при обязанностях налогового агента, импортном НДС или выставлении счёта-фактуры с выделенной суммой налога. 

Источник: ФНС России: применение освобождения от НДС по статье 145.1 НК РФ

61.Что делать, если ИФНС требует декларации, хотя освобождение применяется?

Направить пояснение со ссылкой на применяемое освобождение и приложить подтверждение подачи уведомления и статуса участника. При смене инспекции полезно отдельно проверить, что в информационной системе ИФНС проставлен признак освобождения. 

Источник: ФНС России: применение освобождения от НДС по статье 145.1 НК РФ

62. Можно ли применять освобождение по НДС только к части клиентов или операций?

Нет. Освобождение либо отказ от него применяется ко всем операциям участника, а не выборочно по клиентам. Для сделок, где возникают обязанности налогового агента или импортный НДС, действуют специальные исключения. 

Источник: ФНС России: применение освобождения от НДС по статье 145.1 НК РФ

63. Можно ли отказаться от освобождения по НДС?

Да. Отказ оформляют уведомлением не позднее первого числа налогового периода, с которого компания прекращает применять освобождение. 

Источник: ФНС России: применение освобождения от НДС по статье 145.1 НК РФ

64. Что произойдёт, если участник с освобождением выставит счёт-фактуру с выделенным НДС?

Выделенную сумму НДС придётся исчислить и уплатить, а также представить декларацию. Может возникнуть риск спора у покупателя по вычету. 

Источник: ФНС России: применение освобождения от НДС по статье 145.1 НК РФ

65. Освобождает ли статус от агентского и импортного НДС?

Нет. Освобождение участника не распространяется на НДС при ввозе товаров и на обязанности налогового агента, например в предусмотренных законом операциях с государственным имуществом или иностранными контрагентами. 

Источник: ФНС России: косвенные налоги при импорте и в ЕАЭС

66. Что делать с входным НДС при переходе на освобождение?

Ранее принятый к вычету НДС по остаткам и активам, которые будут использоваться в период освобождения, может потребовать восстановления, в том числе пропорционально остаточной стоимости ОС. Новый входной НДС к вычету не принимают; его учитывают в стоимости либо списывают по выбранной и документированной учётной политике. 

Источник: ФНС России: применение освобождения от НДС по статье 145.1 НК РФ

67. Как перейти на освобождение в середине квартала, если до этого компания начисляла НДС?

Освобождение начинают с выбранного первого числа месяца. За предшествующие месяцы квартала компания остаётся плательщиком НДС, отражает эти операции в декларации и уплачивает налог. 

Источник: ФНС России: применение освобождения от НДС по статье 145.1 НК РФ

68. Облагаются ли проценты по банковскому депозиту налогом на прибыль при действующем освобождении?

При действующем освобождении по налогу на прибыль отдельный налог с депозитных процентов не возникает. При этом с 2026 года такой доход нужно отдельно оценивать по правилам профильной и иной деятельности, включая лимит 70/30.

69. Есть ли у участника льгота по налогу на имущество и нужно ли ежегодно её продлевать?

Льгота составляет 0% и действует в период участия, но не более 10 лет при соблюдении условий НК РФ. Отдельное ежегодное уведомление о начале применения или продлении освобождения не предусмотрено.

70. Какие тарифы страховых взносов применяет участник в 2026 году?

В пределах 1,5 МРОТ применяется общий тариф 30%, а с части выплат сверх 1,5 МРОТ — пониженный тариф 15%. 

Источник: ФНС России: пониженные тарифы страховых взносов с 2026 года

71. Возмещает ли Фонд часть уплаченных страховых взносов в 2025–2026 годах?

Программа возмещения была приостановлена, и информации о возобновлении не было.

72. Когда начинать применять пониженный тариф страховых взносов и нужно ли уведомлять ИФНС?

Тариф применяют с первого числа месяца, следующего за месяцем получения статуса. Отдельное уведомление о начале применения тарифа и ежегодное продление не предусмотрены: право возникает при наличии статуса и соблюдении условий ст. 427 НК РФ, а применение тарифа отражается в расчете по страховым взносам.

73. Можно ли выбрать одну льготу или не применять их вовсе?

Да. Применение льгот это право компании, а не обязанность. Можно использовать одну, несколько либо отказаться от них совсем. Выбранную позицию нужно зафиксировать и оформить в ИФНС. Ограничения на одновременное применение льгот Сколково и других специальных режимов анализируются отдельно.

74. Означают ли 1 млрд рублей выручки и 300 млн рублей прибыли потерю статуса?

Нет. Эти пороги относятся к налоговым последствиям и не являются лимитами для самого статуса участника по Правилам проекта. Необходимо разделять два анализа: сохранение статуса и сохранение права на конкретную налоговую льготу. 

Источник: Фонд «Сколково»: налоговые и таможенные льготы

75. Совместим ли статус с УСН или АУСН?

Да, статус участника можно получить и сохранять при УСН или АУСН. Но доступность конкретной льготы зависит от системы налогообложения

Например, льгота по налогу на прибыль применима только к плательщику этого налога, то есть при ОСНО. Переход режима и его последствия нужно заранее рассчитать.

76. Льготы действуют только для проектной деятельности и проектных сотрудников?

Льготы распространяются на деятельность компании и её сотрудников в целом. Делить операции на «проектные с льготой» и «непроектные без льготы» не предполагается.

77. Можно ли сохранить ИТ-аккредитацию и одновременно применять ИТ-льготы?

Саму ИТ-аккредитацию сохранять можно, если она нужна для неналоговых мер поддержки. Однако, в настоящее время, одновременное применение ИТ-льгот и специального режима льгот участника Сколково не допускается. 

Источник: ФНС России: основные изменения налогового законодательства с 2026 года

78. Что происходит с налогами и взносами при утрате статуса?

НДС с начала квартала утраты статуса, налог на прибыль с начала года, страховые взносы с первого числа месяца утраты.

До добровольного выхода нужно рассчитать возможные доначисления, пени и кассовую нагрузку.

79. Есть ли специальная льгота по НДФЛ?

Нет. НДФЛ уплачивается по общим правилам. Его не следует смешивать с льготными тарифами страховых взносов. Для иностранных работников и специальных налоговых статусов могут действовать отдельные нормы. 

Источник: ФНС России: налог на доходы физических лиц

80. Что будет, если уведомление о налоговой льготе подано с опозданием?

Просрочка создает риск спора с ИФНС, но сама по себе не всегда означает утрату льготы. В деле ООО «Игровые решения» Арбитражный суд Московского округа указал, что при фактическом соблюдении условий освобождения несвоевременная подача уведомления не названа в НК РФ основанием для доначисления налога. Минфин также ссылался на информационный, а не разрешительный характер уведомления. Однако контрольные даты лучше соблюдать, а при просрочке — подать документы как можно быстрее и отдельно оценить риски по конкретному налогу и периоду.

81. Какие таможенные платежи может компенсировать Фонд «Сколково»?

При соблюдении установленной процедуры Фонд может компенсировать 100% ввозной таможенной пошлины и импортного НДС по товарам, ввозимым для исследовательской деятельности участника и коммерциализации проекта. Сборы за таможенное оформление участник оплачивает самостоятельно. Соглашения с Фондом и таможенным представителем, а также цели использования товара нужно согласовать до ввоза.

82. Когда сведения об участнике передаются в ФНС для включения в реестр субъектов МСП?

Фонд ежегодно до 5 июля направляет в ФНС электронную копию реестра с данными действующих участников, получивших статус не позднее 1 июля соответствующего года. Если компания не появилась в реестре МСП, следует проверить сдачу сведений о численности и налоговой отчётности, а затем обратиться в территориальную инспекцию. 

Источник: ФНС России: включение сведений в Единый реестр субъектов МСП

Гранты и меры поддержки

83. Куда обращаться по микрогрантам и где смотреть условия?

Вопросы по микрогрантам направляют на small_funds@sk.ru Также можно попробовать обратиться по номеру телефона +7 (495) 956-00-33, добавочный 2465. Для этой службы лучше использовать обычный адрес компании, а не ОРН@members.sk.ru . 

Источник: Сервис Фонда «Сколково»: микрогранты

Условия конкретной программы можно смотреть на странице микрогрантов и в личном кабинете: «Сервисы» — «Микрогранты».

84. Зависит ли финансовая помощь от УСН или АУСН?

Сама возможность получить финансовую помощь Фонда не зависит от системы налогообложения. При этом налоговый учёт гранта или иной помощи может зависеть от режима, а критерии конкретной программы всё равно нужно проверять отдельно.

85. Как участнику попасть в реестр МТК?

Для участников Сколково процедура бесплатная и упрощённая. При соответствии критериям на почту участника может поступить предложение или согласие на включение. Нужно проверить почту ОРН@members.sk.ru и при необходимости можно написать на mtk@sk.ru

Включение не всегда полностью автоматическое: может потребоваться действие или подпись руководителя.

86. Как учесть микрогрант, если Фонд заплатил исполнителю напрямую и деньги не поступали участнику?

Если заказчиком работы является компания, результат и расходы относятся к ней, даже когда оплату за неё перечислил Фонд. В учёте это отражают как расходы или стоимость создаваемого актива, оплаченные третьим лицом; проводки следует увязать с условиями соглашения и учётной политикой

87. Обязательно ли иметь статус малой технологической компании для получения микрогранта?

По действующим программам статус МТК в большинстве случаев требуется. Исключение предусмотрено для отдельных микрогрантов на авансирование или компенсацию расходов по защите интеллектуальной собственности. Требование нужно перепроверять в документации конкретного отбора.

88. Можно ли подать заявку на новый микрогрант, если предыдущий грант ещё не закрыт?

Как правило, нельзя, если компания является стороной другого грантового или мини-грантового соглашения и отчёт по его последнему этапу ещё не принят Фондом. Перед новой заявкой следует закрыть отчётность по действующему соглашению и проверить ограничения выбранной программы

89. Может ли инвестор получить компенсацию за инвестиции в участника «Сколково»?

Да, такая программа предусмотрена для физических лиц. В общем случае инвестиция должна составлять не менее 1 млн рублей, а компенсация может достигать 50% вложений, но не более 20 млн рублей и не более суммы НДФЛ, уплаченной инвестором за установленный период. Компания проходит проверку расходов и отчитывается о целевом использовании инвестиций

Бухгалтерский учёт, НИОКР и нематериальные активы

90. Можно ли признать товарный знак, полученный с помощью микрогранта, нематериальным активом?

Да, если объект отвечает критериям признания НМА. Первоначальную стоимость формируют из расходов, непосредственно связанных с получением и оформлением прав на товарный знак.

91. Нужно ли принять созданный РИД к учёту как НМА до начала коммерциализации?

Рекомендуем завершить формирование и принять НМА к учёту до получения профильной выручки от коммерциализации этого РИД. Затраты до готовности накапливают на счёте 08, а после готовности переводят на счёт 04.

92. Обязательна ли государственная регистрация права, чтобы принять разработку к учёту как НМА?

Сама государственная регистрация не является универсальным обязательным условием. Компания должна документально подтвердить существование и контроль права, готовность актива и его способность приносить экономические выгоды в соответствии с ФСБУ 14/2022. 

Источник: Приказ Минфина России от 30.05.2022 № 86н (ФСБУ 14/2022)

93. Как учитывать доработки и новые версии программного продукта?

В зависимости от самостоятельности результата и учётной политики затраты на доработку либо увеличивают стоимость существующего НМА, либо формируют отдельный НМА для новой версии или модуля. Выбранный подход нужно обосновать и применять последовательно.

94. Нарушает ли правила Фонда полностью самортизированный НМА?

Само по себе полное начисление амортизации не считается нарушением правил проекта. Это вопрос бухгалтерского учёта; важно, чтобы существование и использование РИД подтверждались документами, а дальнейшие доработки учитывались корректно.

95. Может ли участник сдавать упрощённую бухгалтерскую отчётность?

Статус участника сам по себе не лишает компанию права на упрощённую отчётность. Возможность зависит от выполнения общих критериев для субъектов малого предпринимательства и отсутствия иных ограничений. 

Источник: Письмо ФНС России от 17.03.2014 № ГД-4-3/4788@

96. Как оформить продажу бывшего в употреблении оборудования, чтобы снизить риск претензий Фонда?

Необходимо указывать цену не выше цены приобретения и сохранить договор купли-продажи, документы реализации и расчёт цены. Доход и финансовый результат отражают по правилам бухгалтерского учёта, а соответствие операции Правилам проекта оценивают отдельно. 

Источник: Правила исследовательской деятельности Фонда «Сколково» (ст. 4, подп. 12)

Личный кабинет и коммуникации

97. Куда обращаться, если не работает сайт или личный кабинет?

Технические обращения направляют на sitehelp@sk.ru  через чат-бот сайта sk.ru. К сообщению нужно приложить скриншот, URL, время ошибки, название браузера и ОРН.

98. Вопрос: Как пользоваться почтой участника ОРН@members.sk.ru?

Порядок активации размещён на странице нового участника https://sk.ru/new-participant/   

Источник: Фонд «Сколково»: новому участнику

После активации вход выполняется через https://members.sk.ru логином служит номер участника. Инструкция по восстановлению пароля находится на https://sk.ru/current-participant.

С почты участника лучше писать в Skcontrol, ConsultingCenter и Sitehelp. В другие службы разумнее писать с обычной корпоративной почты.

99. Можно ли изменить e-mail, который служит логином личного кабинета?

Нет. Важно учитывать, что логин личного кабинета и контактный e-mail директора – это разные почты. Изменение контактов руководителя не меняет учётную запись.

100. Сколько ждать ответ Skcontrol?

Для обращения, направленного с почты участника на Skcontrol@sk.ru регламентный срок до 30 дней.

Вместо заключения

У резидента «Сколково» редко возникает одна большая проблема. Чаще риски накапливаются из небольших действий, которые вовремя не сделали: не сообщили о смене директора, отложили отчет на последний день, не зафиксировали технический сбой или начали новую деятельность, не проверив, соответствует ли она правилам проекта.

Поэтому главное после получения статуса — встроить соблюдение правил в обычные процессы компании: следить за почтой и личным кабинетом, вести раздельную аналитику доходов, заранее проверять спорные сделки и перепроверять меняющиеся требования перед их применением.

Сохраните этот FAQ: скорее всего, все 100 ответов сразу вам не понадобятся. Но нужный вопрос почти наверняка возникнет в самый неподходящий момент. Больше полезных материалов оставляю в своем тг-канале про Сколково и другие налоговые льготы для ИТ, подписывайтесь, буду рад вас там видеть!

ссылка на оригинал статьи https://habr.com/ru/articles/1082924/